基本信息
丁建平  男  博导  中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)
电子邮件: jpding@sibs.ac.cn
通信地址: 上海市岳阳路320号新生化大楼113室
邮政编码: 200031
部门/实验室:生物化学与细胞生物学研究所

研究领域

真核基因表达调控的结构生物学

招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
085238-生物工程
招生方向
生物大分子的结构和功能
真核基因表达调控的分子生物学

教育背景

1985-02--1987-12   复旦大学化学系   理学博士
1982-02--1984-10   中山大学化学系   理学硕士
1978-02--1982-01   南京大学化学系   理学学士
学历
-- 研究生
学位
-- 博士

工作经历

工作简历
2001-11~现在, 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所, 研究员、研究组长、博士生导师
1998-07~2001-06,美国新泽西州罗格斯大学化学与化学生物学系, 研究副教授
1994-01~2001-06,美国新泽西州罗格斯大学高级生物技术和医学研究中心, 研究员
1994-01~1998-06,美国新泽西州罗格斯大学化学与化学生物学系, 研究助理教授
1991-09~1993-12,美国新泽西州罗格斯大学化学与化学生物学系, 研究助理
1989-07~1991-08,联邦德国柏林自由大学结晶学研究所, 联邦德国洪堡基金会奖研金学者
1987-11~1989-06,中国科学院上海硅酸盐研究所, 博士后
1984-11~1985-01,中山大学化学系, 助教
社会兼职
2017-11-01-今,中国生物物理学会, 监事会监事长
2014-01-01-今,上海生物物理学会, 理事长
2012-01-01-今,中国晶体学会, 大分子专业委员会副主任委员
2009-08-23-2017-11-01,中国生物物理学会, 副理事长
2008-07-01-今,英国《BMC Structural Biology》, 编辑
2008-05-31-今,上海生物化学与分子生物学会, 常务理事、副理事长
2006-09-01-今,上海生物物理学会, 常务理事、专业委会主任
2006-06-01-今,亚洲晶体学会, 理事
2004-09-29-2018-12-01,英国《The Biochemical Journal》, 编辑顾问委员会委员
2003-07-27-2016-11-01,中国晶体学会, 常务理事
2003-01-01-今,中国晶体学会, 理事
2001-06-01-今,中国生物化学与分子生物学学会, 理事、专业委员会主任、副主任

教授课程

结构生物学
生物化学与分子生物学
实验生物学
高级生化
高级生化、生物化学夏令营

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 2015年上海市领军人才培养计划, 市地级, 2015
(2) The 18th A-IMBN Conference, 其他, 2015
(3) 全国归侨侨眷先进个人, 国家级, 2013
(4) 2010年度国务院政府特殊津贴, , 国家级, 2010
(5) 生物化学与细胞生物学研究所2009年度优秀员工, , 研究所(学校), 2009
(6) 2009药明康德生命化学研究奖, 二等奖, 专项, 2009
(7) 上海市自然科学奖, 二等奖, 省级, 2009
(8) 中国科学院朱李月华优秀导师奖, , 院级, 2008
(9) 上海市优秀学科带头人计划(A类), , 省级, 2007
(10) 生物化学与细胞生物学研究所2007年度优秀员工, , 研究所(学校), 2007
(11) 中国科学院澳大利亚BHP Biliton导师科研奖, , 院级, 2006
(12) 国家人事部“新世纪百千万人才工程”国家级人选, , 部委级, 2006
(13) 日本明治乳业生命科学优秀奖, , 专项, 2004
(14) 中国科学院优秀研究生导师奖, , 院级, 2004
(15) 上海市人事局引进海外高层次人才专项资金二类资助, , 省级, 2004
(16) 国家人事部留学人员科技活动项目择优资助, , 部委级, 2004
(17) 国家人事部留学人员科技活动项目择优资助, , 部委级, 2001
(18) 德国洪堡基金会奖研金学者, , 国家级, 1998
专利成果
( 1 ) Rituximab的Fab片段与CD20抗原表位多肽的复合物, 发明, 2010, 第 1 作者, 专利号: 200710038124.9
( 2 ) C2H7的Fab片段与CD20抗原表位多肽的复合物, 发明, 2012, 第 1 作者, 专利号: 200810032857.6

