框架核酸的生物学应用

课题组开展多学科交叉研究，欢迎物理学、化学、材料学、生物学、医学等背景同学报考。

070301-无机化学

框架核酸生物应用

2003-09--2009-07   四川大学生命科学学院   研究生/获博士学位
1999-09--2013-07   四川大学生命科学学院   本科生/获学士学位

理学博士（遗传学）

   

2018-10~现在, 中国科学院上海高等研究院, 研究员
2009-07~2018-10,中国科学院上海应用物理研究所, 助理研究员，副研究员

   

（1） 1. 中国分析测试协会科学技术奖（CAIA奖）, 一等奖, 其他, 2017

（ 1 ） 一种基于纳米金花与DNA核酶的铅离子目视检测方法及其应用, 发明专利, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN111638209A

（ 2 ） 一种5端磷酸化单链DNA的制备方法及其应用, 发明专利, 2018, 第 3 作者, 专利号: CN108396043A

（ 3 ） 一种脑靶向制剂及其制备方法和应用, 发明专利, 2017, 第 5 作者, 专利号: CN107397960A

（ 4 ） 一种新的纳米金复合物及其制备方法, 发明专利, 2016, 第 4 作者, 专利号: CN105695452A

（ 5 ） 一种纳米金-氧化石墨烯纳米复合材料的制备方法, 发明专利, 2011, 第 4 作者, 专利号: CN101973518A

（ 6 ） 纳米金作为葡萄糖氧化酶的应用, 发明专利, 2010, 第 6 作者, 专利号: CN101832997A

（ 7 ） 一种基于纳米材料的检测葡萄糖的方法, 发明专利, 2010, 第 5 作者, 专利号: CN101832937A

   

