基本信息
施一  男  博导  中国科学院微生物研究所
电子邮件: shiyi@im.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所A427
邮政编码: 100101

招生信息

   
招生专业
100103-病原生物学
100103-病原生物学
招生方向
病原感染调控的分子机制
免疫细胞受体与配体相互作用研究及其识别机制
药物研发

教育背景

2006-09--2011-06   中国科学院微生物研究所   博士
2002-10--2006-07   浙江大学生命科学学院   学士

工作经历

   
工作简历
2018-07~现在, 中国科学院微生物研究所, 病原室副主任、研究员
2016-03~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究员
2013-08~2016-02,中国科学院北京生命科学研究院, 副研究员
2013-03~2013-07,中国科学院北京生命科学研究院, 助理研究员
2011-07~2013-02,中国科学院微生物研究所, 助理研究员
2006-09~2011-06,中国科学院微生物研究所, 博士
2002-10~2006-07,浙江大学生命科学学院, 学士
社会兼职
2020-10-13-今,中国免疫学会, 理事
2019-11-01-今,中国科学院青年创新促进会, 理事长
2019-08-01-今,中国青年科技工作者协会, 理事
2018-09-21-今,中西医结合学会 第四届传染病专业委员会, 青年委员
2018-07-01-今,中国科学院武汉国家生物安全实验室科技指导委员会, 委员
2018-06-21-今,中国畜牧兽医学会, 高级会员
2018-04-17-2021-10-31,中国微生物学会微生物生物安全委员会第一届青年学组, 委员
2017-11-01-2022-10-31,中国微生物学会《生物工程学报》第五届编辑委员会, 编委
2017-10-01-2021-09-30,中国医药生物技术协会实验室生物安全专业委员会第二届委员会, 委员
2017-06-22-今,北京药学会第十六届理事会药物化学生物学专业委员会, 委员
2017-01-01-今,北京生物化学与分子生物学会第二届青年委员会委员,
2016-12-27-今,中国研究型医院学会空间微生物学与感染专业委员会青年委员会, 副主任委员
2016-12-27-今,中国研究型医院学会空间微生物学与感染专业委员会, 常务委员
2016-01-30-2020-01-31,北京免疫学会, 常务理事
2014-03-01-2018-12-31,中国免疫学学会青年工作委员会, 委员
2013-03-01-2017-12-31,中国微生物学会病毒学专业委员会青年委员会, 委员
-今,

教授课程

结构生物学与医学研究
药物设计方法学
分子病毒学

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 中国科学院青年创新促进会优秀会员, 院级, 2019
(2) 求是杰出科技成就集体奖, 其他, 2019
(3) 中国科学院“新时代科技报国”优秀共产党员, , 院级, 2019
(4) 中国科学院北京分院第四届“启明星”复合型人才奖, , 院级, 2018
(5) 中华预防医学会科学技术奖, 一等奖, 其他, 2017
(6) 中国生命科学领域十大进展奖, 其他, 2016
(7) 国家优秀青年基金资助, , 国家级, 2016
(8) 中源协和生命医学创新突破奖, 其他, 2016
(9) 中国科学院青年创新促进会会员, 院级, 2015
(10) 中国科学院卓越青年科学家资助项目, 院级, 2014
(11) 中国科学院卢家锡青年人才奖, , 院级, 2014
专利成果
( 1 ) 一种流感病毒小分子抑制剂, 2020, 第 1 作者, 专利号: 202010419149.9

( 2 ) LTX-315在制备抑制冠状病毒的产品的应用, 2020, 第 1 作者, 专利号: 202010180391.5

( 3 ) 卡泊芬净在制备抑制冠状病毒的产品中的应用, 2020, 第 1 作者, 专利号: 202010114914.6

( 4 ) 一种寨卡病毒小分子抑制剂, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201810832562.0

( 5 ) 一种针对T细胞受体可变区特异性单抗的制备方法, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 2011 1 0247320.3

