合成生物学驱动的功能性营养资源车间制造

围绕蛋白质资源短缺和机体健康保障的重大需求，以发酵高质蛋白和功能性天然产物为解决方案，通过发展基因组编辑工具和高通量筛选方法，结合大数据产生与分析，破译表型和基因型之间的联系，解构复杂生物代谢网络并进行系统重编程，定制高版本酵母菌株高效转化可再生原料合成功能性营养资源。

071005-微生物学
081703-生物化工
071010-生物化学与分子生物学

基因组定向进化
酵母代谢工程

2012-09--2016-01   中国科学院大学   博士学位

2022年10月-今，中国科学院天津工业生物技术研究所，研究员，博士研究生、硕士研究生指导教师

2021年6月-2022年9月，中国科学院天津工业生物技术研究所，副研究员，博士研究生、硕士研究生指导教师

2018年6月-2021年5月，丹麦科技大学，博士研究生、硕士研究生、本科生指导教师

2018年3月-2021年5月，丹麦科技大学，博士后研究员

2016年1月-2018年1月，查尔姆斯理工大学，博士后研究员

2018-03~2021-05,丹麦科技大学, 博士后研究员
2016-01~2018-01,查尔姆斯理工大学, 博士后研究员

   

[1] 张东远, 王国坤, 张运鹏. 利用重组载体在丝状真菌中筛选外源基因的方法. CN: CN105463009A, 2016-04-06.

[2] 宗志友, 高乐, 王国坤, 李晨, 崔超, 陈树林. 一种β-葡萄糖苷酶和β-葡萄糖苷酶突变体及应用. CN: CN104560917A, 2015-04-29.

[3] 宗志友, 宗志友, 高乐, 王国坤, 李晨, 崔超, 陈树林. 一种β-葡萄糖苷酶和β-葡萄糖苷酶突变体及应用. CN: CN104531637A, 2015-04-22.

   

（1） 微生物蛋白制造的发展趋势与挑战, 科学通报, 2023, 通讯作者
（2） 二氧化碳人工生物转化, Artificial bioconversion of carbon dioxide, 生物工程学报, 2022, 第 6 作者
（3） Synthetic biology-driven customization of functional feed resources, Trends in Biotechnology, 2022, 通讯作者
（4） Engineering precursor supply for the high-level production of ergothioneine in Saccharomyces cerevisiae, Metabolic Engineering, 2022, 第 3 作者
（5） An integrated yeast-based process for cis,cis-muconic acid production, BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING, 2022, 第 1 作者
（6） Transportome-wide engineering of Saccharomyces cerevisiae, METABOLIC ENGINEERING, 2021, 第 1 作者
（7） Harnessing the yeast Saccharomyces cerevisiae for the production of fungal secondary metabolites, ESSAYS IN BIOCHEMISTRY, 2021, 通讯作者
（8） Engineering Yeast Yarrowia lipolytica for Methanol Assimilation, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2021, 通讯作者
（9） Efficient biodegradation of aliphatic polyester by genetically engineered strains of the yeast Yarrowia lipolytica, INTERNATIONAL BIODETERIORATION & BIODEGRADATION, 2021, 第 3 作者
（10） Engineering the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica for high-level resveratrol production, METABOLIC ENGINEERING, 2020, 通讯作者
（11） Improvement of cis,cis-Muconic Acid Production in Saccharomyces cerevisiae through Biosensor-Aided Genome Engineering, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2020, 第 1 作者
（12） A single-host fermentation process for the production of flavor lactones from non-hydroxylated fatty acids, METABOLIC ENGINEERING, 2020, 第 7 作者
（13） HOG-Independent Osmoprotection by Erythritol in Yeast Yarrowia lipolytica, GENES, 2020, 第 3 作者
（14） RNAi expression tuning, microfluidic screening, and genome recombineering for improved protein production in Saccharomyces cerevisiae, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2019, 第 1 作者
（15） Multi-Omics Analysis of Fatty Alcohol Production in Engineered Yeasts Saccharomyces cerevisiae and Yarrowia lipolytica, FRONTIERS IN GENETICS, 2019, 第 4 作者
（16） Engineering the protein secretory pathway of Saccharomyces cerevisiae enables improved protein production, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2018, 第 2 作者
（17） A GFP-fusion coupling FACS platform for advancing the metabolic engineering of filamentous fungi, BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, 2018, 第 1 作者
（18） Exploring the potential of Saccharomyces cerevisiae for biopharmaceutical protein production, CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY, 2017, 第 1 作者
（19） Exploring fatty alcohol-producing capability of Yarrowia lipolytica, BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, 2016, 第 1 作者
（20） Mitochondria thioredoxin's backup role in oxidative stress resistance in Trichoderma reesei, MICROBIOLOGICAL RESEARCH, 2015, 第 1 作者
（21） Protein disulfide isomerase homolog TrPDI2 contributing to cellobiohydrolase production in Trichoderma reesei, ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY, 2015, 第 1 作者
（22） Effect of earlier unfolded protein response and efficient protein disposal system on cellulase production in Rut C30, WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 2014, 第 1 作者
（23） Manipulation of monoubiquitin improves chilling tolerance in transgenic tobacco (Nicotiana tabacum), PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 2014, 第 4 作者
（24） 桧状青霉原生质体制备和再生的研究, Analysis of the Preparation and Regeneration of Protoplasts from Pe nicillium piceum, 基因组学与应用生物学, 2014, 第 4 作者
（25） Overexpression of monoubiquitin improves photosynthesis in transgenic tobacco plants following high temperature stress, PLANT SCIENCE, 2014, 第 5 作者
（26） Enhanced stability of thylakoid membrane proteins and antioxidant competence contribute to drought stress resistance in the tasg1 wheat stay-green mutant, JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, 2013, 第 5 作者
（27） Improved drought resistance in a wheat stay-green mutant tasg1 under field conditions, BIOLOGIA PLANTARUM, 2012, 
（28） Increased gibberellin contents contribute to accelerated growth and development of transgenic tobacco overexpressing a wheat ubiquitin gene, PLANT CELL REPORTS, 2012, 第 1 作者
（29） The antioxidative defense system is involved in the delayed senescence in a wheat mutant tasg1, PLANT CELL REPORTS, 2012, 第 3 作者
（30） 泛素/26S蛋白酶体系统介导的细胞程序化死亡, Programmed cell death mediated by ubiquitin-26S proteasome system, 生命科学, 2011, 第 1 作者

   

（ 1 ） 甲基营养型酵母的设计构建及生产高质单细胞蛋白应用, 负责人, 地方任务, 2021-06--2024-05
（ 2 ） 酵母细胞工厂高耐受植物多酚的分子基础探究与再造, 负责人, 国家任务, 2023-01--2026-12
（ 3 ） 功能性饲用蛋白合成生物学, 负责人, 国家任务, 2023-01--2025-12

（1）合成生物学推动绿色养殖发展   第六届农业生态前沿青年论坛   2021-10-16
（2）开发酵母细胞工厂生产蛋白、营养品及化工品   2021年中国生物工程学会第五届青年科技论坛   2021-07-04
（3）Exploring the potential of yeast cell factories for the production of protein, nutraceutical and chemical   2021-05-19
（4）Exploring the potential of yeast cell factories for the production of protein, nutraceutical and chemical   三峡大学第一届合成生物学前沿论坛   2020-10-18

现指导学生

周弘艺  硕士研究生  086000-生物与医药  

史智慧  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学