1. 植物分子系统发育基因组学

利用核、叶绿体基因组和线粒体系统发育基因组学方法重建种子植物科级水平，固氮分支（豆目、蔷薇目、壳斗目和葫芦目）及其分支内蔷薇科、豆科、鼠李科、大麻科等类群的生命之树，重建支系间的系统发育关系，确定主要支系和属种的分类范畴。并在构建的系统发育框架下，探讨基因组和叶绿体基因组进化机制，固氮性状及果实等形态性状的起源和多样化。

2. 植物多样化形成和维持机制

       依据构建的系统发育树，结合古地质、古气候和化石证据推断类群的起源，现在分布格局形成的历史。探讨新性状获得、开拓新生境能力和基因组加倍等因子对物种多样化的影响。

3. 智能植物志“iFlora”

中国维管植物“iFlora”平台构建。对固氮分支，及该分支内的豆科、蔷薇科、鼠李科、大麻科等类群开展DNA条形码和组学数据为主的超级条形码（ultra-barcoding）研究。

招收植物分子系统发育基因组学，植物比较基因组学，和植物多样性和维持机制方向的研究生 

071001-植物学

植物分子系统发育基因组学
植物比较基因组学
植物多样性与维持机制

1999-09--2002-07   中国科学院昆明植物研究所   博士学位
1996-09--1999-07   中国科学院昆明植物研究所   硕士学位
1992-09--1996-07   山东师范大学生物系   学士学位

博士

博士学位

2012.7-2012.8， 访问教授， 东京大学，Komaba Grduate School of Arts and Sciences.
2009.2-2009.4，访问学者，美国自然历史博物馆，史密斯研究所。
2006.8-2006.9， 访问学者，美国自然历史博物馆，史密斯研究所。
2004.11- 2006.8，博士后，美国匹茨堡大学生物系。合作教授：Susan Kalisz博士。
2002.11-2004.11，博士后，美国芝加哥Field 自然历史博物馆植物系。合作教授：Jun Wen博士。

2011.5-， 研究员，中科院昆明植物研究所中国西南种质资源库。
2006.10-2011.5，副研究员，中科院昆明植物研究所中国西南种质资源库。 

2018-05~现在, 中国科学院昆明植物研究所, 研究员
2006-09~2011-05,中国科学院昆明植物研究所, 副研究员
2002-12~2004-10,美国芝加哥Field 自然历史博物馆植物系, 博士后
2002-11~2004-07,美国匹茨堡大学生物, 博士后

2022-01-01-2026-12-31,中国人民政治协商会议昆明市盘龙区第十届委员会, 政协常务委员
2020-12-01-今,云南省植物学会第十三届理事会理事, 理事
2020-01-01-今,国际学术期刊Frontiers in Plant Science副主编, 副主编

植物系统学
种子植物系统学
分子生物地理学

2012年度中国科学院王宽诚西部学者突出贡献奖

（1） 中国科学院王宽诚西部学者突出贡献奖, , 院级, 2012

伊廷双，2020。大麻科Cannabaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，1044-1049。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，2020。芍药科Paeoniaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，815-816。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，2020。小二仙草科Haloragaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，853-855。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，张书东，2020。景天科Crassulaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，843-850。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，张书东，2020。茶藨子科Grossulariaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，831-832。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，张书东，2020。鼠刺科Iteaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，830。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，张书东，2020。交让木科Daphniphyllaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，829。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，张书东，2020。金缕梅科Hamamelidaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，819-827。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，张书东，2020。蕈树科Altingiaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，817-818。（ISBN 978-03-058843-2）

张书东，伊廷双，2020。桑科Moraceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，1050-1056。（ISBN 978-03-058843-2）

张书东，伊廷双，2020。榆科Ulmaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，1041-1043。（ISBN 978-03-058843-2）

张书东，伊廷双，2020。鼠李科Rhamnaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，1032-1040。（ISBN 978-03-058843-2）

张书东，伊廷双，2020。蔷薇科Rosaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。北京：科学出版社，1001-1028。（ISBN 978-03-058843-2）

伊廷双，2018。芍药科Paeoniaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

伊廷双，2018。小二仙草科Haloragaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

伊廷双，2018。大麻科Cannabaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

伊廷双，张书东，2018。茶藨子科Grossulariaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

伊廷双，张书东，2018。金缕梅科Hamamelidaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

伊廷双，张书东，2018。交让木科Daphniphyllaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

