基本信息

杨晟  男  博导  中国科学院分子植物科学卓越创新中心 (中国科学院合成生物学重点实验室)

本科毕业于浙江大学化工系(1995)
博士毕业于中国科学院上海生物化学研究所(2000)
中国科学院上海生命科学研究院工作至今
联系方式:syang@sibs.ac.cn
微信公众号:微生物遗传与工程生物学



课题组简况

新一代DNA测序与低成本DNA合成技术提供了海量基因资源与快速廉价的基因获取手段,为设计和创制工程细胞提供了近乎无限的可能性。杨晟实验室开发基于CRISPR相关系统的微生物基因组编辑工具,加速细胞构建以理解相关遗传与生化机制,据此迭代设计工程微生物,用于绿色化学与益生菌药物。

实验室设计的基因组编辑工具质粒分发四千余次,数十种生物催化酶与化学品高产菌株在国内商用,纤维素乙醇酵母在美国与巴西应用于二代乙醇生产。杨晟研究员获DuPont Young Professor Award, Novozymes Innovation Award, 国务院政府特殊津贴及国家杰出青年科学基金。多位毕业生创办或联合创办各自的合成生物学公司。

本组现有助理7人,博后1人,博士生2人,硕士生6人及一批客座研发人员,拥有微生物分子遗传与工程生物学的完备实验设施。


国家杰出青年基金项目《合成生物催化剂工程》成果科普性介绍

   绿色化学是可减少或消除有害物质使用或产生的化学品和工艺设计。美国环境保护署在过去22年里将总统绿色化学挑战奖授予了114个绿色化学项目,其中生物催化占四分之一以上[https://www.epa.gov/greenchemistry]。然而,生物催化在化学工业中的应用仍然非常有限,因为与化学合成相比,生物催化的开发和实施相当缓慢。

       DNA测序和合成的长足进展为通过功能性表达酶基因和重新排布酶形成新的生物合成途径来构建生物催化剂提供了极为丰富的资源和可能性。

       本项目研究方向是通过提供新的使能技术和新颖的设计,开发基于合成生物学的工业生物催化剂。目标包括:1)开发更高效的微生物基因组编辑工具,以更快地构建工程细胞;2)重构定向进化而来生物催化剂以理解高效催化性能背后的遗传与生化机制,进而设计新一代的生物催化剂。

       换句话说,本项目要

a) 建立一套方法能快速按需改变任意微生物的基因组序列;

b) 重测序诱变或驯化选育的高性能微生物;

c) 查找相对于亲株的基因组序列改变;

d) 在这些改变中确定关键基因及其提升微生物性能的机制;

e) 以关键基因与其提升机制为依据,在亲株甚至其他微生物基础上设计高性能工程细胞。

       通过加速以上构建-测试-学习-设计(Design-Build-Test-Lean, DBTL)循环来获得新知识、新方法和新一代生物催化剂用于绿色化学等领域。

       第一部分工作是建立或升级各种重要微生物特别是细菌的基因组编辑工具。所谓基因组“编辑”,即指在活体基因组中某一精确位点进行DNA插入、删除、修改或替换等定点修饰的一项技术。此过程既模拟了基因的自然突变,又修改并编辑了原有的基因组,真正达成了“编辑基因”。项目组将微生物基因组编辑过程分解为三步:编辑器(如CRISPR-Cas及相关系统)的构建与导入、基因组的靶向突变/重组、已靶向改变细胞的筛选。即分导入、突变/重组与筛选三步优化基因组编辑工具。

       编辑器构建一般仅需常规的重组DNA手段。导入则以电转化较为通用(即以脉冲电场在微生物细胞膜上穿孔),从而将编辑器送入胞内。筛选可用正筛标记如抗生素抗性基因,无痕编辑(不留下抗性基因等无关序列)则需要反筛标记或手段,特别是CRISPR-Cas。在细菌中建立与优化基因组编辑系统的难点大多数是在突变/重组环节,因为

o 编辑器DNA往往会被受体细菌的外来核酸防御系统所降解;

o 编辑器DNA找不到合适的受体细菌质粒来承载,而以非复制型质粒或线性片段进入细胞,得在细胞分裂前引发基因组靶向改变,留给编辑的时间窗口很小;

