基本信息
于波  男  博导  中国科学院微生物研究所
电子邮件: yub@im.ac.cn
通信地址: 北京朝阳区北辰西路1号院3号 中科院微生物所F307
邮政编码: 100101

研究领域

针对生物基化学品开发相关合成生物技术体系,侧重于平台与高值化学品的微生物合成技术开发:


-  具有工业应用潜力的极端微生物的筛选与应用


-  生物基平台化学品的微生物合成技术与产业化开发


-  植源化合物的微生物合成


招生信息

工业微生物代谢工程

招生专业
071010-生物化学与分子生物学
085238-生物工程
招生方向
工业微生物代谢工程
微生物催化
合成生物学

教育背景

2001-09--2006-06   山东大学   博士
出国学习工作
2008-2010  德国Helmholtz Centre for Infection Research 博士后
       德国Hamburg University of Technology 博士后

工作经历

2006-2008  中国科学院微生物研究所,助理研究员 

2010-2016  中国科学院微生物研究所,副研究员、青年研究组长  

2016-     中国科学院微生物研究所,研究员、研究组长 

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 一种生产D-乳酸的方法及其专用芽孢乳杆菌, 发明, 2009, 第 5 作者, 专利号: 200710176056.2
( 2 ) 一种生产L-乳酸的方法及其专用凝结芽孢杆菌, 发明, 2009, 第 5 作者, 专利号: 200710176060.9
( 3 ) 一株可耐受有机溶剂的恶臭假单胞菌及其在双液相反应中的应用, 发明, 2008, 第 3 作者, 专利号: 200610044410.1
( 4 ) (2R,3R)-2,3-丁二醇脱氢酶及其编码基因与应用, 发明, 2010, 第 1 作者, 专利号: 201010564858.2
( 5 ) 一株红平红球菌及其在原油脱硫中的应用, 发明, 2007, 第 3 作者, 专利号: 200510044599.X
( 6 ) 一株基因重组的红平红球菌及其在脱除原油有害物--硫和氮中的应用, 发明, 2008, 第 2 作者, 专利号: 200610042259.8
( 7 ) 一株可耐受糠醛产L-乳酸的芽孢杆菌及其应用, 发明, 2014, 第 3 作者, 专利号: 201310104653.X
( 8 ) 采用棉籽蛋白同步酶解发酵生产D-乳酸的方法, 发明, 2013, 第 3 作者, 专利号: 201310090261.2
( 9 ) 芽孢杆菌利用玉米秸秆水解液生产聚合级L-乳酸的方法, 发明, 2012, 第 2 作者, 专利号: 201210122712.1
( 10 ) 一种利用菊芋水解液生产D-乳酸的方法, 发明, 2013, 第 2 作者, 专利号: 201210122728.2
( 11 ) 经过密码子优化的点突变丙酰辅酶A转移酶基因及其应用, 发明, 2013, 第 2 作者, 专利号: 201310104532.5
( 12 ) 菊糖芽孢乳杆菌的D-乳酸脱氢酶及其编码基因与应用, 发明, 2012, 第 2 作者, 专利号: 201210210735.8
( 13 ) 一种生产L-乳酸的方法及其专用热噬淀粉芽孢杆菌, 发明, 2012, 第 1 作者, 专利号: 201210228391.3
( 14 ) 一种生产L-乳酸的方法及其专用金橙黄微小杆菌, 发明, 2013, 第 5 作者, 专利号: 201210356837.0
( 15 ) 一种以氢氧化钠作为中和剂生产D-乳酸的方法, 发明, 2013, 第 3 作者, 专利号: 201310089767.1
( 16 ) 一种从L-乳酸生产S-1,2-丙二醇的方法, 发明, 2013, 第 3 作者, 专利号: 201310573064.6
( 17 ) 一种利用固定化细菌生产罗伊氏素的方法, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: 201510032747.X
( 18 ) 利用L-乳酸合成S-1,2-丙二醇的重组大肠杆菌及其构建方法, 发明, 2016, 第 3 作者, 专利号: 201410354028.5
( 19 ) 一种用微生物酶法合成苄基异硫氰酸酯的方法, 发明, 2016, 第 4 作者, 专利号: 201610079652.8
( 20 ) 一种枯草芽孢杆菌及其在生产γ-聚谷氨酸中的应用, 发明, 2017, 第 4 作者, 专利号: 201710158450.7
( 21 ) 一株生产D-对羟基苯甘氨酸的枯草芽孢杆菌, 发明, 2019, 第 4 作者, 专利号: 201910150242.1
( 22 ) 重组恶臭假单胞菌株的构建及其在转化苏氨酸合成丙酸中的应用, 发明, 2019, 第 2 作者, 专利号: 201910572968.4
( 23 ) 生产萝卜硫苷的重组菌的构建与应用, 发明, 2019, 第 4 作者, 专利号: 201910608769.4
( 24 ) 一种利用食源安全性宿主表达谷氨酰胺转氨酶的方法, 发明, 2018, 第 4 作者, 专利号: 201810789194.6
( 25 ) 重组恶臭假单胞菌的构建及其在生产丙酸中的应用, 发明, 2018, 第 2 作者, 专利号: 201811381133.2
( 26 ) 一种高产L-高丝氨酸的重组菌及其制备方法与应用, 发明, 2020, 第 5 作者, 专利号: 202010025126.X

