基本信息

孟金涛  男    中国科学院深圳先进技术研究院
电子邮件: jt.meng@siat.ac.cn
通信地址: 深圳市学苑大道1068号
邮政编码: 518055

个人主页: http://210.75.252.46/jintao

研究领域

高性能计算,深度学习,图计算,计算生物等

招生信息

计算机体系结构

计算机应用

招生专业
085400-电子信息
招生方向
电子信息

工作经历

   
工作简历
2020-09~2021-06,中国科学院深圳先进技术研究院, 副研究员
2016-08~2020-09,腾讯AI Lab, 高级研发工程师
2016-01~2016-06,华为诺亚方舟实验室(香港), 访问学者
2014-09~2014-10,美国阿贡国家实验室-数学与计算学部, 访问学者
2008-07~2016-08,中国科学院深圳先进技术研究院, 研发工程师

专利与奖励

   
专利成果
[1] 刘树珍, 孟金涛, 魏彦杰, 冯圣中. 一种基准测试方法、系统及终端设备. CN: CN111597096A, 2020-08-28.
[2] 张慧玲, 陈春, 魏彦杰, 彭丰斌, 孟金涛, 贝振东. 一种基于支持向量机的跨膜蛋白残基作用关系预测方法. CN: CN104252581B, 2019-03-05.
[3] 葛健秋, 孟金涛, 郭宁, 滕彦宁, 魏彦杰. DNA数据文件的读取方法及计算机可读存储介质. 中国: CN107169313A, 2017-09-15.
[4] 滕彦宁, 魏彦杰, 孟金涛, 郭宁, 葛健秋. 基因序列读取方法及读取系统. 中国: CN107145766A, 2017-09-08.
[5] 魏彦杰, 张慧玲, 彭丰斌, 孟金涛, 冯圣中. 基于体外共培养激活Notch-1信号通路的方法. 中国: CN104711227A, 2015-06-17.
[6] 魏彦杰, 张慧琳, 彭丰斌, 孟金涛, 冯圣中. Smac蛋白二聚拟合物及其鉴定方法. 中国: CN104710510A, 2015-06-17.
[7] 魏彦杰, 张帆, 张慧玲, 彭丰斌, 孟金涛, 魏丹. 一种鉴定网络谣言的方法和装置. 中国: CN103902621A, 2014-07-02.
[8] 魏彦杰, 张帆, 张慧玲, 彭丰斌, 孟金涛, 冯圣中. 一种确定城市交通拥堵的方法. 中国: CN103714700A, 2014-04-09.
[9] 魏彦杰, 张慧玲, 彭丰斌, 孟金涛, 冯圣中. 基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统. 中国: CN103714264A, 2014-04-09.
[10] 孟金涛, 张慧琳, 彭丰斌, 魏彦杰, 冯圣中. 双向多步De Bruijn图的错误双向边识别与去除方法. 中国: CN103714263A, 2014-04-09.
[11] 孟金涛, 张慧琳, 彭丰斌, 魏彦杰, 冯圣中. 基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的双向边扩展方法. 中国: CN103699818A, 2014-04-02.
[12] 孟金涛, 张慧琳, 彭丰斌, 魏彦杰, 冯圣中. 双向多步De Bruijn图的重复双向边识别与去除方法. 中国: CN103699813A, 2014-04-02.
[13] 孟金涛, 张慧琳, 彭丰斌, 魏彦杰, 冯圣中. 双向多步De Bruijn图的自环双向边识别与去除方法. 中国: CN103699817A, 2014-04-02.
[14] 孟金涛, 张慧琳, 彭丰斌, 魏彦杰, 冯圣中. 双向多步De Bruijn图的突出端识别与去除方法. 中国: CN103699814A, 2014-04-02.
[15] 孟金涛, 张慧琳, 彭丰斌, 魏彦杰, 冯圣中. 基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法. 中国: CN103699819A, 2014-04-02.
[16] 曾理, 成杰峰, 孟金涛, 涂志兵, 冯圣中. 一种基于De Bruijn图的并行基因拼接方法. 中国: CN103258145A, 2013-08-21.
[17] 孟金涛, 魏彦杰, 成杰峰, 冯圣中. 双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法. 中国: CN103093121A, 2013-05-08.
[18] 孟金涛, 魏彦杰, 曾理, 成杰峰, 冯圣中. 短序列组装中序列片段的过滤方法及系统. 中国: CN103065067A, 2013-04-24.
[19] 孟金涛, 魏延杰, 成杰峰, 冯圣中. 基因测序数据读取方法及系统. 中国: CN103049680A, 2013-04-17.