o 受体细菌的重组频率极低,难为外来DNA编辑模板所改变;

o 编辑器编码基因在受体细胞中难以活性表达,甚至因缺少未知的宿主促进因子而难以发挥编辑功能。

       比如金黄色葡萄球菌基因组编辑的遗传瓶颈即是其强大的外来核酸防御系统,且不同株系的防御系统各不相同。项目组设计了一套几乎可以绕过金黄色葡萄球菌所有菌株外来核酸防御系统的CRISPR-Cas基因组编辑工具,比较彻底地克服了金黄色葡萄球菌各类株系的遗传操作障碍。主要原理是在不影响功能前提下,改变编辑器质粒上DNA序列(比如同义突变)使之不会促发受体金葡菌的防御系统;或者在充当“中转站”的供体大肠杆菌中引入金葡菌强大外来核酸防御系统中相关的甲基化酶编码基因,使编辑器质粒DNA被金葡菌甲基化酶修饰,穿上“马甲”伪装成非外源核酸,此时当编辑器导入到对应的受体金葡菌后,金葡菌无法识别出编辑器质粒DNA是外源核酸,从而躲过防御系统。

       比如大肠杆菌基因组编辑的瓶颈是同源重组效率低,项目组前期开发了pCas/pTargetF组合了噬菌体重组酶和CRISPR-Cas元件,在国内多个课题组广受好评,但大肠杆菌需要在30度培养,生长慢半天。进一步将其升级为pEcCas/pEcgRNA,使其能在大肠杆菌最适生长温度37度培养,缩短编辑周期,且能在大部分大肠杆菌株系中工作,从而更加通用。在实际应用中,对于点突变或某些难编辑的靶点会出现许多假阳性,应称其为“逃逸子”,项目组升级了pEcCas为pEcCas-2.0,大幅改善了这种情况。

       在代谢工程应用中,常常涉及到多个靶点的改造,这时前述大肠杆菌CRISPR-Cas可能就不那么好用了,因为基因组被Cas9切断的多处双链断裂难以被有限的同源重组全部修复。为此,项目组通过挖掘一种新型CRISPR相关转座酶开发了多重基因组编辑工具,它不依赖同源重组,且与CRISPR-Cas类似也可编程。它能实现100%效率的大片段(15 kb)整合,插入位置和方向相对单一,且几乎没有PAM偏好性(而Cas9偏好NGG)。通过设计靶向大肠杆菌和柠檬塔特姆氏菌的多拷贝重复序列的单个crRNA或靶向大肠杆菌和需钠弧菌基因组中多个位点的CRISPR阵列,可以实现多拷贝染色体整合(multicopy chromosomal integration using CRISPR-associated transposases, MUCICAT)。

       MUCICAT无需施加选择压力,5天内就能获得携带4-10拷贝供体DNA的大肠杆菌菌株。在葡萄糖脱氢酶表达的案例中,使用MUCICAT在基因组整合6拷贝葡萄糖脱氢酶的细胞比pET质粒表达葡萄糖脱氢酶的细胞酶活力高2.6倍。通过替换MUCICAT系统中CRISPR相关转座酶相关基因的启动子由T7启动子改为脱水四环素诱导型启动子,可适配于所有大肠杆菌,不受限于T7 RNA聚合酶。截短转座酶右端识别序列消除了内部启动子活性,减少了供体DNA的渗漏表达。改进的MUCICAT系统可在大肠杆菌敲除副产物生成途径的同时整合1-11拷贝氨基葡萄糖途径基因表达簇,从而产生丰富多样的基因型。5拷贝氨基葡萄糖途径基因表达簇的整合菌株的氨基葡萄糖产量显著高于质粒表达版,进一步改造可达工业应用水平。

       此外,项目组还将两种CRISPR相关转座酶正交使用,实现在一个大肠杆菌细胞中,两种CRISPR相关转座酶将各自的货物基因插入至各自对应的5个和2个位点。正交MUCICAT应是工程细胞构建的强大工具,在合成生物学中的应用前景广阔。

       项目组还首次在两个学术上重要且与工业相关的革兰氏阳性菌枯草芽胞杆菌和谷氨酸棒杆菌中成功部署了CRISPR相关转座酶,在谷氨酸棒杆菌中可实现9.3 kb大片段整合,显示了其在多种细菌中的巨大潜力,并可进一步优化用于多重基因组编辑。