科研活动

   
科研项目
( 1 ) "人工合成细胞工厂"子课题, 主持, 国家级, 2011-01--2015-08
( 2 ) 专一性同时脱硫脱氮菌株的构建及其在石油生物处理的应用, 主持, 国家级, 2012-01--2015-12
( 3 ) 光学纯L-乳酸的产业化开发, 主持, 国家级, 2011-01--2015-12
( 4 ) 凝结芽孢杆菌产高光学纯L-乳酸的机理研究, 参与, 国家级, 2013-01--2016-12
( 5 ) L-乳酸/丙酮酸的生物合成与衍生转化, 参与, 部委级, 2013-01--2015-12
( 6 ) 乳酸高值衍生转化生物路径的探索, 主持, 部委级, 2014-01--2015-12
( 7 ) 基于基因组学的多粘类芽孢杆菌合成(2R,3R)-2,3-丁二醇研究, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12
( 8 ) 生物质高效转化光学纯(R,R)-2,3-丁二醇关键技术引进与合作研究, 参与, 省级, 2014-01--2016-12
( 9 ) 二氧化碳的人工生物转化-丙酮酸合酶的筛选与表达, 主持, 部委级, 2016-01--2018-12
( 10 ) 凝结芽孢杆菌乳酸转运蛋白LutP的生理功能及其分子调控机制, 参与, 国家级, 2017-01--2020-12
( 11 ) 新型水体重金属吸附及逃逸控制微生物的设计与构建, 主持, 国家级, 2018-01--2021-12
( 12 ) 植源抗癌化合物-萝卜硫苷的微生物合成, 主持, 省级, 2018-01--2019-12
( 13 ) 甘蔗渣水解液的资源化利用, 主持, 部委级, 2019-01--2020-12
( 14 ) 磷酸盐对耐热凝结芽孢杆菌L-乳酸脱氢酶基因的转录激活机制研究, 主持, 国家级, 2020-01--2023-12
( 15 ) 油藏微生物互作线路的设计与构建优化, 主持, 国家级, 2019-07--2024-06
( 16 ) 高纯度丙酸合成高效细胞工厂构建, 参与, 国家级, 2019-07--2024-06
( 17 ) 高产光学纯(R)-乙偶姻细胞工厂的构建及胁迫抗性分子机制研究, 参与, 国家级, 2019-01--2022-12

指导学生

已指导学生

管祥辰  硕士研究生  085238-生物工程  

朱凌峰  硕士研究生  085238-生物工程  

刘菲霞  硕士研究生  085238-生物工程  

张彩丽  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

李衍峰  硕士研究生  085238-生物工程  

刘洋  硕士研究生  085238-生物工程  

杨寒  博士研究生  071005-微生物学  

现指导学生

薛宇斌  硕士研究生  071005-微生物学  

孙智  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

石雅南  硕士研究生  071005-微生物学  

牟庆璇  博士研究生  071005-微生物学  

刘洋  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

孟凡康  硕士研究生  071007-遗传学  

代表性论文

1.  Ma C, Mu QX, Xue YB, Xue YF, Yu B*, Ma YH*. One major facilitator superfamily transporter is responsible for propionic acid tolerance in Pseudomonas putida KT2440. Microb. Biotechnol. 2020, doi: 10.1111/1751-7915.13597

2.   Ma C, Mu QX, Wang L, Shi YN, Zhu LF, Zhang SS, Xue YF, Tao Y, Ma YH*, Yu B*. Bio-production of high-purity propionate by engineering L-threonine degradation pathway in Pseudomonas putida. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2020, online first PDF

3.  Wang AX, Tian WZ, Cheng L, Xu YQ, Wang XW, Qin JY, Yu B. Enhanced ε-poly-L-lysine production by the synergistic effect of ε-poly-L-lysine synthetase overexpression and citrate in Streptomyces albulus. Front. Bioeng. Biotechnol. 2020, 8: 288. doi: 10.3389/fbioe.2020.00288 PDF

