基本信息

杨晟  男  博导  中国科学院分子植物科学卓越创新中心 (中国科学院合成生物学重点实验室)

本科毕业于浙江大学化工系(1995)
博士毕业于中国科学院上海生物化学研究所(2000)
中国科学院上海生命科学研究院工作至今
联系方式:syang@sibs.ac.cn
微信公众号:合成生物催化剂工程




部门/实验室:植生生态所

课题组简况

新一代DNA测序与低成本DNA合成技术提供了海量基因资源与快速廉价的基因获取手段,为设计和创制理想的工程细胞提供了近乎无限的可能性。我们课题组的研究方向是开发微生物基因组编辑工具,用于更快地构建或重构细胞以理解其高效功能背后的遗传与生化机制,进而设计新一代的工程细胞,助力绿色化学与生物医药应用。

本组累计发表文章过百篇,近5年被他引超千次,2篇进入ESI高被引,基因组编辑工具质粒分发近2000次。与国内外上百家企业合作,纤维素乙醇酵母在巴西和美国投入商业应用,在燃料乙醇与氨基酸等领域取得显著经济效益。酶工程成果获上海市科技进步一等奖,孵化公司5家。组长杨晟研究员获DuPont Young Professor Award, Novozymes Innovation Award, 国务院政府特殊津贴及国家杰出青年科学基金。

本组现有研究、工程与支撑系列各1人;博士后1人;博士生3人;硕士生1人及10余位客座研发人员。拥有从微孔板到2吨罐的完备实验设施,人均面积高于同类实验室平均水平。

招新启事

1. 研究助理:副研究员、特别研究助理或实验师1名。硕士及以上。基本职责为维护实验室技术平台,指导研究生掌握分子生物学技术。高级职责为协助研究组长指导研究生、博士后和研究助理课题;协助撰写相关文章、项目申请书与结题报告的初稿。工资根据上海市同类职位从优执行,住房补贴工作满3年由研究所统一一次性发放。

2. 博士后:职责为完成高水平论文和/或开展企业合作项目。享受上海市落户绿色通道政策,年薪面议。

3. 博士生(如果因招硕博连读生用完当年名额就只能报考华东理工大学联合培养博士生名额)

4. 硕博连读生(每两年3名含博士生)