伊廷双，张书东，2018。蕈树科Altingiaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

伊廷双，张书东，2018。景天科Crassulaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

张书东, 伊廷双，2018。蔷薇科Rosaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

张书东，伊廷双，2018。鼠李科Rhamnaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

张书东，伊廷双，2018。榆科Ulmaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

张书东，伊廷双，2018。桑科Moraceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属词典。北京：科学出版社。（ISBN 978-7-03-055120-7）

He San-An, Yi Ting-Shuang, Pei Sheng-Ji, Huang Hong-Wen, 2013. Crop plants and their wild relatives. In: Hong De-Yuanand Stephen Blackmore (eds.), Plants of China, Acompanion to the Flora of China. Beijing: Science Press, pp. 309–323. (ISBN 978-7-03-038574-1)

Yi Ting-Shuang, Morell L. Peter, Pei Sheng-Ji, He Shan-Aan, 2013. Major introduced economic plants. In: Hong De-Yuan and Stephen Blackmor (eds.), Plants of China, A companion to the Flora of China. Beijing: Science Press, pp. 357–382.  (ISBN 978-7-03-038574-1) 

李德铢等编译，2012. 植物系统学Plant Systematics: A Phylogentic Approach. 北京：高等教育出版社。伊廷双负责pp. 305-409.

（1） Phylotranscriptomic analyses reveal multiple whole-genome duplication events, the history of diversification and adaptations in the Araceae, ANNALS OF BOTANY, 2023, 通讯作者
（2） Does IR-loss promote plastome structural variation and sequence evolution?, FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2022, 通讯作者
（3） Phylogenomics and the flowering plant tree of life, JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2022, 第 4 作者
（4） Phylogenomic analysis of the hemp family (Cannabaceae) reveals deep cyto-nuclear discordance and provides new insights into generic relationships, JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2022, 通讯作者
（5） A Dated Phylogeny of the Pantropical Genus Dalbergia L.f. (Leguminosae: Papilionoideae) and Its Implications for Historical Biogeography, AGRONOMY, 2022, 第 5 作者
（6） Genome Skimming Contributes to Clarifying Species Limits in Paris Section Axiparis (Melanthiaceae), FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2022, 通讯作者
（7） Name and scale matters: Clarifying the geography of Tibetan Plateau and adjacent mountain regions, Global and Planetary Change, 2022, 第 10 作者
（8） Genomic basis of high-altitude adaptation in Tibetan Prunus fruit trees, CURRENT BIOLOGY, 2021, 其他（合作组作者）
（9） Plastid phylogenomic analyses of Fagales reveal signatures of conflict and ancient chloroplast capture, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2021, 通讯作者
（10） Gene duplications and phylogenomic conflict underlie major pulses of phenotypic evolution in gymnosperms, NATURE PLANTS, 2021, 通讯作者
（11） Plastid phylogenomic insights into the evolution of subfamily Dialioideae (Leguminosae), Plastid phylogenomic insights into the evolution of subfamily Dialioideae (Leguminosae), PLANT DIVERSITY, 2021, 通讯作者
（12） Nuclear phylotranscriptomics and phylogenomics support numerous polyploidization events and hypotheses for the evolution of rhizobial nitrogenfixing symbiosis in Fabaceae, Nuclear phylotranscriptomics and phylogenomics support numerous polyploidization events and hypotheses for the evolution of rhizobial nitrogen-fixing symbiosis in Fabaceae, MOLECULAR PLANT, 2021, 通讯作者
（13） New Insights Into the Plastome Evolution of the Millettioid/Phaseoloid Clade (Papilionoideae, Leguminosae) (vol 11, 151, 2020), FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2021, 通讯作者
（14） Plastid phylogenomic insights into relationships of all flowering plant families, BMC BIOLOGY, 2021, 通讯作者
（15） 数字植物标本在科学研究中的应用及挑战, 广西植物, 2021, 第 2 作者
（16） Born migrators: Historical biogeography of the cosmopolitan family Cannabaceae, Born migrators: Historical biogeography of the cosmopolitan family Cannabaceae, JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2020, 通讯作者
（17） GetOrganelle: a fast and versatile toolkit for accurate de novo assembly of organelle genomes, GENOME BIOLOGY, 2020, 通讯作者
（18） The Loss of the Inverted Repeat in the Putranjivoid Clade of Malpighiales, FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2020, 通讯作者
（19） New Insights Into the Plastome Evolution of the Millettioid/Phaseoloid Clade (Papilionoideae, Leguminosae), FRONTIERSINPLANTSCIENCE, 2020, 通讯作者
（20） Plastome Structural Conservation and Evolution in the Clusioid Clade of Malpighiales, SCIENTIFIC REPORTS, 2020, 通讯作者
（21） New insights into plastome structural diversification in subfamily Dialioideae (Leguminosae), Plant Diversity, 2020, 通讯作者
（22） Exploration of Plastid Phylogenomic Conflict Yields New Insights into the Deep Relationships of Leguminosae, SYSTEMATIC BIOLOGY, 2020, 通讯作者
（23） The complete plastome of Ctenolophon englerianus Mildbr. (Ctenolophonaceae), MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2019, 通讯作者
（24） Plastome phylogenomics, biogeography, and clade diversification of Paris (Melanthiaceae), BMC PLANT BIOLOGY, 2019, 第 8 作者
（25） PGA: a software package for rapid, accurate, and flexible batch annotation of plastomes, PLANT METHODS, 2019, 通讯作者
