基本信息
孙际宾  男  博导  中国科学院天津工业生物技术研究所
电子邮件: sun_jb@tib.cas.cn
通信地址: 天津空港经济区西七道32号
邮政编码: 300308

招生信息

   
招生专业
071005-微生物学
085238-生物工程
招生方向
工业微生物系统生物学,生物网络设计与构建
系统生物技术

教育背景

2001-10--2004-10   德国不伦瑞克工业大学/德国国家生物工程中心GBF   博士研究生
1993-09--1996-07   山东大学   硕士研究生
1989-09--1993-07   山东大学   学士
学历
-- 研究生
学位
-- 博士

工作经历

   
工作简历
2008-03~现在, 中科院天津工业生物技术研究所, 副所长,研究员
2004-10~2008-03,Helmholtz Center for Infection Research, Germany, 博士后
1996-07~2000-10,山东大学微生物技术国家重点实验室, 讲师
社会兼职
2018-04-09-2019-12-29,中科院曼谷创新合作中心第一届理事会, 常务理事
2017-11-01-今,国家知识产权局中国专利审查, 审查专家
2014-06-30-今,天津市微生物学会, 副理事长
2013-12-25-今,中国科学院大学生物学科学术委员会, 委员

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 2016年中国科学院特聘研究员, 院级, 2016
(2) 2016年获国务院政府特殊津贴, 国家级, 2016
(3) 赖氨酸工业菌种创新, , 部委级, 2014
(4) 2014年产学研合作促进奖, 部委级, 2014
(5) 德国GBF基金会优秀博士论文奖, , 其他, 2005
(6) 国家科学技术奖技术发明二等奖, 二等奖, 国家级, 2005
(7) 德意志学术交流中心DAAD奖学金, , 其他, 2000
专利成果
( 1 ) (2R,3R)-2,3-丁二醇脱氢酶及其编码基因与应用, 发明, 2012, 第 2 作者, 专利号: 201010564858.2
( 2 ) 琥珀酸高产菌株及其应用, 发明, 2014, 第 1 作者, 专利号: 2011110264353.9
( 3 ) 天冬氨酸激酶III突变体及其宿主细胞和应用, 发明, 2018, 第 2 作者, 专利号: 201210398902.6
( 4 ) 5-氨基乙酰丙酸高产菌株及其制备方法和应用, 发明, 2018, 第 4 作者, 专利号: 201310051018.X
( 5 ) 一种5-氨基乙酰丙酸产生菌株及其制备方法与应用, 发明, 2018, 第 4 作者, 专利号: 2014100158481
( 6 ) 5-氨基乙酰丙酸高产菌株及其制备方法和应用, 发明, 2014, 第 4 作者, 专利号: PCT/CN2014/071712
( 7 ) 一种基因组测序数据序列组装方法, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201410096283.4
( 8 ) Mutant aspartokinase III and the host cell and application, 发明, 2013, 第 2 作者, 专利号: PCT/CN2013/075751
( 9 ) 一种基因组测序数据序列组装方法, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201410177319.1
( 10 ) 天冬氨酸激酶/高丝氨酸脱氢酶突变体及其应用, 发明, 2017, 第 4 作者, 专利号: 201410494708.7
( 11 ) 一种L-脯氨酸-4-羟基化酶及其应用, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 2014107400221
( 12 ) 一种提高L-苏氨酸转化率的方法及其应用, 发明, 2017, 第 5 作者, 专利号: 201410504828.0
( 13 ) 新型的L-苏氨酸-诱导型启动子及其应用, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201510160543.4
( 14 ) 天冬氨酸激酶/高丝氨酸脱氢酶突变体及其应用, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201610031759.5
( 15 ) 新的赖氨酸脱羧酶及其应用, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201610970315.8
( 16 ) Mutant aspartokinase III and the host cell and application, 发明, 2017, 第 2 作者, 专利号: JP 6091629
( 17 ) 一种新型向导RNA 表达盒及在CRISPR/Cas 系统中的应用, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201710380366.X
( 18 ) 新的赖氨酸脱羧酶突变体及其应用, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201710344705.9
( 19 ) 一种生产反式-4-羟基-L-脯氨酸的方法, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201710661945.1
( 20 ) 一种生产反式-4-羟基-L-脯氨酸的方法, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201710707917.9
( 21 ) 一种5-氨基乙酰丙酸高产菌株及其制备方法与应用, 发明, 2017, 第 3 作者, 专利号: 201711047613.0
( 22 ) Mutant aspartokinase III and the host cell and application, 发明, 2018, 第 2 作者, 专利号: US9896734
( 23 ) 5-Aminolevulinic Acid High-Yield Bacterial Strain, Preparation Method and Use There-of, 发明, 2017, 第 4 作者, 专利号: KR101814888
( 24 ) 高丝氨酸乙酰基转移酶突变体及其宿主细胞和应用, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201810107326.2
( 25 ) 5-氨基乙酰丙酸高产菌株及其制备方法和应用, 发明, 2018, 第 3 作者, 专利号: 201810362420.2
( 26 ) 天冬氨酸激酶III突变体及其宿主细胞和应用, 发明, 2018, 第 2 作者, 专利号: 201810150556.7

