基本信息
李晓林 男 硕导 杭州医学研究所
电子邮件： lixiaolin@him.cas.cn
通信地址： 浙江省杭州市
邮政编码：
电子邮件： lixiaolin@him.cas.cn
通信地址： 浙江省杭州市
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招生信息
招生专业
100701-药物化学
招生方向
智能制药，智能诊疗，人工智能大模型
工作经历
工作简历
2022-04~现在, 中国科学院杭州医学研究所, 研究员
2019-12~2022-04,同盾科技、硅谷认知实验室, 合伙人、副总裁
2010-08~2019-12,佛罗里达大学, 教授
2005-08~2010-08,俄克拉荷马州立大学, 助理教授
2001-01~2001-08,新加坡国家信息及通讯研究院I2R, 研究员
2019-12~2022-04,同盾科技、硅谷认知实验室, 合伙人、副总裁
2010-08~2019-12,佛罗里达大学, 教授
2005-08~2010-08,俄克拉荷马州立大学, 助理教授
2001-01~2001-08,新加坡国家信息及通讯研究院I2R, 研究员
专利与奖励
专利成果
（ 1 ） 基于知识联邦的人脸识别方法、装置、设备、介质及系统, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: CN111046857A
（ 2 ） 图像多标签分类方法、装置、设备及介质, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN111126514A
（ 3 ） 图像文本行检测方法、装置、设备及存储介质, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: CN111444834A
（ 4 ） 针对跨特征联邦学习的特征选择方法、装置及相关设备, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112508199A
（ 5 ） 标志识别训练数据合成方法、装置、电子设备及存储介质, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN111091167B
（ 6 ） 基于集成学习模型的疫情预测方法、装置、设备及介质, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: CN110993118A
（ 7 ） 基于视频指纹的视频检索方法、装置和电子设备, 发明专利, 2022, 第 4 作者, 专利号: CN111339368A
（ 8 ） 基于小样本的OCR模板学习方法、装置、电子设备及介质, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN110874618B
（ 9 ） 基于知识联邦的多端模型压缩方法、任务预测方法、装置及电子设备, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN112052938A
（ 10 ） 基于知识联邦的知识推理方法、系统、设备及介质, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112348192A
（ 11 ） 基于知识网络的智能决策方法及装置、终端、存储介质, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: CN111368021A
（ 12 ） 联邦学习的方法、装置及系统, 发明专利, 2023, 第 4 作者, 专利号: CN111553484B
（ 13 ） 安全多方数据融合与联邦共享方法、装置、设备及介质, 发明专利, 2020, 第 2 作者, 专利号: CN111737364B
（ 14 ） 基于XGBoost的跨样本联邦学习、测试方法、系统、设备和介质, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112101577B
（ 15 ） 基于人口迁移的疫情预测方法、装置、电子设备及介质, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN110993119B
（ 16 ） 一种保护用户隐私的疫情信息共享方法及系统, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN111510464B
（ 17 ） 基于知识联邦和图网络的推理方法、系统、设备及介质, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112200321B
（ 18 ） 模型训练方法及装置、数据预测方法、介质、电子设备, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112288002A
（ 19 ） 基于深度强化学习的先导化合物设计方法、系统、设备及介质, 发明专利, 2023, 第 2 作者, 专利号: CN116312865A
（ 20 ） 一种基于条件扩散模型的核糖核酸二级结构预测方法, 发明专利, 2024, 第 5 作者, 专利号: CN117524297A
（ 21 ） 一种基于知识转移联合训练的半监督医学图像分割方法, 发明专利, 2024, 第 5 作者, 专利号: CN117746041A
（ 22 ） 一种基于视频像素时域变化的活体皮肤检测方法, 发明专利, 2024, 第 5 作者, 专利号: CN117765619A
（ 23 ） 一种基于多任务学习的甲状腺结节辅助诊断方法, 发明专利, 2023, 第 5 作者, 专利号: 2023117694146
（ 24 ） 一种基于量子干涉模型的词义消歧方法、设备及存储介质, 发明专利, 2024, 第 2 作者, 专利号: CN118052226A
（ 25 ） 基于情感极性注意力机制的文本情感分析方法、设备及介质, 发明专利, 2024, 第 2 作者, 专利号: 2024104015103
（ 26 ） 一种核酸适体候选文库生成方法、系统及介质, 发明专利, 2024, 第 1 作者, 专利号: 2024102412423
（ 27 ） Apparatus and Method For Detecting Scene Text in An Image, 发明专利, 2020, 第 1 作者, 专利号: US10679085B2
（ 28 ） Dynamic User-defined Check-in Points, 发明专利, 2018, 第 1 作者, 专利号: US10080100B2
（ 2 ） 图像多标签分类方法、装置、设备及介质, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN111126514A
（ 3 ） 图像文本行检测方法、装置、设备及存储介质, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: CN111444834A
（ 4 ） 针对跨特征联邦学习的特征选择方法、装置及相关设备, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112508199A
（ 5 ） 标志识别训练数据合成方法、装置、电子设备及存储介质, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN111091167B
（ 6 ） 基于集成学习模型的疫情预测方法、装置、设备及介质, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: CN110993118A
（ 7 ） 基于视频指纹的视频检索方法、装置和电子设备, 发明专利, 2022, 第 4 作者, 专利号: CN111339368A
（ 8 ） 基于小样本的OCR模板学习方法、装置、电子设备及介质, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN110874618B
（ 9 ） 基于知识联邦的多端模型压缩方法、任务预测方法、装置及电子设备, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN112052938A
