基本信息
石一鸣 男 博导 中国科学院深圳先进技术研究院
电子邮件： ym.shi@siat.ac.cn
通信地址： 广东省深圳市南山区西丽大学城学苑大道1068号
邮政编码： 518055
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研究领域
招生信息
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
招生方向
合成生物学，生物信息学，天然产物化学，生物合成
教育背景
2009-09--2014-07 中国科学院大学昆明植物研究所 博士
工作经历
工作简历
2021-03~2023-02,马普陆地微生物所, Project Group Leader
2016-01~2021-02,歌德法兰克福大学, 博士后
2016-01~2021-02,歌德法兰克福大学, 博士后
专利与奖励
奖励信息
（1） The Alexander von Humboldt Fellowship for Postdoctoral Research (德国亚历山大冯洪堡博士后奖学金), , 其他, 2016
（2） The CAS Presidential Excellence Award (中科院院长奖优秀奖), , 其他, 2014
（3） Outstanding Graduate Student Award at the CAS (中科院优秀毕业生), , 其他, 2014
（4） First-Prize Di-Ao Award of the CAS (中科院地奥一等奖), 一等奖, 其他, 2013
（5） National Scholarship for Ph.D. Students (博士研究生国家奖学金), 一等奖, 国家级, 2013
（2） The CAS Presidential Excellence Award (中科院院长奖优秀奖), , 其他, 2014
（3） Outstanding Graduate Student Award at the CAS (中科院优秀毕业生), , 其他, 2014
（4） First-Prize Di-Ao Award of the CAS (中科院地奥一等奖), 一等奖, 其他, 2013
（5） National Scholarship for Ph.D. Students (博士研究生国家奖学金), 一等奖, 国家级, 2013
出版信息
发表论文
（1） Bacterial Secondary Metabolites Embedded in Producer Cell Membranes and Antibiotics Targeting Their Biosynthesis, ChemMedChem, 2024, 第 3 作者 通讯作者
（2） Exploring nature's battlefield: organismic interactions in the discovery of bioactive natural products, Natural Product Reprots, 2024, 第 4 作者 通讯作者
（3） Pyrrolizwilline, a Unique Bacterial Alkaloid Assembled by a Nonribosomal Peptide Synthetase and non-Enzymatic Dimerization, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2024, 第 4 作者
（4） Cleavage Off-Loading and Post-assembly-Line Conversions Yield Products with Unusual Termini during Biosynthesis, ACS CHEMICAL BIOLOGY, 2022, 第 1 作者 通讯作者
（5） Genome Mining Enabled by Biosynthetic Characterization Uncovers a Class of Benzoxazolinate-Containing Natural Products in Diverse Bacteria, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2022, 第 1 作者 通讯作者
（6） Global analysis of biosynthetic gene clusters reveals conserved and unique natural products in entomopathogenic nematode-symbiotic bacteria, NATURE CHEMISTRY, 2022, 第 1 作者 通讯作者
（7） An Unconventional Melanin Biosynthesis Pathway in Ustilago maydis, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2021, 第 2 作者
（8） Engineering bacterial symbionts of nematodes improves their biocontrol potential to counter the western corn rootworm (Feb, 10.1038/s41587-020-0419-1, 2020), NATURE BIOTECHNOLOGY, 2020, 第 9 作者
（9） Engineering bacterial symbionts of nematodes improves biocontrol potential of the western corn rootworm, NATURE BIOTECHNOLOGY, 2020, 第 9 作者
（10） (��)-Alternarlactones A and B, Two Antiparasitic Alternariol-like Dimers from the Fungus Alternaria alternata P1210 Isolated from the Halophyte Salicornia sp., JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY, 2019, 第 3 作者
（11） Promoter Activation in �� hfq Mutants as an Efficient Tool for Specialized Metabolite Production Enabling Direct Bioactivity Testing, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2019, 第 8 作者
（12） (+/-)-Alternarlactones A and B, Two Antiparasitic Alternariol-like Dimers from the Fungus Alternaria alternata P1210 Isolated from the Halophyte Salicornia sp., JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY, 2019, 第 3 作者
（13） Expanding the Isoprenoid Building Block Repertoire with an IPP Methyltransferase from Streptomyces monomycini, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2019, 第 5 作者
（14） CRAGE enables rapid activation of biosynthetic gene clusters in undomesticated bacteria, NATURE MICROBIOLOGY, 2019, 第 5 作者
（15） An Uncommon Type II PKS Catalyzes Biosynthesis of Aryl Polyene Pigments, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2019, 第 4 作者
