基本信息

张臻峰  男  硕导  中国科学院微生物研究所
电子邮件: zhangzf#im.ac.cn(请将#改为@)
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院中国科学院微生物研究所A518
邮政编码: 100101

研究领域

极端微生物的遗传机制及合成生物学

    本研究组以极端嗜酸热古菌——硫化叶菌为模式,主要研究其遗传信息的存储与传递系统的高温环境适应性,主要包括染色体的组织包装、DNA复制与修复以及古菌病毒的宿主细胞裂解机制等。 同时,开展硫化叶菌的合成生物学相关研究,主要包括生长调控机制研究及底盘细胞构建等。

招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
071005-微生物学
招生方向
极端嗜热古菌遗传机制
极端微生物合成生物学
古菌病毒

教育背景

2001-09--2006-12   南开大学   博士
1997-09--2001-07   山东大学   学士

工作经历

   
工作简历
2010-07~2020-06,中国科学院微生物研究所, 副研究员
2007-03~2010-07,中国科学院微生物研究所, 助理研究员
社会兼职
2019-06-03-今,Front Microbiol审稿编辑, Review Editor

出版信息

   
发表论文
(1) Inhibition of K-Ras4B-plasma membrane association with a membrane microdomain-targeting peptide, Chemical Science, 2020, 第 2 作者
(2) Archaeal chromatin proteins Cren7 and Sul7d compact DNA by bending and bridging, mBio, 2020, 第 1 作者
(3) 探秘生命的第三种形式——我国古菌研究之回顾与展望, 中国科学:生命科学, 2019, 第 7 作者
(4) Architectural roles of Cren7 in folding crenarchaeal chromatin filament, Molecular Microbiology, 2019, 第 1 作者
(5) A novel Sulfolobus virus with an exceptional capsid architecture, Journal of virology, 2018, 第 9 作者
(6) Roles of Leu28 side chain intercalation in the interaction between Cren7 and DNA, The Biochemical journal, 2017, 第 1 作者
(7) Cleavage of The Double-strand Region in Alkali-denatured Supercoiled Plasmid pBR322 Leads to DNA Nodes, Progress in Biochemistry and Biophysics, 2016, 通讯作者
(8) Sequence-Dependent T:G Base Pair Opening in DNA Double Helix Bound by Cren7, a Chromatin Protein Conserved among Crenarchaea, PloS one, 2016, 第 2 作者
(9) aKMT Catalyzes Extensive Protein Lysine Methylation in the Hyperthermophilic Archaeon Sulfolobus islandicus but is Dispensable for the Growth of the Organism, Molecular & cellular proteomics, 2016, 第 5 作者
(10) Genome Sequencing of Sulfolobus sp. A20 from Costa Rica and Comparative Analyses of the Putative Pathways of Carbon, Nitrogen, and Sulfur Metabolism in Various Sulfolobus Strains, Frontiers in microbiology, 2016, 第 3 作者
(11) 大肠杆菌 topA -细胞中tetA-cfaABCE 的高效转录促进 DNA 凝集, 中山大学学报(自然科学版), 2015, 通讯作者
(12) Insights into the interaction between Cren7 and DNA: the role of loop beta3-beta4, Extremophiles, 2015, 第 1 作者
(13) 大肠杆菌 topA -细胞中tetA-cfaABCE 的高效转录促进 DNA 凝集, 中山大学学报(自然科学版), 2015, 通讯作者
(14) Archaeal chromatin proteins, Science China Life sciences, 2012, 第 1 作者
(15) Identification and characterization of a highly conserved crenarchaeal protein lysine methyltransferase with broad substrate specificity, Journal of bacteriology, 2012, 第 2 作者
(16) Structural and functional characterization of the C-terminal catalytic domain of SSV1 integrase, Acta crystallographica Section D, Biological crystallography, 2012, 第 4 作者
(17) Structural insights into the interaction of the crenarchaeal chromatin protein Cren7 with DNA, Molecular microbiology, 2010, 第 1 作者
(18) 在拓扑异构酶Ⅰ缺失的大肠杆菌中拓扑异构酶Ⅲ参与高负超螺旋的消除(英文), 南开大学学报(自然科学版), 2009, 第 2 作者
(19) Biochemical and structural characterization of Cren7, a novel chromatin protein conserved among Crenarchaea, Nucleic acids research, 2008, 第 3 作者
(20) Visualization of alkali-denatured supercoiled plasmid DNA by atomic force microscopy, Biochemical and biophysical research communications, 2008, 第 2 作者
(21) Studies on the supercondensed pBR322 DNA isolated from Escherichia coli topA(-) mutant, Progress in Biochemistry and Biophysics, 2007, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 古菌真核类型引发酶的亚基性质与功能演化的研究, 参与, 国家级, 2018-01--2022-12
( 2 ) 硫化叶菌染色质蛋白Cren7与Sul7d组织包装DNA的分子机制, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
( 3 ) 硫化叶菌中Cren7蛋白在染色体组织中的作用, 主持, 国家级, 2010-01--2012-12
( 4 ) 极端嗜热古菌小分子核酸结合蛋白的研究, 参与, 国家级, 2012-01--2016-12
( 5 ) 古菌引物合成与延伸的偶联机制及调控规律, 参与, 国家级, 2008-01--2012-12
( 6 ) 极端微生物底盘细胞的设计与构建(课题2:耐热、耐酸微生物底盘细胞的设计构建与表征), 参与, 国家级, 2020-04--2025-03
参与会议
(1)Organization of Crenarchaeal Chromosomal DNA by Cren7 and Sso7d: DNA Bending and Bridging   15th International Congress on Thermophiles   2019-09-02
(2)Chromosomal DNA Organization in Sulfolobus: Roles of Cren7 and Sul7d   11th International Congress on Extremophiles   2016-09-12
(3)泉古菌染色质蛋白Cren7组织包装DNA的分子机制   2015年中国微生物学会学术年会   2015-10-23
(4)Structural analysis of DNA binding by Cren7 monomers adjacently located on the DNA   12th International Conference on Thermophiles   2013-09-08
(5)Crenarchaeal chromatin protein – Cren7   Sino-Danish archaea biology and biotechnology symposium   2011-09-22
(6)Insights into the interaction between Cren7 from Sulfolobus slfataricus with dsDNA: the role of Lβ3β4   10th International Conference on Thermophiles Research   2009-09-08

指导学生

现指导学生

丁念念  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学