海洋细菌和珊瑚共生菌中可移动遗传元件的功能和应用研究

   

070703-海洋生物学

海洋生物学

2007-09--2013-06   华中农业大学   硕博连读
2003-09--2007-07   贵州大学   学士

   

2017-12~现在, 中国科学院南海海洋研究所, 副研究员
2013-07~2017-12,中国科学院南海海洋研究所, 助理研究员

   

（ 1 ） 一种调控珊瑚菌群的温和噬菌体VneM1及其应用, 专利授权, 2021, 第 3 作者, 专利号: CN112011520B

（ 2 ） 一种生物膜基因岛GIVal43097及其切除方法, 发明专利, 2020, 第 2 作者, 专利号: CN112143741A

   

（1） Mobile genetic elements used by competing coral microbial populations increase genomic plasticity, ISME JOURNAL, 2022, 第 1 作者
（2） The coral pathogen Vibrio coralliilyticus kills non-pathogenic holobiont competitors by triggering prophage induction, NATURE ECOLOGY & EVOLUTION, 2022, 第 3 作者
（3） The HipAB Toxin-Antitoxin System Stabilizes a Composite Genomic Island in Shewanella putrefaciens CN-32, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2022, 通讯作者
（4） Conjugative plasmid-encoded toxin-antitoxin system PrpT/PrpA directly controls plasmid copy number, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2021, 通讯作者
（5） Eliminating mcr-1-harbouring plasmids in clinical isolates using the CRISPR/Cas9 system, JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY, 2019, 第 1 作者
（6） A minireplicon of plasmid pBMB26 represents a new typical replicon in the megaplasmids of Bacillus cereus group, JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY, 2018, 第 1 作者
（7） Dissemination and loss of a biofilm-related genomic island in marine Pseudoalteromonas mediated by integrative and conjugative elements, ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2017, 第 1 作者
（8） Interaction of Type IV Toxin/Antitoxin Systems in Cryptic Prophages of Escherichia coli K-12, TOXINS, 2017, 第 2 作者
（9） Mob oriT , a mobilizable site-specific recombination system for unmarked genetic manipulation in Bacillus thuringiensis and Bacillus cereus, MICROBIAL CELL FACTORIES, 2016, 第 1 作者
（10） Curing of plasmid pBMB28 from Bacillus thuringiensis YBT-020 using an unstable replication region, JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY, 2016, 第 1 作者
（11） Complete genome sequence of Vibrio alginolyticus ATCC 33787T isolated from seawater with three native megaplasmids, MARINE GENOMICS, 2016, 第 1 作者
（12） Development of an efficient conjugation-based genetic manipulation system for Pseudoalteromonas, MICROBIAL CELL FACTORIES, 2015, 第 1 作者
（13） Complete genome sequence of Bacillus thuringiensis YBT-1518, a typical strain with high toxicity to nematodes, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2014, 第 1 作者
（14） The resolution and regeneration of a cointegrate plasmid reveals a model for plasmid evolution mediated by conjugation and oriT site-specific recombination, ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2013, 第 1 作者

   

（ 1 ） P4类隐蔽性原噬菌体对宿主菌环境适应性的生理功能研究, 负责人, 国家任务, 2015-01--2017-12
（ 2 ） 珊瑚来源假交替单胞菌SCSIO 11900中基因岛对生物膜的调控及应用研究, 负责人, 地方任务, 2019-10--2022-09
（ 3 ） SXT/R391元件介导丛生盔形珊瑚共生微生物互作的机理研究, 负责人, 地方任务, 2020-04--2023-03
（ 4 ） 温和噬菌体VneM1调控珊瑚共生菌群落组成的机制研究, 负责人, 国家任务, 2021-01--2024-12
（ 5 ） 院青年创新促进会会员项目, 负责人, 中国科学院计划, 2021-01--2024-12

（1）Benefits and Risks of Using the CRISPR/Cas9 System to Eliminate mcr-1-harboring Plasmids in Clinical Isolates   2019美国微生物学年会   2019-06-19
（2）Activation Mechanism of Silent Genomic Islands Mediated by Integrative and Conjugative Elements   2018美国微生物学会年会   2018-06-07

现指导学生

杜晓飞  硕士研究生  070703-海洋生物学  

唐欢  硕士研究生  070703-海洋生物学