出版信息

   
发表论文
[1] Meng, Jintao, Chen, Peng, Wahib, Mohamed, Yang, Mingjun, Zheng, Liangzhen, Wei, Yanjie, Feng, Shengzhong, Liu, Wei. Boosting the predictive performance with aqueous solubility dataset curation. SCIENTIFIC DATA[J]. 2022, 9(1): http://dx.doi.org/10.1038/s41597-022-01154-3.
[2] Zhang, Huiling, Huang, Ying, Bei, Zhendong, Ju, Zhen, Meng, Jintao, Hao, Min, Zhang, Jingjing, Zhang, Haiping, Xi, Wenhui. Inter-Residue Distance Prediction From Duet Deep Learning Models. FRONTIERS IN GENETICS[J]. 2022, 13: http://dx.doi.org/10.3389/fgene.2022.887491.
[3] Meng, Jintao, Zhuang, Chen, Chen, Peng, Wahib, Mohamed, Schmidt, Bertil, Wang, Xiao, Lan, Haidong, Wu, Dou, Deng, Minwen, Wei, Yanjie, Feng, Shengzhong. Automatic Generation of High-Performance Convolution Kernels on ARM CPUs for Deep Learning. IEEE TRANSACTIONS ON PARALLEL AND DISTRIBUTED SYSTEMS[J]. 2022, 33(11): 2885-2899, [4] Ge, Jianqiu, Meng, Jintao, Guo, Ning, Wei, Yanjie, Balaji, Pavan, Feng, Shengzhong. Counting Kmers for Biological Sequences at Large Scale. INTERDISCIPLINARY SCIENCES-COMPUTATIONAL LIFE SCIENCES[J]. 2020, 12(1): 99-108, [5] Lan, Haidong, Meng, Jintao, Hundt, Christian, Schmidt, Bertil, Deng, Minwen, Wang, Xiaoning, Liu, Weiguo, Qiao, Yu, Feng, Shengzhong. FeatherCNN: Fast Inference Computation with TensorGEMM on ARM Architectures. IEEE TRANSACTIONS ON PARALLEL AND DISTRIBUTED SYSTEMS[J]. 2020, 31(3): 580-594, http://dx.doi.org/10.1109/TPDS.2019.2939785.
[6] Bingqiang Wang, Meng Jintao, Ning Guo, Jianqiu Ge, Yanjie Wei, Pavan Balaji. Scalable Assembly for Massive Genomic Graphs. 2017, http://ir.siat.ac.cn:8080/handle/172644/12634.
[7] Meng Jintao, Seo Sangmin, Balaji Pavan, Wei Yanjie, Wang Bingqiang, Feng Shenzhong, IEEE. SWAP-Assembler 2: Optimization of De Novo Genome Assembler at Extreme Scale. PROCEEDINGS 45TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON PARALLEL PROCESSING - ICPP 2016null. 2016, 195-204, [8] Meng, Jintao, Wang, Bingqiang, Wei, Yanjie, Feng, Shengzhong, Balaji, Pavan. SWAP-Assembler: scalable and efficient genome assembly towards thousands of cores. BMC BIOINFORMATICS[J]. 2014, 15(Suppl 9): S2-S2, http://www.corc.org.cn/handle/1471x/2374288.
[9] Meng, JinTao, Yuan, JianRui, Feng, ShengZhong, Wei, YanJie. An Energy Efficient Clustering Scheme for Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY[J]. 2013, 28(3): 564-573, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000318509400017.
[10] Yuan Jianrui, Feng Shengzhong, Wei Yanjie, Meng Jintao. An Energy Effcient Clustering Scheme for Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. Journal of Computer Science and Technology[J]. 2013, 28(3): 564-573, [11] Meng, JinTao, Yuan, JianRui, Feng, ShengZhong, Tan, LianSheng. Power Adjusting Algorithm: A New Cross-Layer Power Saving Mechanism for Mobile Ad-Hoc Networks. JOURNAL OF COMPUTER SCIENCE AND TECHNOLOGY[J]. 2013, 28(1): 42-53, https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000314190600005.
[12] []. DGraph: Algorithms for shortgun reads assembly using De Bruijn Graph. http://ir.siat.ac.cn:8080/handle/172644/4222.
[13] []. An Energy Efficient Clustering Scheme for Data Aggregation in Wireless Sensor Networks. http://ir.siat.ac.cn:8080/handle/172644/5041.
[14] []. Improved parallel processing of massive De Bruijn graph for genome assembly. http://ir.siat.ac.cn:8080/handle/172644/5100.
[15] []. Small world asynchronous parallel model for genome assembly. http://ir.siat.ac.cn:8080/handle/172644/4223.

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 面向百万核的高可扩展基因组装研究, 主持, 国家级, 2018-01--2020-12
( 2 ) 面向区域医疗和公共卫生的健康大数据处理分析研究及示范应用, 参与, 国家级, 2015-01--2018-12
( 3 ) 高性能计算环境应用服务优化关键技术研究子项目(新药社区和动漫社区), 参与, 国家级, 2015-01--2018-12
( 4 ) ARM架构DNN软硬件协同优化研究, 主持, 市地级, 2021-03--2023-03
( 5 ) 大数据和人工智能应用移植优化与平台集成, 参与, 国家级, 2019-01--2022-12
( 6 ) 超大规模生物序列聚类分析, 参与, 省级, 2019-01--2022-12
( 7 ) 蛋白序列结构预测, 主持, 院级, 2021-05--2024-05