微生物学的核心准则之一是微生物细胞的大小及其与环境作用的有效距离在微米量级。因此，利用新的技术手段来提高微生物研究的时空分辨率，在微尺度上进行微生物学研究，具有重要意义。本课题组致力于建立微生物学”芯片实验室”，从微流控器件的创新设计、制备和集成出发，通过微分离培养、单细胞分选、单细胞基因组学等新技术，研究微生物的多样性和功能，以及微生物在生态环境、感染疾病中的作用，推动微生物在资源挖掘、生物制造、基因诊断、生物安全等领域的应用。

研究涉及微生物学、生物化学、微流控学等多学科交叉。利用微流控液滴技术实现高通量的微生物单细胞分离和筛选：包括开发自动化的装置和芯片，实现大规模的单细胞分离、培养、互作和测序。利用这些新技术和开发的新平台，希望能够在环境不可培养微生物资源培养、稀有物种和极端微生物获取、潜在产酶和产活性代谢物功能菌株筛选和评价、复杂微生物群落生态功能和进化研究等方面发挥作用。此外，我们将针对临床精准诊断和生物安全现场快速检测等开展应用技术研发，并积极推动微流控技术的产业化应用。近期课题包括：

1.    微生物单细胞分离、培养和高通量分选：利用液滴微流控技术平台在单细胞水平对环境和富集培养样品中的功能菌进行高通量分选、培养和分析，加快微生物资源的收集挖掘和评估。
2.    不可培养微生物单细胞测序：结合流式细胞分选（FACS）和纳升体积单细胞基因组扩增技术，实现环境中未培养功能微生物菌群的单细胞基因组测序和功能分析。
3.    数字PCR技术方法开发和应用：利用基于震动的液滴打印技术以及高通量液滴微流控芯片搭建数字PCR技术平台，用于细菌，病毒等病原微生物的绝对定量分析。
4.    病原微生物分离、鉴定和耐药分析：使用阵列式芯片实现临床样品中病原微生物的分离和分子鉴定，以及病原菌的药物敏感性定量分析。

欢迎具有生物学、化学、物理学、力学、生物医学工程、材料学、计算科学等背景的本科生报考。

课题组常年招收博士后和研究助理，待遇优厚，有意请发邮件至：wenbin@im.ac.cn
博士后应聘条件：
1、具有生物学、生物医学、化学、物理学、工程、生信等相关专业博士学位；
2、具有扎实的专业基础与丰富的实验经验，具有独立承担项目并开展科研工作的能力；
3、具有良好的执行力和条理性，能有效规划并推进课题进展；
4、有较强的中英文阅读写作能力，能够独立撰写研究论文；
5、身体健康，热爱科研工作，具有较强的工作责任心和团队合作精神。

研究助理（项目聘用）应聘条件：
1、具有生物学、化学、光学、流体力学、工程、计算科学等相关专业本科或专科以上学位；
2、具有良好的执行力和条理性，能有效规划并推进课题进展；
3、身体健康，热爱科研工作，具有较强的工作责任心和团队合作精神；
4、具有本市户籍或应届毕业生优先考虑。

http://www.im.cas.cn/zp2018/zjrczp/201907/t20190710_5339602.html

071005-微生物学
0710J3-生物信息学
070302-分析化学

微生物组学，合成生物学
微流控学，单细胞技术
生化分析与临床诊断学

2002-09--2007-06   浙江大学化学系   研究生/博士学位
1998-09--2002-07   浙江大学化学系   本科/学士

   

2021-09~现在, 山东第一医科大学, 联合培养博士生导师
2021-09~现在, 云南大学, 生命科学学院, 联合培养硕士生导师
2019-09~现在, 东北大学, 理学院化学系, 联合培养博士生导师
2016-09~现在, 中国科学院大学, 岗位教授
2014-09~2016-06,中国科学技术大学, 生命科学学院, 联合培养硕士生导师
2013-12~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究员，课题组长
2011-07~2017-11,中国人民大学化学系, 特聘研究员
2007-09~2011-06,美国芝加哥大学化学系, 博士后

2023-09-01-2028-08-31,中国微米纳米技术学会生物微机电系统技术分会, 理事
2023-08-30-2028-08-31,中国微米纳米技术学会微纳流控技术分会, 理事
2022-11-01-今,中国初级卫生保健基金会检验医学研究与转化专业委员会, 首席科研专家
2022-10-01-今,中国化学会, 高级会员
2022-08-31-今,国家药品监督管理局药品审评中心, 外聘专家
2021-07-31-2025-08-30,中国生物物理学会，肠道菌群分会, 委员
2020-09-01-今,中华医学会微生物与免疫学分会, 委员
2017-09-01-2020-09-30,北京医学检验学会, 微生物与感染分会, 常委
2017-04-01-今,生物工程学会-生物传感、生物芯片与纳米生物技术专业委员会, 委员
2017-02-28-今,北京医学检验学会，体外诊断系统工程技术分委会, 理事

微生物组与微生物基因组学
微生物组学与微生物基因组学
病原基因组学
分子诊断技术前沿讲座
仪器分析实验
色谱分析概论

2011-2013: 色谱分析（研究生）

2011-2013: 仪器分析实验（本科）

与国家纳米科学中心、北京大学生物动态光学成像中心、北京协和医院、北京大学口腔医院、北京大学第三医院、东南大学生物电子学国家重点实验室、上海交通大学、浙江大学化学系、中科院南京土壤学研究所、中科院青岛能源与过程研究所、国家海洋局第二海洋研究所、农业部沼气科学研究所等建立了科研和项目合作。

​Zhiyang Dong, Institute of Microbiology, CAS

Bian Wu, Institute of Microbiology, CAS
Jie Feng, Institute of Microbiology, CAS
Yihua Chen, Institute of Microbiology, CAS
Shuang-Jiang Liu, Institute of Microbiology, CAS
Luyan Ma, Institute of Microbiology, CAS
Li Huang, Institute of Microbiology, CAS
Yapei Wang, Renmin University, Chemistry
Feng Shen, Shanghai Jiao Tong University, Biomedical
Jiashu Sun, National Center for Nanoscience and Technology, CAS
Yingchun Xu, Peking Union Medical College Hospital
Qiwen Yang, Peking Union Medical College Hospital
Rustem Ismagilov, California Institute of Technology
Novozymes

已指导学生

奕巧莲  博士研究生  071005-微生物学  

许晶月  硕士研究生  071005-微生物学  

陶艺  博士研究生  071005-微生物学  

聂梦月  硕士研究生  085238-生物工程  

靳增军  博士研究生  071007-遗传学  

徐冰雪  硕士研究生  071005-微生物学  

聂梦月  博士研究生  071005-微生物学  

乔雨歆  博士研究生  071005-微生物学  

胡然  硕士研究生  085238-生物工程  

郑蒙  硕士研究生  085238-生物工程  

谢冰亮  博士研究生  071005-微生物学  

李埰明  硕士研究生  071005-微生物学  

胡倍瑜  博士研究生  071005-微生物学  

于海燕  硕士研究生  071005-微生物学  

吴晓琳  硕士研究生  071005-微生物学  

现指导学生

武斌杰  博士研究生  071005-微生物学  

汪之一  博士研究生  071005-微生物学  

朱晓雅  硕士研究生  086000-生物与医药  

李埰明  博士研究生  071005-微生物学  

郭思思  博士研究生  071005-微生物学