基本信息

徐伟 男 硕导 中国科学院昆明植物研究所
办公电话: 0871-65215722
电子邮件: xuwei@mail.kib.ac.cn
通信地址: 云南省昆明市盘龙区蓝黑路132号中国科学院昆明植物研究所
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通信地址: 云南省昆明市盘龙区蓝黑路132号中国科学院昆明植物研究所
邮政编码: 650201
研究领域
主要研究方向为植物种子发育的表观调控以及适应性进化,集中开展以下两个方面的研究:
1)种子发育与表观调控:围绕种子生物学重要科学问题,如种子发育、休眠、萌发、胚乳发育、种子大小以及储藏物质生物合成,通过分子生物、功能基因组学和表观遗传学,鉴别种子农艺形状发生的关键功能基因和调控网络;重点解析基因组印迹、DNA甲基化、组蛋白修饰以及非编码RNAs对种子发育和储藏物质累积的调控。同时,结合高通量测序和GWAS分析,解析种子重要性状发生的分子基础。
2)植物表型变异与适应性的遗传与表观调控研究:植物作为固着生长的生物,在长期的进化中已经形成了多样的分子机制来适应环境,表现出很强的表型可塑性,但对于植物表型变异的调控机理以及植物如何适应不断变化的环境还不清楚。蓖麻是世界上重要的特种油料作物之一,其基因组小(330 Mb),表型变异特别丰富(从一棵多年生的树到单年生的作物)且具有广泛的分布和适应性(在世界热带和亚热带地区均有分布),是研究表型变异和适应性的理想材料。研究重点利用自然群体的GWAS分析,解析蓖麻表型变异的遗传基础,同时结合表观遗传学(主要是DNA甲基化),解析蓖麻适应性形成的分子基础,特别是表观记忆(或者胁迫记忆)的形成和隔代遗传。
招生信息
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
招生方向
种子和胚乳发育植物表观遗传学种子储藏物质生物合成的调控研究
教育背景
2013-09--2016-12 云南大学与中科院昆明植物研究所联合培养 理学博士学位2009-09--2012-07 扬州大学 理学硕士学位2005-09--2009-07 河北师范大学 学士学位
学历
博士研究生
学位
理学博士
专利与奖励
奖励信息
(1) 蓖麻胚乳油脂累积的生理与分子基础研究, 二等奖, 省级, 2019
专利成果
( 1 ) 一种植物基因组差异甲基化区域的检测方法, 发明, 2020, 第 5 作者, 专利号: ZL 2018 1 1561956.3
出版信息
发表论文
(1) Changes and Associations of Genomic Transcription and Histone Methylation with Salt Stress in Castor Bean, Plant and Cell Physiology, 2020, 第 2 作者(2) Genomic analysis reveals rich genetic variation and potential targets of selection during domestication of castor bean from perennial woody tree to annual semi-woody crop, Plant Direct, 2019, 第 1 作者(3) Differential expression networks and inheritance patterns of long non-coding RNAs in castor bean seeds, The Plant Journal, 2018, 第 1 作者(4) Transcriptome analysis reveals crucial genes involved inthe biosynthesis of nervonic acid in woody Malania oleifera oilseeds, BMC Plant Biology, 2018, 通讯作者(5) Gene structure, expression pattern and interaction of Nuclear Factor-Y family in castor bean (Ricinus communis), Planta, 2018, 其他(合作组作者)(6) Genomic DNA Methylation Analyses Reveal the Distinct Profiles in Castor Bean Seeds with Persistent Endosperms, Plant Physiology, 2016, 第 1 作者(7) Genome-Wide Identification, Evolutionary Analysis, and Stress Responses of the GRAS Gene Family in Castor Beans, International Journal of Molecular Science, 2016, 第 1 作者(8) Genomic imprinting, methylation and parent-of-origin effects in reciprocal hybrid endosperm of castor bean, Nucleic Acids Research, 2014, 第 1 作者(9) Genome-wide survey and expression profiles of the AP2/ERF family in castor bean (Ricinus communis L.), BMC Genomics, 2013, 第 1 作者(10) Transcriptome-wide identification and characterization of microRNAs from castor bean (Ricinus communis L.), PLoS One, 2013, 第 1 作者(11) Influences of harvesting on genetic diversity and population structure of Anemone altaica (Ranunculaceae), a traditional Chinese medicinal herb, Biochemical Systematics & Ecology, 2013, 第 1 作者(12) Development of EST-SSR markers and investigation of genetic relatedness in Tung tree, Tree genetics & genomes, 2012, 第 1 作者(13) Microsatellite makers development in Tung trees (Vernicia montana and V. fordii, Euphorbiaceae), American Journal of Botany, 2011, 第 1 作者
发表著作
(1) The castor bean genome-10 Chapter: Epigenetic Regulation in Castor Bean Seeds DNA Methylation and Genomic Imprinting in Castor Bean, Springer International Publishing, 2019-03, 第 1 作者
科研活动
科研项目
( 1 ) 蓖麻栽培驯化和表型变异的遗传和表观调控研究, 主持, 市地级, 2019-03--2023-03( 2 ) 长链非编码RNAs在蓖麻胚 乳发育过程 中的表达网 络及其表观调控研究, 主持, 国家级, 2018-01--2020-12( 3 ) 蓖麻种子发育与储藏油脂累积的分子机制研究, 主持, 省级, 2018-01--2019-12( 4 ) 蓖麻从多年生木本到一年生油料作物栽培驯化过程中的遗传变异研究与种质资源 发掘, 参与, 国家级, 2017-01--2021-12( 5 ) 蓖麻起源、进化以及种子发育调控研究, 主持, 部委级, 2020-01--2023-12( 6 ) 蓖麻胚乳基因组印迹对储藏物质代谢的调控及其发生的分子机理研究, 主持, 国家级, 2020-01--2023-12
参与会议
(1)蓖麻种子基因组印迹、DNA甲基化与长链非编码RNAs 第五届全国计算生物学与生物信息学学术会议 2018-04-21