出版信息

   
发表论文
(1) Structural Basis of SARS-CoV-2 Polymerase Inhibition by Favipiravir, The Innovation, 2021, 第 8 作者
(2) A broadly protective antibody that targets the flavivirus NS1 protein, SCIENCE, 2021, 通讯作者
(3) Cryo-EM structures of Lassa and Machupo virus polymerases complexed with cognate regulatory Z proteins identify targets for antivirals, NATURE MICROBIOLOGY, 2021, 通讯作者
(4) Structural basis for the inhibition of the SARS-CoV-2 main protease by the anti-HCV drug narlaprevir, Structural basis for the inhibition of the SARS-CoV-2 main protease by the anti-HCV drug narlaprevir, SIGNAL TRANSDUCTION AND TARGETED THERAPY, 2021, 通讯作者
(5) Structural insight into arenavirus replication machinery, NATURE, 2020, 通讯作者
(6) Structural and Biochemical Characterization of the nsp12-nsp7-nsp8 Core Polymerase Complex from SARS-CoV-2, CELL REPORTS, 2020, 通讯作者
(7) Structural insight into RNA synthesis by influenza D polymerase, NATURE MICROBIOLOGY, 2019, 通讯作者
(8) Intact Glycopeptide Analysis of Influenza A/H1N1/09 Neuraminidase Revealing the Effects of Host and Glycosite Location on Site-Specific Glycan Structures, PROTEOMICS, 2019, 通讯作者
(9) Structure-function analysis of neutralizing antibodies to H7N9 influenza from naturally infected humans, NATURE MICROBIOLOGY, 2019, 通讯作者
(10) Structural insight into multistage inhibition of CRISPR-Cas12a by AcrVA4, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2019, 通讯作者
(11) Novel cyclo-peptides inhibit Ebola pseudotyped virus entry by targeting primed GP protein, ANTIVIRAL RESEARCH, 2018, 通讯作者
(12) Structures of Zika Virus E & NS1: Relations with Virus Infection and Host Immune Responses, DENGUE AND ZIKA: CONTROL AND ANTIVIRAL TREATMENT STRATEGIES, 2018, 
(13) Structure of the S1 subunit C-terminal domain from bat-derived coronavirus HKU5 spike protein, VIROLOGY, 2017, 通讯作者
(14) Two classes of protective antibodies against Pseudorabies virus variant glycoprotein B: Implications for vaccine design, PLOS PATHOGENS, 2017, 通讯作者
(15) Cryo-EM structures of MERS-CoV and SARS-CoV spike glycoproteins reveal the dynamic receptor binding domains, NATURE COMMUNICATIONS, 2017, 通讯作者
(16) Structural Biology of the Zika Virus, TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES, 2017, 通讯作者
(17) The crystal structure of Zika virus NS5 reveals conserved drug targets, EMBO JOURNAL, 2017, 通讯作者
(18) Conserved Vδ1 Binding Geometry in a Setting of Locus-Disparate pHLA Recognition by δ/αβ T Cell Receptors (TCRs): Insight into Recognition of HIV Peptides by TCRs, Journal of Virology, 2017, 
(19) Contribution of intertwined loop to membrane association revealed by zika virus full-length ns1 structure, EMBO JOURNAL, 2016, 通讯作者
(20) Ebola Viral Glycoprotein Bound to Its Endosomal Receptor Niemann-Pick C1, CELL, 2016, 第 2 作者
(21) Ribavirin is effective against drug-resistant H7N9 influenza virus infections, Ribavirin is effective against drug-resistant H7N9 influenza virus infections, PROTEIN & CELL, 2016, 通讯作者
(22) Zika virus NS1 structure reveals a diversified electrostatic surface for flavivirus, Nature Structural and Molecular Biology, 2016, 通讯作者
(23) Enabling the 'host jump': structural determinants of receptor-binding specificity in influenza A viruses, NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY, 2014, 通讯作者
(24) Bat-derived influenza-like viruses H17N10 and H18N11, TRENDS IN MICROBIOLOGY, 2014, 第 4 作者
(25) Superimposed Epitopes Restricted by the Same HLA Molecule Drive Distinct HIV-Specific CD8+ T Cell Repertoires, American Association of Immunologists, 2014, 
(26) Bat-Derived Influenza Hemagglutinin H17 Does Not Bind Canonical Avian or Human Receptors and Most Likely Uses a Unique Entry Mechanism, CELL REPORTS, 2013, 第 2 作者
(27) Molecular Basis of the Receptor Binding Specificity Switch of the Hemagglutinins from both the 1918 and 2009 Pandemic Influenza A Viruses by a D225G Substitution, JOURNAL OF VIROLOGY, 2013, 第 2 作者
(28) The Lancet, 2013, 