欢迎重点高校学业成绩排名前5%的本科生在大三下学期中提交简历,参加夏令营和暑期实验室实习,课题组每年从通过推免生面试的优秀学生中遴选。


毕业去向

学生/博后

毕业/出站时间

去向

现职

王晶茹

2004

中科院神经科学研究所

基石药业 资深临床科学家

陈茂林

2004

青岛汉河动植物药业有限公司

青岛汉河动植物药业有限公司 总经理

张燕

2004

青岛市食品药品检验研究院

青岛市食品药品检验研究院 科研中心主任

苏流利

2005

中科院巴斯德研究所

Eppendorf公司 产品技术支持经理

范文超

2005

横店集团

浙江华睿生物技术有限公司 总经理

林欣

2005

中科院巴斯德研究所

药明生物抗体开发 助理主任

夏雨

2007

江南大学食品学院

江南大学食品学院 副教授

郑华宝

2007

德国马普煤炭研究所

浙江农林大学 教授

王金刚

2008

美国乔治亚理工

浙江华睿生物技术有限公司 副总经理

杨俊杰

2010

留所

中科院分子植物科学中心 副研究员

刘旭东

2011博后

上海莱士

上海莱士 资深专家

张仙

2011博后

美国莱斯大学

上海合全药物研发有限公司 副主任高级研究员

朱丽

2011

上海来益生物药物研究开发中心

上海来益生物药物研究开发中心 研发研究员

张大龙

2011

中科院天津工生所

杭州贝颐药业有限公司 研发研究员

王帅

2011博后

中科院上海应用物理研究所

中科院上海应用物理研究所 副研究员

吴辉

2011博后

美国莱斯大学

华东理工大学 教授

柳鹏福

2011博后

浙江工业大学

浙江工业大学 助理研究员

孙周通

2012

新加坡南洋理工

中科院天津工生所 研究员

刁刘洋

2012

留所

缮思药业(苏州)有限公司 高级研发总监

李键

2012

芬美意中国研发中心

安进研发中心 研发研究员

肖晗

2012

伊利诺伊大学厄巴纳香槟分校

上海交通大学 副研究员

唐玮

2012

金佰利

雅诗兰黛全球总部(纽约)消费者互动经理

赵蒙

2012

中科院计算生物学所

美国求职中

徐舒

2013

长宁区财税局

复朴投资 投资经理

张凝

2015

睿智化学

安进研发中心 副研究员

闻志强

2016博后

南京理工大学

南京师范大学 副教授

段春兰

2016

Selleck中国

Selleck中国 客户经理

徐晓庶

2017

斯坦福大学

斯坦福大学 博后

高书良

2017

上海生工

浙江华睿生物技术有限公司 研发总监

童阳阳

2017

浙江医药

枫杨生物研发公司 研发员

陈晓雪

2017

上海罗氏制药有限公司

上海罗氏制药有限公司 高级医药信息顾问

曾哲

2017

荷兰瓦赫宁根大学食品微生物

荷兰瓦赫宁根大学食品微生物 博士在读

章美琴

2017

复旦大学上海医学院

复旦大学上海医学院 博士在读

刘琦

2017

上海交通大学生命科学学院

上海交通大学生命科学学院 博士在读

任晓丹

2018

河南平顶山市高中

河南平顶山市高中 生物老师

王心

2018

河南工业大学

河南工业大学 讲师

杨海锋

2018

江苏省产业技术研究院

浙江华睿生物技术有限公司 研发研究员

江源

2018

德国

德国求职中

李琦

2019

四川师范大学

四川师范大学 讲师

刘金乐

2019

郑州大学

郑州大学 师资博士后

武美贤

2019

淮阴师范学院

淮阴师范学院 辅导员

汪庆卓

2020

南京师范大学

南京师范大学 师资博士后

孔杨杨

2020

上海某公司

上海某公司 管培生


发表论文

     https://www.researchgate.net/profile/Sheng_Yang10

    1、Jiao Zhang, Fenghui Qian, Feng Dong, Qingzhuo Wang, Junjie Yang, Yu Jiang*, Sheng Yang* (2020) De Novo Engineering of Corynebacterium glutamicum for l-Proline Production. ACS Synth Biol. doi: 10.1021/acssynbio.0c00249

    2、Yiwen Zhang, Xiaoman Sun, Qingzhuo Wang, Jiaqi Xu, Feng Dong, Siqi Yang, Jiawei Yang, Zixu Zhang, Yuan Qian, Jun Chen, Jiao Zhang, Yingmiao Liu, Rongsheng Tao, Yu Jiang, Junjie Yang*, Sheng Yang* (2020) Multicopy chromosomal integration using CRISPR-associated transposases. ACS Synth Biol. doi: 10.1021/acssynbio.0c00073

    3、Jinle Liu, Yu Jiang, Jun Chen, Junjie Yang, Weihong Jiang, Wei Zhuang, Hanjie Ying, Sheng Yang* (2020) Metabolic engineering and adaptive evolution of Clostridium beijerinckii to increase solvents production from corn stover hydrolysate. J Agric Food Chem. doi: 10.1021/acs.jafc.0c03048

    4、Zhiqiang Wen, Qi Li, Jinle Liu, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) Consolidated bioprocessing for butanol production of cellulolytic Clostridia: development and optimization. Microb Biotechnol. 13(2):410-422

    5、Zhiqiang Wen, Minrui Lu, Rodrigo Ledesma-Amaro, Qi Li, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) TargeTron Technology Applicable in Solventogenic Clostridia: Revisiting 12 Years' Advances. Biotechnology journal. 15(1):e1900284

    6、Zhiqiang Wen, Rodrigo Ledesma-Amaro, Minrui Lu, Yu Jiang, Shuliang Gao, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) Combined evolutionary engineering and genetic manipulation improve low pH tolerance and butanol production in a synthetic microbial Clostridium community. Biotechnology and Bioengineering. Doi: 10.1002/bit.27333

