基本信息
陈玲玲  女  博导  中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)
电子邮件: linglingchen@sibcb.ac.cn
通信地址: 上海市岳阳路320号
邮政编码: 200031
部门/实验室:生物化学与细胞生物学研究所

研究领域

   

招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
招生方向
非编码RNA的生成及代谢

教育背景

2007-09--2009-05   University of Connecticut   工商管理硕士(MBA)
2004-09--2009-02   University of Connecticut   博士
2000-09--2003-06   中科院上海药物研究所   硕士
1996-09--2000-06   兰州大学   学士
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2016-05~现在, 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所, 中国科学院特聘研究员
2011-01~现在, 中国科学院生物化学与细胞生物学研究所, 二级研究员
2010-05~2011-01,University of Connecticut Health Center, Assistant Professor
2009-04~2010-04,University of Connecticut Health Center, 博士后
2007-09~2009-05,University of Connecticut, 工商管理硕士(MBA)
2004-09~2009-02,University of Connecticut, 博士
2000-09~2003-06,中科院上海药物研究所, 硕士
1996-09~2000-06,兰州大学, 学士
社会兼职
2018-01-01-今,Mobile DNA, 编委
2017-07-01-2022-06-30,Journal of Biological Chemistry, 编委
2017-05-31-今,HGNC基因命名委员会, 委员
2016-08-01-今,Chinese Biological Investigators Society, 理事
2015-09-01-今,外籍评委, European Research Council Advanced Grant
2015-05-01-今,Trends in Genetics, 编委
2015-01-01-今,上海科技大学, 特聘教授
2014-06-01-今,Genome Biology, 编委
2011-04-01-今,康涅狄格大学健康中心客座教授, 客座教授
2011-01-01-今,Frontiers in Non-Coding RNA, 编委

教授课程

bio2000 分子生物学

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 中组部国家“万人计划”科技创新领军人才, 国家级, 2018
(2) 中国科学院青年科学家奖, 部委级, 2018
(3) 第十三届中国青年女科学家奖, , 国家级, 2017
(4) 科技部创新人才推进计划中青年科技创新领军人才, , 部委级, 2017
(5) 上海市科技系统三八红旗手, , 省级, 2017
(6) 霍华德•休斯国际研究员 (HHMI International Research Scholar), , 其他, 2017
(7) 普洛麦格创新奖, , 其他, 2017
(8) 谈家桢生命科学创新奖, 其他, 2017
(9) 中科院优秀导师奖, 部委级, 2017
(10) 第八届上海青年科技英才奖, , 省级, 2016
(11) 中国细胞生物学学会干细胞青年研究员奖, 其他, 2016
(12) 华人生物学家协会杰出青年研究员奖 (CBIS Young Instigator Award), , 其他, 2016
(13) A-IMBN Research Young Investigator/Ken-ichi Arai Award, , 其他, 2016
(14) 第十五届李汝祺动物遗传奖, , 其他, 2015
(15) 基金委国家优秀青年, 国家级, 2013
(16) 中组部万人计划青年拔尖人才, 国家级, 2012
(17) 中科院上海生科院特别人才, 院级, 2012
(18) Gordon 国际学术会议最佳墙报表述奖(Best Poster Presentation), , 国家级, 2009
(19) 最佳口头报告奖(Best Oral Presentation), , 国家级, 2009
(20) 干细胞研究重点项目(Connecticut Stem Cell Seed Award), , 省级, 2009
(21) 莙政奖金, , 国家级, 1999
专利成果
( 1 ) Novel nuclear retained noncoding RNAs, 2010, 第 2 作者, 专利号: A
( 2 ) 一种内含子来源环形RNA分子及其成环关键核酸序列的应用, 2013, 第 1 作者, 专利号: ZL 201310398809.X
( 3 ) 一种利用基因组编辑技术实现原位激活基因的表达方法及其应用, 2014, 第 1 作者, 专利号: 201410051873.5
( 4 ) RNA核滞留载体的构建及应用, 2014, 第 1 作者, 专利号: 201410165883.1

