基本信息
唐继军  男  博导  中国科学院深圳先进技术研究院
电子邮件: jj.tang@siat.ac.cn
通信地址: 天津
邮政编码:

研究领域

生物信息和计算生物学,通过算法、人工智能以及数学和统计方法


招生信息

   
招生专业
081203-计算机应用技术
0812J3-生物信息学
招生方向
生物信息,算法,基因组学

教育背景

2002-06--2004-08   美国University of New Mwxico   博士

工作经历

   
工作简历
2015-01~2021-06,美国University of South Carolina, 教授
社会兼职
2021-01-01-今,Frontiers in Genetics副主编,
2017-12-18-今,BMC Bioinformatics副主编,

教授课程

生物信息学导论
Computer Architecture
Computer Algorithm and Data Structure
Computer Game Development
Algorithm in Bioinformatics

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 2019年度天津市工程专业学位硕士研究生优秀学位论文指导教师, 省级, 2019
专利成果
( 1 ) 多元互信息和残基结合能量蛋白质间相互作用预测方法, 发明, 2019, 第 5 作者, 专利号: CN201811366481.2
( 2 ) 识别4-甲基胞嘧啶位点的预测方法, 发明, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN202011024490.0
( 3 ) 一种用于癌症细胞基因突变研究的高通量基因测序装置, 实用新型, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN201920917583.2
( 4 ) 一种基于支持向量机预测非编码DNA的方法及应用平台, 发明, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN201811052055.1
( 5 ) 一种基于神经网络集成学习的皮肤镜图像的分类方法, 发明, 2020, 第 4 作者, 专利号: CN202010750674.9

出版信息

   
发表论文
(1) DeepATT: a hybrid category attention neural network for identifying functional effects of DNA sequences, Briefings in Bioinformatics, 2021, 通讯作者
(2) Utilizing Deep Learning and Oversampling Methods to Identify Children’s Emotional and Behavioral Risk, Journal of Psychoeducational Assessment, 2021, 通讯作者
(3) Identify RNA-associated subcellular localizations based on multi-label learning using Chou’s 5-steps rule, BMC Genomics, 2021, 第 3 作者
(4) Identification of Drug-Target Interactions via Multi-view Graph Regularized Link Propagation Model, Neurocomputing, 2021, 第 2 作者
(5) Predicting MHC class I binder: existing approaches and a novel recurrent neural network solution, Briefings in Bioinformatics, 2021, 第 4 作者
(6) DeepAVP: a dual-channel deep neural network for identifying variable-length antiviral peptides, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2020, 通讯作者
(7) Computational Methods for Predicting DNA Binding Proteins, Current Proteomics, 2020, 通讯作者
(8) Critical evaluation of web-based prediction tools for human protein subcellular localization, Briefings in Bioinformatics, 2020, 通讯作者
(9) Identification of membrane protein types via multivariate information fusion with Hilbert–Schmidt independence criterion, Neurocomputing, 2020, 第 3 作者
(10) Identification of drug–target interactions via fuzzy bipartite local model, Neural Computing and Applications, 2020, 第 2 作者
(11) Identification of Drug–Target interactions via dual Laplacian regularized least squares with multiple kernel fusion, Knowledge-Based Systems, 2020, 第 2 作者
(12) Discovering Cancer Subtypes via an Accurate Fusion Strategy on Multiple Profile Data, Frontiers in genetics, 2019, 通讯作者
(13) Identification of protein subcellular localization via integrating evolutionary and physicochemical information into Chou’s general PseAAC, Journal of Theoretical Biology, 2019, 通讯作者
(14) LightCpG: a multi-view CpG sites detection on single-cell whole genome sequence data, BMC Genomics, 2019, 第 3 作者
(15) Identification of drug-side effect association via multiple information integration with centered kernel alignment, Neurocomputing, 2019, 第 2 作者
(16) Enhancing Hi-C data resolution with deep convolutional neural network HiCPlus, Nature Communications, 2018, 通讯作者
(17) Phylogenetic reconstruction for copy-number evolution problems, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2018, 通讯作者
(18) Bi-stream CNN Down Syndrome screening model based on genotyping array, BMC Medical Genomics, 2018, 通讯作者
(19) MDA-SKF: similarity kernel fusion for accurately discovering miRNA-disease association, Frontiers in Genetics, 2018, 第 3 作者
(20) Identification of drug-target interactions via multiple information integration, Information Sciences, 2017, 第 2 作者
(21) Excess of non-conservative amino acid changes in marine bacterioplankton lineages with reduced genomes, Nature Microbiology, 2017, 第 4 作者
(22) MLGO: phylogeny reconstruction and ancestral inference from gene-order data, BMC Bioinformatics, 2014, 通讯作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 癌细胞基因组结构变异及进化的算法研究, 主持, 国家级, 2020-01--2023-12
( 2 ) 新蛋白质元件设计的智能算法研究, 主持, 国家级, 2020-11--2025-10