出版信息

   
发表论文
(1) 5S rRNA Promoter for Guide RNA Expression Enabled Highly Efficient CRISPR/Cas9 Genome Editing in Aspergillus niger, ACS Synth Biol., 2018, 通讯作者
(2) MACBETH: multiplex automated Corynebacterium glutamicum base editing method, Metabolic Engineering, 2018, 通讯作者
(3) Comprehensive Optimization of the Metabolomics Methodology for Metabolite Profiling of Corynebacterium glutamicum, Applied Microbiology and Biotechnology, 2018, 通讯作者
(4) A Novel L-Glutamate Exporter of Corynebacterium glutamicum, Appl. Environ. Microbiol., 2018, 通讯作者
(5) Heterologous and endogenous U6 snRNA promoters enabled CRISPR/Cas9 mediated genome editing in Aspergillus niger, Fungal Biology and Biotechnology, 2018, 通讯作者
(6) Efficient production of trans-4-hydroxy-L-proline from glucose using a new transproline 4-hydroxylase in Escherichia coli, J. BIOSCI. BIOENG, 2018, 通讯作者
(7) Biological conversion of methanol by evolved Escherichia coli carrying a linear methanol assimilation pathway, Bioresour. Bioprocess, 2017, 通讯作者
(8) Development of a CRISPR/Cas9 genome editing toolbox for Corynebacterium glutamicum, Microb Cell Fact, 2017, 通讯作者
(9) Removal of feedback inhibition of Corynebacterium glutamicum phosphoenolpyruvate carboxylase by addition of a short terminal peptide, Biotechnology and Bioprocess Engineering, 2017, 第 8 作者
(10) 利用定向进化提高基因工程大肠杆菌的甲醇利用能力, 生物技术通报, 2017, 通讯作者
(11) Evolving the L-lysine high-producing strain of Escherichia coli using a newly developed high-throughput screening method, Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, 2016, 通讯作者
(12) Characterization of a new lysine decarboxylase from Aliivibrio salmonicida for cadaverine production at alkaline pH, Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic, 2016, 通讯作者
(13) 4. Complete genome sequence of Corynebacterium glutamicum B253, a Chinese lysine-producing strain, Journal of Biotechnology, 2015, 通讯作者
(14) 黑曲霉柠檬酸工业菌株原生质体制备与转化, 生物技术通报, 2015, 通讯作者
(15) CRISPR-Cas9介导的基因组编辑技术的研究进展, 生物技术进展, 2015, 通讯作者
(16) Developing a high-throughput screening method for threonine overproduction based on an artificial promoter, Microb Cell Fact, 2015, 通讯作者
(17) Essential O2-responsive genes of Pseudomonas aeruginosa and their network revealed by integrating dynamic data from inverted conditions, Integrative Biology, 2014, 通讯作者
(18) 全细胞网络重建与细胞工厂设计, 生物化学与生物物理进展, 2014, 通讯作者
(19) 。琥珀酸脱氢酶或琥珀酰辅酶A 合成酶缺失促进大肠杆菌积累5-氨基乙酰丙酸, 生物工程学报, 2013, 通讯作者
(20) ReacKnock: Identifying reaction deletion strategies for microbial strain optimization based on genome-scale metabolic network, PLOS ONE, 2013, 通讯作者
(21) Development of Thermodynamic Optimum Searching (TOS) to Improve the Prediction Accuracy of Flux Balance Analysis, Biotechnol Bioeng, 2013, 第 4 作者
(22) 不同抑制剂对谷氨酸棒状杆菌磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶酶活的影响, 生物技术通报, 2013, 通讯作者
(23) 一种改进的赖氨酸浓度测定方法, 生物技术通报, 2013, 通讯作者
(24) Study and reengineering of the binding sites and allosteric regulation of biosynthetic threonine deaminase by isoleucine and valine in Escherichia coli., Appl Microbiol Biotechnol, 2013, 通讯作者
(25) Construction and Analysis of the Model of Energy Metabolism in E. coli, PLOS ONE, 2013, 通讯作者
(26) Cloning of two 5-Aminolevulinic Acid Synthase Isozymes HemA and HemO from Rhodopseudomonas palustris with favorable characters for 5-aminolevulinic acid production, Biotechnology Letters , 2013, 第 4 作者
(27) Exploring the allosteric mechanism of dihydrodipicolinate synthase by reverse engineering of the allosteric inhibitor binding sites and its application for lysine production, Applied Microbiology and Biotechnology, 2012, 通讯作者