（1） Single-Stranded DNA-Encoded Gold Nanoparticle Clusters as Programmable Enzyme Equivalents, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2022, 通讯作者
（2） Directing Multivalent Aptamer-Receptor Binding on the Cell Surface with Programmable Atom-Like Nanoparticles, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2022, 通讯作者
（3） Recent Advances of DNA Nanostructure-Based Cell Membrane Engineering, ADVANCED HEALTHCARE MATERIALS, 2021, 第 2 作者
（4） Encoding Fluorescence Anisotropic Barcodes with DNA Frameworks, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2021, 通讯作者
（5） Probing the Intracellular Dynamics of Nitric Oxide and Hydrogen Sulfide Using an Activatable NIR II Fluorescence Reporter, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2021, 通讯作者
（6） A DNA nanodevice boosts tumour immunity, NATURE NANOTECHNOLOGY, 2021, 通讯作者
（7） Poly-Adenine-Based Spherical Nucleic Acids for Efficient Live-Cell MicroRNA Capture, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2021, 第 9 作者
（8） DNA origami, Nature Reviews Methods Primers, 2021, 通讯作者
（9） Nucleic Acids Analysis, SCIENCE CHINA-CHEMISTRY, 2021, 第 14 作者
（10） Nanoenabled Tumor Oxygenation Strategies for Overcoming Hypoxia-Associated Immunosuppression, ACS APPLIED BIO MATERIALS, 2021, 第 3 作者
（11） Probing Transient DNA Conformation Changes with an Intercalative Fluorescent Excimer, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2021, 通讯作者
（12） Single cell imaging with near‐field terahertz scanning microscopy, CELL PROLIFERATION, 2020, 第 6 作者
（13） Classifying Cell Types with DNA-Encoded Ligand-Receptor Interactions on the Cell Membrane, NANO LETTERS, 2020, 第 6 作者
（14） 框架核酸在蛋白精确组装中的应用, Application of Framework Nucleic Acids in Protein Precise Arrangement, 化学通报, 2020, 第 3 作者
（15） Programming Cell-Cell Communications with Engineered Cell Origami Clusters, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2020, 通讯作者
（16） DNA Framework-Mediated Electrochemical Biosensing Platform for Amplification-Free MicroRNA Analysis, ANALYTICAL CHEMISTRY, 2020, 第 3 作者
（17） Engineering a chemoenzymatic cascade for sustainable photobiological hydrogen production with green algae, ENERGY & ENVIRONMENTAL SCIENCE, 2020, 第 2 作者
（18） 脂质修饰DNA复合结构的可控制备及膜生物学研究, Construction of Controllable Lipid-DNA Complex for Study in Membrane Biology, 高等学校化学学报, 2020, 第 7 作者
（19） Blood exposure to graphene oxide may cause anaphylactic death in non-human primates, NANO TODAY, 2020, 第 3 作者
（20） Programming PAM antennae for efficient CRISPR-Cas9 DNA editing, SCIENCE ADVANCES, 2020, 第 4 作者
（21） Label-Free and Three-Dimensional Visualization Reveals the Dynamics of Plasma Membrane-Derived Extracellular Vesicles, NANO LETTERS, 2020, 第 3 作者
（22） DNA Origami-Enabled Engineering of Ligand-Drug Conjugates for Targeted Drug Delivery, SMALL, 2020, 第 4 作者
（23） Construction of Controllable Lipid-DNA Complex for Study in Membrane Biology, CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES-CHINESE, 2020, 通讯作者
（24） Programming Switchable Transcription of Topologically Constrained DNA, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2020, 通讯作者
（25） Programming nanoparticle valence bonds with single-stranded DNA encoders, NATURE MATERIALS, 2020, 第 2 作者
（26） Programmable Live-Cell CRISPR Imaging with Toehold-Switch-Mediated Strand Displacement, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2020, 第 2 作者
（27） Programming Biomimetically Confined Aptamers with DNA Frameworks, ACS NANO, 2020, 第 8 作者
（28） DNA Nanoribbon-Templated Self-Assembly of Ultrasmall Fluorescent Copper Nanoclusters with Enhanced Luminescence, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2020, 第11作者
（29） Encoding quantized fluorescence states with fractal DNA frameworks, NATURE COMMUNICATIONS, 2020, 第 1 作者
（30） Implementing digital computing with DNA-based switching circuits, Nature Communications, 2020, 第 4 作者
（31） Directing curli polymerization with DNA origami nucleators, Nature Communications, 2019, 第 10 作者
（32） 针对中枢神经系统的核酸递送策略及其诊疗应用, Delivery of nucleic acids towards central nervous system for theranostic applications, 核技术, 2019, 第 2 作者