    7、Zhiqiang Wen, Rodrigo Ledesma-Amaro, Minrui Lu, Mingjie Jin*, Sheng Yang* (2020) Metabolic Engineering of Clostridium cellulovorans to Improve Butanol Production by Consolidated Bioprocessing. ACS synthetic biology.Doi: 10.1021/acssynbio.9b00331

    8、Qi Li, Francois M. Seys, Nigel P. Minton, Junjie Yang, Yu Jiang, Weihong Jiang, Sheng Yang*(2019)CRISPR-Cas9(D10A) nickase-assisted base editing in solvent producer Clostridium beijerinckii. Biotechnol Bioeng. Doi: 10.1002/bit.26949

    9、He Huang, Xin Song, Sheng Yang*2019 Development of a RecE/T-Assisted CRISPR-Cas9 Toolbox for Lactobacillus. Biotechnology journal. doi: 10.1002/biot.201800690.

    10、Zhiqiang Wen, Ledesma-Amaro, Rodrigo; Jianping Lin*, Yu Jiang, Sheng Yang*(2019)Improved n-butanol production from Clostridium cellulovorans by integrated metabolic and evolutionary engineering. Appl Environ Microbiol. Doi: 10.1128/AEM.02560-18

    11、Xinyun Jing, Bingran Xie, Longxian Chen, Niubing Zhang, Yiyi Jiang, Hang Qin, Hongbing Wang, Pei Hao*, Sheng Yang* , Xuan Li*(2018)Implementation of the CRISPR-Cas13a system in fission yeast and its repurposing for precise RNA editing. Nucleic Acids Res. Doi :10.1093/nar/gky433

    12、Bingbing Sun, Junjie Yang, Sheng Yang*, Richard D. Ye*, Daijie Chen,*; Yu Jiang*(2018)A CRISPR-Cpf1-Assisted Non-Homologous End Joining Genome Editing System of Mycobacterium smegmatis. Biotechnology journal . 13 (9) :1700588

    13、Xin Wang, Junjie Yang, Sheng Yang*, Yu Jiang*(2018)Unraveling the genetic basis of fast L-arabinose consumption on top of recombinant xylose-fermenting Saccharomyces cerevisiae. Biotechnol Bioeng. Doi:10.1002/bit.26827

    14、Jun Sun, Qingzhuo Wang, Yu Jiang, Zhiqiang Wen, Lirong Yang, Jianping Wu* and Sheng Yang*(2018)Genome editing and transcriptional repression in Pseudomonas putida KT2440 via the type II CRISPR system. Microb Cell Fact. 17:41

    15、Xin Song, He Huang, Zhi-Qiang Xiong, Lianzhong Ai*, Sheng Yang* (2017) CRISPR-Cas9D10A Nickase-Assisted Genome Editing in Lactobacillus casei. Appl. Environ. Microbiol. doi: 10.1128/AEM.01259-17

    16、Qi Liu, Yu Jiang, Lei Shao, Ping Yang, Bingbing Sun,Sheng Yang*, and Daijie Chen* (2017) CRISPR/Cas9-based efficient genome editing in Staphylococcus aureus. Acta Biochim Biophys Sin. doi: 10.1093/abbs/gmx074

    17、Xiaoshu Xu, Chao Wang, Jun Chen, and Sheng Yang* (2017)Streptomyces virginiae PPDC is a new type of phenylpyruvate decarboxylase composed of two subunits. ACS Chemical Biology 2017; doi:10.1021/acschembio.7b00307

    18、Yu Jiang, Fenghui Qian, Junjie Yang, Yingmiao Liu, Feng Dong, Chongmao Xu, Bingbing Sun, Biao Chen, Xiaoshu Xu, Yan Li, Renxiao Wang, Sheng Yang* (2017) CRISPR-Cpf1 -assisted genome editing of Corynebacterium glutamicum. Nature Communications.doi:10.1038/ncomms15179 ESI高被引