       项目组还在谷氨酸棒杆菌、枯草芽胞杆菌、解淀粉芽胞杆菌、需钠弧菌、解朊黄金杆菌、拜氏梭菌、乙醇梭菌、鼠乳杆菌、短小乳杆菌、植物乳杆菌、稻根根瘤菌、油菜假单胞菌、鲍曼不动杆菌、嗜黏蛋白阿克曼菌与工业酿酒酵母等工业、农业或医学相关重要微生物中建立或升级了基因组编辑系统。其中大部分微生物的编辑方法已发表,编辑质粒保藏在Addgene和Molecular Cloud共享。

      项目组的另一部分工作是对定向进化(诱变或驯化育种而非理性改造)而来的菌株进行重测序,分析其与亲本菌株的差异,找到引起表型变化(即获得高效催化性能)的关键突变,以基因组编辑工具加以验证,提出高产机制,进而设计新一代的工程菌株用于生物催化。

       项目组独立或在相关企业的支持下,测定了纤维素乙醇酵母、耐葡萄糖的阿拉伯糖发酵酵母、纤维素溶剂梭菌、高可溶表达需钠弧菌、腺苷肌苷鸟苷高产芽胞杆菌、L-缬氨酸高产大肠杆菌、L-精氨酸高产谷氨酸棒杆菌、β胡萝卜素高产解脂耶氏酵母、克拉维酸高产棒状链霉菌、谷氨酰胺转氨酶高产茂原链霉菌、蛋白质谷氨酰胺酶高产解朊金黄杆菌、头孢菌素C高产顶头孢霉等基因组序列,找到了一批高产靶点。

       项目组还从头设计了L-脯氨酸和L-精氨酸的谷氨酸棒杆菌等生产菌株。

       综上所述,项目组在国家杰出青年科学基金的资助下,具备了各种微生物的(快速)改造能力,摸清了我国发酵工业菌株的家底,学习了代表性菌株的诱变高产机制,将能指导工程菌株的进一步改良或从头设计。

CRISPR转座讲座视频

酶库

菌株质粒:

1、质粒请至金斯瑞Molecular Cloud查询,需菌株或贵校在美国制裁名单上(不能从美国公司获取),请下载“材料转移协议(学术版)”,补充相关内容后由法人单位(校办)签章,并将“材料转移协议”扫描件发送至info@cibt.ac.cn,我们即将相关质粒寄送给您。

2、若无法取得法人单位(校办)签章或公司需要使用,下载“材料转移协议(工业版)”,补充相关内容后将“材料转移协议”扫描件发送至info@cibt.ac.cn并按照协议中方式支付手续费,费用到账后我们即将相关质粒寄送给您。

招新启事

1. 硕博连读生:每两年三名含博士生。

建议重点高校本科生在大三暑期前早联系早实习早了解早决定早选择。

2. 外招博士生:我们微生物专业一般4-5位招生导师,每位导师从报考TA的初试考生中推出1名,竞争一个国科大外招博士生名额和两个华东理工大学联合培养博士生名额。如果导师因招硕博连读生(两年三名)用完当年国科大名额,考生只能竞争华东理工大学联合培养博士生名额(报考、考试、培养与待遇同国科大,唯学位为华东理工大学授予)。