（33） Fractal Nanoplasmonic Labels for Supermultiplex Imaging in Single Cells, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2019, 第 8 作者
（34） Citrate‐assisted efficient local delivery of naked oligonucleotide into live mouse brain cells, CELL PROLIFERATION, 2019, 通讯作者
（35） 蛋白-DNA协同组装构建亚微米级复合结构, Submicrometre Superstructure Co-assembled from Protein and DNA, ACTA POLYMERICA SINICA, 2019, 第 7 作者
（36） Redox Engineering of Cytochrome c using DNA Nanostructure-Based Charged Encapsulation and Spatial Control, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2019, 第 4 作者
（37） 蛋白-DNA协同组装构建亚微米级复合结构, Submicrometre Superstructure Co-assembled from Protein and DNA, ACTA POLYMERICA SINICA, 2019, 第 8 作者
（38） Whole-Brain Mapping of Monosynaptic Afferent Inputs to Cortical CRH Neurons, FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, 2019, 第 5 作者
（39） Programming chain-growth copolymerization of DNA hairpin tiles for in-vitro hierarchical supramolecular organization, NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 第 10 作者
（40） 构建多模式全光谱暗场显微镜用于纳米单颗粒局域表面等离子共振实时动力学研究, Multi-Mode Full Spectrum Dark Field Microscope for Single NanoparticleLocalized Surface Plasmon Resonance Dynamics Study, 物理化学学报, 2019, 第 5 作者
（41） Myelin Sheath as a Dielectric Waveguide for Signal Propagation in the Mid-Infrared to Terahertz Spectral Range, ADVANCED FUNCTIONAL MATERIALS, 2019, 第 9 作者
（42） Gold nanoflower‐based surface‐enhanced Raman probes for pH mapping of tumor cell microenviroment, CELL PROLIFERATION, 2019, 第 6 作者
（43） Multi-Mode Full Spectrum Dark Field Microscope for Single Nanoparticle Localized Surface Plasmon Resonance Dynamics Study, ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA, 2019, 第 5 作者
（44） Programming DNA origami patterning with non-canonical DNA-based metallization reactions, NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 第 8 作者
（45） Valency-Controlled Framework Nucleic Acid Signal Amplifiers, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2018, 第 8 作者
（46） Programming Chemical Reaction Networks Using Intramolecular Conformational Motions of DNA, ACS NANO, 2018, 第 5 作者
（47） Bacterial Analysis Using an Electrochemical DNA Biosensor with Poly-Adenine-Mediated DNA Self-Assembly, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2018, 通讯作者
（48） Protein-mimicking nanoparticle (Protmin)-based nanosensor for intracellular analysis of metal ions, NUCLEAR SCIENCE AND TECHNIQUES, 2018, 第 4 作者
（49） Epitope Binning Assay Using an Electron Transfer-Modulated Aptamer Sensor, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2018, 第 9 作者
（50） Real-time label-free analysis of the thermostability of DNA structures using GelRed, NUCLEAR SCIENCE AND TECHNIQUES, 2018, 通讯作者
（51） Deciphering active biocompatibility of iron oxide nanoparticles from their intrinsic antagonism, NANO RESEARCH, 2018, 第 6 作者
（52） Poly-adenine-mediated fluorescent spherical nucleic acid probes for live-cell imaging of endogenous tumor-related mRNA, NANOMEDICINE-NANOTECHNOLOGY BIOLOGY AND MEDICINE, 2018, 第 7 作者
（53） Systematic Study in Mammalian Cells Showing No Adverse Response to Tetrahedral DNA Nanostructure, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2018, 通讯作者
（54） DNA Nanostructure-Programmed Like-Charge Attraction at the Cell-Membrane Interface, ACS CENTRAL SCIENCE, 2018, 第 2 作者
（55） Protein-mimicking nanoparticle (Protmin)-based nanosensor for intracellular analysis of metal ions, Protein-mimicking nanoparticle (Protmin)-based nanosensor for intracellular analysis of metal ions, 核技术：英文版, 2018, 第 4 作者
（56） MoS2 Nanoprobe for MicroRNA Quantification Based on Duplex-Specific Nuclease Signal Amplification, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2018, 通讯作者
（57） Precisely Tailored DNA Nanostructures and their Theranostic Applications, CHEMICAL RECORD, 2017, 通讯作者
（58） Preservation of DNA Nanostructure Carriers: Effects of Freeze - Thawing and Ionic Strength during Lyophilization and Storage, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2017, 通讯作者