（16） Dual phenazine gene clusters enable diversification during biosynthesis, NATURE CHEMICAL BIOLOGY, 2019, 第 1 作者
（17） Chemical language and warfare of bacterial natural products in bacteria-nematode-insect interactions, NATURAL PRODUCT REPORTS, 2018, 第 1 作者
（18） Schinortriterpenoids with Identical Configuration but Distinct ECD Spectra Generated by Nondegenerate Exciton Coupling, ORGANIC LETTERS, 2018, 第 1 作者
（19） Georatusin, a Specific Antiparasitic Polyketide-Peptide Hybrid from the Fungus Geomyces auratus, ORGANIC LETTERS, 2018, 第 1 作者
（20） Refining the Natural Product Repertoire in Entomopathogenic Bacteria, TRENDS IN MICROBIOLOGY, 2018, 第 2 作者
（21） Structure and Biosynthesis of Isatropolones, Bioactive Amine-Scavenging Fluorescent Natural Products from Streptomyces Go66, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2017, 第 2 作者
（22） Natural product diversity associated with the nematode symbionts Photorhabdus and Xenorhabdus, NATURE MICROBIOLOGY, 2017, 第 6 作者
（23） Lanostane-type triterpenoids from Kadsura coccinea, TETRAHEDRON, 2017, 第 3 作者
（24） Structure and Biosynthesis of Isatropolones, Bioactive Amine-Scavenging Fluorescent Natural Products from Streptomyces Go66, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2017, 第 2 作者
（25） MICROROBIOLOGY A new language for small talk, NATURE CHEMICAL BIOLOGY, 2017, 第 1 作者
（26） Natural product diversity associated with the nematode symbionts Photorhabdus and Xenorhabdus, NATURE MICROBIOLOGY, 2017, 第 6 作者
（27） Plasiatine, an Unprecedented Indole-Phenylpropanoid Hybrid from Plantago asiatica as a Potent Activator of the Nonreceptor Protein Tyrosine Phosphatase Shp2, SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 第 2 作者
（28） Structural Characterization of Kadcoccinin A: A Sesquiterpenoid with a Tricyclo4.4.0.0(3,10)decane Scaffold from Kadsura coccinea, ORGANIC LETTERS, 2016, 第 2 作者
（29） Plasiatine, an Unprecedented Indole-Phenylpropanoid Hybrid from Plantago asiatica as a Potent Activator of the Nonreceptor Protein Tyrosine Phosphatase Shp2, SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 第 2 作者
（30） LC-UV-Guided Isolation and Structure Determination of Lancolide E: A Nortriterpenoid with a Tetracyclo5.4.0.0(2,4).0(3,7)undecane-Bridged System from a "Talented" Schisandra Plant, ORGANIC LETTERS, 2016, 第 1 作者
（31） Rearranged 6/6/5/6-Fused Triterpenoid Acids from the Stems of Kadsura coccinea, JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS, 2016, 第 3 作者
（32） Chemical constituents from Piper wallichii, NATURAL PRODUCT RESEARCH, 2015, 第 4 作者
（33） Kadcoccinones A-F, New Biogenetically Related Lanostane-Type Triterpenoids with Diverse Skeletons from Kadsura coccinea, ORGANIC LETTERS, 2015, 第 2 作者
（34） Laxiflorol A, the first example of 7,8:15,16-di-seco-15-nor-21-homo-ent-kauranoid from Isodon eriocalyx var. laxiflora, RSC ADVANCES, 2015, 第 3 作者
（35） Triterpenoids from the Schisandraceae family: an update, NATURAL PRODUCT REPORTS, 2015, 第 1 作者
（36） Lignans and aromatic glycosides from Piper wallichii and their antithrombotic activities, JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY, 2015, 第 2 作者
（37） Two New 18-Norschiartane-type Schinortriterpenoids from Schisandra lancifolia, NATURAL PRODUCT COMMUNICATIONS, 2015, 第 4 作者
（38） Kadcoccinic Acids A-J, Triterpene Acids from Kadsura coccinea, JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS, 2015, 第 2 作者
（39） Structure and bioactivity of triterpenoids from the stems of Schisandra sphenanthera, ARCHIVES OF PHARMACAL RESEARCH, 2014, 第 6 作者
（40） Three new diterpenoids from Leonurus japonicus, CHINESE CHEMICAL LETTERS, 2014, 第 3 作者
（41） Structural Characterization and Antioxidative Activity of Lancifonins: Unique Nortriterpenoids from Schisandra lancifolia, ORGANIC LETTERS, 2014, 第 1 作者
