基本信息
林荣呈  男  博导  中国科学院植物研究所
电子邮件: rclin@ibcas.ac.cn
通信地址: 中国科学院植物研究所
邮政编码: 100093

研究领域

        太阳光既为植物光合作用提供能量,也是植物一种重要的环境因子。植物也有“眼睛”,能精确分辨太阳光的波长、方向、强度和周期等信息,并告诉自己如何生长发育去适应环境。
        课题组综合运用植物生理学、遗传学、生物化学、分子生物学、细胞生物学、基因组学和生物信息学等学科及其手段,主要研究(1)植物如何感知和传递光的信息,并调控叶绿体发育、形态建成、生物钟和开花等重要生理过程;(2)叶绿素合成途径的功能与分子调控;(3)植物对强光的响应和适应机制,尤其是光与活性氧信号的交互作用。通过挖掘与解析重要基因的分子和生化功能,期望建立信号调控网络,为深入揭示植物与光的关系,及其对光的利用奠定基础。
        近期,课题组在光精细调控叶绿素合成(Tang et al.,2012 Plant Cell;Tang et al., 2013 Plant Physiology)、光与活性氧信号的互作(Chen et al.,2013 Plant Cell)、光形态建成调控(Jing et al.,2013 Plant Cell;Li et al., 2014 Plant Physiology;Zhang et al., 2014 Plant Cell)、以及RNA编辑(Zhang et al., 2014 PNAS)等方面取得了重要进展。

招生信息

        每年将招收2-3名硕士(含硕博连读)和博士研究生,欢迎对本课题组研究方向感兴趣的有志青年学生报考。研究组也欢迎客座研究生和博士后的申请。相关事宜请直接与课题组长联系。
招生专业
071008-发育生物学
071009-细胞生物学
招生方向
光信号调控与叶绿体发育
光合作用

教育背景

1999-09--2002-07   中国科学院植物研究所   博士
1996-09--1999-06   华中农业大学   硕士
1992-09--1996-06   华中农业大学   本科
学历
中国科学院植物研究所 -- 研究生
学位
中国科学院植物研究所 -- 博士

工作经历

   
工作简历
2015-03~现在, 中国科学院大学, 岗位教授
2015-03~现在, 中国科学院分子植物卓越中心, 特聘研究员
2008-06~现在, 中国科学院植物研究所, 研究组长,****入选者
2002-09~2008-05,美国康奈尔大学, 博士后

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 朱李月华优秀教师奖, 一等奖, 院级, 2020
(2) “万人计划”科技创新领军人才, 国家级, 2017
(3) 中国科学院优秀指导教师, 院级, 2015
(4) 中国科学院青年科学家奖, , 院级, 2014
(5) 中国侨界创新人才贡献奖, 部委级, 2014
(6) 国家杰出青年科学基金, , 国家级, 2013