（59） Real-time visualization of clustering and intracellular transport of gold nanoparticles by correlative imaging, NATURE COMMUNICATIONS, 2017, 第 4 作者
（60） PCR-Free Colorimetric DNA Hybridization Detection Using a 3D DNA Nanostructured Reporter Probe, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2017, 通讯作者
（61） DNA Hydrogel with Aptamer-Toehold-Based Recognition, Cloaking, and Decloaking of Circulating Tumor Cells for Live Cell Analysis, NANO LETTERS, 2017, 第 4 作者
（62） Bubble-Mediated Ultrasensitive Multiplex Detection of Metal Ions in Three-Dimensional DNA Nanostructure-Encoded Microchannels, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2017, 第 4 作者
（63） Programming Enzyme-Initiated Autonomous DNAzyme Nanodevices in Living Cells, ACS NANO, 2017, 第 8 作者
（64） Sub-diffraction-limit cell imaging using a super-resolution microscope with simplified pulse synchronization, SCIENCE CHINA-CHEMISTRY, 2017, 第 3 作者
（65） Engineering nucleic acid structures for programmable molecular circuitry and intracellular biocomputation, NATURE CHEMISTRY, 2017, 第 1 作者
（66） Valence-Engineering of Quantum Dots Using Programmable DNA Scaffolds, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2017, 第 4 作者
（67） Programming Cell Adhesion for On-Chip Sequential Boolean Logic Functions, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2017, 第 6 作者
（68） Intermediate temperature embrittlement of one new Ni-26W-6Cr based superalloy for molten salt reactors, Materials Science & Engineering A, 2016, 第 1 作者
（69） Superresolution imaging of telomeres with continuous wave stimulated emission depletion (STED) microscope, SCIENCE CHINA-CHEMISTRY, 2016, 通讯作者
（70） 纳米金在肿瘤检测及放射治疗中的应用, 辐射研究与辐射工艺学报, 2016, 第 6 作者
（71） One-Shot Immunomodulatory Nanodiamond Agents for Cancer Immunotherapy, ADVANCED MATERIALS, 2016, 第 6 作者
（72） DNA orientation-specific adhesion and patterning of living mammalian cells on self-assembled DNA monolayers, CHEMICAL SCIENCE, 2016, 第 4 作者
（73） Activity modulation and allosteric control of a scaffolded DNAzyme using a dynamic DNA nanostructure, CHEMICAL SCIENCE, 2016, 第 5 作者
（74） DNA纳米技术与生物医学研究, 科学, 2016, 第 1 作者
（75） Quantitative investigation of the poly-adenine DNA dissociation from the surface of gold nanoparticles, SCIENTIFIC REPORTS, 2015, 第 3 作者
（76） Clicking DNA to gold nanoparticles: poly-adenine-mediated formation of monovalent DNA-gold nanoparticle conjugates with nearly quantitative yield, NPG ASIA MATERIALS, 2015, 第 3 作者
（77） Cotranscriptionally Folded RNA Nanostructures Pave the Way to Intracellular Nanofabrication, CHEMBIOCHEM, 2015, 第 1 作者
（78） A novel ultrasensitive electrochemical DNA sensor based on double tetrahedral nanostructures, Biosensors and Bioelectronics, 2015, 第 4 作者
（79） Constructing Higher-Order DNA Nanoarchitectures with Highly Purified DNA Nanocages, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2015, 第 4 作者
（80） A novel ultrasensitive electrochemical DNA sensor based on double tetrahedral nanostructures, BIOSENSORS & BIOELECTRONICS, 2015, 第 4 作者
（81） Gold-Nanoparticle-Mediated Jigsaw-Puzzle-like Assembly of Supersized Plasmonic DNA Origami, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2015, 第 2 作者
（82） 基于DNA自组装过程的纳米结构研究, 生物技术通报, 2015, 第 2 作者
（83） Self-assembly of DNA-based drug delivery nanocarriers with rolling circle amplification, METHODS, 2014, 第 2 作者
（84） 基于纳米材料的CpG核酸药物载运系统, 科学通报, 2014, 第 2 作者
（85） Single-Particle Tracking and Modulation of Cell Entry Pathways of a Tetrahedral DNA Nanostructure in Live Cells, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2014, 第 2 作者
（86） DNA-Gold Nanoparticle Conjugates-Based Nanoplasmonic Probe for Specific Differentiation of Cell Types, ANALYTICAL CHEMISTRY, 2014, 第 2 作者
（87） Long-Term Effects of Nanoparticles on Nutrition and Metabolism, SMALL, 2014, 第 4 作者
（88） Physical and Biochemical Insights on DNA Structures in Artificial and Living Systems, ACCOUNTS OF CHEMICAL RESEARCH, 2014, 第 2 作者
