结构生物学，生物化学，生物物理

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071010-生物化学与分子生物学

结构生物学, 生物化学

2003-07--2003-12   德国布伦布仑其维克科技大学植物生物学院（访问学生）   无
1999-09--2004-09   纽约州立大学石溪分校生理及生物物理系   博士
1997-09--1999-07   纽约市立大学物理系   硕士
1993-09--1997-07   复旦大学物理系   学士
1992-09--1993-07   南昌陆军学院（大学入学军训）   无

1999-09--2004-09   纽约州立大学石溪分校生理及生物物理系   博士
1997-09--1999-07   纽约市立大学物理系   硕士
1993-09--1997-07   复旦大学物理系   学士

物理学学士、硕士；生物物理学博士

2009-10~现在, 中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所, 研究员
2004-10~2009-08,哥伦比亚大学生物学系, 博士后

结构生物学与营养科学

   

（1） Crystal Structure of Glycogen Debranching Enzyme and Insights into Its Catalysis and Disease-Causing Mutations, Nature Communications, 2016, 通讯作者
（2） mRNA quality control at the 5' end, J Zhejiang Univ Sci B, 2014, 通讯作者
（3） Advances in structural studies of biotin-dependent carboxylases, Chinese Bulletin of Life Sciences, 2013, 通讯作者
（4） Structure and Function of Allophanate Hydrolase, JBC, 2013, 通讯作者
（5） Crystal structure of urea carboxylase provides insights into the carboxyltransfer reaction, JBC, 2012, 通讯作者
（6） Structural and biochemical studies of the 5’-3’ exoribonuclease Xrn1, Nat Struct Mol Biol, 2011, 第 1 作者
（7） Identification of a quality-control mechanism for mRNA 5’-end capping, Nature, 2010, 第 2 作者
（8） Crystal structure of the human symplekin-Ssu72-CTD phosphopeptide complex, Nature, 2010, 第 2 作者
（9） Cryo-EM Analysis Reveals New Insights into the Mechanism of Action of Pyruvate Carboxylase, Structure, 2010, 第 4 作者
（10） Structure and function of the 5’-3’ exoribonuclease Rat1 and its activating partner Rai1, Nature, 2009, 第 1 作者
（11） A symmetrical tetramer for S. aureus pyruvate carboxylase in complex with coenzyme A, Structure, 2009, 第 2 作者
（12） Real-time fluorescence detection of exoribonucleases, RNA, 2009, 第 3 作者
（13） A different mechanism for the inhibition of the carboxyltransferase domain of acetyl-coenzyme A carboxylase by tepraloxydim, Proc Natl Acad Sci U S A, 2009, 第 1 作者
（14） Crystal structures of human and Staphylococcus aureus pyruvate carboxylase and molecular insights into the carboxyltransfer reaction, Nat Struct Mol Biol, 2008, 第 1 作者
（15） Mutational analysis of Escherichia coli MoeA: two functional activities map to the active site cleft, Biochemistry, 2007, 第 2 作者
（16） structure of 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase, a crucial enzyme for isoprenoids biosynthesis, J Biol Chem, 2007, 第 1 作者
（17） Crystal structure of human nicotinamide riboside kinase, Structure, 2007, 第 1 作者
（18） The crystal structure of yeast protein disulfide isomerase suggests cooperativity between its active sites, Cell, 2006, 第 2 作者
（19） The crystal structure of Cdc42 in complex with collybistin II, a gephyrin-interacting guanine nucleotide exchange factor, J Mol Biol, 2006, 第 1 作者
（20） Structural insights into sulfite oxidase deficiency, J Biol Chem, 2005, 第 4 作者
（21） On the relationship between protein stability and folding kinetics: a comparative study of the N-terminal domains of RNase HI, E. coli and Bacillus stearothermophilus L9, J Mol Biol., 2001, 第 2 作者
（22） The crystal structure of Escherichia coli MoeA and its relationship to the multifunctional protein gephyrin, Structure, 2001, 第 1 作者

Ribonucleases (Chapter 7, 5'-3' Exoribonucleases), Springer, 2011-01, 第 2 作者
Eukaryotic RNases and Their Partners in RNA Degradation and Biogenesis, part A (Chapter 6, Structures of 5'–3' Exoribonucleases), Elsvier, 2012-01, 第 2 作者
Isoprenoid Synthesis in Plants and Microorganisms: New Concepts and Experimental Approaches (Chapter 2, 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase (DXS), a Crucial Enzyme for Isoprenoids Biosynthesis), Springer, 2013-01, 第 1 作者

代谢关键蛋白质的结构和功能机理
机体的代谢包括多个复杂过程，多种蛋白质在其中发挥作用，理解这些蛋白质行使功能的机制是深入认识相关代谢通路重要的一步。我们运用X射线晶体学的方法，以结构研究为切入点，结合生物物理、生物化学等手段揭示代谢关键蛋白质行使功能的分子机理。我们的研究也为以这些蛋白质为靶点的药物设计提供结构基础。已在Nature、Nature Structural and  Molecular Biology、PNAS、Structure、JBC等刊物上发表文章20余篇。
（1）糖脂代谢。糖脂代谢是能量代谢的重要部分，它的紊乱与肥胖和糖尿病等疾病密切相关。在这个方向上，我们的研究对象包括Pyruvate Carboxylase (PC)、Acetyl-CoA   Carboxylase(ACC)、若干参与调控糖原与葡萄糖相互转化的蛋白质等。我们期望通过揭示这些蛋白质的结构和功能机理，为糖尿病等疾病的防治提供指导。PC与ACC同属于依赖生物素的羧化酶，为深入认识这一酶家族的功能机理，我们也正在开展对该家族另一成员Urea Amidolyase的结构和功能研究。
（2）核酸代谢。5’-3’  RNA外切酶（5’-3’eXoRiboNuclease,   XRN）从5’端降解RNA分子，释放单核酸。该家族包括Xrn1、Xrn2等成员，在真核生物中高度保守，具有重要的功能。Xrn1分布在细胞质内，是mRNA降解的关键酶；Xrn2分布在细胞核内，它的酶活性在mRNA转录终止过程中起关键作用。我们揭示了Xrn1和Xrn2的结构和它们催化RNA剪切反应的机制。我们的工作也表明Rai1，一个Xrn2的激活因子，具有新颖的酶活性，在mRNA分子的质量控制中起关键作用。Rai1催化未被正确加帽的mRNA分子的脱帽反应，导致这些mRNA分子的降解和清除。

（ 1 ） 细胞膜重要脂质代谢产物对重大疾病病理生理过程的调控, 参与, 国家级, 2010-01--2014-12
（ 2 ） 重要蛋白质复合物的结构与功能研究, 参与, 国家级, 2011-01--2015-12
（ 3 ） 对Rad18和Rad5的结构和功能研究, 主持, 国家级, 2011-01--2011-12
（ 4 ） 糖原代谢关键蛋白质的结构和功能研究, 主持, 国家级, 2016-01--2019-12

（1）Crystal Structure of Glycogen Debranching Enzyme and Insights into Its Catalysis and Disease-Causing Mutations   第五届中国结构生物学学术讨论会   2016-04-27
（2）Structural and Functional Studies of Urea Amidolyase   第四届中国结构生物学学术讨论会   2013-03-31

已指导学生

樊晨  01  19183  

翟丽婷  01  19183  

赵婧  01  19183  

现指导学生

宋宜辉  01  19183  

沈苗苗  01  19183  

徐鑫  01  19183  

李晓帆  02  19183  

余俊  01  19183  

章洪伟  02  63228  

张行  01  19183