基本信息
周金秋  男  博导  中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)
电子邮件: zhoulab@sibs.ac.cn
通信地址: 岳阳路320号生化所新大楼1303室
邮政编码: 200031
部门/实验室:生物化学与细胞生物学研究所

研究领域

        实验室的长远目标是探索真核细胞维持染色体稳定性的机制和细胞衰老的机理。真核细胞中的染色质分为常染色质和异染色质,处于常染色质区的基因表达活跃,而处于异染色质区的基因保持沉默。由于异染色质会扩展,常、异染色质之间会形成特异的“边界”。该边界的形成既有特异的DNA元件,也有染色质的修饰因子参与。在酿酒酵母中,位于染色体末端的端粒是研究染色质结构/功能、沉默、染色质边界形成/调节、以及DNA复制/重组等表观遗传调控的很好的模型。端粒是由简单的DNA重复序列及其结合蛋白组成。端粒对于维持染色体的稳定性,维持细胞连续分裂和防止细胞衰老具有非常重要的作用。在大多数真核生物中,端粒DNA是由特异性的反转录酶、即端粒酶合成的,在端粒酶缺失的情况下也可以由同源的重组途径合成。另外,端粒也是一种典型的异染色质结构,能抑制相邻的基因表达。
        鉴于端粒的异染色质的特性,以及酵母基因组具有灵活的遗传操作性,我们用酵母端粒作为特别的切入点来研究一些基础问题,比如端粒是如何保持染色体稳定性的;在常染色质和异染色质之间的边界是如何建立的;DNA双链损伤或端粒复制发生时所产生的表观遗传信息是什么;细胞衰老的分子基础又是什么。

招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
招生方向
细胞衰老和真核细胞维持染色体稳定性的机制

教育背景

1992-08--1997-05   美国迈阿密大学医学院   博士
1984-09--1988-06   南京大学   本科
学历


学位
   

工作经历

   
工作简历
2001-09~现在, 中科院上海生化细胞所, 研究员
1998-07~2001-09,美国普林斯顿大学, 博士后
1997-06~1998-05,美国迈阿密大学医学院, 博士后
1988-07~1992-07,中科院上海生化所, 研究助理
社会兼职
2014-08-01-今,中国生物化学与分子生物学会, 常务理事
2014-01-01-2016-12-31,Journal of Genetics and Genomics, 编委
2013-01-01-今,上海科技大学, 兼职教授
2012-07-01-2017-06-30,Journal of Biological Chemistry, 编委
2011-07-01-2016-06-30,PLoS Genetics, 副主编(Associate Editor)
2009-06-01-今,Journal of Molecular and Cellular Biology, 副主编
2007-01-01-2010-12-31,“Mechanisms of Aging and Development”杂志的编辑顾问委员会委员,
2003-01-01-今,中国生物化学与分子生物学会理事,
2003-01-01-今,中国遗传学会理事,
2003-01-01-今,中国细胞生物学会理事,
2002-02-01-2007-01-30,中国科学院与德国马普学会合作的青年科学家小组组长,