（89） Gold Nanoparticle-Based Enzyme-Linked Antibody-Aptamer Sandwich Assay for Detection of Salmonella Typhimurium, ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 2014, 第 4 作者
（90） Pattern Recognition Analysis of Proteins Using DNA-Decorated Catalytic Gold Nanoparticles, SMALL, 2013, 第 2 作者
（91） Graphene-based nanoprobes and a prototype optical biosensing platform, BIOSENSORS & BIOELECTRONICS, 2013, 第 4 作者
（92） Graphene Oxide-Based Antibacterial Cotton Fabrics, ADVANCED HEALTHCARE MATERIALS, 2013, 第 8 作者
（93） Rolling Circle Amplification-Based DNA Origami Nanostructrures for Intracellular Delivery of Immunostimulatory Drugs, SMALL, 2013, 第 2 作者
（94） Graphene-based nanoprobes and a prototype optical biosensing platform, Biosensors and Bioelectronics, 2013, 第 4 作者
（95） Pattern recognition analysis of proteins using DNA-decorated catalytic gold nanoparticles, ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2013, 第 2 作者
（96） Smart Drug Delivery Nanocarriers with Self-Assembled DNA Nanostructures, ADVANCED MATERIALS, 2013, 第 1 作者
（97） 单壁碳纳米管在LB培养基及生理盐水中的抗菌性研究, Single-walled carbon nanotubes: a nanospecific enhancer of cellular growth in LB culture, 核技术, 2012, 第 5 作者
（98） Nanomechanical identification of proteins using microcantilever-based chemical sensors, NANOSCALE, 2012, 第 4 作者
（99） Akt signaling-associated metabolic effects of dietary gold nanoparticles in Drosophila, SCIENTIFIC REPORTS, 2012, 第 4 作者
（100） Reconfigurable Three-Dimensional DNA Nanostructures for the Construction of Intracellular Logic Sensors, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2012, 第 4 作者
（101） Polyvalent Immunostimulatory Nanoagents with Self-Assembled CpG Oligonucleotide-Conjugated Gold Nanoparticles, ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2012, 第 3 作者
（102） A Graphene-Based Sensor Array for High-Precision and Adaptive Target Identification with Ensemble Aptamers, JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2012, 第 2 作者
（103） Gold nanoparticles-based nanoconjugates for enhanced enzyme cascade and glucose sensing, ANALYST, 2012, 通讯作者
（104） Silicon nanowires-based highly-efficient SERS-active platform for ultrasensitive DNA detection, NANO TODAY, 2011, 第 6 作者
（105） Regenerable electrochemical immunological sensing at DNA nanostructure-decorated gold surfaces, CHEMICAL COMMUNICATIONS, 2011, 第 3 作者
（106） Self-Assembled Multivalent DNA Nanostructures for Noninvasive Intracellular Delivery of Immunostimulatory CpG Oligonucleotides, ACS NANO, 2011, 第 1 作者
（107） Universal optical assays based on multi-component nanoprobes for genomic deoxyribonucleic acid and proteins, ANALYTICA CHIMICA ACTA, 2011, 第 1 作者
（108） Cellular uptake and cytotoxic evaluation of fullerenol in different cell lines, TOXICOLOGY, 2010, 第 4 作者
（109） Laundering Durability of Superhydrophobic Cotton Fabric, ADVANCED MATERIALS, 2010, 第 6 作者
（110） Biomolecular sensing via coupling DNA-based recognition with gold nanoparticles, JOURNAL OF PHYSICS D-APPLIED PHYSICS, 2009, 第 2 作者
（111） 基于金胶聚集体放大作用实现酶标记的DNA比色传感器, 分析化学, 2009, 第 3 作者
（112） Multi-functional crosslinked Au nanoaggregates for the amplified optical DNA detection, BIOSENSORS & BIOELECTRONICS, 2009, 第 1 作者
（113） Highly Sensitive Electrochemical Sensor for Mercury(II) Ions by Using a Mercury-Specific Oligonucleotide Probe and Gold Nanoparticle-Based Amplification, ANALYTICAL CHEMISTRY, 2009, 第 3 作者
（114） Aptamer-based biosensors, TRAC-TRENDS IN ANALYTICAL CHEMISTRY, 2008, 第 3 作者
（115） Enzyme-based multi-component optical nanoprobes for sequence-specific detection of DNA hybridization, ADVANCED MATERIALS, 2008, 第 1 作者

   

（ 1 ） 寡聚腺嘌呤核苷酸调控下精确定制金纳米结构的小角X射线散射研究, 负责人, 国家任务, 2016-01--2018-12
（ 2 ） 可控的“DNA-纳米金”交联聚集结构用于免疫检测信号增强的研究, 负责人, 国家任务, 2012-01--2014-12
（ 3 ） 基于等离子体显微成像的活细胞微小RNA实时成像, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 4 ） 上海市青年拔尖人才开发计划, 负责人, 地方任务, 2019-01--2021-12
（ 5 ） 同步辐射结合AI技术用于微纳机器人的空间组学及分子作用机制研究, 负责人, 国家任务, 2020-09--2025-08
（ 6 ） 框架核酸荧光纳米标记的生物界面理化机制研究, 负责人, 地方任务, 2019-11--2022-10

已指导学生

黎瑜辉  硕士研究生  071011-生物物理学  

樊谨菘  硕士研究生  071011-生物物理学  

现指导学生

叶伟卿  硕士研究生  070305-高分子化学与物理  

高越  硕士研究生  071011-生物物理学