基本信息
寸玉鹏  男  硕导  中国科学院昆明植物研究所
电子邮件: cunyupeng@mail.kib.ac.cn
通信地址: 云南省昆明市蓝黑路132号
邮政编码:
部门/实验室:中国西南野生生物种质资源库

研究领域

主要是发展基于机器学习和统计学的计算生物学模型来理解生物复杂性。

招生信息

我们欢迎计算机、统计学和生物学类的学生报考我们生物信息组的研究组!现在实验室开放的客座研究生课题有:

  • 高通量基因组数据的组装和分析流程的优化(需要良好Python,unix shell等编程基础)
  • 网络数据的分析(需要良好的数学基础和R编程基础)
  • 多组学数据的网络整合方法(需要良好的数学基础和R编程基础)

如果你还有一年以上的时间,同时对如何用机器学习和统计学来分析大数据感兴趣,并准备为之付出你的努力,欢迎来邮件或直接到我们办公室咨询面谈。物理学、计算机、通信工程、统计学、计算数学类的研究生或对数据分析感兴趣的研究生都可。


招生专业
086000-生物与医药
0710Z2-计算生物学
招生方向
生物信息学

教育背景

2010-09--2013-09   德国波恩大学   自然科学博士学位
2004-09--2007-06   云南大学   理学硕士学位
2000-09--2004-06   云南大学   工学学士学位
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2018-07~现在, 中国科学院昆明植物所, 正高级工程师
2016-11~2018-06,云南省烟草农业科学研究院, 专业技术人员
2013-09~2016-10,德国科隆大学, 博士后
2009-07~2010-07,中国科学院北京基因组所, 助理研究员
2008-08~2009-06,中国科学院中德马普计算生物学伙伴所, 研究助理
2007-07~2008-07,中国科学院昆明动物所, 研究实习员
社会兼职
2019-11-20-今,中国生物信息学学会, 理事

教授课程

生物信息学

专利与奖励

   
奖励信息
   
专利成果
   

出版信息

   
发表论文
(1) Pan-cancer analysis of whole genomes, Nature, 2020, 其他(合作组作者)
(2) The evolutionary history of 2,658 cancers, Nature, 2020, 其他(合作组作者)
(3) Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig, Nature Communications, 2020, 其他(合作组作者)
(4) Inferring structural variant cancer cell fraction, Nature Communications, 2020, 其他(合作组作者)
(5) Integrative genomic profiling of large-cell neuroendocrine carcinomas reveals distinct molecular subtypes of high-grade neuroendocrine lung tumors, Nature Communications, 2018, 其他(合作组作者)
(6) Copy number analysis and inference of subclonal populations in cancer genomes using Sclust, Nature Protocols, 2018, 第 1 作者
(7) Two mouse models reveal an actionable PARP1 dependence in aggressive chronic lymphocytic leukemia, Nature Communications, 2017, 第 9 作者
(8) Transcriptomic profile of tobacco in response to Tomato zonate spot orthotospovirus infection, Virology Journal, 2017, 第 2 作者
(9) Comprehensive genomic profiles of small cell lung cancer, Nature, 2015, 第 4 作者
(10) netClass: an R-package for network based, integrative biomarker signature discovery, Bioinformatics, 2014, 第 1 作者
(11) Network and data integration for biomarker signature discovery via network smoothed T-statistics, PLoS ONE, 2013, 第 1 作者
(12) Prognostic gene signatures for patient stratification in breast cancer - accuracy, stability and interpretability of gene selection approaches using prior knowledge on protein-protein interactions, BMC Bioinformatics, 2012, 第 1 作者
(13) Biomarker gene signature discovery integrating network knowledge, Biology, 2012, 第 1 作者
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 发展机器学习模型用于智能植物志的物种分类和鉴定, 主持, 部委级, 2019-01--2021-12
( 2 ) 植物基因组从头组装和遗传变异分析平台的构建, 主持, 市地级, 2018-10--2020-09
( 3 ) 大尺度区域生物多样性格局与生命策略, 参与, 部委级, 2018-10--2022-12
参与会议
   

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生