教授课程

Bio2000, 分子生物学
染色体,染色质和端粒
细胞周期调控的分子机制
细胞衰老

专利与奖励

   
奖励信息
   
专利成果
( 1 ) 一种人Pif1基因、其编码蛋白及其应用, 发明, 2008, 第 1 作者, 专利号: ZL 200410047385.3

出版信息

   
发表论文
(1) Rad6–Bre1-mediated H2B ubiquitination regulates telomere replication by promoting telomere-end resection, Nucleic Acids Research, 2017, 通讯作者
(2) MOF as an evolutionarily conserved histone crotonyltransferase and transcriptional activation by histone acetyltransferase- deficient and crotonyltransferase-competent CBP/p300, Cell Discovery, 2017, 第 10 作者
(3) Independent manipulation of histone H3 modifications in individual nucleosomes reveals the contributions of sister histones to transcription, elife, 2017, 通讯作者
(4) Molecular dynamics of de novo telomere heterochromatin formation in budding yeast, Journal of Genetics and Genomics, 2016, 通讯作者
(5) Tethering Telomerase to Telomeres Increases Genome Instability and Promotes Chronological Aging in Yeast, Aging, 2016, 通讯作者
(6) Inhibition of Telomere Recombination by Inactivation of KEOPS Subunit Cgi121 Promotes Cell Longevity, PloS Genetics, 2015, 通讯作者
(7) Yeast Hmt1 catalyses asymmetric dimethylation of histone H3 arginine 2 in vitro, Biochemical Journal, 2015, 通讯作者
(8) Telomere recombination preferentially occurs at short telomeres in telomerase-null type II survivors, PloS One, 2014, 通讯作者
(9) Telomerase-null survivor screening identifies novel telomere recombination regulators, Plos Genetics, 2013, 通讯作者
(10) Characterization of the intramolecular G-quadruplex promoting activity of Est1, FEBS Letters, 2013, 通讯作者
(11) The tail-module of yeast Mediator complex is required for telomere heterochromatin maintenance, Nucleic Acids Resserch, 2012, 通讯作者
(12) Recent transcription-induced histone H3K4 methylation inhibits gene reactivation, J. Biol. Chem., 2011, 通讯作者
(13) Histone H3 Lysine 4 Hypermethylation Prevents Aberrant Nucleosome Remodeling at the PHO5 Promoter, Molecular Cell Biology, 2011, 通讯作者
(14) Histone H4 Lysine 12 Acetylation Regulates Telomeric Heterochromatin Plasticity in Saccharomyces cerevisiae, Plos Genetics, 2011, 通讯作者
(15) Est1 Protects Telomeres and Inhibits Subtelomeric Y-Element Recombination, Molecular Cell Biology, 2011, 通讯作者
(16) Yeast telomerase subunit Est1p has guanine quadruplex–promoting activity that is required for telomere elongation, Nature Structural and Molecular Biology, 2010, 通讯作者
(17) SWR1 Complex Poises Heterochromatin Boundaries for Antisilencing Activity Propagation, Molecular Cell Biology, 2010, 通讯作者
(18) The N-terminus of histone H3 is required for de novo DNA methylation in chromatin, Proceedings of the National Academy of Sciences, 2009, 通讯作者
(19) Telomere Recombination Accelerates Cellular Aging in Saccharomyces cerevisiae, Plos Genetics, 2009, 通讯作者
(20) Histone deacetylase Rpd3 antagonizes Sir2-dependent silent chromatin propagation, Nucleic Acids Research, 2009, 通讯作者
(21) Sua5p a single-stranded telomeric DNA-binding protein facilitates telomere replication, The EMBO Journal, 2009, 通讯作者
(22) Ten1p promotes the telomeric DNA-binding activity of Cdc13p: implication for its function in telomere length regulation, Cell Research, 2009, 通讯作者
(23) Candida albicans,a distinctive fungal model for cellular aging study, Aging Cell, 2008, 通讯作者
(24) Structure of human MRG15 chromo domain and its binding to Lys36-methylated histone H3, Nucleic Acids Research, 2006, 通讯作者
(25) Characterization of ATPase Activity of Recombinant Human Pif1, Acta Biochimica et Biophysica Sinica, 2006, 通讯作者
