基本信息
吴东东  男  博导  中国科学院昆明动物研究所
电子邮件: wudongdong@mail.kiz.ac.cn
通信地址: 昆明市教场东路32号
邮政编码: 650223

研究领域

1. 人类和灵长类神经系统进化、发育和衰老遗传机制
利用研究所灵长类动物模型资源,借助各种组学技术(包括基因组、转录组、代谢组、脂质组等),整合分子进化学、系统生物学、生物信息学等分析手段,通过多学科交叉,立体解析包括非编码转录元件和调控元件、新基因、RNA编辑和RNA甲基化等在进化,发育和疾病发生,尤其是神经系统进化、发育和衰老等过程中的作用机制。

2. 动物进化与医学
基于基因组学和转录组数据,利用各种生物信息学方法并结合功能生物学实验,研究动物复杂性状进化的遗传基础及其在医学中的启示意义。


招生信息

博士

硕士

招生专业
071007-遗传学
071022-基因组学
071021-生物信息学
招生方向
分子进化,基因组进化
基因组进化
计算比较基因组学

教育背景

2006-09--2011-01   中国科学院昆明动物研究所   博士
2002-09--2006-07   复旦大学,生命科学学院   学士
学历

博士研究生

学位
博士

工作经历

2016-01~现在,中国科学院昆明动物研究所, 研究员,PI

2011-01~2016-01,中国科学院昆明动物研究所, 副研究员

2006-09~2011-01,中国科学院昆明动物研究所, 博士
2002-09~2006-07,复旦大学,生命科学学院, 学士


工作简历
2017-01~现在, 中国科学院昆明动物研究所, 研究员
2011-01~2016-12,中国科学院昆明动物研究所, 副研究员
社会兼职
   

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 基因组多样性与亚洲人群的演化, 二等奖, 国家级, 2015
(2) 卢嘉锡人才奖, , 部委级, 2014
(3) 基因组多样性与亚洲人群的演化, 特等奖, 省级, 2013
(4) 动物适应性进化的分子机制, 一等奖, 省级, 2013
(5) 中国科学院优秀博士论文, , 院级, 2012