出版信息


发表论文
(1) Insights into the inhibitory mechanisms of NADH on the αγ heterodimer of human NAD-dependent isocitrate dehydrogenase, Sci. Rep., 2018, 通讯作者
(2) Molecular mechanism of the allosteric regulation of the αγ heterodimer of human NAD-dependent isocitrate dehydrogenase, Sci. Rep., 2017, 通讯作者
(3) The β and γ subunits play distinct functional roles in the α2βγ heterotetramer of human NAD-dependent isocitrate dehydrogenase, Sci. Rep., 2017, 通讯作者
(4) LRCH1 interferes with DOCK8-Cdc42-induced T cell migration and ameliorates experimental autoimmune encephalomyelitis, J. Experimental Medicine, 2017, 第 10 作者
(5) Structural and mechanistic insights into regulation of HBO1 histone acetyltransferase activity by BRPF2, Nucleic Acids Res., 2017, 通讯作者
(6) Molecular basis for the recognition of CCN1 by monoclonal antibody 093G9, J. Mol. Recognit., 2017, 通讯作者
(7) Cbln1 and Cbln4 are structurally similar but differ in GluD2 binding interactions, Cell Rep., 2017, 通讯作者
(8) Structural basis for Ragulator functioning as a scaffold in membrane-anchoring of Rag GTPases and mTORC1, Nature Commun., 2017, 通讯作者
(9) Structural basis for the functional role of the Shu complex in homologous recombination, Nucleic Acids Res., 2017, 通讯作者
(10) Human antibody 3E1 targets the HA stem region of H1N1 and H5N6 influenza A viruses, Nature Communication, 2016, 通讯作者
(11) Structural insight into the arginine binding specificity of CASTOR1 in amino acid-dependent mTORC1 signaling, Cell Discovery, 2016, 通讯作者
(12) Structural basis for targeting BIG1 to Golgi apparatus through interaction of its DCB domain with Arl1, J. Mol. Cell Biol., 2016, 通讯作者
(13) Structural basis for Sfm1 functioning as a protein arginine methyltransferase, Cell Discovery, 2015, 通讯作者
(14) Molecular basis for the substrate specificity and catalytic mechanism of thymine-7-hydroxylase in fungi, Nucleic Acids Res., 2015, 通讯作者
(15) Conotoxin D-GeXXA utilizes a novel strategy to antagonize nicotinic acetylcholine receptors, Sci. Rep., 2015, 通讯作者
(16) Crystal structures of Arabidopsis thaliana Nudix hydrolase NUDT7 reveal a previously unobserved conformation, Mol. Plant, 2015, 通讯作者
(17) Crystal structure of the Ego1-Ego2-Ego3 complex and its role in promoting Rag GTPase-dependent TORC1 signaling, Cell Res., 2015, 通讯作者
(18) Structural basis of intramitochondrial phosphatidic acid transport mediated by Ups1-Mdm35 complex, EMBO Rep., 2015, 通讯作者
(19) Functional role of histidine in the conserved His-x-Asp motif in the catalytic core of protein kinases, Sci. Rep., 2015, 通讯作者
(20) Crystal structure of the Rab9A-RUTBC2 RBD complex reveals the molecular basis for the binding specificity of Rab9A with RUTBC2, Structure, 2014, 通讯作者
(21) Subdomain II of -isopropylmalate synthase is essential for activity: inferring a mechanism of feedback inhibition, J. Biol. Chem., 2014, 通讯作者
(22) Crystal structure of the WOPR-DNA complex and implications for Wor1 function in white-opaque switching of Candida albicans, Cell Res., 2014, 通讯作者
(23) Molecular mechanism for Rabex-5 GEF activation by Rabaptin-5, eLife, 2014, 通讯作者
(24) Structural insights into the functions of the FANCM-FAAP24 complex in DNA repair, Nucleic Acids Res., 2013, 通讯作者
(25) Crystal structures of isoorotate decarboxylases reveal a novel catalytic mechanism of 5-carboxyl-uracil decarboxylation and shed lights on the search for DNA decarboxylase, Cell Res., 2013, 通讯作者
(26) Crystal structures of S6K1 provide insights into the regulation mechanism of S6K1 by the hydrophobic motif, Biochem. J., 2013, 通讯作者
(27) Crystal structure of Drosophila melanogaster tryptophan 2,3-dioxygenase reveals insights into substrate recognition and catalytic mechanism, J. Struct. Biol., 2013, 通讯作者
(28) Functional and structural characterization of DNMT2 from Spodoptera frugiperda, J. Mol. Cell Biol., 2013, 通讯作者
(29) Structures of trans-2-enoyl-CoA reductases from Clostridium acetobutulicum and Treponema denticola: insights into the substrate specificity and the catalytic mechanism, Biochem. J., 2013, 通讯作者