(28) 谷氨酸棒状杆菌集成细胞网络的构建与结构分析, 生物工程学报, 2012, 通讯作者
(29) A genome-wide study of two-component signal transduction systems in eight newly sequenced mutans streptococci strains, BMC Genomics, 2012, 通讯作者
(30) Construction of Recombinant E.coli Expressing Fusion Protein to Produce 1,3-Propanediol, International Journal of Biological and Medical Sciences, 2011, 通讯作者
(31)  Integrating molecular dynamics and co-evolutionary analysis for reliable target prediction and deregulation of the allosteric inhibition of aspartokinase for amino acid production, Journal of Biotechnology, 2011, 第 3 作者
(32) Genome Sequence of Thermophilic Strain Bacillus coagulans 2-6, an Efficient Producer of High Optical Purity L-Lactic Acid, Journal of Bacteriol, 2011, 第 3 作者
(33) A novel (2R,3R)-2,3-Butanediol Dehydrogenase From An Industrially Potential Strain Paenibacillus polymyxa ATCC12321, Applied and Environmental Microbiology, 2011, 第 2 作者
(34) Co-evolutionary analysis enables rational deregulation of allosteric enzyme inhibition in Corynebacterium glutamicum for lysine production, Applied and Environmental Microbiology, 2011, 第 4 作者
(35) An extended bioreaction database that significantly improves reconstruction and analysis of genome-scale metabolic networks, Integrative Biology, 2011, 第 2 作者
(36) Biofuel production by in vitro synthetic enzymatic pathway Biotransformation, Current Opinion in Biotechnology, 2011, 第 2 作者
(37) Multi-objective MINLP Optimization Used to Identify Theoretical Gene Knockout Strategies for E. coli Cell, Chem. Biochem. Eng. Q. , 2011, 第 3 作者
(38) The intra- and extracellular proteome of Aspergillus niger growing on defined medium with xylose or maltose as carbon substrate, Microbiol Cell Factory, 2010, 第 2 作者
(39) Metabolic modelling of syntrophic-like growth of a 1,3-propanediol producer, Clostridium butyricum, and a methanogenic archeon, Methanosarcina mazei, under anaerobic conditions, Bioprocess Biosystem Engineer, 2010, 第 3 作者
(40) 黑曲霉作为细胞工厂:知识准备与技术基础, 生物工程学报, 2010, 通讯作者
(41) Biodiversity and evolution of primary carbon metabolism in Aspergillus nidulans and other Aspergillus spp, Fungal Genetics and Biology, 2009, 第 2 作者
发表著作
(1) 代谢网络, Metabolic network, Wiley, 2006-07, 第 3 作者
(2) 基因组与蛋白质组学数据在生物过程分析与优化中的应用, Application of Genomic and Proteomic Data for Bioprocess Analysis and Optimization, Elservier Inc, 2006-07, 第 2 作者
(3) 代谢调控网络的重建与结构分析,  Reconstruction and Structural Analysis of Metabolic and Regulatory Networks., Sangdun Choi, Humana Press, 2007-07, 第 3 作者
(4) 系统生物技术,  Systems Biotechnology, Science Press, 2008-10, 第 1 作者
(5) 连续培养, Continuous Culture, ASM press, 2010-07, 第 2 作者
(6) 黑曲霉作为细胞工厂:知识准备与技术基础, Aspergillus niger as a Potential Cell Factory:Prior Knowledge and Key Technology, 科学社出版社, 2010-07, 第 3 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 化学品生物合成代谢网络的计算模拟与途径设计, 主持, 国家级, 2011-01--2015-08
( 2 ) 天津市工业微生物基因组解析, 主持, 省级, 2011-10--2014-09
( 3 ) 赖氨酸高产菌种改造, 主持, 研究所(学校), 2011-09--2014-09
( 4 ) 人工细胞工厂创新团队, 主持, 部委级, 2014-01--2016-12
( 5 ) 工业微生物组学数据集成分析软件研究, 参与, 部委级, 2013-01--2015-12
( 6 ) 黑曲霉糖代谢途径中关键酶与小分子相互作用的系统研究, 主持, 国家级, 2014-01--2017-12
( 7 ) 工业微生物组学数据集成分析软件研究, 主持, 部委级, 2013-01--2015-12
( 8 ) 戊二胺生物制造新技术, 主持, 部委级, 2014-01--2015-12
( 9 ) 氨基酸发酵产业提升, 主持, 部委级, 2014-01--2015-12
( 10 ) 生物法生产反式4-羟脯氨酸, 主持, 研究所(学校), 2014-06--2014-12
( 11 ) 谷氨酸高产菌株的构建, 主持, 研究所(学校), 2014-06--2015-06
( 12 ) 原料药和药物中间体的生物合成, 主持, 部委级, 2017-05--2019-04
( 13 ) 微生物细胞工厂设计创新团队, 主持, 省级, 2016-01--2017-12

合作情况