3. 专业硕士生:每年一名,没想好是否读博的可以考虑。往年基本没啥竞争,推免生或上线统考生先到先得。

4. 特别研究助理/博士后:职责为完成高水平论文和/或开展企业合作项目。享受上海市落户绿色通道政策,年薪按单位标准,就高不就低。

5. 中国科技大学"所系结合”联合培养硕博连读生

  1)中国科技大学依托学院负责组织基地研究生招生,将基地介绍和招生专业纳入本学院招生简章和专业目录,统筹安排招生计划,组织复试录取工作,邀请基地专家参与招生选拔工作。
  2)基地研究生纳入中科大学籍管理。基地研究生第一学年在校本部完成基础课程学习,第二学年开始进入研究所开展科研训练。
  3)基地硕士研究生可申请转博,淘汰率约50%。 
  4)基地研究生学位申请和授予按照中国科大相关学科研究生学位授予标准执行。(博士毕业要求:a,科大为第一署名单位;b 独立一作或并列一作的前两位。独立一作文章的水平大概在3-5分的杂志,并列作者文章大概 Plant Cell及以上,硕士毕业要求:一篇第一作者文章(杂志不限)或专利)
  5)基地研究生在所系结合研究生导师指导下取得的科研成果,其知识产权原则上由我校和基地所在科研院所共享, 发表学术论文(著作)、申请专利、申报奖项等成果可署名双方 单位,用以申请学位的科研成果必须以“中国科学技术大学”为 第一署名(完成)单位。 
  6)所系结合研究生导师负责提供基地研究生在学期间的助研津贴,在基地学习期间的资助标准不低于基地所在科研院所研究生助研津贴标准。


毕业去向


学生/博后

毕业/出站时间

去向

现职

王晶茹

2004

中国科学院神经科学研究所

基石药业   Director

陈茂林

2004

青岛汉河动植物药业有限公司

青岛汉河动植物药业有限公司   总经理

张燕

2004

青岛市食品药品检验研究院

青岛市食品药品检验研究院   科研中心主任

苏流利

2005

中国科学院巴斯德研究所

帝肯公司   产品经理

范文超

2005

横店集团

浙江华睿生物技术有限公司 创始人

林欣

2005

中国科学院巴斯德研究所

药明生物抗体开发   助理主任

郑华宝

2007

德国马普煤炭研究所

浙江农林大学   教授

夏雨

2007

江南大学食品学院

江南大学食品学院   教授

王金刚

2008

美国乔治亚理工

上海邦林生物技术有限公司 创始人

杨俊杰

2010

中国科学院上海生命科学研究院

中国科学院分子植物科学卓越创新中心   副研究员

刘旭东

2011博后

上海莱士

上海莱士   资深专家

张仙

2011博后

美国莱斯大学

苏州百福安酶技术有限公司 CTO

朱丽

2011

上海来益生物药物研究开发中心

和度生物 副总裁

张大龙

2011

中国科学院天津工业生物技术研究所

杭州酶因生物技术有限公司 创始人

王帅

2011博后

中国科学院上海应用物理研究所

中国科学院上海应用物理研究所   副研究员

吴辉

2011博后

美国莱斯大学

大连理工大学   教授

柳鹏福

2011博后

浙江工业大学

浙江工业大学   助理研究员

李治林

2012博后

美国莱斯大学

-

孙周通

2012

新加坡南洋理工

中国科学院天津工业生物技术研究所   研究员

刁刘洋

2012博/2014博后

梅花生物

柯泰亚生物科技 联合创始人

李键

2012

芬美意中国研发中心

天境生物 总监

肖晗

2012

伊利诺伊大学厄巴纳香槟分校

上海交通大学   副研究员

唐玮

2012

金佰利

雅诗兰黛全球总部(纽约)消费者互动经理

赵蒙

2012

中国科学院计算生物学所

上海休整

徐舒

2013

长宁区财税局

道禾长期投资   投资经理

张凝

2015

睿智化学

基石药业 资深科学家

闻志强

2016博后

南京理工大学

南京食气生物 创始人

段春兰

2016

Selleck中国

Selleck中国 客户经理

徐晓庶

2017

斯坦福大学

斯坦福大学 博后

高书良

2017

上海生工

塔夫茨大学 博后

童阳阳

2017

浙江医药

南京纽邦生物科技有限公司   研发员

陈晓雪

2017

上海罗氏制药有限公司

上海恒瑞   高级医药信息顾问

曾哲

2017

荷兰瓦赫宁根大学食品微生物

达能 科学家

章美琴

2017

复旦大学上海医学院

上海市第九人民医院   博后

刘琦

2017

上海交通大学生命科学学院

上海交通大学生命科学学院   博后

任晓丹

2018

河南平顶山市高中

河南平顶山市高中   生物教师

王心

2018

河南工业大学

河南工业大学   讲师

杨海锋

2018

江苏省产业技术研究院

之江实验室 工程专员

江源

2018

德国海德堡大学

中国科学院上海营养与健康研究所

李琦

2019

四川师范大学

四川师范大学 副教授

刘金乐

2019

郑州大学

郑州大学   师资博士后

武美贤

2019

淮阴师范学院

淮阴师范学院   辅导员

刘映淼

2019博后

浙江华睿生物技术有限公司

浙江华睿生物技术有限公司 研发研究员

汪庆卓

2020

南京师范大学

南京中医药大学 讲师

孔杨杨

2020

上海志学文化传播有限公司

橙帆医药  科学家

孙兵兵

2021博后

中国科学院分子植物科学卓越创新中心

中国科学院分子植物科学卓越创新中心   助理研究员

张姣

2022

迪辅乐生物(上海) 

