基本信息
孙喆  男  博导  中国科学院天津工业生物技术研究所
电子邮件: sunzhe@tib.cas.cn
通信地址: 天津市空港经济区西七道32号
邮政编码: 300308

招生信息

   
招生专业
071010-生物化学与分子生物学
071005-微生物学
招生方向
细菌转录调控;合成生物学;微生物代谢工程

教育背景

2009-09--2022-05   中国科学院上海生命科学研究院   博士
2005-09--2009-06   哈尔滨工业大学   学士

工作经历

   
工作简历
2021-12~现在, 中国科学院天津工业生物技术研究所, 研究员
2015-06~2021-10,美国国立卫生研究院/国家癌症研究所, 博士后
2009-09~2022-05,中国科学院上海生命科学研究院, 博士
2005-09~2009-06,哈尔滨工业大学, 学士

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 木糖转运蛋白及其应用, 2014, 第 3 作者, 专利号: CN104177480A

( 2 ) 一种提高丙酮丁醇梭菌在混合糖发酵中糖利用率的方法, 2012, 第 7 作者, 专利号: CN102796692A

出版信息

   
发表论文
(1) Nascent RNA sequencing identifies a widespread sigma70-dependent pausing regulated by Gre factors in bacteria, NATURE COMMUNICATIONS, 2021, 第 1 作者
(2) Escherichia coli σ38 promoters use two UP elements instead of a −35 element: resolution of a paradox and discovery that σ38 transcribes ribosomal promoters, bioRxiv, 2020, 第 2 作者
(3) Density of σ70 promoter-like sites in the intergenic regions dictates the redistribution of RNA polymerase during osmotic stress in Escherichia coli, Nucleic Acids Research, 2019, 第 1 作者
(4) Imaging of transcription and replication in the bacterial chromosome with multicolor Three-Dimensional Superresolution Structured Illumination Microscopy, Methods in Molecular Biology, 2018, 第 3 作者
(5) Extrachromosomal Nucleolus-Like Compartmentalization by a Plasmid-Borne Ribosomal RNA Operon and Its Role in Nucleoid Compaction, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2018, 第 2 作者
(6) Nucleolus-like compartmentalization of the transcription machinery in fast-growing bacterial cells, CRITICAL REVIEWS IN BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 2017, 第 3 作者
(7) Molecular mechanism of environmental d -xylose perception by a XylFII-LytS complex in bacteria, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2017, 第 4 作者
(8) A novel three-component system-based regulatory model for D-xylose sensing and transport in Clostridium beijerinckii, MOLECULAR MICROBIOLOGY, 2015, 第 1 作者
(9) Reconstruction of xylose utilization pathway and regulons in Firmicutes, BMC GENOMICS, 2010, 第 4 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 基于转录调控的微生物代谢进化及应用, 负责人, 地方任务, 2022-02--2025-01
( 2 ) 细菌转录起始阶段重复转录的分子机制研究, 负责人, 国家任务, 2023-01--2026-12
( 3 ) 营养化学品生物合成元件的挖掘、设计和优化, 负责人, 国家任务, 2023-02--2027-01