(1) 基因组学技术的革命性进步，孕育着作物科学理论与技术的新突破。燕麦属(Avena)约29种，分布于地中海气候区，发掘燕麦属野生种的基因组资源，构建染色体分子核型，对诠释燕麦起源，乃至亲本基因组非常近缘的多倍体作物起源具有重要的现实意义。(2) 基于叶绿体基因组演化动力学，探索禾本科关键类群系统发育及叶绿体基因组重组区段的系统发育价值，为解析叶绿体基因组演化机制提供证据。(3) 多倍化引起广泛地染色体重组，产生一系列变异来缓解基因组融合所带来的冲击效应，挖掘多倍体物种实现核型稳定的机制，解析亚热带牧草较强生态适应性的遗传基础。

 

071007-遗传学
071001-植物学

植物遗传育种学
重复序列组学

2002-03--2005-03   中国科学院华南植物园   博士
1998-09--2001-07   中国科学院华南植物园   硕士

-- 研究生

-- 博士

工作经历
2001.7-至今                      中国科学院华南植物园      研究实习员     助研       副研    青年研究员      陈焕镛研究员
2006.7-9                         美国史密斯桑尼亚研究所   访问学者
2009.7-2010.7                美国史密斯桑尼亚研究所   访问学者
2012.8-2013.2                美国史密斯桑尼亚研究所   访问学者
2016.11-2017.11            英国莱斯特大学                  访问学者

2016-11~2017-10,University of Leicester, 访问学者
2012-08~2013-01,Smithsonian Institution, 访问学者
2009-07~2010-07,Smithsonian Institution, 访问学者
2001-07~现在, 中国科学院华南植物园, 助理研究员,副研究员,青年研究员,陈焕镛研究员

2018-05-01-2018-06-10,国家自然科学基金项目, 通讯评议
2016-04-13-2018-05-14,国家自然科学基金项目, 通讯评审专家
2016-03-27-今,中国农业国际合作促进会(农促会, CAPIAC), 专家顾问团顾问
2015-03-31-今,广东省科技厅, 二审评委

   

（1） 2018年度广州教育基地优秀研究生导师, 三等奖, 院级, 2018
（2） 美国史密斯桑尼亚基金会访问学者奖, 一等奖, 其他, 2006

1.        Liu Qing*, Li Xiaoyu, Zhou Xiangying, Li Mingzhi, Zhang Fengjiao, Trude Schwarzacher, Pat Heslop-Harrison*. 2019. The DNA landscape in Avena: Chromosome and genome evolution defined by major repetitive DNA classes in whole-genome sequence reads. BMC Plant Biology, 19(1):226.

2.        Liu Qing*, Lin Lei, Zhou Xiangying, Peterson Paul M, Wen Jun*. 2017. Unraveling the evolutionary dynamics of ancient and recent polyoidization events in Avena (Poaceae), Scientific Reports, 7(1): 41944.

3.        Liu Qing*, Liu Huan, Wen Jun*. 2017. Relationships between Sorghum bicolor (Poaceae) and its close relatives based on genomic in situ hybridization evidence. Turkish Journal of Botany, 41(1): 11-24.

4.        Liu Qing*, Liu Huan. 2015. Genomic in situ hybridization identifies genomic relationships of Sorghum bicolor and closely related species (Poaceae). Chromosome Research. 23(S1): S132-S133.

5.        Liu Huan, Hu Xiaoying, Liu Yunxiao, Liu Qing*. 2015. Caryopsis micromorphological survey of Sorghum (Poaceae)—taxonomic implications. South African Journal of Botany, 99(1): 1-11.

6.        Liu Qing*, Liu H, Wen J, Peterson PM*. 2014. Infrageneric phylogeny and temporal divergences in Sorghum (Andropogonodae, Poaceae) based on low-copy nuclear and plastid sequences. PLoS One, 9(8): e104933.

7.        Zhang Y, Hu XY, Liu YX, Liu Qing*. 2014. Caryopsis micromorphological survey of Themeda (Poaceae) and allied spathaceous genera in the Andropogoneae. Turkish Journal of Botany, 38(4): 665-676.

8.        Liu Qing*, Jiang B, Wen J, Peterson PM. 2014. Low-copy nuclear gene and McGISH resolving polyploidy history of Eleusine coracana and morphological character evolution in Eleusine. Turkish Journal of Botany, 38(1): 1-12.