（ 10 ） 基于知识联邦的知识推理方法、系统、设备及介质, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112348192A
（ 11 ） 基于知识网络的智能决策方法及装置、终端、存储介质, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: CN111368021A
（ 12 ） 联邦学习的方法、装置及系统, 发明专利, 2023, 第 4 作者, 专利号: CN111553484B
（ 13 ） 安全多方数据融合与联邦共享方法、装置、设备及介质, 发明专利, 2020, 第 2 作者, 专利号: CN111737364B
（ 14 ） 基于XGBoost的跨样本联邦学习、测试方法、系统、设备和介质, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112101577B
（ 15 ） 基于人口迁移的疫情预测方法、装置、电子设备及介质, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN110993119B
（ 16 ） 一种保护用户隐私的疫情信息共享方法及系统, 发明专利, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN111510464B
（ 17 ） 基于知识联邦和图网络的推理方法、系统、设备及介质, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112200321B
（ 18 ） 模型训练方法及装置、数据预测方法、介质、电子设备, 发明专利, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112288002A
（ 19 ） 基于深度强化学习的先导化合物设计方法、系统、设备及介质, 发明专利, 2023, 第 2 作者, 专利号: CN116312865A
（ 20 ） 一种基于条件扩散模型的核糖核酸二级结构预测方法, 发明专利, 2024, 第 5 作者, 专利号: CN117524297A
（ 21 ） 一种基于知识转移联合训练的半监督医学图像分割方法, 发明专利, 2024, 第 5 作者, 专利号: CN117746041A
（ 22 ） 一种基于视频像素时域变化的活体皮肤检测方法, 发明专利, 2024, 第 5 作者, 专利号: CN117765619A
（ 23 ） 一种基于多任务学习的甲状腺结节辅助诊断方法, 发明专利, 2023, 第 5 作者, 专利号: 2023117694146
（ 24 ） 一种基于量子干涉模型的词义消歧方法、设备及存储介质, 发明专利, 2024, 第 2 作者, 专利号: CN118052226A
（ 25 ） 基于情感极性注意力机制的文本情感分析方法、设备及介质, 发明专利, 2024, 第 2 作者, 专利号: 2024104015103
（ 26 ） 一种核酸适体候选文库生成方法、系统及介质, 发明专利, 2024, 第 1 作者, 专利号: 2024102412423
（ 27 ） Apparatus and Method For Detecting Scene Text in An Image, 发明专利, 2020, 第 1 作者, 专利号: US10679085B2
（ 28 ） Dynamic User-defined Check-in Points, 发明专利, 2018, 第 1 作者, 专利号: US10080100B2
出版信息
发表论文
（1） BatmanNet: Bi-branch Masked Graph Transformer Autoencoder for Molecular Representation, Briefings in Bioinformatics, 2024, 第 8 作者 通讯作者
（2） A Coarse-Fine Collaborative Learning Model for Three Vessel Segmentation in Fetal Cardiac Ultrasound Images, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2024, 第 7 作者 通讯作者
（3） Communication-efficient and Attack-Resistant Federated Edge Learning with Dataset Distillation, IEEE Transactions on Cloud Computing, 2023, 第 4 作者 通讯作者
（4） Learning Fast and Slow: PROPEDEUTICA for Real-time Malware Detection, IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems, 2022, 第 8 作者
（5） ES Attack: Model Stealing Against Deep Neural Networks Without Data Hurdles, IEEE TRANSACTIONS ON EMERGING TOPICS IN COMPUTATIONAL INTELLIGENCE, 2022, 第 4 作者
（6） Deep Learning in Drug Design: Protein-Ligand Binding Affinity Prediction, IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2022, 第 4 作者 通讯作者
（7） DyScore: A Boosting Scoring Method with Dynamic Properties for Identifying True Binders and Non-binders in Structure-based Drug Discovery, Journal of Chemical Information and Modeling, 2022, 第 6 作者
（8） Decision analysis and reinforcement learning in surgical decision-making, SURGERY, 2020, 第 10 作者
（9） A Praise for Defensive Programming: Leveraging Uncertainty for Effective Malware Mitigation, 2020, 第 7 作者
（10） A Batch Normalized Inference Network Keeps the KL Vanishing Away, 2020, 第 6 作者
（11） MySurgeryRisk : Development and Validation of a Machine-Learning Risk Algorithm for Major Complications and Death after Surgery, ANNALS OF SURGERY, 2019, 第 15 作者
（12） Statistical Learning for Semantic Parsing: A Survey, Statistical Learning for Semantic Parsing: A Survey, 大数据挖掘与分析(英文), 2019, 第 3 作者
（13） Adversarial Examples: Attacks and Defenses for Deep Learning, IEEE TRANSACTIONS ON NEURAL NETWORKS AND LEARNING SYSTEMS, 2019, 第 4 作者 通讯作者
（14） Predicting the clinical impact of human mutation with deep neural networks, NATURE GENETICS, 2018, 第 13 作者