西北民族大学 讲师

张译文

2022

中国科学院天津工业生物技术研究所

中国科学院天津工业生物技术研究所   博后

吴联

2022

中国科学院有机化学研究所

中国科学院有机化学研究所   助理研究员

 


发表论文

     https://www.researchgate.net/profile/Sheng_Yang10

    1、Yuguo Niu, Xiaoming Hu, Yali Song, Cunchuan Wang, Peixiang Luo, Shihong Ni, Fuxin Jiao, Ju Qiu, Weihong Jiang, Sheng Yang, Jun Chen, Rui Huang, Haizhou Jiang, Shanghai Chen, Qiwei Zhai, Jia Xiao*, Feifan Guo*2024Blautia Coccoides is a Newly Identified Bacterium Increased by Leucine Deprivation and has a Novel Function in Improving Metabolic Disorders. Advanced Science. doi10.1002/advs.202309255

    2、Jiaqi Xu, Yijie Sun, Jianping Wu, Sheng Yang*, Lirong Yang* (2023) Chromosome Recombination and Modification by LoxP -mediated Evolution in Vibrio natriegens using CRISPR-associated Transposases. Biotechnology and Bioengineering. 121(3):1163-1172

    3、Jinzhong Tian†*, Wangshuying Deng†, Ziwen Zhang, Jiaqi Xu, Guiling Yang, Guoping Zhao, Sheng Yang, Weihong Jiang*, Yang Gu*(2023) Discovery and remodeling of Vibrio natriegens as a microbial platform for efficient formic acid biorefinery. Nature Communications. doi:10.1038/s41467-023-43631-2

    4、Ping Yang, Junjie Yang, Ting Lin, Qi Liu, Yu Yin, Daijie Chen, Sheng Yang* (2023) Efficient Genome Editing in Most Staphylococcus aureus by Using the Restriction-Modification Systems Silent CRISPR-Cas9 Toolkit. ACS Synthetic Biology .DOI: 10.1021/acssynbio.3c00339

    5、Jinle Liu, Junjie Yang, Lihua Yuan, Chunhua Wu, Yu Jiang, Wei Zhuang, Hanjie Ying, Sheng Yang* (2023) Modulated Arabinose Uptake and cAMP Signaling Synergistically Improve Glucose and Arabinose Consumption in Recombinant Yeast. J Agric Food Chem. DIO: 10.1021/acs.jafc.3c04386

    6、 Junbin He, Lian Wu, Wanqing Wei , Song Meng , Zhengtao Liu , Xuan Wu , Haixue Pan , Sheng Yang , Yong Liang*, Jiahai Zhou*, Gongli Tang* (2023)  Enzymatic catalysis favours eight-membered over five-membered ring closure in bicyclomycin biosynthesis. Nature Catalysis. DOI: 10.1038/s41929-023-00987-4

    7、Siqi Yang, Jiao Zhu, Xiaojie Zhou, Jiao Zhang, Qi Li, Furong Bian, Jidong Zhu, Ting Yan, Xiaoyu Wang, Ying Zhang, Junjie Yang, Yu Jiang, Sheng Yang*  (2023) RNA-guided DNA transposition in  Corynebacterium glutamicum and  Bacillus subtilis. ACS Synthetic Biology. DOI:10.1021/acssynbio.3c00193

    8、Yu Jiang#, Xiyuan Li#, Fenghui Qian, Bingbing Sun, Xiyuan Wang, Yan Zhang, Deqiang Zhang, Meiyu Geng,  Zuoquan Xie*, Sheng Yang* (2023) Fine-tuning Bacterial Cyclic di-AMP Production for Durable Antitumor Effects Through the Activation of the STING Pathway. Research . 6: 0102

    9、Ziyu Yang, Juanxiu Qin, Lina Zhao, Tianchi Chen, Qian Huang, Ying Jian, Qi Zhao, Sheng Yang, Qi Li, Qian Liu, Michael Otto*, Min Li* (2023) Host sorbitol and bacterial sorbitol utilization promote C. difficile infection in inflammatory bowel disease. Gastroenterology, doi: https://doi.org/10.1053/j.gastro.2023.02.046.

