基本信息
张亮  男    杭州医学研究所
电子邮件: zhangliang@him.cas.cn
通信地址: 浙江省杭州市钱塘区福城路150号
邮政编码:

招生信息

   
招生专业
100706-药理学
100701-药物化学
100702-药剂学
招生方向
生物技术药物,结构药理学,肿瘤药理学,免疫药理学
创新药物发现与研究
新型药物递释系统研究与应用

教育背景

2017-03--2022-06   俄勒冈州立大学   哲学博士(计算机科学)
2013-08--2015-07   伦敦商学院   硕士研究生理学硕士(金融学/量化交易)
2008-02--2010-07   香港科技大学   硕士研究生理学硕士(电子工程/电信学)
2000-09--2004-06   南开大学   本科学士(电子工程/通信工程)

工作经历

   
工作简历
2024-03~现在, 中国科学院杭州医学研究所, 研究员,正高级
2023-05~2024-03,中国药科大学, 教授,博士生导师,正高级
2020-06~2022-07,百度(美国)研究院, 高级研发科学家
2017-03~2022-06,俄勒冈州立大学, 哲学博士(计算机科学)
2013-08~2015-07,伦敦商学院, 硕士研究生理学硕士(金融学/量化交易)
2008-02~2010-07,香港科技大学, 硕士研究生理学硕士(电子工程/电信学)
2000-09~2004-06,南开大学, 本科学士(电子工程/通信工程)
社会兼职
2023-11-07-今,中国生物工程学会疫苗工程专业委员会筹备委员会, 委员
2023-10-19-今,美国帕斯(PATH)适宜卫生科技组织, 顾问

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 百度总技术委员会(TC)技术创新奖 (百度最高等级技术奖项), 特等奖, 研究所(学校), 2022

出版信息

   
发表论文
(1) Improving the Circularization Efficiency, Stability and Translatability of Circular RNA by circDesign, bioRxiv, 2024, 
(2) siRNADiscovery: A Graph Neural Network for siRNA Efficacy Prediction via Deep RNA Sequence Analysis, Briefings in Bioinformatics, 2024, 
(3) LinearAlifold: Linear-time consensus structure prediction for RNA alignments, Journal of Molecular Biology, 2024, 第 1 作者
(4) A nucleoside-modified rabies mRNA vaccine induces long-lasting and comprehensive immune responses in mice and non-human primates, Molecular Therapy(已投稿), 2024, 
(5) Algorithm for optimized mRNA design improves stability and immunogenicity, Nature, 2023, 第 1 作者
(6) LinearCoFold and LinearCoPartition: linear-time algorithms for secondary structure prediction of interacting RNA molecules, Nucleic Acids Research, 2023, 第 4 作者
(7) LazySampling and LinearSampling: fast stochastic sampling of RNA secondary structure with applications to SARS-CoV-2, Nucleic acids research, 2023, 第 3 作者
(8) Analysis and visualization of spatial transcriptomic data, Frontiers in Genetics, 2022, 第 3 作者
(9) LinearTurboFold: Linear-time global prediction of conserved structures for RNA homologs with applications to SARS-CoV-2, Proceedings of the National Academy of Sciences, 2021, 第 3 作者
(10) LinearPartition: linear-time approximation of RNA folding partition function and base-pairing probabilities, Bioinformatics, 2020, 第 2 作者
(11) CoV-Seq, a New Tool for SARS-CoV-2 Genome Analysis and Visualization: Development and Usability Study, Journal of Medical Internet Research, 2020, 第 4 作者
发表著作
Linear-Time Algorithms for RNA Structure Prediction, Methods in Molecular Biology,Humana, New York, NY, 2022-07, 第 2 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 基于人工智能的mRNA全序列“从头设计”和药物研发应用, 负责人, 国家任务, 2025-01--2028-12
( 2 ) 抗原蛋白及mRNA序列设计 (盖茨基金会,上海市生物医药科技发展中心), 负责人, 其他国际合作项目, 2024-06--2026-01
( 3 ) 全面价值导向下疫苗快速研发、高效试验与科学监管决策支持平台及管理机制构建 (子课题主持), 负责人, 国家任务, 2024-01--2026-12
( 4 ) 抗幽门螺杆菌 mRNA疫苗及 circRNA疫苗的研究与开发 (子课题主持), 负责人, 地方任务, 2024-01--2027-12
参与会议
(1)通过circDesign提高环状mRNA的环化效率、稳定性、蛋白表达水平和免疫原性   中国化学会第34届学术年会 核酸分子医学分会   2024-06-17
(2)Leveraging Algorithms: A New Era in Drug & Vaccine Development   盖茨基金会中国创新周疫苗创新研讨会   2023-11-29
(3)AI核酸药物研发   阿里云云栖大会   2023-10-31
(4)AI-driven mRNA vaccine and therapeutic development   第二届冠状病毒国际前沿研究与创新论坛   2023-09-14
(5)Efficient Algorithms for Optimized mRNA Sequence Design   2021-07-25