9.        Liu Qing*, Triplett JK, Wen J, Peterson PM*. 2011.  Allotetraploid origin and divergence in Eleusine (Chloridoideae, Poaceae): evidence from low-copy nuclear gene phylogenies and a plastid gene chronogram. Annals of Botany, 108(7): 1287-1298.

10.   Liu Qing*, Zhang DX, Peterson PM. 2010. Lemma micromorphological characters in the Chloridoideae (Poaceae) optimized on a molecular phylogeny. South African Journal of Botany, 76(2): 196-209.

 

（1） 燕麦属重复序列研究, The Repetitive DNA landscape In Avena (Poaceae): chromosome and genome evolution defined by major repeat classes in whole genome sequence reads, BMC Plant Biology, 2019, 第 1 作者
（2） 植物基因组重复序列研究进展, Research Progress of Repetitive DNA Sequences in Plant Genomes, 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2019, 第 4 作者
（3） 第27届国际动植物基因组学大会要事记, Important Progresses in the Plant and Animal Genome XXVII Conference, 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2019, 第 1 作者
（4） 栽培高粱和近缘物种亲缘关系的原位杂交证据, Relationships between Sorghum bicolor (Poaceae) and its close relatives based on genomic in situ hybridization evidence, Turkish Journal of Botany, 2017, 第 1 作者
（5） 燕麦属多倍化事件演化过程研究, Unraveling the evolutionary dynamics of ancient and recent polyoidization events in Avena (Poaceae), Scientific Reports, 2017, 第 1 作者
（6） 燕麦属颖果微形态特征及其分类学意义, Caryopsis Micromorphological Characteristics of Avena (Poaceae) and Its Taxonomic Significances, 热带亚热带植物学报, 2016, 通讯作者
（7） 栽培高粱基因组起源原位杂交研究, Genomic in situ hybridization identifies genomic relationships of Sorghum bicolor and closely related species (Poaceae), Chromosome Research, 2015, 第 1 作者
（8） 植物着丝粒的研究进展, Research Progress on Structure and Evolution of Plant Centromeres, 热带亚热带植物学报, 2015, 第 1 作者
（9） 高梁属颖果微形态学研究-分类学价值, Caryopsis micromorphological survey of Sorghum (Poaceae)—taxonomic implications, South African Journal of Botany, 2015, 通讯作者
（10） 禾本科燕麦属植物的地理分布, Geographical Distribution of Avena L. (Poaceae), 热带亚热带植物学报, 2015, 通讯作者
（11） 菅属及近缘佛焰苞类群颖果微形态学研究, Caryopsis micromorphological survey of Themeda (Poaceae) and allied spathaceous genera in the Andropogoneae, Turkish Journal of Botany, 2014, 通讯作者
（12） 穇属系统发育及形态性状演化的低拷贝核基因及多色原位杂交证据, Low-copy nuclear gene and McGISH resolving polyploidy history of Eleusine coracana and morphological character evolution in Eleusine, Turkish Journal of Botany, 2014, 通讯作者
（13） 基于低拷贝核基因和质体基因片段的高梁属系统发育研究, Infrageneric phylogeny and temporal divergence of Sorghum (Andropogoneae, Poaceae) based on low-copy nuclear and plastid sequences, PLOS ONE, 2014, 第 1 作者
（14） 燕麦属系统学研究进展, 燕麦属系统学研究进展, 热带亚热带植物学报, 2014, 第 1 作者
（15） 燕麦属植物的地理分布, 燕麦属植物的地理分布, 热带亚热带植物学报, 2014, 通讯作者
（16） 高粱属植物的地理分布, Geographical Distribution of Sorghum Moench (Poaceae), 热带亚热带植物学报, 2014, 通讯作者
（17） 基因组原位杂交鉴定牛筋草AA基因组在穇子染色体上分布, Distribution of Eleusine indica AA genome on finger millet (Poaceae) chromosomes identified by genomic in situ hybridization and optimization method of probe length, 热带亚热带植物学报, 2012, 第 4 作者
（18） 菅属地理分布, Geographical distribution of Themeda Forssk. (Poaceae)., 热带亚热带植物学报, 2012, 第 2 作者
（19） Allotetraploid origin and divergence in Eleusine (Chloridoideae, Poaceae): Evidence from low-copy nuclear gene phylogenies and a plastid gene chronogram, Annals of Botany, 2011, 第 1 作者
（20） Phylogenetic signals in the realized climate niches of Chinese grasses (Poaceae), Plant Ecology, 2011, 第 1 作者
（21）  Lemma micromorphological characters in the Chloridoideae (Poaceae) optimized on a molecular phylogeny, South African Journal of Botany , 2010, 第 1 作者
（22） Grass (Poaceae) richness patterns across China’s nature reserves, Plant Ecology, 2009, 第 1 作者

