基本信息
黄涛  男  博导  中国科学院上海营养与健康研究所
电子邮件: huangtao@sibs.ac.cn
通信地址: 上海市徐汇区岳阳路320号
邮政编码: 200031

招生信息

   
招生专业
0710Z2-计算生物学
招生方向
计算生物学
机器学习
网络分析

教育背景

2007-09--2012-07   中国科学院上海生命科学研究院   博士
2003-09--2007-07   华中科技大学   学士

工作经历

   
工作简历
2020-11~现在, 中国科学院上海营养与健康研究所, 青年研究员
2014-11~现在, 中国科学院上海营养与健康研究所, 副研究员
2012-08~2014-08,美国纽约西奈山伊坎医学院, 博士后
2007-09~2012-07,中国科学院上海生命科学研究院, 博士
2003-09~2007-07,华中科技大学, 学士
社会兼职
2019-10-29-今,中国科学院青年创新促进会生命分会, 副会长

专利与奖励

   
奖励信息
(1) Big Data Research Top Cited Articles Award Winner, 特等奖, 其他, 2019

出版信息

   
发表论文
(1) Investigating the gene expression profiles of cells in seven embryonic stages with machine learning algorithms, Genomics, 2020, 通讯作者
(2) The methylation pattern for knee and hip osteoarthritis, Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2020, 通讯作者
(3) MiR-139-5p/SLC7A11 inhibits the proliferation, invasion and metastasis of pancreatic carcinoma via PI3K/Akt signaling pathway, BBA Molecular Basis of Disease, 2020, 通讯作者
(4) Identifying robust microbiota signatures and interpretable rules to distinguish cancer subtypes, Frontiers in Molecular Biosciences, 2020, 通讯作者
(5) Decipher the connections between proteins and phenotypes, BBA Proteins and Proteomics, 2020, 通讯作者
(6) Identification of leukemia stem cell expression signatures through Monte Carlo feature selection strategy and support vector machine, Cancer Gene Therapy, 2019, 通讯作者
(7) Identifying methylation pattern and genes associated with breast cancer subtypes, International Journal of Molecular Sciences, 2019, 通讯作者
(8) Identifying Essential Signature Genes and Expression Rules Associated With Distinctive Development Stages of Early Embryonic Cells, IEEE Access, 2019, 通讯作者
(9) Immunosignature screening for multiple cancer subtypes based on expression rule, Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2019, 通讯作者
(10) The transcriptome difference between colorectal tumor and normal tissues revealed by single-cell sequencing, Journal of Cancer, 2019, 通讯作者
(11) Proteogenomic characterization and comprehensive integrative genomic analysis of human colorectal cancer liver metastasis, Molecular Cancer, 2018, 第 2 作者
(12) Gene expression differences among different MSI statuses in colorectal cancer, International Journal of Cancer, 2018, 通讯作者
(13) Next-generation sequencing identifies novel genes with rare variants in total anomalous pulmonary venous connection, EBioMedicine, 2018, 第 2 作者
(14) Implications of Newly Identified Brain eQTL Genes and Their Interactors in Schizophrenia, Molecular Therapy Nucleic Acids, 2018, 第 2 作者
(15) Classification of widely and rarely expressed genes with recurrent neural network, Computational and Structural Biotechnology Journal, 2018, 通讯作者
发表著作
Computational Systems Biology - Methods and Protocols, Springer, 2018-03, 第 1 作者
Precision Medicine, Springer, 2020-07, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 基于转录组测序大数据的肺癌PDX模型评估方法研究, 主持, 国家级, 2018-01--2020-12
( 2 ) 上海市科技重大“国际表型组计划”开放课题 基于深度学习与网络向量化的疾病基因与表型研究, 主持, 省级, 2019-01--2020-12
( 3 ) 精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发, 参与, 国家级, 2018-06--2021-06
( 4 ) 创建生态草牧业科技体系, 参与, 部委级, 2020-11--2024-12
( 5 ) 多维大数据驱动的中国人群精准健康研究, 参与, 部委级, 2020-01--2024-12
参与会议
(1)精准医学大数据整合分析   中国科学院青年创新促进会2020年学术年会   2020-10-27
(2)可解释机器学习和多组学网络整合分析在精准医学中的应用   中国科学院青年创新促进会第二届青年生命科学论坛   2020-09-24
(3)Accelerate Precision Medicine with Machine Learning and Network Analysis of Biomedical Big Data   2020-09-11
(4)精准医学中的机器学习和网络分析   生物信息、精准医疗与大数据分析国际会议   2019-11-29
(5)生物信息学在生物医学新技术发展中的应用   中国科学院分子细胞科学卓越创新中心青年科学家论坛   2019-11-02
(6)多组学数据整合分析在癌症研究中的应用   中国科学院青年创新促进会2019年学术年会   2019-10-16
(7)生物信息学在免疫性疾病中的应用   江苏省医学会风湿病学分会青年委员会临床科研学术论坛   2019-08-25
(8)肝癌基因及其分子调控网络研究   第九届全国肝脏疾病新观念新技术学习班   2019-07-05
(9)精准医学生物信息分析与应用   中国科学院青年创新促进会首届青年生命科学论坛   2019-04-25
(10)精准医学中的机器学习和网络分析方法   中国科学院青年创新促进会上海分会生命科学前沿交叉与创新论坛   2019-01-12
(11)肺癌大数据开发与转化   中国肿瘤精准检测与靶向治疗峰会   2018-11-10
(12)精准医学中的计算方法研究   中国科学院青年创新促进会2018年学术年会   2018-11-05
(13)The applications of deep learning in biomedicine   2018-10-11
(14)深度学习技术在生物医学中的应用   NVIDIA HPC & AI GPU技术研讨会   2018-07-12
(15)机器学习和网络分析在肿瘤研究中的应用   常州市医学会肿瘤分会医学统计及生物信息学组成立大会   2018-04-21
(16)预测模型在生命科学中的应用   中国科学院青年创新促进会2017年学术年会   2017-11-05
(17)Machine Learning and Graph Theory in Health Sciences   2017-08-22
(18)Deciphering the mechanisms of complex diseases using machine learning and network analysis approaches   2017-06-20
(19)利用机器学习方法研究扰动对生物系统的影响   合成生物学青年论坛   2017-02-21
(20)整合多组学大数据从网络角度揭示复杂疾病致病机制   中国科学院青年创新促进会2016年学术年会   2016-11-15
(21)Identification of novel candidate drivers connecting different dysfunctional levels for lung adenocarcinoma   2016-08-18