071022-基因组学
071021-生物信息学
071007-遗传学

体细胞组学分析；单细胞组学
精准基因组医学数据分析

1999-09--2005-12   清华大学   研究生-博士
1995-09--1999-09   清华大学   本科-学士

-- 研究生

-- 博士

   

2009-05~现在, 中国科学院北京基因组研究所, 研究员
2006-03~2008-06,美国伊利诺伊大学香槟分校, 博士后

精准基因组医学新技术前沿研讨课
遗传咨询与未来医疗
基因组学与医学健康研讨课
遗传咨询入门

   

（1） Genetic Load and Potential Mutational Meltdown in Cancer Cell Populations, Molecular Biology and Evolution, 2019-05, 其他（合作组作者）
（2） DSMNC: a Database of Somatic Mutations in Normal Cells, Nucleic Acids Research, 2019-01, 通讯作者
（3） Histone arginine methylation by Prmt5 is required for lung branching morphogenesis through repression of BMP signaling, J Cell Sci, 2018, 第 6 作者
（4） Tumor diversity and evolution revealed through RADseq, Oncotarget, 2017, 第 5 作者
（5） 体细胞谱系追踪研究进展, Research advances in lineage tracing of somatic cells, 发育医学电子杂志, 2017, 通讯作者
（6） Acetoacetate Accelerates Muscle Regeneration and Ameliorates Muscular Dystrophy in Mice, Journal of Biological Chemistry, 2016, 第 4 作者
（7） Unique features of mutations revealed by sequentially reprogrammed induced pluripotent stem cells, Nature Communications, 2015, 通讯作者
（8） Whole Genome Sequencing Identifies Genetic Variances in Culture-Expanded Human Mesenchymal Stem Cells, Stem Cell Reports, 2014, 第 1 作者
（9） Exome sequencing identifies frequent mutation of MLL2 in non-small cell lung carcinoma from Chinese patients, Scientific Reports, 2014, 通讯作者
（10） Identification of medium-sized genomic deletions with low coverage, mate-paired restricted tags, BMC Genomics, 2013, 第 4 作者
（11） Determination of genomic copy number alteration emphasizing a restriction-site based strategy of genome re-sequencing, Bioinformatics, 2013, 通讯作者
（12） Sperm, but not oocyte, DNA methylome is inherited by zebrafish early embryos, Cell, 2013, 其他（合作组作者）
（13） Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by cell-population genetic analysis of whole-genome data, PNAS, 2011, 第 1 作者
（14） Modeling co-expression across species for complex traits: insights to the difference of human and mouse embryonic stem cells, PLoS Computational Biology, 2010, 第 1 作者
（15） A core Klf circuitry regulates self-renewal of embryonic stem cells, Nature Cell Biology, 2008, 第 2 作者
（16） Cross-species de novo identification of cis-regulatory modules with GibbsModule: application to gene regulation in embryonic stem cells., Genome Research, 2008, 第 2 作者
（17） A genome-wide survey of alternative translational initiation events in human., Science in China Series C: Life Sciences, 2007, 第 2 作者
（18） Alteration of protein subcellular location and domain formation by alternative translational initiation., Proteins, 2006, 第 1 作者
（19） Inferring protein -protein interactions from messenger RNA expression profiles with SVM., Journal of Biological Systems, 2005, 第 1 作者
（20） ATID: a web-oriented database for collection of publicly available alternative translational initiation events, Bioinformatics, 2005, 第 1 作者
（21） Classifying G-protein coupled receptors with bagging classification tree, Computational Biology and Chemistry, 2004, 第 2 作者

   

（ 1 ） 诱导多能干细胞的单细胞起源和特异性基因组变异来源组成的研究, 主持, 国家级, 2016-01--2019-12
（ 2 ） 基因组学与表观遗传信息深度挖掘, 主持, 国家级, 2018-07--2020-12

（1）A survey of somatic genome deletions and HBV DNA insertions in a Hepatocellular Carcinoma (HCC) case   Jun Cai   2010-09-27

已指导学生

张卓凡  硕士研究生  085238-生物工程  

李莹  硕士研究生  071022-基因组学  

庄雯  硕士研究生  0710Z1-基因组学  

李轩  硕士研究生  085238-生物工程  

苗雪霞  博士研究生  0710Z1-基因组学  

赵宁  硕士研究生  0710Z1-基因组学  

现指导学生

王力飞  博士研究生  0710Z1-基因组学  

于泽阳  博士研究生  0710Z1-基因组学  

崔博宇  博士研究生  0710Z1-基因组学  

许雯秋  博士研究生  0710Z1-基因组学  

王晓丹  硕士研究生  0710Z1-基因组学  

肖镜舒  硕士研究生  085238-生物工程  

聂瑞  博士研究生  0710Z1-基因组学  

李溪  硕士研究生  0710Z1-基因组学  

王翠霞  硕士研究生  0710Z1-基因组学  

李盼盼  博士研究生  0710Z1-基因组学