    19、Shuliang Gao, Yangyang Tong, Li Zhu, Ge Mei, Zhang Yian, Daijie Chen, Yu Jiang, Sheng Yang* (2017) Iterative integration of multiple-copy pathway genes in Yarrowia lipolytica for heterologous β-carotene production. Metabolic Engineering. 41:192-201

    20、Zhiqiang Wen, Nigel P. Minton, Ying Zhang, Qi Li, Jinle Liu, c, Yu Jiang, Sheng Yang*(2017)Enhanced solvent production by metabolic engineering of a twin-clostridial consortium. Metabolic Engineering.39:38-48

    21、Junjie Yang and Sheng Yang* (2016)Comparative analysis of Corynebacterium glutamicum genomes: a new perspective for the industrial production of amino acids. BMC Genomics . 18(1):940

    22、Yu Jiang, Rongsheng Tao, Zhengquan Shen, Liangdong Sun, Fuyun Zhu, Sheng Yang*(2016)Enzymatic Production of Glutathione by Bifunctional γ-Glutamylcysteine Synthetase/Glutathione Synthetase Coupled with In Vitro Acetate Kinase-Based ATP Generation. Appl Biochem Biotechnol.180(7) 1446-1455

    23、Shuliang Gao, Yangyang Tong, Zhiqiang Wen, Li Zhu, Mei Ge, Daijie Chen*, Yu Jiang*, Sheng Yang* (2016) Multiplex gene editing of the Yarrowia lipolytica genome using the CRISPR-Cas9 system. Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology . 43(8)1085–1093

    24、Yu Jiang Rongsheng Tao , Sheng Yang* (2016) Tailor-made biocatalysts enzymes for the fine chemical industry in China. Biotechnol Journal. 11,1121–1123

    25、Qi Li, Jun Chen, Nigel P. Minton, Ying Zhang, Zhiqiang Wen, Jinle Liu, Haifeng Yang, Zhe Zeng, Xiaodan Ren, Junjie Yang, Yang Gu, Weihong Jiang, Yu Jiang, Sheng Yang* (2016) CRISPR-based genome editing and expression control systems in Clostridium acetobutylicum and Clostridium beijerinckii. Biotechnology Journal. 11(7):961-72

    26、Chen Yang, Xiang Gao, Yu Jiang, Bingbing Sun, Fang Gao, Sheng Yang*(2016)Synergy between methylerythritol phosphate pathway and mevalonate pathway for isoprene production in Escherichia coli. Metabolic Engineering, 2016, 37:79–91

    27、Xiaoshu Xu, Jun Chen, Qingzhuo Wang, Chunlan Duan, Yan Li, Renxiao Wang,Sheng Yang*(2016) Mutagenesis of Key Residues in the Binding Center of l-Aspartate-b-Semialdehyde Dehydrogenase from Escherichia coli Enhances Utilization of the Cofactor NAD(H), ChemBioChem.17:56-64

    28、Yu Jiang, Biao Chen, Chunlan Duan, Bingbing Sun, Junjie Yang, and Sheng Yang* (2015)Multigene Editing in the Escherichia coli Genome via the CRISPR-Cas9 System. Appl. Environ. Microbiol. 81:2506-14  ESI高被引

    29、Ning Zhang, Lijun Shao, Yu Jiang, Yang Gu, Qi Li, Jinle Liu, Weihong Jiang, Sheng Yang* (2015) I-SceI-mediated scarless gene modification via allelic exchange in Clostridium. Journal Microbial Methods. 108:49-60

    30、Yu Jiang, Jinle Liu, Yunliu Yang, Weihong Jiang, Sheng Yang* (2014) Current status and prospects of industrial bio-production of n-butanol in China, Biotechnology Advances. 33:1493-1501

    31、Junjie Yang, Bingbing Sun, He Huang, Yu Jiang, Liuyang Diao, Biao Chen, Chongmao Xua,Xin Wang, Jinle Liu, Weihong Jiang, Sheng Yang* (2014) High-efficiency Scarless Genetic Modification in Escherichia coli Using lambda-Red Recombination and I-SceI Cleavage. Appl. Environ. Microbiol. 80(13):3826-34