出版信息

   
发表论文
(1) FHY3 interacts with phytochrome B and regulates seed dormancy and germination., Plant Physiology, 2021, 通讯作者
(2) The SNL-HDA19 histone deacetylase complex antagonizes HY5 activity to repress photomorphogenesis in Arabidopsis, New Phytologist, 2021, 通讯作者
(3) A pentatricopeptide repeat protein DUA1 interacts with sigma factor 1 to regulate chloroplast gene expression in rice, Photosynthesis Research, 2021, 通讯作者
(4) Interplay between REVEILLE1 and RGA-LIKE2 regulates seed dormancy and germination in Arabidopsis, New Phytologist, 2020, 通讯作者
(5) The evening complex and the chromatin-remodeling factor PICKLE coordinately control seed dormancy by directly repressing DOG1 in Arabidopsis., Plant Communications, 2020, 通讯作者
(6) Transcriptional regulatory network of the light signaling pathways, New Phytologist, 2020, 通讯作者
(7) PIF1 and RVE1 form a transcriptional feedback loop to control light-mediated seed germination in Arabidopsis., Journal of Integrative Plant Biology, 2020, 通讯作者
(8) SIZ1-mediated SUMO modification of SEUSS regulates photomorphogenesis in Arabidopsis., Plant Communications, 2020, 通讯作者
(9) OsPIL14 and SLENDER RICE1 interaction regulates seedling growth under salt stress in rice, Plant Physiology, 2020, 通讯作者
(10) Functional analysis of ZmCOP1 and ZmHY5 reveals conserved light signaling mechanism in maize and Arabidopsis, Physiologia Plantarum, 2020, 通讯作者
(11) The central circadian clock proteins CCA1 and LHY regulate iron homeostasis in Arabidopsis, Journal of Integrative Plant Biology, 2019, 通讯作者
(12) The chromatin-remodeling factor PICKLE interacts with CONSTANS to promote flowering in Arabidopsis, Plant Cell Environment, 2019, 通讯作者
(13) The B3-domain transcription factor VAL1 regulates the floral transition by repressing FLOWERING LOCUS T, Plant Physiology, 2019, 通讯作者
(14) Rice FLUORESCENT1 is involved in the regulation of chlorophyll, Plant Cell Physiology, 2019, 通讯作者
(15) Chloroplast-localized protoporphyrinogen ix oxidase1 is required for the mitotic cell cycle in Arabidopsis, Plant Cell Physiology, 2019, 通讯作者
(16) The chromatin-remodeling factor PICKLE antagonizes polycomb repression of FT expression to promote flowering in Arabidopsis, Plant Physiology, 2019, 通讯作者
(17) SEUSS and PIF4 coordinately regulate light and temperature signaling pathways to control plant growth, Molecular Plant, 2018, 通讯作者
(18) The central circadian clock proteins CCA1 and LHY regulate iron homeostasis in Arabidopsis, Journal of Integrative Plant Biology, 2018, 通讯作者
(19) The SWI2/SNF2 chromatin-remodeling ATPase BRAHMA regulates chlorophyll biosynthesis in Arabidopsis, Molecular Plant, 2017, 通讯作者
(20) A PIF1/PIF3-HY5-BBX23 transcription factor cascade affects photomorphogenesis., Plant Physiology, 2017, 通讯作者
(21) PICKLE chromatin remodeling factor controls thermosensory hypocotyl growth of Arabidopsis., Plant, Cell and Environment, 2017, 通讯作者
(22) Phytochrome B and REVEILLE1/2-mediated signaling controls seed dormancy and germination in Arabidopsis, Nature Communications, 2016, 通讯作者
(23) A pair of light signaling factors FHY3 and FAR1 regulates plant immunity by modulating chlorophyll biosynthesis, Journal of Integrative Plant Biology, 2016, 通讯作者
(24) Glycosyltransferase-like protein ABI8/ELD1/KOB1 promotes Arabidopsis hypocotyl elongation through regulating cellulose biosynthesis, Plant, Cell and Environment, 2015, 通讯作者
(25) The VQ-motif-containing protein family of plant-specific transcriptional regulators, Plant Physiology, 2015, 通讯作者
(26) REVEILLE1 promotes NADPH:Protochlorophyllide oxidoreductase A expression and seedling greening in Arabidopsis, Photosynthesis Research, 2015, 通讯作者
(27) Tetrapyrrole biosynthetic enzyme protoporphyrinogen IX oxidase 1 is required for plastid RNA editing, PNAS, 2014, 通讯作者
(28) Arabidopsis VQ-MOTIF-CONTAINING PROTEIN29 represses seedling de-etiolation by interacting with PHYTOCHROME-INTERACTING FACTOR1, Plant Physiology, 2014, 通讯作者
(29) The chromatin remodeling factor PICKLE integrates brassinosteroid and gibberellin signaling during skotomorphogenic growth in Arabidopsis, Plant Cell, 2014, 通讯作者
(30) FHY3 and FAR1 transcription factors integrate light and abscisic acid signaling in Arabidopsis, Plant Physiology, 2013, 通讯作者
(31) Arabidopsis chromatin-remodeling factor PICKLE interacts with transcription factor HY5 to regulate hypocotyl cell elongation., Plant Cell, 2013, 通讯作者
(32) Antagonistic bHLH/bZIP transcription factors form transcriptional modules that integrate light and reactive oxygen species signaling in Arabidopsis., Plant Cell, 2013, 通讯作者
(33) PICKLE is a repressor in seedling de-etiolation pathway, Plant Signaling and Behavior, 2013, 通讯作者
(34) Transposase-derived proteins FHY3/FAR1 interact with PHYTOCHROME-INTERACTING FACTOR 1 to regulate chlorophyll biosynthesis by modulating HEMB1 during deetiolation in Arabidopsis., Plant Cell, 2012, 通讯作者
(35) Coordinated transcriptional regulation underlying the circadian clock in Arabidopsis, Nature Cell Biology, 2011, 第 4 作者
(36) Genome-wide Analysis of FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL 3 Binding Targets Reveals Its Novel Function in Arabidopsis Development, Plant Cell, 2011, 通讯作者
(37) Discrete and essential roles of the multiple domains of Arabidopsis FHY3 in mediating phytochrome A signal transduction., Plant Physiology, 2008, 第 1 作者
(38) Role of Arabidopsis RAP2.4 in regulating light- and ethylene-mediated developmental processes and drought stress tolerance, Molecular Plant, 2008, 第 1 作者
(39) Transposase-derived transcription factors regulate light signaling in Arabidopsis., Science, 2007, 第 1 作者
(40)  Two homologous ATP-binding cassette transporter proteins, AtMDR1 and AtPGP1, regulate Arabidopsis photomorphogensis and root development by mediating polar auxin transport, Plant Physiology, 2005, 第 1 作者
(41)  Arabidopsis FHY3/FAR1 gene family and distinct roles of its members in light control of Arabidopsis development, Plant Physiology, 2004, 第 1 作者
(42) Molecular cloning, in vitro expression and enzyme activity analysis of violaxanthin deepoxidase from Oryza sativa L, Chinese Science Bulletin, 2002, 第 1 作者
(43) A rapid and efficient DNA minipreparation suitable for screening transgenic plants, Plant Molecular Biology Reporter, 2001, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 植物光信号调控, 负责人, 国家任务, 2014-01--2017-12
( 2 ) VQ25调节拟南芥开花的分子机理研究, 负责人, 国家任务, 2016-01--2019-12
( 3 ) 高等植物叶绿素合成途径的调控机理, 负责人, 国家任务, 2012-01--2015-12
( 4 ) 养分与光能高效利用关键基因的克隆和功能验证, 负责人, 国家任务, 2011-01--2015-12
( 5 ) 提高光合作用和同化物分配的分子机制, 负责人, 国家任务, 2016-07--2020-12
( 6 ) 养分与光能高效利用关键基因的克隆和功能验证, 负责人, 国家任务, 2016-01--2020-12
( 7 ) 拟南芥MORF蛋白调控叶绿体发育的分子机理, 负责人, 国家任务, 2019-01--2022-12
( 8 ) 光温信号调控植物个体早期发育的分子机制, 参与, 中国科学院计划, 2018-01--2022-12
( 9 ) 叶绿体单线态氧信号与光信号互作的机制研究, 负责人, 国家任务, 2021-01--2025-12