（42） Nortriterpenoids from Schisandra chinensis and their absolute configurational assignments by electronic circular dichroism study, TETRAHEDRON, 2014, 第 1 作者
（43） New Lignans from the Leaves and Stems of Schisandra chinensis and Their Anti-HIV-1 Activities, CHINESE JOURNAL OF CHEMISTRY, 2014, 第 1 作者
（44） Six new lignans from the leaves and stems of Schisandra sphenanthera, FITOTERAPIA, 2013, 第 4 作者
（45） Lancolides, Antiplatelet Aggregation Nortriterpenoids with Tricyclo6.3.0.0(2,11)undecane-Bridged System from Schisandra lancifolia, ORGANIC LETTERS, 2013, 第 1 作者
（46） Bioactive phenolics and terpenoids from Manglietia insignis, FITOTERAPIA, 2013, 第 7 作者
（47） Four new lignans from the leaves and stems of Schisandra propinqua var. sinensis, NATURAL PRODUCTS AND BIOPROSPECTING, 2013, 第 3 作者
（48） Five New Nortriterpenoids from the Stems of Schisandra neglecta, HELVETICA CHIMICA ACTA, 2013, 第 3 作者
（49） Schisphenlignans A-E: Five New Dibenzocyclooctadiene Lignans from Schisandra sphenanthera, CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN, 2013, 第 3 作者
（50） Asperterrestide A, a Cytotoxic Cyclic Tetrapeptide from the Marine-Derived Fungus Aspergillus terreus SCSGAF0162, JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS, 2013, 第 5 作者
（51） Kadcotriones A-C: Tricyclic Triterpenoids from Kadsura coccinea, JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS, 2013, 第 2 作者
（52） Phenolic constituents from Parakmeria yunnanensis and their anti-HIV-1 activity, ARCHIVES OF PHARMACAL RESEARCH, 2013, 第 7 作者
（53） Schilancitrilactones A-C: Three Unique Nortriterpenoids from Schisandra lancifolia, Organic Letters, 2012, 第 2 作者
（54） Four new indole alkaloids from Plantago asiatica, NATURAL PRODUCTS AND BIOPROSPECTING, 2012, 第 4 作者
（55） Schilancitrilactones A-C: Three Unique Nortriterpenoids from Schisandra lancifolia, ORGANIC LETTERS, 2012, 第 2 作者
（56） Kadcoccitones A and B, Two New 6/6/5/5-Fused Tetracyclic Triterpenoids from Kadsura coccinea, ORGANIC LETTERS, 2012, 第 2 作者
（57） Ternifolide A, a New Diterpenoid Possessing a Rare Macrolide Motif from Isodon ternifolius, ORGANIC LETTERS, 2012, 第 4 作者
（58） Schicagenins A-C: Three Cagelike Nortriterpenoids from Leaves and Stems of Schisandra chinensis, ORGANIC LETTERS, 2011, 第 1 作者
（2） Exploring nature's battlefield: organismic interactions in the discovery of bioactive natural products, Natural Product Reprots, 2024, 第 4 作者 通讯作者
（3） Pyrrolizwilline, a Unique Bacterial Alkaloid Assembled by a Nonribosomal Peptide Synthetase and non-Enzymatic Dimerization, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2024, 第 4 作者
（4） Cleavage Off-Loading and Post-assembly-Line Conversions Yield Products with Unusual Termini during Biosynthesis, ACS CHEMICAL BIOLOGY, 2022, 第 1 作者 通讯作者
（5） Genome Mining Enabled by Biosynthetic Characterization Uncovers a Class of Benzoxazolinate-Containing Natural Products in Diverse Bacteria, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2022, 第 1 作者 通讯作者
（6） Global analysis of biosynthetic gene clusters reveals conserved and unique natural products in entomopathogenic nematode-symbiotic bacteria, NATURE CHEMISTRY, 2022, 第 1 作者 通讯作者
（7） An Unconventional Melanin Biosynthesis Pathway in Ustilago maydis, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2021, 第 2 作者
（8） Engineering bacterial symbionts of nematodes improves their biocontrol potential to counter the western corn rootworm (Feb, 10.1038/s41587-020-0419-1, 2020), NATURE BIOTECHNOLOGY, 2020, 第 9 作者
（9） Engineering bacterial symbionts of nematodes improves biocontrol potential of the western corn rootworm, NATURE BIOTECHNOLOGY, 2020, 第 9 作者
