​主要从事计算生物学与新药开发方面的研究工作。其研究兴趣和领域包括：(1) 粗粒化弹性网络模型理论、算法和软件的开发与应用；(2) 高通量虚拟筛选、成药性模拟等计算机辅助药物设计算法、工具的开发与应用；(3) 基于多尺度模拟计算等方法的酶的理性设计与改造。

招收计算生物学、生物信息学、生物化学与分子生物学和计算机辅助药物设计方向的硕士研究生和客座硕、博士学生。

0703Z1-化学生物学
071010-生物化学与分子生物学
086000-生物与医药

计算机辅助药物设计
计算生物学
蛋白质理性设计

2010-09--2014-09   厦门大学   理学博士
2007-09--2010-07   华侨大学   理学硕士
2002-09--2006-07   华侨大学   工学学士

2010.09–2014.09 厦门大学 博士 化学生物学专业

2007.09–2010.07 华侨大学 硕士 生物化学与分子生物学专业 

2002.09–2006.07 华侨大学 本科 生物工程专业

   

2019-09~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院, 副研究员
2014-12~2019-08,美国匹兹堡大学, 博士后
2012-02~2014-07,台湾清华大学, 访问学者

生物技术前沿课程

   

（ 1 ） In silico design of peptides equilibrated in a lipid bilayer with partition free energies indicating probability of antimicrobial activity, 发明专利, 2020, 第 3 作者, 专利号: US10810329B

（ 2 ） 评估抗菌肽抗菌力的系统及其使用方法, 发明专利, 2019, 第 3 作者, 专利号: ZL2016106824377

Google Scholar:

https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=GZfKhjwAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate

（1） Helical structure motifs made searchable for functional peptide design, Nature Communications, 2022, 第 3 作者
（2） Precise druggability of the PTH type 1 receptor, NATURE CHEMICAL BIOLOGY, 2022, 第 8 作者
（3） Network-Based Target Prioritization and Drug Candidate Identification for Multiple Sclerosis: From Analyzing "Omics Data" to Druggability Simulations, ACS CHEMICAL NEUROSCIENCE, 2021, 第 2 作者
（4） Editorial: Understanding Protein Dynamics, Binding and Allostery for Drug Design, FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES, 2021, 第 3 作者
（5） MolADI: A Web Server for Automatic Analysis of Protein-Small Molecule Dynamic Interactions, MOLECULES, 2021, 通讯作者
（6） ProDy 2.0: Increased Scale and Scope after 10 Years of Protein Dynamics Modelling with Python, Bioinformatics, 2021, 通讯作者
（7） Modulation of Toroidal Proteins Dynamics in Favor of Functional Mechanisms upon Ligand Binding, BIOPHYSICAL JOURNAL, 2020, 第 1 作者
（8） Pharmmaker: Pharmacophore modeling and hit identification based on druggability simulations, PROTEIN SCIENCE, 2020, 通讯作者
（9） Clinical HDAC Inhibitors Are Effective Drugs to Prevent the Entry of SARS-CoV2, ACS PHARMACOLOGY & TRANSLATIONAL SCIENCE, 2020, 第 7 作者
（10） QuartataWeb: Integrated Chemical–Protein-Pathway Mapping for Polypharmacology and Chemogenomics, BIOINFORMATICS, 2020, 第 1 作者
（11） Pharmacological suppression of B7-H4 glycosylation restores antitumor immunity in immune-cold breast cancers, Cancer Discovery, 2020, 第 1 作者
（12） Intrinsic dynamics is evolutionarily optimized to enable allosteric behavior, CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY, 2020, 第 6 作者
（13） Coenzyme Coupling Boosts Charge Transport through Single Bioactive Enzyme Junctions, ISCIENCE, 2020, 第 6 作者
（14） Quantitative Systems Pharmacological Analysis of Drugs of Abuse Reveals the Pleiotropy of Their Targets and the Effector Role of mTORC1, FRONTIERS IN PHARMACOLOGY, 2019, 第 2 作者
（15） A novel strategy to block mitotic progression for targeted therapy, EBIOMEDICINE, 2019, 第 2 作者
（16） Shared Signature Dynamics Tempered by Local Fluctuations Enables Fold Adaptability and Specificity, MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 2019, 第 2 作者
（17） DynOmics: dynamics of structural proteome and beyond, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2017, 第 1 作者
（18） Dynamic Modulation of Binding Affinity as a Mechanism for Regulating Interferon Signaling, JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2017, 第 1 作者
（19） iGNM 2.0: the Gaussian network model database for biomolecular structural dynamics, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2016, 第 1 作者
（20） Molecular Binding Sites Are Located Near the Interface of Intrinsic Dynamics Domains (IDDs), JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, 2014, 第 1 作者

   

（ 1 ） 复合型高通量虚拟筛选和优化靶向Cdc20的抗癌药物分子, 负责人, 国家任务, 2021-01--2023-12
（ 2 ） 不依赖heme的脱羧酶undA的理性设计改造, 负责人, 地方任务, 2022-01--2024-12
（ 3 ） 新一代实体瘤免疫治疗药物与技术研发团队, 参与, 地方任务, 2022-10--2027-09
（ 4 ） 蛋白复合物分子设计与合成关键算法研究, 参与, 地方任务, 2023-01--2025-12
（ 5 ） 含杂原子新型靶向药物及机制研究, 参与, 地方任务, 2023-01--2025-12