出版信息

   
发表论文
(1) Rapid Evolution of Genes Involved in Learning and Energy Metabolism for Domestication of the Laboratory Rat., Molecular Biology and Evolution, 2017, 通讯作者
(2) Hypoxia potentially promotes Tibetan longevity., Cell Research., 2017, 通讯作者
(3) An Evolutionary Genomic Perspective on the Breeding of Dwarf Chickens., Molecular Biology and Evolution, 2017, 通讯作者
(4) Out of Southern East Asia of the Brown Rat Revealed by Large-Scale Genome Sequencing., Molecular Biology and Evolution, 2017, 通讯作者
(5) Draft genome of the gayal,Bos frontalis., GIGAScience, 2017, 通讯作者
(6) Origin of new genes after zygotic genome activation in vertebrate., Journal of Molecular Cell Biology, 2017, 通讯作者
(7) The RNA editome of Macaca mulatta and functional characterization of RNA editing in mitochondria., Science Bulletin, 2017, 通讯作者
(8) Annotating long intergenic non-coding RNAs under artificial selection during chicken domestication., BMC Evol Biol, 2017, 通讯作者
(9) Population variation reveals independent selection towards small body size in Chinese Debao pony., Genome Biology and Evolution, 2016, 通讯作者
(10) Positive selection rather than relaxation of functional constraint drives the evolution of vision during chicken domestication., Cell Research, 2016, 通讯作者
(11) Olfactory genes in Tibetan wild boar, Nature Genetics, 2016, 通讯作者
(12) Transcriptome profiles using next generation sequencing reveal liver changes in the early stage of diabetes in tree shrew (Tupaia belangeri chinensis)., Journal of Diabetes Research, 2016, 通讯作者
(13) Cellular responses to HSV-1 infection are linked to specific types of alterations in the host transcriptome., Scientific Reports, 2016, 通讯作者
(14) Comparative population genomics reveal genetic basis underlying body size of domestic chickens, Journal of Molecular Cell Biology, 2016, 通讯作者
(15) A molecular genome scan to identify DNA segments associated with live weight in Japanese quail., Mol Biol Rep, 2016, 通讯作者
(16) Genomic Analyses Reveal Potential Independent Adaptation to High Altitude in Tibetan Chickens., Molecular Biology and Evolution, 2015, 通讯作者
(17) Recent Positive Selection Drives the Expansion of a Schizophrenia Risk Nonsynonymous Variant at SLC39A8 in Europeans., Schizophrenia Bulletin, 2015, 第 2 作者
(18) Integrative analysis of young genes, positively selected genes and lncRNAs in the development of Drosophila melanogaster., BMC Evol Biol, 2015, 通讯作者
(19) Domestication of the dog from the wolf was promoted by enhanced excitatory synaptic plasticity: a hypothesis., Genome Biol Evol, 2014, 通讯作者
(20) Out of pollen hypothesis for origin of new genes in flowering plants: study from Arabidopsis thaliana., Genome Biol Evol, 2014, 第 1 作者
(21) Molecular evolution in the CREB1 signal pathway and a rare haplotype in CREB1 with genetic predisposition to schizophrenia., J Psychiatr Res., 2014, 第 2 作者
(22) Population variation revealed high-altitude adaptation of tibetan mastiffs., Molecular Biology and Evolution, 2014, 通讯作者
(23) Artificial Selection on Brain-Expressed Genes during the Domestication of Dog., Molecular Biology and Evolution, 2013, 通讯作者
(24) Evidence of recent natural selection on the Southeast Asian deletion (--(SEA)) causing α-thalassemia in South China., BMC Evolutionary Biology , 2013, 第 2 作者
(25) Evolution and function of de novo originated genes, Molecular Phylogenetics and Evolution, 2013, 第 1 作者
(26) Rapid Evolution of the Mammalian HILS1 Gene and the Nuclear Condensation Process during Mammalian Spermiogenesis, Journal of Genetics and Genomics , 2013, 通讯作者
(27) Positive selection on the osteoarthritis-risk and decreased-height associated variants at the GDF5 gene in East Asians, PLoS one, 2012, 第 1 作者
(28) Positive selection on the gene RNASEL: correlation between patterns of evolution and function., Molecular Biology and Evolution , 2012, 通讯作者
(29) The origin and evolution of variable number tandem repeat of CLEC4M gene in the global human population., PLoS one , 2012, 第 3 作者
(30) De novo origin of human protein-coding genes, PLoS Genetics, 2011, 第 1 作者
(31) Multi-locus analysis reveals a different pattern of genetic diversity for mitochondrial and nuclear DNA between wild and domestic pigs in East Asia, PLoS one , 2011, 第 2 作者
(32) Eukaryotic origin of a metabolic pathway in virus by horizontal gene transfer, Genomics, 2011, 第 1 作者
(33) Correlated evolution among six gene families in Drosophila revealed by parallel change of gene numbers., Genome Biology and Evolution, 2011, 第 1 作者
(34) Different level of population differentiation among human genes, BMC Evolutionary Biology , 2011, 第 1 作者
(35) Evidence for positive selection on the Osteogenin (BMP3) gene in human populations., PLoS one, 2010, 第 1 作者
(36) Positive selection drives population differentiation in the skeletal genes in modern humans, Human Molecular Genetics, 2010, 第 1 作者
(37) Association of disease-predisposition polymorphisms of the melatonin receptors and sunshine duration in the global human populations., Journal of Pineal Research, 2010, 第 3 作者
(38) A profound role for the expansion of trypsin-like serine protease family in the evolution of hematophagy in mosquito., Molecular Biology and Evolution, 2009, 第 1 作者
(39) Molecular evolution of the keratin associated protein gene family in mammals, role in the evolution of mammalian hair. , BMC Evolutionary Biology , 2008, 第 1 作者
(40) Intriguing balancing selection on the intron 5 region of LMBR1 in human population., PLoS one , 2008, 第 2 作者
(41) Positive Darwinian selection in human population: a review, Chinese Science Bulletin, 2008, 第 1 作者
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 利用从头合成起源新基因研究基因网络的起源与适应性进化, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
( 2 ) 中国科学院青促会专项基金, 主持, 部委级, 2013-01--2016-12
( 3 ) 老年痴呆症研究团队, 参与, 部委级, 2013-01--2016-12
( 4 ) 家鸡驯化过程中相互作用座位所受人工选择作用, 主持, 国家级, 2014-01--2016-12
( 5 ) 我国重要家养动植物在人工选择下进化的遗传和基因组机制——子课题, 主持, 国家级, 2015-01--2017-08
( 6 ) 西部之光重点项目, 主持, 部委级, 2016-01--2018-12
( 7 ) 应用基础研究重点-云南地区家鸡群体基因组学与人工选择作用分析, 主持, 省级, 2015-07--2018-06
( 8 ) 中科院昆明动物所“青年科学家小组”启动经费, 主持, 部委级, 2016-01--2018-12
( 9 ) 青藏高原家养动物适应性状的解析, 主持, 部委级, 2014-07--2019-06
( 10 ) 年轻新起源lincRNA基因在人类神经系统中的进化和功能研究, 主持, 国家级, 2017-01--2020-12
( 11 ) 多组学视角下家犬行为微进化的基因相互作用机制, 主持, 国家级, 2018-01--2020-12
参与会议
   

指导学生

已指导学生

王明山  博士研究生  071007-遗传学  

现指导学生

任小蝶   硕士研究生  071007-遗传学  

李明莉  博士研究生  071007-遗传学