基本信息
赵方庆 中国科学院动物研究所
电子邮件: zhfq@biols.ac.cn
通信地址: 朝阳区北辰西路1号院5号
邮政编码: 100101
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研究领域
1.生命多维组学技术创新
复杂组织作为生命活动的功能单元,其中生物分子的精准解析与原位检测,能够系统揭示生物大分子的组成、空间排布与动态变化,对阐明生物体内部的调控机制、进而理解生命过程的本质具有重要意义。然而,传统组学方法在检测维度和灵敏度方面存在局限,难以实现多种生物分子的高通量、高分辨检测。针对上述挑战,我们发展高效的空间组学技术与单分子RNA精准检测方法,为深入探究细胞内生命活动规律、解析细胞异质性、空间组织特征以及宿主-微生物互作机制提供了关键技术。
2.组学数据挖掘算法开发
随着组学技术和实验方法的快速发展,当前已在分子、细胞及个体层面产生了多维度、跨尺度的复杂生物数据。然而,海量数据背后蕴含的生物学信息尚未得到充分解析,如何高效挖掘和利用这些组学大数据已成为生命科学与医学研究中的重要挑战。针对这一难题,我们通过构建创新的算法体系,对细胞异质性、非编码RNA调控机制及微生物组结构等多尺度生物学规律开展了系统解析,为生物大数据的深度挖掘与高效利用提供关键的分析工具与理论支撑。
3.菌群-宿主互作机制解析
随着微生物组学研究的不断深入,我们对人体微生物群落的结构组成已有初步认识。然而,当前距离全面理解微生物群落的动态变化及其功能,进而实现精准预测和靶向调控菌群对宿主的作用,仍有较大差距。针对上述挑战,我们围绕生命早期微生物组的建立、母婴间菌群传递以及菌群跨系统互作机制等关键问题,开展动态追踪、功能解析与靶向调控研究,为深入揭示母婴微生物组的结构与功能多样性,并在时空尺度上解析微生物与宿主互作机制奠定重要基础。
招生信息
欢迎具有计算机科学、统计学和生物信息学背景的考生报考!
招生专业
071007-遗传学0710J3-生物信息学0710Z1-基因组学
招生方向
非编码RNA,微生物组学人工智能与大数据
工作经历
工作简历
2024-05~现在, 中国科学院动物研究所, 研究员2010-10~现在, 中国科学院北京生命科学研究院, 研究员2006-07~2010-09,美国宾州州立大学, 博士后
社会兼职
2020-11-01-今,Journal of Genetics and Genomics, 编委
2020-09-01-今,遗传, 副主编
2019-03-01-今,Medicine in Microecology, 副主编
2016-01-01-今,Hereditas, 编委
2015-01-01-今,Briefings in Bioinformatics, 编委
2014-06-30-今,Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 副主编
2020-09-01-今,遗传, 副主编
2019-03-01-今,Medicine in Microecology, 副主编
2016-01-01-今,Hereditas, 编委
2015-01-01-今,Briefings in Bioinformatics, 编委
2014-06-30-今,Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 副主编
教授课程
生态基因组学实用生物信息学(1):高通量测序数据分析技术生物信息学前沿生物信息学实用生物信息学(1):高通量测序数据分析技术生物统计及生物信息学高通量测序数据分析技术医学遗传学与基因组学医学遗传学与人类基因组学基因组学和生物信息学前沿系列讲座基因组学前沿