（15） GRAM-CNN: a deep learning approach with local context for named entity recognition in biomedical text, BIOINFORMATICS, 2018, 第 2 作者 通讯作者
（2） A Coarse-Fine Collaborative Learning Model for Three Vessel Segmentation in Fetal Cardiac Ultrasound Images, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2024, 第 7 作者 通讯作者
（3） Communication-efficient and Attack-Resistant Federated Edge Learning with Dataset Distillation, IEEE Transactions on Cloud Computing, 2023, 第 4 作者 通讯作者
（4） Learning Fast and Slow: PROPEDEUTICA for Real-time Malware Detection, IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems, 2022, 第 8 作者
（5） ES Attack: Model Stealing Against Deep Neural Networks Without Data Hurdles, IEEE TRANSACTIONS ON EMERGING TOPICS IN COMPUTATIONAL INTELLIGENCE, 2022, 第 4 作者
（6） Deep Learning in Drug Design: Protein-Ligand Binding Affinity Prediction, IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2022, 第 4 作者 通讯作者
（7） DyScore: A Boosting Scoring Method with Dynamic Properties for Identifying True Binders and Non-binders in Structure-based Drug Discovery, Journal of Chemical Information and Modeling, 2022, 第 6 作者
（8） Decision analysis and reinforcement learning in surgical decision-making, SURGERY, 2020, 第 10 作者
（9） A Praise for Defensive Programming: Leveraging Uncertainty for Effective Malware Mitigation, 2020, 第 7 作者
（10） A Batch Normalized Inference Network Keeps the KL Vanishing Away, 2020, 第 6 作者
（11） MySurgeryRisk : Development and Validation of a Machine-Learning Risk Algorithm for Major Complications and Death after Surgery, ANNALS OF SURGERY, 2019, 第 15 作者
（12） Statistical Learning for Semantic Parsing: A Survey, Statistical Learning for Semantic Parsing: A Survey, 大数据挖掘与分析(英文), 2019, 第 3 作者
（13） Adversarial Examples: Attacks and Defenses for Deep Learning, IEEE TRANSACTIONS ON NEURAL NETWORKS AND LEARNING SYSTEMS, 2019, 第 4 作者 通讯作者
（14） Predicting the clinical impact of human mutation with deep neural networks, NATURE GENETICS, 2018, 第 13 作者
（15） GRAM-CNN: a deep learning approach with local context for named entity recognition in biomedical text, BIOINFORMATICS, 2018, 第 2 作者 通讯作者
科研活动
参与会议
（1）"FedMONN: Meta Operation Neural Network for Secure Federated Aggregation 2022-12-06
（2）Communication-Efficient Federated Learning via Dataset Distillation 2020-12-06
（3）A Secure and Efficient Sample Filtering Protocol for Massive Data 2020-12-06
（4）Secure Federated Feature Selection for Cross-Feature Federated Learning 2020-12-06
（5）Collusion-free Cross-feature Logistic Regression 2020-12-06
（6）Masked Transmitting for Federated Learning 2020-12-06
（7）Connecting Web Event Forecasting with Anomaly Detection: A Case Study on Enterprise Web Applications Using Self-Supervised Neural Networks 2020-10-21
（8）Knowledge Federation: A Unified and Hierarchical Privacy-Preserving AI Framework 2020-08-09
（2）Communication-Efficient Federated Learning via Dataset Distillation 2020-12-06
（3）A Secure and Efficient Sample Filtering Protocol for Massive Data 2020-12-06
（4）Secure Federated Feature Selection for Cross-Feature Federated Learning 2020-12-06
（5）Collusion-free Cross-feature Logistic Regression 2020-12-06
（6）Masked Transmitting for Federated Learning 2020-12-06
（7）Connecting Web Event Forecasting with Anomaly Detection: A Case Study on Enterprise Web Applications Using Self-Supervised Neural Networks 2020-10-21
（8）Knowledge Federation: A Unified and Hierarchical Privacy-Preserving AI Framework 2020-08-09
指导学生
现指导学生
李子凌 硕士研究生 085410-人工智能
韦欢 硕士研究生 085410-人工智能
胡帅怿 硕士研究生 085410-人工智能
冯旭晗 硕士研究生 085602-化学工程
胡寅劼 硕士研究生 085602-化学工程
张泽翼 硕士研究生 085410-人工智能
刘子祺 硕士研究生 085410-人工智能
刘益豪 硕士研究生 085410-人工智能