基本信息
张跃斌  男    中国科学院大连化学物理研究所
电子邮件: zhangyb@dicp.ac.cn
通信地址: 辽宁省大连市沙河口区中山路457号
邮政编码:
部门/实验室:研究生部

研究领域

   

招生信息

   
招生专业
070304-物理化学(含:化学物理)
招生方向
计算化学、计算生物学

教育背景

2005-09--2010-06   吉林大学 分子酶学与工程教育部重点实验室   博士
2001-09--2005-06   湖北大学 生命科学院   学士
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2016-07~现在, 中国科学院大连化学物理研究所, 副研究员
2013-07~2016-06,中国科学院大连化学物理研究所, 助理研究员
2010-10~2013-04,吉林大学 超分子结构与材料国家重点实验室, 博士后
社会兼职
   

教授课程

   

专利与奖励

   
奖励信息
   
专利成果
   

出版信息

   
发表论文
(1) Integrating Multiple Accelerated Molecular Dynamics To Improve Accuracy of Free Energy Calculations, Journal of Chemical Theory and Computation, 2018, 第 1 作者
(2) Integrin α4β7 switches its ligand specificity via distinct conformer-specific activation, Journal of Cell Biology, 2018, 第 3 作者
(3) Polarizable atomic multipole-based force field for DOPC and POPE membrane lipids, Molecular Physics, 2018, 第 4 作者
(4) Inert Gas Deactivates Protein Activity by Aggregation, Scientific Reports, 2017, 第 1 作者
(5) Cholesterol modulating the orientation of His17 in hepatitis C virus p7 (5a) viroporin − A molecular dynamic simulation study, Chinese Chemical Letters, 2017, 第 1 作者
(6) A Polarizable Atomic Multipole-Based Force Field for Molecular Dynamics Simulations of Anionic Lipids, Molecules, 2017, 第 4 作者
(7) Accurate evaluation of ion conductivity of gramicidin A channel using polarizable force field without any corrections, Journal of Chemical Theory and Computation, 2016, 第 1 作者
(8) Structural basis for activity regulation of MLL family methyltransferases, Nature, 2016, 第 3 作者
(9) Entry of water into the distal heme pocket of soluble Guanylate Cyclase β1 H-NOX domain alters the ligated CO structure: A resonance Raman and in silico simulation study, RSC Advances, 2016, 第 2 作者
(10) Inhibition of MAPK pathway is essential for suppressing Rheb-Y35N driven tumor growth, Oncogene, 2016, 第 5 作者
(11) Free energy simulations with the AMOEBA polarizable force field and metadynamics on GPU platform, Journal of Computational Chemistry, 2015, 第 1 作者
(12) Mechanistic insight into the functional transition of the enzyme guanylate kinase induced by a single mutation, Scientific Reports, 2015, 第 1 作者
(13) Theoretical investigation on the diatomic ligand migration process and ligand binding properties in non-O 2 -binding H-NOX domain, Proteins Structure Function and Bioinformatics, 2013, 第 1 作者
(14) PH-induced quaternary assembly of Vitreoscilla hemoglobin: The monomer exhibits better peroxidase activity, Biochimica et Biophysica Acta, 2013, 第 2 作者
(15) H-NOX domains display different tunnel systems for ligand migration, Journal of molecular graphics & modelling, 2010, 第 1 作者
发表著作
(1) Computer Simulations to Explore Membrane Organization and Transport, Springer, 2017-11, 第 2 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 基于多尺度分子动力学模拟和高精度可极化力场研究PIP2对TRP通道调控微观分子机理, 主持, 国家级, 2018-01--2020-12
参与会议
   

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生