（10） (��)-Alternarlactones A and B, Two Antiparasitic Alternariol-like Dimers from the Fungus Alternaria alternata P1210 Isolated from the Halophyte Salicornia sp., JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY, 2019, 第 3 作者
（11） Promoter Activation in �� hfq Mutants as an Efficient Tool for Specialized Metabolite Production Enabling Direct Bioactivity Testing, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2019, 第 8 作者
（12） (+/-)-Alternarlactones A and B, Two Antiparasitic Alternariol-like Dimers from the Fungus Alternaria alternata P1210 Isolated from the Halophyte Salicornia sp., JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY, 2019, 第 3 作者
（13） Expanding the Isoprenoid Building Block Repertoire with an IPP Methyltransferase from Streptomyces monomycini, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2019, 第 5 作者
（14） CRAGE enables rapid activation of biosynthetic gene clusters in undomesticated bacteria, NATURE MICROBIOLOGY, 2019, 第 5 作者
（15） An Uncommon Type II PKS Catalyzes Biosynthesis of Aryl Polyene Pigments, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2019, 第 4 作者
（16） Dual phenazine gene clusters enable diversification during biosynthesis, NATURE CHEMICAL BIOLOGY, 2019, 第 1 作者
（17） Chemical language and warfare of bacterial natural products in bacteria-nematode-insect interactions, NATURAL PRODUCT REPORTS, 2018, 第 1 作者
（18） Schinortriterpenoids with Identical Configuration but Distinct ECD Spectra Generated by Nondegenerate Exciton Coupling, ORGANIC LETTERS, 2018, 第 1 作者
（19） Georatusin, a Specific Antiparasitic Polyketide-Peptide Hybrid from the Fungus Geomyces auratus, ORGANIC LETTERS, 2018, 第 1 作者
（20） Refining the Natural Product Repertoire in Entomopathogenic Bacteria, TRENDS IN MICROBIOLOGY, 2018, 第 2 作者
（21） Structure and Biosynthesis of Isatropolones, Bioactive Amine-Scavenging Fluorescent Natural Products from Streptomyces Go66, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2017, 第 2 作者
（22） Natural product diversity associated with the nematode symbionts Photorhabdus and Xenorhabdus, NATURE MICROBIOLOGY, 2017, 第 6 作者
（23） Lanostane-type triterpenoids from Kadsura coccinea, TETRAHEDRON, 2017, 第 3 作者
（24） Structure and Biosynthesis of Isatropolones, Bioactive Amine-Scavenging Fluorescent Natural Products from Streptomyces Go66, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2017, 第 2 作者
（25） MICROROBIOLOGY A new language for small talk, NATURE CHEMICAL BIOLOGY, 2017, 第 1 作者
（26） Natural product diversity associated with the nematode symbionts Photorhabdus and Xenorhabdus, NATURE MICROBIOLOGY, 2017, 第 6 作者
（27） Plasiatine, an Unprecedented Indole-Phenylpropanoid Hybrid from Plantago asiatica as a Potent Activator of the Nonreceptor Protein Tyrosine Phosphatase Shp2, SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 第 2 作者
（28） Structural Characterization of Kadcoccinin A: A Sesquiterpenoid with a Tricyclo4.4.0.0(3,10)decane Scaffold from Kadsura coccinea, ORGANIC LETTERS, 2016, 第 2 作者
（29） Plasiatine, an Unprecedented Indole-Phenylpropanoid Hybrid from Plantago asiatica as a Potent Activator of the Nonreceptor Protein Tyrosine Phosphatase Shp2, SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 第 2 作者
（30） LC-UV-Guided Isolation and Structure Determination of Lancolide E: A Nortriterpenoid with a Tetracyclo5.4.0.0(2,4).0(3,7)undecane-Bridged System from a "Talented" Schisandra Plant, ORGANIC LETTERS, 2016, 第 1 作者
（31） Rearranged 6/6/5/6-Fused Triterpenoid Acids from the Stems of Kadsura coccinea, JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS, 2016, 第 3 作者
（32） Chemical constituents from Piper wallichii, NATURAL PRODUCT RESEARCH, 2015, 第 4 作者
（33） Kadcoccinones A-F, New Biogenetically Related Lanostane-Type Triterpenoids with Diverse Skeletons from Kadsura coccinea, ORGANIC LETTERS, 2015, 第 2 作者