 

华南植物园海外知名学者项目 2018-2023 负责人

科创计划                   2018      主持

科创计划                   2016      主持

国家自然科学基金           2012-2016 主持
国家自然科学基金           2013      主持
国家自然科学基金           2008-2010 主持
国家留学基金               2016-2017 主持
国家留学基金               2009-2010 主持
中国科学院国际人才计划     2016 主持
中国科学院公派留学         2012-2013 主持
教育部留学回国人员科研启动基金2011-2013 主持

 

（ 1 ） 高粱属分子系统学及栽培高粱和约翰逊草基因组起源的研究, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
（ 2 ） 泛喜马拉雅地区植物综合考察与植物志编研, 主持, 国家级, 2013-06--2018-05
（ 3 ） 普通栽培燕麦重复序列组学特征研究, 主持, 国家级, 2016-11--2017-11
（ 4 ） 中国科学院国际人才计划(CAS President’s International Fellowship Initiative), 主持, 部委级, 2016-09--2016-10
（ 5 ） 六倍体普通栽培燕麦重复序列生物信息学研究(国家外国专家局重点外国专家项目), 主持, 国家级, 2016-09--2016-10
（ 6 ） 普通栽培燕麦重复序列组结构特征丰度及染色体分布研究, 主持, 部委级, 2017-11--2017-11
（ 7 ） 海外知名学者项目子课题普通栽培燕麦基因组多样性和演化, 参与, 市地级, 2018-05--2023-08

（1）The repetitive DNA landscape in Avena (Poaceae): chromosome and genome evolution defined by major repeat classes in whole-genome sequence reads   国际动物植物基因组大会   Qing Liu*, Xiaoyu Li, Xiangying Zhou, Mingzhi Li, Fengjiao Zhang, Trude Schwarzacher, Pat Heslop Harrison.    2019-01-12
（2）Multicolor Genomic in situ hybridization identifies genomic relationships of Sorghum bicolor and closely related species (Poaceae)   第10界欧洲细胞遗传学协会   Qing Liu   2015-07-04

Visiting Scholar Fellow, November 2016–October 2017. Department of Genetics and Genome Biology, University of Leicester. Collaborator: Pat Heslop Harrison.

Project title: The Repetitive DNA Landscape in Avena (Poaceae).

Funds: China Scholarship Council. No. 201604910096.

 

Visiting Scholar Fellow, July 2012–December 2013. Smithsonian Institution, National Museum of Natural History (NMNH). Collaborators: Paul M. Peterson and Jun Wen.

Project title: Phylogeny of Sorghum (Poaceae) and the origin of cultivated sorghum and Johnsongrass.

Funds: Smithsonian Institution’s Small Grant Program. No. 2012-136.

 

Visiting Scholar Fellow, July 2009–July 2010. Smithsonian Institution, National Museum of Natural History (NMNH). Collaborator: Paul M. Peterson.

Project title: Phylogeny of Eleusine (Poaceae) and the origin of finger millet based on nuclear Pepc4 and EF-1α sequences.

Funds: National Geographic Society Committee for Research and Exploration No. 8087-06 to PMP and China Scholarship Council No. 2008-3027 to QL.

 

Visiting Scholar Fellow, June–July 2006. Smithsonian Institution, National Museum of Natural History. Collaborator: Paul M. Peterson.

Project title: Phylogenetics of the grass ‘Aveneae-type plastid DNA clade’ (Poaceae: Pooideae, Poeae) based on plastid and nuclear ribosomal DNA sequence data

Fund: Smithsonian Institution Short-Term Visitor Award to QL.

已指导学生

姜斌  硕士研究生  071001-植物学  

刘欢  硕士研究生  085238-生物工程  

林磊  硕士研究生  071001-植物学  

周湘英  硕士研究生  085238-生物工程  

现指导学生

李晓宇  硕士研究生  085238-生物工程  

潘浩研  硕士研究生  085238-生物工程  

王梓维  博士研究生  071007-遗传学