（26） Testing and using complete plastomes and ribosomal DNA sequences as the next generation DNA barcodes in Panax (Araliaceae), MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, 2019, 通讯作者
（27） The plastid genome of Pentadiplandra brazzeana Baillon (Pentadiplandraceae), MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2019, 通讯作者
（28） The plastid genome of Klainedoxa gabonensis Pierre ex Engl. (Malpighiales), MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2019, 通讯作者
（29） Origin of angiosperms and the puzzle of the Jurassic gap, NATURE PLANTS, 2019, 第 2 作者
（30） Plastome Reduction in the Only Parasitic Gymnosperm Parasitaxus Is Due to Losses of Photosynthesis but Not Housekeeping Genes and Apparently Involves the Secondary Gain of a Large Inverted Repeat, GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, 2019, 通讯作者
（31） Plastid phylogenomic insights into the evolution of caryophyllales, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2019, 通讯作者
（32） Assembly and comparative analyses of the mitochondrial genome of Castanospermum australe (Papilionoideae, Leguminosae), AUSTRALIAN SYSTEMATIC BOTANY, 2019, 通讯作者
（33） Pseudarthria panii (Fabaceae: Desmodieae), a new species from Asia, 120 years after its first collection, PHYTOTAXA, 2018, 第 2 作者
（34） Plastome characteristics of Cannabaceae, Plastome characteristics of Cannabaceae, PLANT DIVERSITY, 2018, 通讯作者
（35） GetOrganelle: a simple and fast pipeline for de novo assembly of a complete circular chloroplast genome using genome skimming data, bioRxiv, 2018, 通讯作者
（36） Plastome characteristics of Cannabaceae, Plastome characteristics of Cannabaceae, PLANT DIVERSITY, 2018, 通讯作者
（37） Characterization of the complete chloroplast genome of Dalbergia odorifera (Leguminosae), a rare and critically endangered legume endemic to China, CONSERVATION GENETICS RESOURCES, 2018, 第 2 作者
（38） Plastome Phylogenetics: 30 Years of Inferences Into Plant Evolution, PLASTID GENOME EVOLUTION, 2018, 第 3 作者
（39） Plastid Genome Evolution in the Early-Diverging Legume Subfamily Cercidoideae (Fabaceae), FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2018, 通讯作者
（40） Plastomes of Mimosoideae: structural and size variation, sequence divergence, and phylogenetic implication, TREE GENETICS & GENOMES, 2017, 通讯作者
（41） Evolution of Rosaceae Fruit Types Based on Nuclear Phylogeny in the Context of Geological Times and Genome Duplication, MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 2017, 第 6 作者
（42） Diversification of Rosaceae since the Late Cretaceous based on plastid phylogenomics, NEW PHYTOLOGIST, 2017, 通讯作者
（43） Evolution of biogeographic disjunction between eastern Asia and North America in Chamaecyparis: Insights from ecological niche models, PLANT DIVERSITY, 2017, 通讯作者
（44） Insights into the Existence of Isomeric Plastomes in Cupressoideae (Cupressaceae), GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, 2017, 通讯作者
（45） A new subfamily classification of the Leguminosae based on a taxonomically comprehensive phylogeny, TAXON, 2017, 第 96 作者
（46） he complete chloroplast genomes of Adenolobus garipensis and Cercis glabra (Cercidoideae, Fabaceae), Coservation Genetics Resources, 2017, 通讯作者
（47） The complete chloroplast genomes of Adenolobus garipensis and Cercis glabra (Cercidoideae, Fabaceae), CONSERVATION GENETICS RESOURCES, 2017, 通讯作者
（48） Phylogeny and biogeography of the amphi-Pacific genus Aphananthe, PLOS ONE, 2017, 通讯作者
（49） Multiple measures could alleviate long-branch attraction in phylogenomic reconstruction of Cupressoideae (Cupressaceae), SCIENTIFIC REPORTS, 2017, 通讯作者
（50） The chloroplast genome of a rare and an endangered species Salweenia bouffordiana (Leguminosae) in China, Conservation Genetics Resources, 2017, 第 1 作者
（51） Environmental and Historical Determinants of Patterns of Genetic Differentiation in Wild Soybean (Glycine soja Sieb. et Zucc), SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 通讯作者
（52） Phylogenetic relationships, character evolution and biogeographic diversification of Pogostemon s.l. (Lamiaceae), MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2016, 第 3 作者
（53） Phylogenomic analyses of large-scale nuclear genes provide new insights into the evolutionary relationships within the rosids, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2016, 第 5 作者
（54） Nuclear genetic variation of Rosa odorata var. gigantea (Rosaceae): population structure and conservation implications, TREE GENETICS & GENOMES, 2016, 通讯作者
（55） Chloroplast capture and intra- and inter-continental biogeographic diversification in the Asian – New World disjunct plant genus Osmorhiza (Apiaceae), MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2015, 第 1 作者
（56） Nucleotide Sequence Diversity and Linkage Disequilibrium of Four Nuclear Loci in Foxtail Millet (Setaria italica), PLOS ONE, 2015, 通讯作者
（57） Evolution and divergence of SBP-box genes in land plants, BMC GENOMICS, 2015, 第 3 作者
（58） The population genetic structure and diversification of Aristolochia delavayi (Aristolochiaceae), an endangered species of the dry hot valleys of the Jinsha River, southwestern China, BOTANY, 2014, 第 2 作者