(29) Structures and Receptor Binding of Hemagglutinins from Human-Infecting H7N9 Influenza Viruses, Science, 2013, 
(30) An airborne transmissible avian influenza H5 hemagglutinin seen at the atomic level, Science, 2013, 
(31) Linking innate and adaptive immunity, Linking innate and adaptive immunity, 中国科学通报:英文版, 2012, 第 1 作者
(32) Plasticity of human CD8 alpha alpha binding to peptide-HLA-A*2402, MOLECULAR IMMUNOLOGY, 2011, 第 1 作者
发表著作
( 1 ) 第二版《免疫学前沿进展》第七章, 《Advance in Immunology》Chapter 7, 人民卫生出版社, 2011-12, 第 2 作者
( 2 ) 免疫学前沿进展 第4版 第七章, 人民卫生出版社, 2017-04, 第 2 作者
( 3 ) 《寨卡病毒与寨卡病毒病》,第二章, 人民卫生出版社, 2019-05, 第 1 作者
( 4 ) 《生态基因组学》第25章, 科学出版社, 2019-09, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 病原感染与跨种传播, 负责人, 国家任务, 2017-01--2019-12
( 2 ) P9类多肽新药临床前病毒学研究, 负责人, 企业委托, 2016-07--2018-07
( 3 ) 一带一路”新发突发病原研究支撑计划, 参与, 中国科学院计划, 2016-01--2020-12
( 4 ) 抗HIV 广谱中和抗体生成与重塑的分子基础, 参与, 国家任务, 2014-01--2018-08
( 5 ) 大流感前疫苗研发, 负责人, 企业委托, 2017-01--2018-07
( 6 ) 中国科学院青年促进会项目, 负责人, 中国科学院计划, 2015-01--2018-12
( 7 ) 东非、中亚和东南亚等区域重要传染病防控关键保障技术研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-06
( 8 ) 病毒溯源、跨种传播及致病机制, 负责人, 中国科学院计划, 2018-07--2023-07
( 9 ) 寨卡病毒药物研发与作用机制研究, 负责人, 国家任务, 2019-01--2022-12
( 10 ) 非洲猪瘟研究应急项目, 负责人, 中国科学院计划, 2019-01--2021-12
( 11 ) 新型冠状病毒复制转录复合物工作机制及抑制剂筛选研究, 负责人, 国家任务, 2020-03--2022-03
( 12 ) 科技前沿战略研究-青年科技工作者视角, 负责人, 中国科学院计划, 2021-01--2022-12
( 13 ) 多学科视角病毒溯源研究, 参与, 国家任务, 2021-04--2024-03
( 14 ) 潜在流行风险动物源性人兽共患病毒关键蛋白结构与功能研究, 负责人, 国家任务, 2022-01--2026-12
( 15 ) 冰川、冻土等极端生境和水体环境中“休眠”病毒复苏的潜在传播风险, 负责人, 中国科学院计划, 2021-01--2022-12
参与会议
(1)病毒感染与广谱药物靶点   全国病毒学学术研讨会   2021-09-26
(2)Viral polymerase and design broad-spectrum drug   第十五届国际基因组学大会   2020-10-25
(3)病毒聚合酶与广谱药物设计   中国科学院青年创新促进会工程与装备分会   2020-10-22
(4)病毒聚合酶与广谱药物设计   第二届青年生命科学论坛   2020-09-24
(5)病毒聚合酶:广谱性药物靶点和传染病流行准备   中国生物工程学会第十三届学术年会暨 2019 年全国生物技术大会   2019-11-09
(6)Entry mechanisms of highly pathogenic coronaviruses: MERS-CoV and SARS-CoV   预防和应对流行病的多学科研究研讨会   2019-10-02
(7)Influenza virus replication and antiviral coutermeature development   第二届中国巴西传染病研究与控制中心(IDRPC)学术研讨会暨第一届CAS-TWAS新发突发传染病研究与交流卓越中心(CEEID)研讨会   2019-06-26
(8)Structural basis of Ebola virus neutralization by ZMappTM   中-肯传染病研讨会   2019-05-06
(9)Influenza virus entry and replication   靶标与配体:基于结构的药物设计35年历程   2019-04-07
(10)Influenza virus entry, neutralization and replication   第29届病毒学年会   2019-03-22
(11)无   中国研究型医院学会空间微生物学与感染专业委员会 第三届学术大会暨转化应用战略研讨会   2018-11-18
(12)Influenza virus and neutralizing antibodies   中国科学院青年创新促进会2018年学术年会暨“青促会讲堂   2018-11-06
(13)流感病毒、埃博拉病毒、寨卡病毒、中东呼吸综合征冠状病毒等病毒研究进展   第七届国际青年学者“流行病、传染病和动物传染病的快速诊断”会议及与斯马拉金采夫研究所的双边学术研讨会   2018-09-11
(14)Entry mechanisms of highly pathogenic coronaviruses: MERS-CoV and SARS-CoV   第三届突发新发病毒前言研讨会   2018-09-01
(15)病毒的致病机制   访问巴西Fiocruz基金会并洽谈传染病防控的合作   2018-07-26
(16)Cryo-electron microscopy structures of MERS-CoV and SARS-CoV spike glycoproteins reveal the dynamic receptor binding domains   2018年第28届国际病毒学年会   2018-03-14
(17)Host jump of Flu and MERS-CoV and Ebola   参加2018年美国德克莎斯大学加尔维斯医学部传染病讨论会   2018-01-16
(18)Ebola virus entry: target for membrane fusion inhibiti   27届病毒学年会   2017-03-22
(19)Structure of zika virus ns1: association with virus infection and immune system   参加首届国际寨卡病毒会议   2017-02-22
(20)Ebola viral glycoprotein bound to its endosomal receptor Niemann-Pick C1   参加第26届德国国际病毒学会   2016-04-05
(21)Enabling the 'host jump': structural determinants of receptor-binding specificity in influenza A viruses   Yi Shi   2015-10-18
(22)Enabling the 'host jump': structural determinants of receptor-binding specificity in influenza A viruses   Yi Shi   2015-09-02
(23) 无   2014年国际微生物学大会    施一   2014-07-27
(24)禽流感H5N1/H7N9的跨种间传播机制   中国预防医学会第四届学术年会“新发传染病的挑战与应对”专题研讨会   施一   2013-11-08
(25)Structural basis of virulence-associated D225G substitution resulting in similar binding specificity shift in 1918 and 2009 pandemic influenza hemagglutinin   2011年国际微生物学大会   施一   2011-09-12
(26)CDR3 loop is responsible for the MHC restriction   中国免疫学会第六次全国会员代表大会暨第七届学术会议   施一   2010-10-24