    10、Qi Li, Mingjun Sun, Lu Lv, Yong Zuo, Suyi Zhang, Ying Zhang, and Sheng Yang* (2023) Improving the Editing Efficiency of CRISPR-Cas9 by Reducing the Generation of Escapers Based on the Surviving Mechanism.  ACS Synthetic Biology. DOI: https://doi.org/10.1021/acssynbio.2c00619

    11、Zhiqiang Wen, Jun Chen, Yunliu Yang, Ying Zhang, Yu Jiang*, Sheng Yang* (2022) Pilot-scale fermentation of 300 t/a total solvents from sweet sorghum stalk juice. Chemical Engineering Journal. DOI:https://doi.org/10.1016/j.cej.2022.140534

    12、Yu Jiang#*, Bingbing Sun#, Fenghui Qian , Feng Dong, Chongmao Xu , Wuling Zhong, Rui Huang , Qiwei Zhai , Sheng Yang* (2022) Expression of phenylalanine ammonia lyase as an intracellularly free and extracellularly cell surface-immobilized enzyme on a gut microbe as a living therapeutic for phenylketonuria. SCIENCE CHINA Life Sciences. DOI: 10.1007/s11427-021-2137-3

    13、Wuling Zhong, Hui Wang, Yale Yang, Yali Zhang, Hejin Lai, Yalan Cheng, Huimin Yu, Ning Feng , Rui Huang, Shen Liu, Sheng Yang, Tongyang Hao, Baoyu Zhang, Hao Ying, Fang Zhang, Feifan Guo, Qiwei Zhai* (2022) High-protein diet prevents fat mass increase after dieting by counteracting Lactobacillus-enhanced lipid absorption. Nature Metabolism. 4:1713–1731

    14、Qingzhuo Wang#, Huabao Zheng#, Rongsheng Tao, Qi Li, Yu Jiang*, Sheng Yang* (2022) Vitreoscilla hemoglobin enhances the catalytic performance of industrial oxidases in vitro. Applied Microbiology and Biotechnology. DOI: 10.1007/s00253-022-11974-3

    15、Junjie Yang*#, Jiawei Yang#, Yiwen Zhang, Siqi Yang, Jieze Zhang, Yu Jiang, Sheng Yang* (2021) CRISPR-associated transposase system can insert multiple copies of donor DNA into the same target locus. The CRISPR Journal. 4(6):789-798

    16、Jiaqi Xu, Sheng Yang*, Lirong Yang* (2021) Vibrio natriegens as a host for rapid biotechnology. Trends in Biotechnology. DOI:10.1016/j.tibtech.2021.10.007

    17、Qi Li, Jieze Zhang, Junjie Yang, Yu Jiang, Sheng Yang* (2021) Recent progress on n-butanol production by lactic acid bacteria. World Journal of Microbiology and Biotechnology . 37:205

    18、Siqi Yang#, Yiwen Zhang#, Jiaqi Xu, Jiao Zhang, Jieze Zhang, Junjie Yang, Yu Jiang, Sheng Yang* (2021) Orthogonal CRISPR-associated transposases for parallel and multiplexed chromosomal integration. Nucleic Acids Research. DOI: 10.1093/nar/gkab752

    19、Yiwen Zhang, Jiawei Yang, Siqi Yang, Jieze Zhang,  Jun Chen,  Rongsheng Tao, Yu Jiang, Junjie Yang and Sheng Yang* (2021) Programming cells by multicopy chromosomal integration using CRISPR-associated transposases. The CRISPR Journal. 4(3):350-359

    20、Jiaqi Xu, Junjie Yang, Yu Jiang, Mianbin Wu*, Sheng Yang*, Lirong Yang (2021) A novel global transcriptional perturbation target identified by forward genetics reprograms Vibrio natriegens for improving recombinant protein production. Acta Biochim Biophys Sin. 53(9):1124–1130

    21、Tianqiong Shi, Yawen Li, Li Zhu, Yangyang Tong, Junjie Yang, Yunming Fang, Meng Wang, Jieze Zhang, Yu Jiang, Sheng Yang*(2021) Engineering the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica for β-farnesene overproduction. Biotechnology journal. DOI: 10.1002/biot.202100097

    22、Li Zhu, Jieze Zhang, Jiawei Yang, Yu Jiang, Sheng Yang*(2021) Strategies for optimizing acetyl-CoA formation from glucose in bacteria. Trends in Biotechnology. doi: 10.1016/j.tibtech.2021.04.004.