(30) Molecular basis of the acetyltransferase activity of MEC-17 towards α-tubulin, Cell Res., 2012, 通讯作者
(31) Ego3 functions as a homodimer to mediate the interaction between Gtr1-Gtr2 and Ego1 within the TORC1 activating EGO complex, Structure, 2012, 通讯作者
(32) Crystal structures of human CaMKI reveal insights into the regulation mechanism of CaMKI, PLoS One, 2012, 通讯作者
(33) Saccharomyces cerevesiae MHF complex structurally resembles the histones (H3-H4)2 heterotetramer and functions as a heterotetramer, Structure, 2012, 通讯作者
(34) Structure of human lysine methyltransferase Smyd2 reveals insights into the substrate divergence in Smyd protein, Cell Biol., 2011, 通讯作者
(35) Crystal structures and kinetic studies of human kappa class glutathione transferase provide insights into the catalytic mechanism, Biochem. J., 2011, 通讯作者
(36) New G-protein-coupled receptor structures provide insights into the recognition of CXCL12 and HIV-1 gp120 by CXCR4, Acta Biochem Biophys Sin, 2011, 通讯作者
(37) Regulation of the histone acetyltransferase activity of hMOF via autoacetylation of Lys274, Cell Res., 2011, 通讯作者
(38) A novel calcium-binding site of von illebrand factor A2 domain regulates its cleavage by ADAMTS13, Blood, 2011, 通讯作者
(39) Structural and biochemical studies of human lysine methyltransferase Smyd3 reveal unique features of the enzyme, Nucleic Acids Res., 2011, 通讯作者
(40) Crystal structure of the catalytic core of Saccharomyces cerevesiae histone demethylase Rph1: insights into the substrate specificity and catalytic mechanism, Biochem. J., 2011, 通讯作者
(41) Molecular mechanisms of “off-on switch” of activities of human IDH1 by tumor-associated mutation R132H, Cell Res., 2010, 通讯作者
(42) Structural basis of the immunosuppressive mechanism of therapeutic antibody daclizumab, Cell Res., 2010, 通讯作者
(43) Crystal structure of Saccaromyces cerevisae tryptophanyl-tRNA synthetase: new insights into the mechanism of trptophan activation and implications for anti-fungal drug design, Nucleic Acids Res., 2010, 通讯作者
(44) Crystal structure of P. Horikoshi tryptophanyl-tRNA synthetase and structure-based phylogenetic analysis suggest an archaeal origin of tryptophanyl-tRNA synthetases, Nucleic Acids Res., 2010, 通讯作者
(45) Crystal structure of human copper homeostasis protein CutC reveals a potential copper-binding site, J. Struct. Biol., 2010, 通讯作者
(46) Structural basis for the blockage of IL-2 signaling by therapeutic antibody Basiliximab, Structural basis for the blockage of IL-2 signaling by therapeutic antibody Basiliximab, 2010, 通讯作者
(47) Molecular basis of the acceleration of the nucleotide exchange of Rheb by TCTP, J. Biol. Chem., 2009, 通讯作者
(48) Structural modeling and biochemical studies reveal insights into the molecular basis of the recognition of ?-2-microglobulin by antibody BBM.1, J. Mol. Recognition, 2009, 通讯作者
(49) Structure of the Fab fragment of therapeutic antibody Ofatumumab provides insights into the recognition mechanism with CD20, Mol. Immonol., 2009, 通讯作者
(50) Molecular basis of the inhibitor selectivity and insights into the feedback inhibition mechanism of citramalate synthase from Leptospira interrogans, Biochem. J., 2009, 通讯作者
(51) Crystal structure of the ARL2-GTP-BART complex reveals a novel recognition and binding mode of small GTPase with effector, Structure, 2009, 通讯作者
(52) Efalizumab binding to the LFA-1 ?L I domain blocks ICAM-1 binding via steric hindrance, Proc. Natl. Acad. Sci. USA,, 2009, 通讯作者
(53) Molecular basis of the interaction of Saccharomyces cerevisiae Eaf3 chromo domain with methylated H3K36, J. Biol. Chem., 2008, 通讯作者
(54) Isoquinoline-1,3,4-trione derivatives inactivates caspase-3 by generation of reactive oxygen species, J. Biol. Chem., 2008, 通讯作者
(55) Molecular basis of recognition of human osteopontin by 23C3, a potential therapeutic antibody for treatment of rheumatoid arthritis, J. Mol. Biol., 2008, 通讯作者