（59） Lineage diversification and hybridization in the Cayratia japonica–Cayratia tenuifolia species complex, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2014, 第 3 作者
（60） The population genetic structure and diversification of Aristolochia delavayi (Aristolochiaceae), an endangered species of the dry hot valleys of the Jinsha River, southwestern China, BOTANY-BOTANIQUE, 2014, 第 2 作者
（61） Biogeographic history of Pistacia (Anacardiaceae), emphasizing the evolution of the Madrean-Tethyan and the eastern Asian-Tethyan disjunctions, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2014, 第 5 作者
（62） 苹果叶绿体基因组特征分析（英文）, 植物分类与资源学报, 2014, 第 3 作者
（63） Complete Sequencing of Five Araliaceae Chloroplast Genomes and the Phylogenetic Implications, PLOS ONE, 2013, 第 4 作者
（64） Major introduced economic plants. In: Hong De-Yuan and Stephen Blackmor (eds.), Plants of China, A companion to the Flora of China, 2013, 第 4 作者
（65） Molecular phylogeny of the nettle family (Urticaceae) inferred from multiple loci of three genomes and extensive generic sampling, Molecular Phylogenetics and Evolution, 2013, 第 5 作者
（66） The Relationships between Chemical and Genetic Differentiation and Environmental Factors across the Distribution of Erigeron breviscapus (Asteraceae), PLOS ONE, 2013, 通讯作者
（67） Crop plants and their wild relatives. In: Hong De-Yuan and Stephen Blackmore (eds.), Plants of China, A companion to the Flora of China, 2013, 第 2 作者
（68） Global legume diversity assessment: Concepts, key indicators, and strategies, TAXON, 2013, 其他（合作组作者）
（69） Metabarcoding技术在植物鉴定和多样性研究中的应用, 植物分类与资源学报, 2013, 第 2 作者
（70） 构建基于磁珠微流控芯片的iFlora遗传信息高效获取系统, 植物分类与资源学报, 2013, 第 2 作者
（71） Molecular phylogenetics and character evolution of Cannabaceae, TAXON, 2013, 
（72） Conservation genetics and population diversity of Erigeron breviscapus (Asteraceae), an important Chinese herb, BIOCHEMICAL SYSTEMATICS AND ECOLOGY, 2013, 通讯作者
（73） Genetic Diversity and Population Structure: Implications for Conservation of Wild Soybean (Glycine soja Sieb. et Zucc) Based on Nuclear and Chloroplast Microsatellite Variation, INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2012, 第 5 作者
（74） 关于iFlora 创建工作框架的建, 植物分类与资源学报, 2012, 第 1 作者
（75） 中国植物志、Flora of China和维管植物新系统中科的比较, A Comparison of Classifications of Families of Chinese Vascular Plants among Flora Republicae Popularis Sinicae, Flora of China and the New Classifications, 植物分类与资源学报, 2012, 第 2 作者
（76） 遗传信息及其获取技术与iFlora, 植物分类与资源学报, 2012, 第 2 作者
（77） 新一代植物志：iFlora, 植物分类与资源学报, 2012, 第 3 作者
（78） 关于iFlora创建工作框架的建议, 植物分类与资源学报, 2012, 第 5 作者
（79） Multi-gene analysis provides a well-supported phylogeny of Rosales, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2011, 第 5 作者
（80） Secondary Metabolites from Glycine soja and Their Growth Inhibitory Effect against Spodoptera litura, JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY, 2011, 第 3 作者
（81） Is Remusatia (Araceae) Monophyletic? Evidence from Three Plastid Regions, MDPI, 2011, 第 2 作者
（82） Untangling the hybrid origin of the ancient Chinese tea roses: Evidence from DNA sequences of single-copy nuclear and chloroplast genes, Plant Systematics and Evolution, 2011, 通讯作者
（83） Biogeographic Disjunction between Eastern Asia and North America in the Maidenhair Fern Adiantum pedatum Complex, American Journal of Botany, 2011, 第 1 作者
（84） Karyological studies of Erigeron breviscapus and related species, CARYOLOGIA, 2010, 第 3 作者
（85） Evolution and biogeographic diversification of the witch-hazel genus ( Hamamelis L., Hamamelidaceae) in the Northern Hemisphere, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2010, 通讯作者
（86） Development and characterization of microsatellite loci for Rosa odorata var. gigantea Rehder & E. H. Wilson (Rosaceae), CONSERVATION GENETICS, 2009, 通讯作者
（87） Phylogenetics and reticulate evolution in Pistacia (Anacardiaceae), AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, 2008, 第 1 作者
（88） Phylogenetic inferences in Prunus (Rosaceae) using chloroplast ndhF and nuclear ribosomal ITS sequences, JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2008, 第 5 作者
（89） Phylogenetics of Pistacia (Anacardiaceae) inferred from multiple molecular data sets, American Journal of Botany, 2008, 第 1 作者
（90） Phylogeny of Nolana (Nolaneae, Solanoideae, Solanaceae) as inferred from granule-bound starch synthase I (GBSSI) sequences, TAXON, 2007, 第 4 作者
（91） The phylogeny of Rhus (Anacardiaceae) based on sequences of nuclear NIA-i3 intron and chloroplast trnC-D suggests reticulate evolution, Systematic Botany, 2007, 第 1 作者
（92） Chromosome studies on the genus Pinellia (Araceae), Botanical Journal of the Linnean Society, 2005, 第 1 作者
（93） Phylogenetic and biogeographic diversification of Rhus (Anacardiaceae) in the Northern Hemisphere, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2004, 
（94） Chromosomal evolution in Araliaceae and close relatives, TAXON, 2004, 
（95） 天南星科分类系统的沿革, 武汉植物学研究, 2002, 第 1 作者
（96） 香石竹的脱病毒苗与带病毒苗生长发育特征比较, 云南植物研究, 2001, 第 1 作者
（97） 昆明地区香石竹病毒病流行状况调查及脱病毒苗的制备, 云南植物研究, 2001, 第 2 作者
（98） 香石竹的脱病毒苗与带病毒苗生长发育特性比较, 云南植物研究, 2001, 第 1 作者