    32、Rongsheng Tao, Yu Jiang, Fuyun Zhu, Sheng Yang* (2014) A one-pot system for production ofL-2-aminobutyric acid from L-threonine by L-threonine deaminase and a NADH regeneration system based on L-leucine dehydrogenase and formate dehydrogenase. Biotechnology Letters 36(4):835-41

    33、Liuyang Diao, Yingmiao Liu, Fenghui Qian, Junjie Yang, Yu Jiang, Sheng Yang* (2013)Construction of fast xylose-fermenting yeast based on industrial ethanol-producing diploid Saccharomyces cerevisiaeby rational design and adaptive evolution. BMC Biotechnology 13:110

    34、Zhilin Li, Han Xiao, Weihong Jiang, Yu Jiang*, Sheng Yang* (2013) Improvement of butanol production from xylose mother liquor by engineering xylose metabolic pathway in Clostridium acetobutylicum EA 2018. Applied Biochemistry and Biotechnology. 171(3):555-68

    35、Han Xiao, Zhilin Li, Yu Jiang, Yunliu Yang, Weihong Jiang, Yang Gu*, Sheng Yang* (2012) Metabolic engineering of D-xylose pathway in Clostridium beijerinckii to optimize solvent production from xylose mother liquid. Metabolic Engineering 14: 565-578

    36、Han Xiao, Yang Gu, Yuanyuan Ning, Yunliu Yang, W.J. Mitchell, Weihong Jiang*, Sheng Yang* (2011) Confirmation and elimination of xylose-metabolic bottlenecks in glucose-PTS-deficient Clostridium acetobutylicum to realize simultaneous utilization of glucose, xylose and arabinose. Appl. Environ. Microbiol 77:7886-7895

    37、Zhoutong Sun, Yuanyuan Ning, Lixia Liu, Yingmiao Liu, Bingbing Sun, Weihong Jiang, Chen Yang and Sheng Yang* (2011) Metabolic engineering of the L-phenylalanine pathway in Escherichia coli for the production of S- or R-mandelic acid. Microbial Cell Factories. 10:71 Highly Accessed

    38、Li Zhu, Rongsheng Tao, Yi Wang, Yu Jiang, Xin Lin, Yunliu Yang, Huabao Zheng, Weihong Jiang, Sheng Yang* (2011) Removal of L-alanine from the production of L-2-aminobutyric acid by introduction of alanine racemase and D-amino acid oxidase. Appl Microbiol Biotechnol. 90:903-910

    39、Jian LI, Jingbo ZHAO, Meng ZHAO, Yunliu YANG, Weihong JIANG, Sheng YANG* (2010)Screening and Characterization of Butanol Tolerant Microorganisms. Letters in Applied Microbiology 50: 373-9

    40、Yu JIANG, Chongmao XU, Feng DONG, Yunliu YANG, Weihong JIANG*, Sheng YANG* (2009) Disruption of the acetoacetate decarboxylase gene in solvent-producing Clostridium acetobutylicum increases the butanol ratio. Metabolic Engineering 11: 284-91

    41、Junjie YANG, Weihong JIANG, Sheng YANG* (2009). mazF as a counter-selectable marker for unmarked genetic modification of Pichia pastoris. FEMS Yeast Research. 9(4): 600-9

    42、Hong YU, Jian LI, Dalong ZHANG, Yunliu YANG, Weihong JIANG, Sheng YANG* (2009). Improving the thermostability of N-carbamyl-D-amino acid amidohydrolase by error-prone PCR. Appl. Microbiol. Biotechnol. 82(2): 279-85

    43、Lijun SHAO, Shiyuan HU, Yi YANG, Yang GU, Jun CHEN, Yunliu YANG, Weihong JIANG*, Sheng YANG* (2007) Targeted gene disruption by use of a group II intron (targetron) vector in Clostridium acetobutylicum. Cell Research. 17: 963-5