新基因组测序、组装、注释

• 水稻基因组测序：结合二、三代测序和大片段DNA文库，比如BAC库、Fosmid文库，现已构建出一个接近完成的高质量籼稻参考基因组。
• 小麦基因组测序：结合二、三代测序和BAC文库，构建高质量的二倍体和六倍体参考基因组。
• 其它多个物种基因组测序：以三代测序为主的基因组组装。

水稻等群体基因型分析及GWAS
基因调控网络：利用RNA-seq数据为主进行基因共表达网络的构建
组学数据整合、分析、和数据库建设

   

0710J3-生物信息学
086000-生物与医药

基因组大数据分析
生物信息数据库和软件开发

1999-01--2001-06   加拿大Waterloo大学计算机系   硕士
1992-09--1995-07   中科院遗传所   博士
1985-09--1989-07   武汉大学   学士

   

2012-02~现在, 中科院遗传发育所, 研究员
2009-12~2012-02,菲律宾国际水稻所, Scientist/Crop Information Systems Specialist
2004-10~2009-11,美国冷泉港实验室, Scientific Informatics Manager I
2003-07~2004-10,美国University of Maryland Biotechnology Institute, Research Associate
2001-07~2003-06,加拿大Bioinformatics Solutions公司, Bioinformatics Scientist
1996-06~1998-12,美国purdue大学昆虫系, postdoctoral Research Associate

2019-01-01-2023-12-31,植物学报编委,
2014-04-01-今,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专家委员会,

已指导学生

余华  博士研究生  0710J3-生物信息学  

杜会龙  博士研究生  0710J3-生物信息学  

鲁宏伟  博士研究生  0710J3-生物信息学  

李秀秀  博士研究生  0710J3-生物信息学  

焦丙可  硕士研究生  071021-生物信息学  

陈倬  博士研究生  0710J3-生物信息学  

彭骅  博士研究生  0710J3-生物信息学  

陆敏  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

现指导学生

陈永顺  硕士研究生  086000-生物与医药  

潘颖  硕士研究生  086000-生物与医药  

杨凯欣  硕士研究生  086000-生物与医药  

黄超  博士研究生  0710J3-生物信息学  

田骄阳  博士研究生  0710J3-生物信息学  

周健  硕士研究生  086000-生物与医药  

姬玉  硕士研究生  086000-生物与医药