（1） 植物系统学, Plant Systematics, 高等教育出版社, 2012-07, 第 5 作者
（2） Crop plants and their wild relatives, Science Press, Beijing, 2013-10, 第 2 作者
（3） Major introduced economic plants., Science Press, Beijing, 2013-10, 第 1 作者
（4） 蕈树科Altingiaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 1 作者
（5） 蔷薇科Rosaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 2 作者
（6） 鼠李科Rhamnaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 2 作者
（7） 榆科Ulmaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 2 作者
（8） 景天科Crassulaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 1 作者
（9） 桑科Moraceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 2 作者
（10） 茶藨子科 Grossulariaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 1 作者
（11） 金缕梅科Hamamelidaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 1 作者
（12） 交让木科Daphniphyllaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 1 作者
（13） 芍药科Paeoniaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 1 作者
（14） 小二仙草科Haloragaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 1 作者
（15） 大麻科 Cannabaceae. 见：李德铢等编，中国维管植物科属词典, 科学出版社, 2018-01, 第 1 作者
（16） 芍药科Paeoniaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 1 作者
（17） 小二仙草科Haloragaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 1 作者
（18） 景天科Crassulaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 1 作者
（19） 茶藨子科 Grossulariaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 1 作者
（20） 鼠刺科Iteaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 2 作者
（21） 交让木科Daphniphyllaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 1 作者
（22） 金缕梅科Hamamelidaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 1 作者
（23） 蕈树科Altingiaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 1 作者
（24） 桑科Moraceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 2 作者
（25） 榆科Ulmaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 2 作者
（26） 鼠李科Rhamnaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志, 科学出版社, 2020-04, 第 2 作者
（27） 蔷薇科Rosaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 2 作者
（28） 大麻科Cannabaceae。见：李德铢等编，中国维管植物科属志。, 科学出版社, 2020-04, 第 1 作者