4.   Liu Y, Zhu LF, Qi WP, Yu B*. Biocatalytic production of D-p-hydroxyphenylglycine by optimizing protein expression and cell wall engineering in Escherichia coli. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2019, 103(21): 8839-8851. PDF

5.   Liu FX, Malaphan M, Xing FG, Yu B*. Biodetoxification of fungal mycotoxins zearalenone by engineered probiotic bacterium Lactobacillus reuteri with surface-displayed lactonohydrolase. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2019, 103(21): 8813-8824. PDF

6.  Zheng Y#, Meng FK#, Zhu ZH, Wei WJ, Sun Z, Chen JC, Yu B*, Lou CB*, Chen GQ*. A tight cold-inducible switch built by coupling thermosensitive transcriptional and proteolytic regulatory parts. Nucleic Acids Res., 2019, 47 (12), e137 (#Equal contributors) PDF

7.   Wang Y, Zhang CL, Liu GX, Ju JS, Yu B*, Wang LM*. Elucidating the role and regulation of a lactate permease as lactate transporter in Bacillus coagulans DSM1. Appl. Environ. Microbiol. 2019, 85(14): e00672-19 PDF

8.   Wang LM*, Yu B, Wang RX, Xie JC. Biotechnological routes for transglutaminase production: recent achievements, perspectives and limits. Trends Food Sci. Tech. 2018, 81: 116-120. PDF

9.    Yang H, Liu FX, Li Y*, Yu B*. Reconstructing biosynthetic pathway of the plant-derived cancer chemopreventive-precursor glucoraphanin in Escherichia coli. ACS Synth. Biol. 2018, 7(1): 121-131. PDF

10.   Liu FX, Yang H, Wang LM, Yu B*. Biosynthesis of the high-value plant secondary product benzyl isothiocyanate via functional expression of multiple heterologous enzymes in E. coli. ACS Synth. Biol. 2016, 5(12): 1557-1565. PDF

11.  Wang M#, Zhu LF#, Xu XL, Wang LM, Yin RC*, Yu B*. Efficient production of enantiomerically pure D-phenyllactate from phenylpyruvate by structure-guided design of an engineered D-lactate dehydrogenase. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2016, 100(17): 7471-7478 (#Equal contributors) PDF

12.  Sun LF, Li YF, Wang LM, Wang YP, Yu B*. Diammonium phosphate stimulates transcription of L-lactate dehydrogenase leading to increased L-lactate production in the thermotolerant Bacillus coagulans strain. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2016, 100(15): 6653-6660 PDF

13.  Hou JF, Liu FX, Wu N, Ju JS, Yu B*. Efficient biodegradation of chlorophenols in aqueous phase by magnetically immobilized aniline-degrading Rhodococcus rhodochrous strain. J. Nanobiotechnol. 2016, 14: 5. doi: 10.1186/s12951-016-0158-0 PDF

14.    Zhu LF#, Guan XC#, Xie NZ, Wang LM, Yu B*, Ma YH. Fermentative production of enantiomerically pure S-1,2-propanediol from glucose by engineered E. coli strain. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2016, 100(3): 1241-1251. (#Equal contributors) PDF

15.    Zhu LF, Xu XL, Wang LM, Dong H*, Yu B*, Ma YH. NADP+-preferring D-lactate dehydrogenase from Sporolactobacillus inulinus. Appl. Environ. Microbiol. 2015, 81(18): 6294-6301. PDF

16.    Liu FX, Yu B*. Efficient production of reuterin from glycerol by magnetically immobilized Lactobacillus reuterin. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2015, 99(11): 4659-4666. PDF

17.    Wang LM#, Cai YM#, Zhu LF, Guo HL, Yu B*. Major role of NAD-dependent lactate dehydrogenases in high optically pure L-lactic acid production by thermophilic Bacillus coagulans. Appl. Environ. Microbiol. 2014, 80(23): 7134-7141. (#Equal contributors) PDF

18.    Peng LL, Wang LM, Che CC, Yang G, Yu B*, Ma YH. Bacillus sp. strain P38: an efficient producer of L-lactate from cellulosic hydrolysate, with high tolerance for 2-furfural. Bioresour. Technol. 2013, 149: 169-176. PDF

19.    Li Y, Wang LM, Ju JS, Yu B*, Ma YH. Efficient production of polymer-grade D-lactate by Sporolactobacillus laevolacticus DSM442 with agricultural waste cottonseed as the sole nitrogen source. Bioresour. Technol. 2013, 142: 186-191. PDF

20.    于波*,曾艳,姜旭,王丽敏,马延和. 聚合级L-乳酸的非粮生物质发酵研究进展. 生物工程学报, 2013, 29(4): 411-421. (特邀综述)