出版信息

   
发表论文
(1) N6-Methyladenosines Modulate A-to-I RNA Editing, Mol Cell, 2018, 第 11 作者
(2) RNA-binding protein SAMD4 regulates skeleton development through translational inhibition of Mig6 expression, Cell Discov, 2017, 第 6 作者
(3) ALU ternative regulation for gene expression, Trends Cell Biol, 2017, 第 11 作者
(4) SLERT regulates DDX21-rings associated with Pol I transcription, Cell, 2017, 第 11 作者
(5) Coordinated circRNA biogenesis and function with NF90/NF110 in viral infection, Mol Cell, 2017, 第 11 作者
(6) The diversity of long noncoding RNAs and their generation, Trends Genet, 2017, 第 11 作者
(7) Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine., Cell Res, 2017, 第 9 作者
(8) Enhancing the RNA engineering toolkit, Science, 2017, 第 11 作者
(9) The Output of Protein-Coding Genes Shifts to Circular RNAs When the Pre-mRNA Processing Machinery Is Limiting, Mol Cell, 2017, 第 6 作者
(10) Long Noncoding RNAs Stabilized by Small Nucleolar RNA-Protein (snoRNP) Ends, Chin J Cell Biol, 2017, 第 11 作者
(11) CircRNA-derived pseudogenes, Cell Res, 2016, 第 5 作者
(12) The biogenesis of nascent circular RNAs, Cell Reports, 2016, 第 11 作者
(13)  Diverse alternative back-splicing and alternative splicing landscape of circular RNAs, Genome Res, 2016, 第 11 作者
(14) Ling-Ling Chen: Linking Long Noncoding RNA Processing and Function to RNA Biology, Trends Biochem Sci, 2016, 第 11 作者
(15) Linking Long Noncoding RNA Localization and Function, Trends Biochem Sci, 2016, 第 11 作者
(16) Characterization of circular RNAs, Methods Mol Biol, 2016, 第 11 作者
(17) The biogenesis and emerging roles of circular RNAs, Nat Rev Mol Cell Biol, 2016, 第 11 作者
(18) Shedding light on paraspeckle structure by super-resolution microscopy, J Cell Biol, 2016, 第 11 作者
(19) Research progress of long noncoding RNA in China, IUBMB Life, 2016, 第 11 作者
(20) A two-fold challenge: the experience of women of color in genomics, Genome Biol, 2016, 第 11 作者
(21) Unusual Processing Generates SPA LncRNAs that Sequester Multiple RNA Binding Proteins, Mol Cell, 2016, 第 11 作者
(22) Increased complexity of circRNA expression during species evolution, RNA Biol, 2016, 第 11 作者
(23) Fractionation of non-polyadenylated and ribosomal-free RNAs from mammalian cells, Methods Mol Biol, 2015, 第 2 作者
(24) Regulation of circRNA biogenesis, RNA Biol, 2015, 第 11 作者
(25) The long noncoding RNA regulation at the MYC locus, Curr Opin Genet Dev, 2015, 第 11 作者
(26) Gear up in circles, Mol Cell, 2015, 第 11 作者
(27) SnoVectors for nucelar expression of RNA, Nucleic Acids Res, 2015, 第 11 作者
(28) ADAR1 is required for differentiation and neural induction by regulating microRNA processing in a catalytically independent manner, Cell Res, 2015, 第 11 作者
(29) Protein arginine methyltransferase CARM1 attenuates the paraspeckle-mediated nuclear retention of mRNAs containing IRAlus, Genes Dev, 2015, 第 11 作者
(30) Scientific migration of junior scientists to China, Genome Biol, 2014, 第 11 作者
(31) Functional analysis of long noncoding RNAs in development and diseases, Adv Exp Med Biol, 2014, 第 11 作者
(32) Competition of RNA splicing: line in or circle up, Sci China Life Sci, 2014, 第 11 作者
(33) Life without A tail: new formats of long noncoding RNAs, Int J Biochem and Cell Biol, 2014, 第 11 作者