    23、Qi Li, Bingbing Sun, Jun Chen, Yiwen Zhang, Yu Jiang, Sheng Yang*(2021) A modified pCas/pTargetF system for CRISPR-Cas9-assisted genome editing in Escherichia coli. Acta Biochim Biophys Sin53(5):620-627.

    24、Xin Wang, Bei Liao, Zhijun Li, Guangxin Liu, Liuyang Diao, Fenghui Qian, Junjie Yang, Yu Jiang, Shumiao Zhao, Youguo Li, Sheng Yang*(2021) Reducing glucoamylase usage for commercial-scale ethanol production from starch using glucoamylase expressing Saccharomyces cerevisiae. Bioresources and Bioprocessing.8:20

    25、Jiaqi Xu, Feng Dong, Meixian Wu, Rongsheng Tao, Junjie Yang, Mianbin Wu, Yu Jiang*, Sheng Yang*, Lirong Yang*(2021) Vibrio natriegens as a pET compatible expression host complementary to Escherichia coli. Frontiers in Microbiology. doi:10.3389/fmicb.2021.627181.

    26、Bingbing Sun, Haiyan Liu , Yu Jiang, Lei Shao, Sheng Yang*, Daijie Chen*(2020) New Mutations Involved in Colistin Resistance in Acinetobacter baumannii. mSphere. 5(2):e00895-19

    27、Qi Li, Meixian Wu, Zhiqiang Wen, Yuan Jiang, Xin Wang, Yawei Zhao, Jinle Liu, Junjie Yang, Yu Jiang, Sheng Yang*(2020) Optimization of n‑butanol synthesis in Lactobacillus brevis via the functional expression of thl, hbd, crt and te.Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology. doi:10.1007/s10295-020-02331-2

    28、Xiaoman Sun, Zixu Zhang, Lingru Wang, Jinggang Wang, Yan Liang, Haifeng Yang, Rongsheng Tao, Yu Jiang, Junjie Yang, Sheng Yang* (2020) Downregulation of T7 RNA polymerase transcription enhances pET‐based recombinant protein production in Escherichia coli BL21 (DE3) by suppressing autolysis. Biotechnology and Bioengineering. doi: 10.1002/bit.27558

    29、Jiao Zhang, Fenghui Qian, Feng Dong, Qingzhuo Wang, Junjie Yang, Yu Jiang*, Sheng Yang* (2020) De Novo Engineering of Corynebacterium glutamicum for l-Proline Production. ACS Synth Biol. doi: 10.1021/acssynbio.0c00249

    30、Yiwen Zhang, Xiaoman Sun, Qingzhuo Wang, Jiaqi Xu, Feng Dong, Siqi Yang, Jiawei Yang, Zixu Zhang, Yuan Qian, Jun Chen, Jiao Zhang, Yingmiao Liu, Rongsheng Tao, Yu Jiang, Junjie Yang*, Sheng Yang* (2020) Multicopy chromosomal integration using CRISPR-associated transposases. ACS Synth Biol. doi: 10.1021/acssynbio.0c00073

    31、Jinle Liu, Yu Jiang, Jun Chen, Junjie Yang, Weihong Jiang, Wei Zhuang, Hanjie Ying, Sheng Yang* (2020) Metabolic engineering and adaptive evolution of Clostridium beijerinckii to increase solvents production from corn stover hydrolysate. J Agric Food Chem. doi: 10.1021/acs.jafc.0c03048

    32、Zhiqiang Wen, Qi Li, Jinle Liu, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) Consolidated bioprocessing for butanol production of cellulolytic Clostridia: development and optimization. Microb Biotechnol. 13(2):410-422

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