​主要从事计算生物学与新药开发方面的研究工作。其研究兴趣和领域包括：(1) 粗粒化弹性网络模型理论、算法和软件的开发与应用；(2) 高通量虚拟筛选、成药性模拟等计算机辅助药物设计算法、工具的开发与应用；(3) 基于多尺度模拟计算等方法的酶的理性设计与改造。

招收计算生物学、生物化学与分子生物学和计算机辅助药物设计方向的硕士研究生。

071010-生物化学与分子生物学
0710Z2-计算生物学
0710J3-生物信息学

计算机辅助药物设计
计算生物学
蛋白质理性设计

2010-09--2014-09   厦门大学   理学博士
2007-09--2010-07   华侨大学   理学硕士
2002-09--2006-07   华侨大学   工学学士

2010.09–2014.09 厦门大学 博士 化学生物学专业

2007.09–2010.07 华侨大学 硕士 生物化学与分子生物学专业 

2002.09–2006.07 华侨大学 本科 生物工程专业

   

2019-09~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院, 副研究员
2014-12~2019-08,美国匹兹堡大学, 博士后
2012-02~2014-07,台湾清华大学, 访问学者

生物技术前沿课程

   

（ 1 ） 评估抗菌肽抗菌力的系统及其使用方法, 发明, 2019, 第 3 作者, 专利号: ZL2016106824377
（ 2 ） In silico design of peptides equilibrated in a lipid bilayer with partition free energies indicating probability of antimicrobial activity, 发明, 2020, 第 3 作者, 专利号: US10810329B

Google Scholar:

https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=GZfKhjwAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate

（1） Network-based target prioritization and drug candidate identification for multiple sclerosis: from analyzing “omics data” to druggability simulations, ACS Chemical Neuroscience, 2021, 第 2 作者
（2） ProDy 2.0: Increased Scale and Scope after 10 Years of Protein Dynamics Modelling with Python, Bioinformatics, 2021, 通讯作者
（3） Pharmacological suppression of B7-H4 glycosylation restores antitumor immunity in immune-cold breast cancers, Cancer Discovery, 2020, 第 3 作者
（4） QuartataWeb: integrated chemical-protein-pathway mapping for polypharmacology and chemogenomics, Bioinformatics, 2020, 第 1 作者
（5） Modulation of Toroidal Proteins Dynamics in Favor of Functional Mechanisms upon Ligand Binding, Biophysical Journal, 2020, 第 1 作者
（6） Pharmmaker: Pharmacophore modeling and hit identification based on druggability simulations, Protein Science, 2020, 通讯作者
（7） A Novel Strategy to Block Mitotic Progression for Targeted Therapy, EBioMedicine, 2019, 第 2 作者
（8） Shared signature dynamics tempered by local fluctuations enables fold adaptability and specificity, Molecular Biology and Evolution, 2019, 第 2 作者
（9） Quantitative Systems Pharmacological Analysis of Drugs of Abuse Reveals the Pleiotropy of Their Targets and the Effector Role of mTORC1, Frontiers in Pharmacology, 2019, 第 2 作者
（10） DynOmics: dynamics of structural proteome and beyond, Nucleic Acids Research, 2017, 第 1 作者
（11） Dynamic Modulation of Binding Affinity as a Mechanism for Regulating Interferon Signaling, Journal of Molecular Biology, 2017, 第 1 作者
（12） iGNM 2.0: The Gaussian Network Model Database for Biomolecular Structural Dynamics, Nucleic Acids Research, 2016, 第 1 作者
（13） Molecular binding sites are located near the interface of intrinsic dynamics domains (IDDs), Journal of Chemical Information and Modeling, 2014, 第 1 作者

   

（ 1 ） 基于蛋白质机器动力学的相互作用网络研究：构建、分析与应用, 参与, 国家级, 2019-01--2022-12
（ 2 ） 复合型高通量虚拟筛选和优化靶向Cdc20的抗癌药物分子, 主持, 国家级, 2021-01--2023-12