基本信息
鲍一明  男  博导  中国科学院北京基因组研究所
电子邮件: baoym@big.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号104楼
邮政编码:

招生信息

   
招生专业
071021-生物信息学
071022-基因组学
招生方向
生物数据库,病毒基因组注释,病毒进化与分类

教育背景

1991-01--1994-10   英国东英吉利大学   博士
1983-09--1987-07   北京大学   学士

工作经历

   
工作简历
2001-07~2017-03,美国国家生物信息中心, Staff Scientist
1994-11~2001-07,美国Noble基金会, 高级研究助理
1987-07~1991-01,北京大学, 助教
社会兼职
2019-06-05-今,国家基因组科学数据中心, 主任
2018-07-29-2021-07-28,中国科学院大学健康医疗大数据国家研究院, 副院长

教授课程

生物信息大数据挖掘分析和实践

出版信息

   
发表论文
(1) NucMap: a database of genome-wide nucleosome positioning map across species, Nucleic Acids Research, 2019, 第 10 作者
(2) iDog: an integrated resource for domestic dogs and wild canids, Nucleic Acids Research, 2019, 第 10 作者
(3) EWAS Atlas: a curated knowledgebase of epigenome-wide association studies, Nucleic Acids Research, 2019, 通讯作者
(4) Database Resources of the BIG Data Center in 2019, Nucleic Acids Research, 2019, 通讯作者
(5) Molecular evolutionary and structural analysis of familial exudative vitreoretinopathy associated FZD4 gene, BMC Evolutionary Biology, 2019, 通讯作者
(6) Characterization and identification of long non-coding RNAs based on feature relationship, Bioinformatics, 2019, 第 8 作者
(7) Evolutionary history of the human multigene families reveals widespread gene duplications throughout the history of animals, BMC Evolutionary Biology, 2019, 通讯作者
(8) Taxonomy of the family Arenaviridae and the order Bunyavirales: update 2018, Archives of Virology, 2018, 第 3 作者
(9) Current Status and Prospect of Life and Health Big Data, Bulletin of the Chinese Academy of Sciences, 2018, 通讯作者
(10) Overlapping genes and the proteins they encode differ significantly in their sequence composition from non-overlapping genes, PLoS ONE, 2018, 第 4 作者
(11) Prospects for national biological big data centers, 遗传, 2018, 通讯作者
(12) NCBI will no longer make taxonomy identifiers for individual influenza strains on January 15, 2018, PeerJ Preprints, 2018, 第 2 作者
(13) ICG: a wiki-driven knowledgebase of internal control genes for RT-qPCR normalization, Nucleic Acids Research, 2018, 第 10 作者
(14) Database Resources of the BIG Data Center in 2018, Nucleic Acids Research, 2018, 通讯作者
(15) Genome Variation Map: a data repository of genome variations in BIG Data Center, Nucleic Acids Research, 2018, 第 7 作者
(16) MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species, Nucleic Acids Research, 2018, 第 8 作者
(17) Preliminary Classification of Novel Hemorrhagic Fever-Causing Viruses Using Sequence-Based PAirwise Sequence Comparison (PASC) Analysis, Methods Mol Biol, 2018, 通讯作者
(18) Implementation of Objective PASC-Derived Taxon Demarcation Criteria for Official Classification of Filoviruses, Viruses, 2017, 第 1 作者
(19) A novel negative-stranded RNA virus mediates sex ratio in its parasitoid host, PLoS Pathology, 2017, 第 6 作者
(20) Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2017, Archives of Virology, 2017, 第 2 作者
(21) Virus Variation Resource - improved response to emergent viral outbreaks, Nucleic Acids Research, 2017, 第 3 作者
(22) Genomic Characterization of the Genus Nairovirus (Family Bunyaviridae), Viruses, 2016, 第 4 作者
(23) Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2016, Archives of Virology, 2016, 第 4 作者
(24) Reorganization and expansion of the nidoviral family Arteriviridae, Archives of Virology, 2016, 第 6 作者
(25) Reference sequence (RefSeq) database at NCBI: current status, taxonomic expansion, and functional annotation, Nucleic Acids Research, 2016, 第 10 作者
(26) Historical Outbreaks of Simian Hemorrhagic Fever in Captive Macaques Were Caused by Distinct Arteriviruses, Journal of Virology, 2015, 第 3 作者
(27) Past, present, and future of arenavirus taxonomy, Archives of Virology, 2015, 第 2 作者
(28) NCBI Viral Genomes Resource, Nucleic Acids Research, 2015, 第 3 作者
(29) Taxonomic reorganization of the family Bornaviridae, Archives of Virology, 2015, 第 3 作者
(30) Nomenclature- and Database-Compatible Names for the Two Ebola Virus Variants that Emerged in Guinea and the Democratic Republic of the Congo in 2014, Viruses, 2014, 第 4 作者
(31) Filovirus RefSeq Entries: Evaluation and Selection of Filovirus Type Variants, Type Sequences, and Names, Viruses, 2014, 第 3 作者
(32) Improvements to pairwise sequence comparison (PASC): a genome-based web tool for virus classification, Archives of Virology, 2014, 通讯作者
(33) Nuclear-cytoplasmic partitioning of the Cucumber mosaic virus 2b protein determines the balance between its roles as a virulence determinant and RNA silencing suppressor, Journal of Virology, 2014, 第 6 作者
(34) Virus Variation Resource--recent updates and future directions, Nucleic Acids Research, 2014, 第 2 作者
(35) Virus nomenclature below the species level: a standardized nomenclature for filovirus strains and variants rescued from cDNA, Archives of Virology, 2014, 第 2 作者
发表著作
(1) Hemorrhagic Fever Viruses, Springer, 2017-09, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 国际生命组学数据共享计划, 主持, 国家级, 2017-09--2020-07
( 2 ) 大数据驱动的生物信息领域创新示范平台, 主持, 部委级, 2018-01--2019-12
参与会议
   

指导学生

现指导学生

郭同坤  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

张韬  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

邢培琪  博士研究生  0710J3-生物信息学  

李萌伟  博士研究生  0710J3-生物信息学  

熊壮  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

李兆华  博士研究生  0710J3-生物信息学  

宗文婷  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

亢红恩  硕士研究生  0710J3-生物信息学  

杨飞  博士研究生  0710J3-生物信息学  

宫政  博士研究生  0710J3-生物信息学