（34） Laxiflorol A, the first example of 7,8:15,16-di-seco-15-nor-21-homo-ent-kauranoid from Isodon eriocalyx var. laxiflora, RSC ADVANCES, 2015, 第 3 作者
（35） Triterpenoids from the Schisandraceae family: an update, NATURAL PRODUCT REPORTS, 2015, 第 1 作者
（36） Lignans and aromatic glycosides from Piper wallichii and their antithrombotic activities, JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY, 2015, 第 2 作者
（37） Two New 18-Norschiartane-type Schinortriterpenoids from Schisandra lancifolia, NATURAL PRODUCT COMMUNICATIONS, 2015, 第 4 作者
（38） Kadcoccinic Acids A-J, Triterpene Acids from Kadsura coccinea, JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS, 2015, 第 2 作者
（39） Structure and bioactivity of triterpenoids from the stems of Schisandra sphenanthera, ARCHIVES OF PHARMACAL RESEARCH, 2014, 第 6 作者
（40） Three new diterpenoids from Leonurus japonicus, CHINESE CHEMICAL LETTERS, 2014, 第 3 作者
（41） Structural Characterization and Antioxidative Activity of Lancifonins: Unique Nortriterpenoids from Schisandra lancifolia, ORGANIC LETTERS, 2014, 第 1 作者
（42） Nortriterpenoids from Schisandra chinensis and their absolute configurational assignments by electronic circular dichroism study, TETRAHEDRON, 2014, 第 1 作者
（43） New Lignans from the Leaves and Stems of Schisandra chinensis and Their Anti-HIV-1 Activities, CHINESE JOURNAL OF CHEMISTRY, 2014, 第 1 作者
（44） Six new lignans from the leaves and stems of Schisandra sphenanthera, FITOTERAPIA, 2013, 第 4 作者
（45） Lancolides, Antiplatelet Aggregation Nortriterpenoids with Tricyclo6.3.0.0(2,11)undecane-Bridged System from Schisandra lancifolia, ORGANIC LETTERS, 2013, 第 1 作者
（46） Bioactive phenolics and terpenoids from Manglietia insignis, FITOTERAPIA, 2013, 第 7 作者
（47） Four new lignans from the leaves and stems of Schisandra propinqua var. sinensis, NATURAL PRODUCTS AND BIOPROSPECTING, 2013, 第 3 作者
（48） Five New Nortriterpenoids from the Stems of Schisandra neglecta, HELVETICA CHIMICA ACTA, 2013, 第 3 作者
（49） Schisphenlignans A-E: Five New Dibenzocyclooctadiene Lignans from Schisandra sphenanthera, CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN, 2013, 第 3 作者
（50） Asperterrestide A, a Cytotoxic Cyclic Tetrapeptide from the Marine-Derived Fungus Aspergillus terreus SCSGAF0162, JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS, 2013, 第 5 作者
（51） Kadcotriones A-C: Tricyclic Triterpenoids from Kadsura coccinea, JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS, 2013, 第 2 作者
（52） Phenolic constituents from Parakmeria yunnanensis and their anti-HIV-1 activity, ARCHIVES OF PHARMACAL RESEARCH, 2013, 第 7 作者
（53） Schilancitrilactones A-C: Three Unique Nortriterpenoids from Schisandra lancifolia, Organic Letters, 2012, 第 2 作者
（54） Four new indole alkaloids from Plantago asiatica, NATURAL PRODUCTS AND BIOPROSPECTING, 2012, 第 4 作者
（55） Schilancitrilactones A-C: Three Unique Nortriterpenoids from Schisandra lancifolia, ORGANIC LETTERS, 2012, 第 2 作者
（56） Kadcoccitones A and B, Two New 6/6/5/5-Fused Tetracyclic Triterpenoids from Kadsura coccinea, ORGANIC LETTERS, 2012, 第 2 作者
（57） Ternifolide A, a New Diterpenoid Possessing a Rare Macrolide Motif from Isodon ternifolius, ORGANIC LETTERS, 2012, 第 4 作者
（58） Schicagenins A-C: Three Cagelike Nortriterpenoids from Leaves and Stems of Schisandra chinensis, ORGANIC LETTERS, 2011, 第 1 作者
科研活动
科研项目
（ 1 ） ***, 负责人, 国家任务, 2025-01--2028-12
（ 2 ） ***, 负责人, 国家任务, 2024-01--2026-12
（ 3 ） ***, 负责人, 中国科学院计划, 2024-01--2026-12
（ 2 ） ***, 负责人, 国家任务, 2024-01--2026-12
（ 3 ） ***, 负责人, 中国科学院计划, 2024-01--2026-12
指导学生
现指导学生
何智莹 硕士研究生 071000-生物学
向浩 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学
吴宇浩 硕士研究生 086000-生物与医药