(34) Microexons go big, Cell, 2014, 第 11 作者
(35) Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin interactions in the MYC locus, Cell Res, 2014, 第 11 作者
(36) Species-specific alternative splicing leads to unique expression of sno-lncRNAs, BMC Genomics, 2014, 第 11 作者
(37) Gene expression profiling of non-polyadenylated RNA-seq across species, Genomics Data, 2014, 第 3 作者
(38) Complementary sequence-mediated exon circularization, Cell, 2014, 第 11 作者
(39) Prediction of constitutive A-to-I editing sites from human transcriptomes in the absence of genomic sequences, BMC Genomics, 2013, 第 11 作者
(40) Circular intronic long noncoding RNAs, Mol Cell, 2013, 第 11 作者
(41) Nuclear editing of mRNA 3’-UTRs, Curr. Top. Microbiol. Immunol, 2012, 第 11 作者
(42) Long noncoding RNAs with snoRNA ends, Mol Cell, 2012, 第 11 作者
(43) Genomewide characterization of non-polyadenylated RNAs, Genome Biol, 2011, 第 11 作者
(44) Genome-wide studies reveal that Lin28 enhances the translation of genes important for growth and survival of human embryonic stem cells, Stem Cells, 2011, 第 2 作者
(45) Molecular basis for an attenuated cytoplasmic dsRNA response in human embryonic stem cells, Cell Cycle, 2010, 第 11 作者
(46) Long non-coding RNAs in mammalian cells What Where and Why, WIREs RNA, 2010, 第 11 作者
(47) Decoding the function of nuclear long non-coding RNAs, Curr. Opin. Cell Biol, 2010, 第 11 作者
(48) Altered nuclear retention of mRNAs containing inverted repeats in human embryonic stem cells: functional role of a nuclear noncoding RNA, Mol Cell, 2009, 第 1 作者
(49) Gene regulation by SINES and inosines: biological consequences of A-to-I editing of Alu element inverted repeats, Cell Cycle, 2008, 第 1 作者
(50)  Alu element-mediated gene silencing, EMBO J, 2008, 第 1 作者
(51) On the mechanism of induction of heterochromatin by the RNA-binding protein vigilin, RNA, 2008, 第 3 作者
(52) Identification of potent type I MetAPs inhibitors by simple bioisosteric replacement, Bioorg. Med. Chem. Lett, 2005, 第 4 作者
(53)  Identification of potent type I MetAP inhibitors by simple bioisosteric replacement. Part 1: Synthesis and preliminary SAR studies of thiazole-4-carboxylic acid thiazol-2-ylamide derivatives, Bioorg. Med. Chem. Lett, 2005, 第 4 作者
(54) Inhibitors of type I MetAPs containing pyridine-2-carboxylic acid thiazol-2-ylamide. Part 2: SAR studies on the pyridine ring 3-substituent, Bioorg. Med. Chem. Lett, 2005, 第 3 作者
(55) Inhibitors of type I MetAPs containing pyridine-2-carboxylic acid thiazol-2-ylamide. Part 1: SAR studies on the determination of the key scaffold,  Bioorg. Med. Chem. Lett, 2005, 第 3 作者
(56) Type I methionine aminopeptidase from Saccharomyces cerevisiae is a potential target for antifungal drug screening,  Acta. Pharmacol. Sin, 2004, 第 1 作者
(57) Characterization of full length and truncated type I hMetAP expressed from E. coli, Biochemistry, 2004, 第 2 作者
(58) Design and synthesis of chromogenic thiopeptolide substrates as MetAPs active site probes, Bioorg. Med. Chem. Lett, 2004, 第 3 作者
(59) Mutations at the S1 sites of methionine aminopeptidases from Escherichia coli and Homo sapiens reveal the residues critical for substrate specificity, J Biol. Chem, 2004, 第 3 作者