植物分子系统与进化研究组

主要从事植物系统发育基因学和进化生物学研究。与本所同事首次提出新一代“iFlora”（智能植物志）的发展目标，列为研究所“十二五”的重大突破目标。在种子植物生命之树构建和固氮等重要性状的解析等取得了一系列原创性研究成果。以第一或通讯作者在本领域顶级期刊Nature Plants、Genome Biology、Systematic Biology、Molecular Plant等发表研究论文85篇，其中3篇热点论文，6篇高引论文，1篇入选2021“中国百篇最具影响国际学术论文”。主编《Plants of China, A companion to the Flora of China》第20章，《中国维管植物科属词典》12个科，《中国维管植物科属志》13个科。研发的叶绿体基因组组装和注释的软件GetOrganelle和PGA在世界范被广泛应用，对推动质体系统发育基因组学发挥了关键作用。研究成果被Science等国际顶级期刊引用4367余次，1项成果被《植物学报》选为“2019年植物系统进化的重要进展”，3篇论文入选中国科学院B类先导动态季报亮点成果，多项研究成果被Nature Plants、Genome Biology等期刊正面评价，多项成果被美国科技促进会和科技日报等重要新闻媒体报道，在国内外产生了广泛影响。先后主持国家自然科学基金重点国际合作项目、中国科学院战略性先导科技专项（B类）课题等重要科研项目20余项。

（ 1 ）  iFlora交叉与合作团队, 负责人, 中国科学院计划, 2013-01--2015-12
（ 2 ） 大麻科分子系统发育和多样化时空格局重建, 负责人, 国家任务, 2013-01--2016-12
（ 3 ） 西南山地典型生态系统植物多样性对气候变化的响应, 参与, 国家任务, 2014-01--2017-11
（ 4 ） 非洲资源植物种子库建设, 负责人, 国家任务, 2013-01--2015-12
（ 5 ） 《中国植物志》的数字化和DNA条形码, 参与, 国家任务, 2013-01--2017-12
（ 6 ） 云南省中青年学术技术带头人后备人才, 负责人, 地方任务, 2011-01--2015-12
（ 7 ） 东亚-北美间断植物类群的分子系统学和生物地理学, 负责人, 国家任务, 2012-01--2015-12
（ 8 ） 三个重要药用类群DNA条形码鉴定系统构建, 负责人, 其他任务, 2016-05--2017-05
（ 9 ） 《肯尼亚植物志》中蔷薇目（Rosales）等类群植物的分类研究和志书编写, 参与, 中国科学院计划, 2016-01--2020-12
（ 10 ） 三个重要植物类群DNA条形码鉴定系统构建。环境保护部-生物多样性保护专项, 负责人, 其他任务, 2017-05--2018-05
（ 11 ） 维管植物系统框架重建与APG系统修订, 负责人, 中国科学院计划, 2018-01--2022-12
（ 12 ） 蔷薇目全球多样化时空格局重建, 负责人, 国家任务, 2018-01--2022-12
（ 13 ） 生物多样性的演化历史与格局, 负责人, 中国科学院计划, 2017-07--2018-07
（ 14 ） 西南山地种子植物多样性分布格局和成因, 负责人, 中国科学院计划, 2018-07--2023-06
（ 15 ） 我国轻纺用野生纤维植物调查、种质保藏和分子鉴定, 负责人, 国家任务, 2020-01--2024-12
（ 16 ） 西南山地植物多样性的格局动态与成因, 负责人, 中国科学院计划, 2020-09--2023-06

