基本信息
钱文峰  男  博导  中国科学院遗传与发育生物学研究所
电子邮件: wfqian@genetics.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院2号,遗传发育所,2号楼114室
邮政编码: 100101

研究领域

单细胞遗传学
定量功能基因组学
系统生物学

招生信息

   
招生专业
071021-生物信息学
071007-遗传学
071023-计算生物学
招生方向
单细胞遗传学
生物信息学
系统生物学

教育背景

2006-09--2012-08   美国密歇根大学   博士
2002-09--2006-07   北京大学   本科

工作经历

2012年12月起,在遗传与发育生物学研究所任研究员。入选中组部“青年千人计划”计划。

教授课程

群体遗传与分子进化
生物统计学与实验设计
分子遗传学
基因组学和生物信息学前沿系列讲座
遗传发育学系列讲座
Biostatistics

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 国际分子进化学会Walter Fitch Award Finalist, , 其他, 2012
(2) 国家自费留学生奖学金, 特等奖, 其他, 2012

出版信息

   
发表论文
(1) HeteroMeth: A Database of Cell-to-cell Heterogeneity in DNA Methylation, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2018, 通讯作者
(2) Reduced intrinsic DNA curvature leads to increased mutation rate, Genome Biology, 2018, 通讯作者
(3) Independent regulation of gene expression level and noise by histone modifications, PLoS Comput Biol, 2017, 通讯作者
(4) Trans-splicing enhances translational efficiency in C. elegans, Genome Res, 2017, 通讯作者
(5) Codon-resolution analysis reveals a direct and context-dependent impact of individual synonymous mutations on mRNA level, Mol Biol Evol, 2017, 通讯作者
(6) Single-cell transcriptome analysis reveals widespread monoallelic gene expression in individual rice mesophyll cells, Sci Bull, 2017, 通讯作者
(7) Genetic interaction network as an important determinant of gene order in genome evolution, Mol Biol Evol, 2017, 通讯作者
(8) Genomic evidence for adaptation by gene duplication, Genome Research, 2014, 第 1 作者
(9) Optimization of eukaryotic translational efficiency by balanced codon usage, PLoS Genetics, 2012, 第 1 作者
(10) Genome-wide quantification of antagonistic pleiotropy in yeast, Cell Reports, 2012, 第 1 作者
(11) Genomic evidence for elevated mutation rates in highly expressed genes, EMBO Reports, 2012, 第 2 作者
(12) Measuring the evolutionary rate of protein-protein interaction, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2011, 第 1 作者
(13) Prevalent positive epistasis in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae metabolic networks, Nature Genetics, 2010, 第 1 作者
(14) Maintenance of duplicate genes and their functional redundancy by reduced expression, Trends in Genetics, 2010, 第 1 作者
(15) Protein subcellular relocalization in the evolution of yeast singleton and duplicate genes, Genome Biology and Evolution, 2009, 第 1 作者
(16) Positive selection for elevated gene expression noise in yeast, Molecular Systems Biology, 2009, 第 2 作者
(17) Evolutionary dynamics of nematode operons: easy come, slow go, Genome Research, 2008, 第 1 作者
(18) Gene dosage and gene duplicability, Genetics, 2008, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 所创新领域前沿课题, 主持, 市地级, 2013-01--2016-01
( 2 ) 青年千人计划, 主持, 国家级, 2012-12--2017-12
( 3 ) 水稻优质高效的多模块耦合模拟计算, 主持, 部委级, 2013-08--2018-12
( 4 ) 基于实验进化的同源重组速率进化规律的研究, 主持, 国家级, 2014-01--2016-12
( 5 ) 胚胎干细胞和细胞转分化与重编程过程中表观遗传修饰的谱系鉴定与关系分析, 参与, 国家级, 2014-01--2018-12
( 6 ) 基于Ribo-Seq的生物进化中翻译缓冲机制的研究, 主持, 国家级, 2016-01--2019-12
( 7 ) 肿瘤发生、发展和治疗过程中细胞进化模式及机制研究, 参与, 国家级, 2018-01--2019-12

指导学生

已指导学生

张晓庆  博士研究生  0710J3-生物信息学  

吴少欢  博士研究生  071021-生物信息学  

现指导学生

段朝瑞  博士研究生  0710J3-生物信息学  

陈思羽  博士研究生  071007-遗传学  

楚霄  博士研究生  071007-遗传学  

曹文清  博士研究生  0710J3-生物信息学  

张宇亮  博士研究生  0710J3-生物信息学  

陈瑛  博士研究生  0710J3-生物信息学  

王嘉  博士研究生  0710J3-生物信息学  

单科家  博士研究生  0710J3-生物信息学  

孔金辉  硕士研究生  085238-生物工程  

陈燕鸣  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

王瑜  博士研究生  0710J3-生物信息学