(60)  Specificity for inhibitors of metal-substituted methionine aminopeptidase, Biochem Biophys Res Commun, 2003, 第 2 作者
(61) Discovery and structural modification of inhibitors of methionine aminopeptidases from Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae, J Med. Chem, 2003, 第 4 作者
(62) Studies on the apoptosis of retinal neurons following optic nerve injure in Zebrafish (Brachydanio rerio), J Lanzhou University , 2001, 第 1 作者
(63) 
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 非编码RNA在干细胞命运调控中的功能及分子机制, 参与, 国家级, 2011-01--2015-08
( 2 ) 细胞谱系的建立与发育调控, 参与, 部委级, 2011-01--2015-12
( 3 ) 新型内含子来源的长非编码RNA加工成熟机制及功能研究, 主持, 市地级, 2012-06--2014-05
( 4 ) 中国科学院上海生命科学研究院S类人才计划项目, 主持, 研究所(学校), 2012-07--2015-12
( 5 ) 一类内含子来源的长非编码 RNA 的加工成熟机制及功能研究, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
( 6 ) 青年拔尖人才支持计划, 主持, 国家级, 2013-01--2015-12
( 7 ) 单倍体干细胞表观遗传特性维持的研究, 主持, 国家级, 2014-01--2018-08
( 8 ) 长非编码RNA 的机制与功能研究, 主持, 国家级, 2014-01--2016-12
( 9 ) 两类环形RNA的生成加工机制研究及其功能探索, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12
( 10 ) 非编码RNA 介导的染色质高级结构动态变化对细胞命运决定的调控作用及分子机制, 参与, 国家级, 2016-07--2020-12
( 11 ) 非编码RNA调控细胞增殖与分化的转换与维持, 主持, 部委级, 2016-07--2020-12
( 12 ) 长非编码RNA的代谢与功能, 主持, 国家级, 2018-01--2022-12
( 13 ) 霍华德•休斯医学研究所国际科学家支持计划 (HHMI International Research Scholar Program), 主持, 研究所(学校), 2017-09--2022-08
参与会议
(1)Unconventional RNA Form & Function and beyond   2018-05-22
(2)Unconventional RNA form and function - regulation by Alu elements   2018-02-26
(3)The diversity of long noncoding RNAs, their generation and function   2018-02-18
(4)AlUternative regulation for gene expression   2018-02-12
(5)The diversity of long noncoding RNAs and their generation   谈家桢生命科学奖十周年庆典暨第十届颁奖大会,北京   2017-11-18
(6)The long noncoding RNA regulation in the nucleolus   2017-11-04
(7)Genome-wide screening of NEAT1 regulators reveals mito-paraspeckle communications   2017-10-21
(8)Biogenesis and functional implications of Circular RNAs   2017-09-26
(9)Coordinated circRNA Biogenesis and Function with NF90/NF110 in Viral Infection   第十二次全国基因功能与表观遗传调控学术研讨会,北京   2017-08-15
(10)The Diversity And Function of Long Noncoding RNAs   2017-06-14
(11)CircRNAs   2017-06-01
(12)SLERT regulates DDX21-rings associated with Pol I transcription   RNA加工学术研讨会,镇江   2017-04-23
(13)The diversity of sno-processed lncRNAs and their roles in gene regulation   2017-02-08
(14)The diversity of long noncoding RNAs - their generation and function   2017-02-01
(15)The processing and functional implication of sno-processed long noncoding RNAs   2016年上海科技大学细胞生物学前沿学术研讨会,上海   2016-12-16
(16)Unusual processing generates SPA lncRNAs that sequester multiple RNA binding proteins   2016-11-17
(17)Characterization of new long noncoding RNA species   2016年上海科技大学免疫化学国际生物论坛,上海(3rd ShanghaiTech-SIAIS BioForum)   2016-11-08
(18)Sno-processed long noncoding RNAs   2016-11-07
(19)Discovery, biogenesis and functional implication of new long noncoding RNA species   2016-10-31
(20)Characterization of long noncoding RNAs in the Prader-Willi Syndrome deletion region   中国生物化学与分子生物学会2016年全国学术年会,杭州   2016-10-21
(21)Unusual processing generates sno-processed long noncoding RNAs   第九届全国核糖核酸 (RNA) 学术讨论会,上海   2016-09-27
(22)Circular RNAs   2016-09-12