指导学生

已指导学生

陈东钦  博士研究生  071008-发育生物学  

李云良  博士研究生  071008-发育生物学  

张帆  博士研究生  071008-发育生物学  

王昕  博士研究生  071008-发育生物学  

纪强  硕士研究生  430139-生物工程  

郭海燕  硕士研究生  071009-细胞生物学  

蒋志敏  博士研究生  071008-发育生物学  

徐刚  博士研究生  071008-发育生物学  

王晚晴  博士研究生  071008-发育生物学  

尚芳芳  硕士研究生  071009-细胞生物学  

张栋  博士研究生  071009-细胞生物学  

郑垚  硕士研究生  071008-发育生物学  

李家龙  博士研究生  071008-发育生物学  

李玉红  博士研究生  071008-发育生物学  

查萍  博士研究生  071008-发育生物学  

李执运  硕士研究生  071008-发育生物学  

莫伟平  博士研究生  071008-发育生物学  

张鑫裕  博士研究生  071008-发育生物学  

刘梦雨  硕士研究生  071008-发育生物学  

刘双荣  博士研究生  071008-发育生物学  

现指导学生

杜岩新  博士研究生  071008-发育生物学  

袁佳睿  博士研究生  071008-发育生物学  

李洋  博士研究生  071008-发育生物学  

孙慧伦  博士研究生  071008-发育生物学  

刘瀚鸿  博士研究生  071008-发育生物学  

郭强  博士研究生  071008-发育生物学  

高楠  硕士研究生  071008-发育生物学  

刘一彤  博士研究生  071008-发育生物学  

高源  硕士研究生  071008-发育生物学  

祁佩佩  博士研究生  071008-发育生物学  

孙然  博士研究生  071008-发育生物学  

王延东  硕士研究生  071008-发育生物学  

毕业生就业

陈东钦 中国科学院遗传与发育生物学研究所
纪   强   波士顿科学(上海)有限公司
张   帆   美国 The University of Texas at Austin
李云良  加拿大 McGill University
王晚晴  北京联合大学
王   昕  沈阳大学