（1）豆科的分子系统发育与进化研究   2022全国系统与进化植物学研讨会暨第十五届青年学术论坛   2023-05-06
（2）系统发育转录组学分析揭示天南星科系统发育关系和多样化   2022全国系统与进化植物学研讨会暨第十五届青年学术论坛   2023-05-06
（3）Phylogenomics of legumes   2021-10-25
（4）叶绿体系统发育基因组学   云南省植物学会第十三次会员代表大会暨植物多样性与绿色发展学术研讨会   2020-11-12
（5）Plastid Phylogenomic Insights into Deep Relationships of Leguminosae with Conflicting Signals on Some Nodes   2019-05-06
（6）Plastid phylogenomic insights into the evolution of legumes   山东植物学会第十五届会员代表大会暨学术研讨会   2018-12-20
（7）Plastid phylogenomic insights into the evolution of Caryophyllales   第三届全国生物系统学学术论坛   2018-12-08
（8）Plastid phylogenomic insights into the evolution of legumes. 7th International Legume Conference   2018-08-29
（9）Plastid phylogenomic insights into the evolution of Caryophyllales   2018-07-20
（10）Sino-Latin America Symposium on plant biodiversity   2017-11-06
（11）Plastid phylogenomics reveals deep relationships of Leguminosae   2017-07-23
（12）Plastid phylogenomics resolve difficult phylogenetic relationships of angiosperms   2016-10-19
（13）Born Migrators: Historical Biogeography of Cosmopolitan Family Cannabaceae.   Tingshuang Yi   2016-05-05
（14）Chloroplast capture and genetic diversification in Osmorhiza (Apiaceae)   Tingshuang Yi, Guihua Jin, Jun Wen   2013-10-27

Collaborator:
De-Zhu Li, Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences.
Jun Wen, Department of Botany, National Museum of Natural History.
Mark W. Chase, Science Directorate, Royal Botanic Gardens.
Douglas E. Soltis, Florida Museum of Natural History, University of Florida.
Pamela S. Soltis, Florida Museum of Natural History, University of Florida.
Stephen A. Smith, Department of Ecology and Evolutionary Biology and Department of Computational Medicine and Bioinformatics, University of Michigan.
Michael J. Moore, Department of Biology, Oberlin College
Peter W. Fritsch, Botanical Research Institute of Texas.
The current collaborative projects:
1. Collaborate with Douglas E. Soltis, Pamela S. Soltis, Robert P. Guralnick, Ryan A. Folk from University of Florida on “The global diversification of Rosales in space and time”, the National Natural Science Foundation of China, key international (regional) cooperative research project (No. 31720103903).
2. Collaborate with Pamela S. Soltis and Douglas Soltis (University of Florida), Mark Chase (Royal Botanic Garden, Kew), Hong Ma (Pennsylvania State University) on “Reconstruction of phylogenetic framework of vascular plants and revision of the APG system”, The Large-scale Scientific Facilities of the Chinese Academy of Sciences (No. 2017-LSF-GBOWS-02).

已指导学生

李翔  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

金桂花  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

贺水莲  博士研究生  071001-植物学  

杨美青  博士研究生  071001-植物学  

刘萍  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

曲小健  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

金建军  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王银环  博士研究生  071001-植物学  

张荣  博士研究生  071001-植物学  

吴佳瑾  硕士研究生  085238-生物工程  

金冬敏  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杨莹莹  博士研究生  071001-植物学  

甘露  硕士研究生  071001-植物学  

张焕雷  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

朱光福  硕士研究生  085238-生物工程  

赵磊  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

现指导学生

刘水银  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

田琴  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈斯云  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杨晨璇  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

鲁晴  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

李云霞  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王丁洁  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

顾威  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

夏侯佐英  博士研究生  071001-植物学  

付小刚  博士研究生  071001-植物学  

安凯伦  硕士研究生  071001-植物学