(23)Unusual processing generates long noncoding RNAs with new formats   2016-08-01
(24)Unusual processing generates long noncoding RNAs with new formats   2016-08-01
(25)SPA lncRNAs   2016-06-27
(26)Biogenesis and functional studies of lncRNAs with new formats   浙江大学医学院,杭州   2016-04-15
(27)Biogenesis of long noncoding RNAs with new formats   2016-03-24
(28)Characterization of long noncoding RNAs in the Prader-Willi Syndrome deletion region   2016-03-21
(29)The biogenesis of circular RNAs   2016-02-14
(30)Biogenesis of different types of new long noncoding RNA species   中国科学技术大学生命科学学院,合肥, 中国   2015-12-16
(31)Characterization of new long noncoding RNA species: discovery, biogenesis and functional implication   2015-10-27
(32)Biogenesis and functional implication of new long noncoding RNA species   2015-10-25
(33)CircRNA biogenesis   2015-10-18
(34)CARM1 regulates mRNA nuclear retention in paraspeckles   第十一次全国基因功能与表观遗传调控学术研讨会, 上海, 中国   2015-10-13
(35)long noncoding RNA species with new formats: discovery, biogenesis and functional implication   2015-09-13
(36)Characterization of new long noncoding RNA species from the Prader-Willi Syndrome deletion region   2015-05-31
(37)New long noncoding RNA species in gene regulation   2014-10-11
(38)Complementary-sequences mediated exon circularization   2014-09-10
(39)Identification and characterization of new long noncoding RNA species   2014-07-07
(40)Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin interactions at the MYC locus   2014-06-03
(41)Characterization of new long noncoding RNA species   2014-06-02
(42)Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin interactions at the MYC locus   2014-05-05
(43)characterization of new long noncoding RNA species   2014-05-01
(44)Characterization and functional implications of new long noncoding RNA species   2014-05-01
(45)Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin interactions at the MYC locus   2014年春RNA研究战略研讨学术研讨会,合肥,中国   2014-04-11
(46)Life without A tail: new long noncoding RNAs from excised introns   2013-12-21
(47)New formats of long noncoding RNAs from excised introns: mechanisms and functional implications   2013-11-18
(48)Gene expression regulation by intronic long noncoding RNAs   2013-11-06
(49)Functional noncoding RNAs from excised introns   2013-10-20
(50)Functional intronic long noncoding RNAs   2013-10-09
(51)Life without (A) tail: new long noncoding RNAs from excised introns   2013-08-28
(52)Circular intronic long noncoding RNAs   2013-08-20
(53)Circular intronic long noncoding RNAs   第1次非编码RNA研究战略研讨会,北京   2013-04-12
(54)Prader-Willi Syndrome associated new long noncoding RNAs in splicing regulation in human embryonic stem cells   2012-12-03
(55)A new class of intron-derived long noncoding RNAs with snoRNA ends   2012-10-08
(56)New long noncoding RNAs in human embryonic stem cells   “非编码RNA在重大生物学过程中功能和机制” 香山科学会议   2012-06-05
(57)Long noncoding RNAs with snoRNA ends   2012-04-23
(58)Intron-derived long noncoding RNAs in human embryonic stem cells   2011-12-07
(59)Altered Nuclear Retention Of MRNAS Containing Inverted Repeats In Human Embryonic Stem Cells: Functional Role Of A Nuclear Noncoding RNA   Ling-Ling Chen    2009-10-30

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生