基本信息
刘晓  男  博导  中国科学院微生物研究所
电子邮件: liux@im.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所
邮政编码: 100101

研究领域

1.  真菌生物钟调控机制

        生物钟是指生物生命活动的内在节律性,并通过生化反应、细胞、发育和行为等层面表现出来,对于生物有效适应地球环境具有重要意义。生物钟基因突变会引发不同的人类疾病,例如睡眠障碍、情绪低落、代谢综合症以及癌症等。 课题组以利用粗糙脉孢菌和病原真菌为材料,研究生物钟调控机制以及生物钟对病原真菌致病因子的调控作用。相关研究不仅解析生物钟对真菌遗传发育和致病性的调控机制,还促进理解不同物种保守的生物钟运行机制。

       主要研究内容包括:(1)转录因子和表观遗传调控因子对生物钟基因表达的调控作用;(2)生物钟与体内各类信号通路的相互调控关系;(3)生物钟的温度补偿机制;(4)生物钟对真菌发育、代谢和侵染的调控作用。

 

2. 真菌表观遗传调控机制

        表观遗传调控是基因表达调控的重要环节,包括DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑等。表观遗传调控与人类发育、代谢、免疫和肿瘤疾病等密切相关。课题组以粗糙脉孢菌和病原真菌为材料,研究不同的环境和营养条件下表观遗传调控因子、转录因子以及激酶信号通路对基因表达的调控作用。

 

3. 真菌与病毒的相互作用机制

        真菌病毒包括RNA病毒和DNA病毒,感染真菌并在其体内增殖。真菌病毒侵染真菌并影响真菌的生长发育,例如造成蘑菇等真菌的减产或减弱植物病原真菌病害。在长期进化过程中,真菌体内形成拮抗病毒感染的宿主防御系统。课题组以利用粗糙脉孢菌和病原真菌为材料,一方面研究病毒如何侵染病原真菌,为病原真菌的生物防治提供理论基础;另一方面,研究真菌体内除RNA干扰之外的新型宿主防御系统,为开发新型基因编辑工具奠定理论基础。

招生信息

   
招生专业
071005-微生物学
招生方向
微生物学
遗传学
分子生物学与生物化学

教育背景

2009-09--2014-07   中国农业大学   博士
2005-09--2009-07   山东农业大学   本科

工作经历

   
工作简历
2019-03~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究员
2014-10~2019-03,美国德克萨斯大学西南医学中心, 博士后
社会兼职
2019-04-27-今,中国细胞学会生物节律分会委员,
2019-03-05-今,Mycology杂志副主编,

出版信息

   
发表论文
(1) The Neurospora RNA Polymerase II Kinase CTK Negatively Regulates Catalase Expression in a Chromatin Context-Dependent Manner, Environmental Microbiology, 2020, 第 7 作者
(2) NC2 complex is a key factor for the activation of catalase-3 transcription by regulating H2A.Z deposition, Nucleic Acids Research, 2020, 通讯作者
(3) FRQ-CK1 Interaction Determines the Period of Circadian Rhythms in Neurospora, Nature Communications, 2019, 第 1 作者
(4) Transcription factor CBF-1 suppresses frequency transcription by modulating the proper binding of WHITE COLLAR complex in Neurospora, PLoS Genetics, 2018, 第 1 作者
(5) DNA replication is required for circadian clock function by regulating rhythmic nucleosome composition, Molecular Cell, 2017, 第 1 作者
(6) Transcriptional repression of frequency by the IEC-1-INO80 complex is required for normal Neurospora circadian clock function, PLoS Genetics, 2017, 第 7 作者
(7) Suppression of WHITE COLLAR-independent frequency transcription by histone H3 lysine 36 methyltransferase SET-2 is necessary for clock function in Neurospora, The Journal of Biological Chemistry, 2016, 第 1 作者
(8) Role for protein kinase A in the Neurospora circadian clock by regulating White Collar-independent frequency transcription through phosphorylation of RCM-1, Molecular and Cellular Biology, 2015, 第 1 作者
(9) Suppression of WC-independent frequency transcription by RCO-1 is essential for Neurospora circadian clock, PNAS, 2013, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 脉孢菌酪蛋白激酶CK1调控生物钟温度补偿的分子机制研究, 主持, 国家级, 2020-01--2023-12
( 2 ) 粗糙脉孢菌生物钟基因的mRNA前体剪接因子筛选及其作用机制研究, 主持, 省级, 2020-01--2022-12
( 3 ) 脉孢菌分子遗传学, 主持, 市地级, 2019-03--2023-12
参与会议
(1)Molecular mechanisms of circadian clock and its interconnection with cell cycle in Neurospora   第十一届全国微生物学青年学者学术研讨会   2019-09-20
(2)Molecular mechanisms of circadian clock and its interconnection with cell cycle in Neurospora   中国菌物学会2019年学术年会   2019-08-03
(3)Molecular mechanism of circadian period determination   2019年第十二届中国模式真菌研讨会   2019-05-11
(4)Molecular mechanism of circadian period determination and temperature compensation   the V World Congress of Chronobiology 2019   2019-04-26
(5) DNA replication is required for circadian clock function by regulating rhythmic nucleosome composition   The 2018 Society for Research on Biological Rhythms meeting   2018-05-13

指导学生

现指导学生

杨钰琳  博士研究生  071005-微生物学  

卢悄佳  硕士研究生  085238-生物工程  

王泽宇  博士研究生  071005-微生物学  

吴京京  硕士研究生  071005-微生物学