(26) Schizosaccharomyces pombe pfh1 Encodes an Essential 5 to 3 DNA Helicase That Is a Member of the PIF1 Subfamily of DNA Helicases, Molecular Biology of the Cell, 2002, 第 1 作者
(27) Saccharomyces Rrm3p, a 5 to 3 DNA helicase that promotes replication fork progression through telomeric and subtelomeric DNA, Genes and Development, 2002, 第 1 作者
(28) Pif1p Helicase, a Catalytic Inhibitor of Telomerase in Yeast, Science, 2000, 第 1 作者
(29) The Saccharomyces Pif1p DNA Helicase and the Highly Related Rrm3p Have Opposite Effects on Replication Fork Progression in Ribosomal DNA, Cell, 2000, 第 1 作者
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 干细胞编程与重编程中表观遗传密码建立和维持的分子机制和结构基础, 参与, 国家级, 2011-01--2015-08
( 2 ) 组蛋白H4的K5/8/12乙酰化“密码”的建立和解读, 主持, 国家级, 2009-01--2012-12
( 3 ) 干细胞编程与重编程中表观遗传密码建立和维持的分子机制和结构基础, 参与, 国家级, 2011-01--2015-12
( 4 ) 端粒与染色体稳定性, 主持, 国家级, 2013-01--2017-08
( 5 ) 染色质共价修饰在表观遗传调控中的机制研究(表观遗传学), 主持, 国家级, 2013-01--2015-12
( 6 ) 端粒异染色质形成的分子基础, 主持, 国家级, 2013-01--2017-12
( 7 ) 端粒长度的遗传调控机制, 主持, 国家级, 2014-10--2016-09
( 8 ) 染色质共价修饰在表观遗传调控中的机制研究(表观遗传学), 主持, 国家级, 2016-01--2018-12
( 9 ) 表观遗传调控中关键蛋白质机器的结构功能研究, 参与, 国家级, 2016-07--2020-12
参与会议
(1)Independent manipulation of histone H3 modifications in individual nucleosomes reveals the contributions of sister histones to transcription   第三届遗传学和基因组学前沿会议   2017-10-09
(2)KEOPS Complex Affects DNA Double-Strand Break Repair by Promotion DNA End Resection   第十届中国模式真菌研讨会   2017-06-09
(3)Modifications on both sister histone H3s coordinate to regulate chromatin structure and transcription   第十二次全国基因功能与表观遗传调控学术研讨会   2017-06-01
(4)Asymmetrically modified nucleosomes poise genes for activation or repression   2016年度全国生化大会   2016-10-20
(5)Inhibition of telomere recombination promotes yeast cell longevity   2016-09-09
(6)Rad6-Bre1 mediated H2B ubiquitination regulates telomere replication by promoting telomere-end resection   苏州冷泉港   2016-09-05
(7)Rad6-Bre1 mediated H2B ubiquitination regulates telomere replication by promoting telomere-end resection   苏州冷泉港   2016-09-05
(8)Asymmetrically modified nucleosomes poise genes for activation/repression in yeast   第七届全国微生物遗传学学术研讨会   2016-08-05
(9)无   第九届中国模式真菌研讨会   2016-06-17
(10)The KEOPS complex regulates telomere replication and recombination independently of tRNA modification   苏州冷泉港   2016-06-13
(11)Asymmetrically modified nucleosomes poise gene activation/repression in yeast   苏州冷泉港   2016-05-09
(12)Inhibition of Telomere Recombination Promotes Cell Longevity   第十五屆美洲華人生物科學學會學術研討會   2015-06-26
(13)无   第八届中国模式真菌研讨会   2015-06-12
(14)Hmt1 dimer fulfills methylation of histone H3 arginine 2 in trans   第七届中国模式真菌研讨会   李宏韬   2014-05-30
(15)无   无   2014-04-30
(16)Histone H4 lysine 12 acetylation regulates telomere dynamics in Saccharomyces cerevisiae   染色质与表观遗传研讨会   Bo Zhou   2010-05-16
(17)The function of Est1p and Est3p in regulation of telomerase activity in Saccharomyces cerevisiae   第66届日本癌症学会年会   Jinqiu Zhou   2007-10-05

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生

已指导学生

张登宏  01  19183  

陈勇彬  01  19182  

付晓虹  01  19183  

廖新化  01  19183  

杨翠萍  01  19183  

张明亮  01  19183  

钱慰  01  19183  

黄妤  02  19182  

孟飞龙  01  19183  

陈小芬  01  19183  

周波  01  19183  

童夏静  01  19183  

胡琰  01  19183  

王珊珊  01  19183  

刘宁宁  01  19183  

彭晶  01  19183  

段一民  01  19183  

周振  01  19183  

现指导学生

刘雨婷  01  19183  

何明洪  01  19183  

张伶俐  01  19183  

刘颖颖  01  19183  

蔡琛  01  19183  

吴年凤  02  19183  

李亭宜  02  19183  

张琼娣  01  19183  

吴至竞   02  19182  

刘家程  01  19183  

温洋  01  19183