(56) Structural studies of Saccharomyces cerevesiae mitochondrial NADP-dependent isocitrate dehydrogenase in different enzymatic states reveal substantial conformational changes during the catalytic reaction, Protein Sci., 2008, 通讯作者
(57) Molecular basis of the substrate specificity and the catalytic mechanism of citramalate synthase from Leptospira interrogans, Biochem. J., 2008, 通讯作者
(58) Molecular mechanism of ADPR hydrolysis by human NUDT5 from structural and kinetic studies, J. Mol. Biol., 2008, 通讯作者
(59) Crystal structure of chimeric antibody C2H7 Fab in complex with a CD20 peptide, Mol. Immunol., 2008, 通讯作者
(60) Catalytic mechanism of the tryptophan activation reaction revealed by crystal structures of human tryptophanyl-tRNA synthetase in different enzymatic states, Nucleic Acids Res., 2008, 通讯作者
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 干细胞编程与重编程中表观遗传调控的分子机制和结构基础, 主持, 国家级, 2011-01--2015-08
( 2 ) 参与组蛋白修饰的重要蛋白质和蛋白质复合物的结构与功能研究, 主持, 国家级, 2008-01--2011-12
( 3 ) 基于天然活性分子LX0278为探针的胰岛素增敏新信号转导通路的发现, 参与, 国家级, 2008-01--2011-12
( 4 ) 具有重要生物学功能的蛋白质和蛋白质复合物的结构生物学研究, 主持, 部委级, 2008-10--2011-09
( 5 ) 表观遗传调控中组蛋白甲基化修饰的分子机制, 主持, 省级, 2010-10--2013-09
( 6 ) 染色体结构与功能, 参与, 国家级, 2013-01--2017-08
( 7 ) 参与细胞内吞体代谢调控的重要蛋白质复合物的结构和功能研究, 主持, 国家级, 2013-01--2017-12
( 8 ) DNA损伤修复过程中FA复合体的结构与功能研究, 主持, 部委级, 2014-01--2018-12
( 9 ) 氨基酸诱导的mTORC1信号通路调控的分子机制研究, 主持, 国家级, 2016-01--2020-12
( 10 ) 染色质共价修饰在表观遗传调控中的机制研究, 参与, 国家级, 2016-01--2018-12
参与会议
(1)Molecular basis for thymine demethylation by T7H and IDCase in fungi: Implications for active DNA demethylation in mammals   Jianping Ding   2015-09-20
(2)Structural and functional studies of Rab GTPases with their GEF and effector proteins in endocytosis   中国生物化学与分子生物学会第十一次会员代表大会暨2014年全国学术会议   Jianping Ding   2014-08-21
(3)Crystal structures of isoorotate decarboxylases reveal the catalytic mechanism of decarboxylation and shed lights on the search for DNA decarboxylase   第13次中国暨国际生物物理大会   Jianping Ding   2013-10-28
(4)Structural basis of a novel regulation mechanism of the GEF activity of human Rabex5 by Rabaptin5 and Rab5 in endocytosis   第四届全国“跨学科蛋白质研究”学术讨论会   丁建平   2013-10-12
(5)Crystal structures of isoorotate decarboxylases reveal the catalytic mechanism of the 5-carboxyl-uracil decarboxylation   第四届中国结构生物学学术讨论会   Jianping Ding   2013-03-31
(6)Ego3 functions as a homodimer to mediate the interaction between Gtr1-Gtr2 and Ego1 within the TORC1 activatory EGO complex   Jianping Ding   2012-09-24
(7)Ego3 functions as a homodimer to mediate the interaction between Gtr1-Gtr2 and Ego1 in the EGO complex to activate TORC1   Jianping Ding   2012-08-24
(8)Ego3 functions as a homodimer to mediate the interaction between Gtr1-Gtr2 and Ego1 in the EGO complex to activate TORC1   Jianping Ding   2012-08-20
(9)A novel calcium-binding site of von Willebrand factor A2 domain provides new insights into the regulatory mechanism of A2 cleavage by ADAMTS13   Jianping Ding   2011-10-30
(10)The regulation of the histone acetyltransferase activity of hMOF based on structural, biochemical and cell biology studies   Jianping Ding   2011-10-20
(11)Structural and functional studies of tryptophanyi-tRNA synthetases: Implications for catalytic mechanism and drug design   Jianping Ding   2011-09-19
(12)A tale of an ancient enzyme: Function, mechanism and evolution of tryptophanyl-tRNA synthetases   丁建平   2011-08-08
(13)Structure and functional studies of proteins involved in histone modifications   第四届纪念曹天钦蛋白质研究国际研讨会   丁建平   2010-12-05
(14)Structure, function, and evolution of tryptophanyl-tRNA synthetases: Implications for anti-fungal drug design   丁建平   2010-09-12
(15)A tale of an ancient enzyme: function, mechanism and evolution of tryptophanyl-tRNA synthetases   丁建平   2010-04-01
(16)A tale of an ancient enzyme:Function, mechanism and evolution of tryptophanyl-tRNA synthetases   第三届中国结构生物学学术讨论会   丁建平   2010-03-03

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生

已指导学生

查满武  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

沈宁  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

卢永城  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

徐翔  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

赵景月  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

俞亚东  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

侯春晖  博士研究生  071009-细胞生物学  

刘云清  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张鹏  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

李胜  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张天龙  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

武健  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杜嘉木  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

李颖洁  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杨贝  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

董咸池  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

彭英杰  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

孙兵法  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王冰  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

常媛媛  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王建船  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

周旻昀  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

黄炜  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

徐曙彤  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

胡宽  硕士研究生  071020-生物技术与医药  

马腾飞  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杨荟  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

唐庆余  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

吕凤娟  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

吴丽静  硕士研究生  071020-生物技术与医药  

沈彤  硕士研究生  430139-生物工程  

朱军军  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

沈金龙  硕士研究生  085238-生物工程  

陶冶  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

李文婧  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王凯凯  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张世成  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王文帅  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王闪闪  硕士研究生  085238-生物工程  

张会冰  硕士研究生  085238-生物工程  

陆容  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

现指导学生

王嵘  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

朱涵文  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张春笑  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王志精  硕士研究生  071009-细胞生物学  

张真  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

白图雅  硕士研究生  085238-生物工程  

杨俊  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

叶洁  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

殷军  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

孙鹏凯  硕士研究生  085238-生物工程