基本信息
徐志建  男  硕导  中国科学院上海药物研究所
电子邮件: zjxu@simm.ac.cn
通信地址: 上海市浦东新区祖冲之路555号1201室
邮政编码: 201203

招生信息

   
招生专业
100720-药物设计学
招生方向
计算机辅助药物设计
化学信息学
分子模拟

教育背景

2007-09--2012-06   中国科学院上海药物研究所   理学博士
2003-09--2007-07   山东大学   理学学士

工作经历

   
工作简历
2015-10~现在, 中国科学院上海药物研究所, 副研究员
2014-08~2015-09,中国科学院上海药物研究所, 助理研究员
2012-07~2014-07,中国科学院上海药物研究所, 博士后
社会兼职
2018-01-01-2019-12-31,Journal of Chemical Information and Modeling ECB (Early Career Board) member,

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 原花青素及其类似物在制备抗寨卡病毒的药物中的应用, 发明, 2017, 第 4 作者, 专利号: 201710703223.8
( 2 ) 雷复尼特和氯生太尔在制备抗肿瘤药物中的应用, 发明, 2016, 第 2 作者, 专利号: 201610124976.9
( 3 ) 一种治疗乙型肝炎的联合用药物, 发明, 2016, 第 3 作者, 专利号: ZL201310103706.6
( 4 ) 4-羟基水杨酰苯胺在制备抗癌药物中的应用, 发明, 2013, 第 3 作者, 专利号: ZL201110363959.8

出版信息

   
发表论文
(1) Underestimated Halogen Bonds Forming with Protein Backbone in Protein Data Bank, J. Chem. Inf. Model, 2017, 通讯作者
(2) The Underestimated Halogen Bonds Forming with Protein Side Chains in Drug Discovery and Design, J. Chem. Inf. Model., 2017, 通讯作者
(3) How do Distance and Solvent Affect the Halogen Bonding Involving Negatively Charged Donors?, J. Phys. Chem. B, 2016, 通讯作者
(4) Repositioning organohalogen drugs: a case study for identification of potent B-Raf V600E inhibitors via docking and bioassay, Scientific Reports, 2016, 通讯作者
(5) Stability and Characteristics of the Halogen Bonding Interaction in an Anion-Anion Complex: A Computational Chemistry Study., J. Phys. Chem. B, 2016, 通讯作者
(6) Inhibition of hepatitis B virus replication by targeting ribonucleotide reductase M2 protein., Biochem. Pharmacol., 2016, 第 2 作者
(7) Like-Charge Guanidinium Pairing between Ligand and Receptor: An Unusual Interaction for Drug Discovery and Design?, J. Phys. Chem. B, 2015, 通讯作者
(8) Unstable, metastable, or stable halogen bonding interaction involving negatively charged donors? A statistical and computational chemistry study., J. Phys. Chem. B, 2014, 第 2 作者
(9) Halogen Bond: Its Role beyond Drug-Target Binding Affinity for Drug Discovery and Development., J. Chem. Inf. Model., 2014, 第 1 作者
(10) The conserved Lys-95 charged residue cluster is critical for the homodimerization and enzyme activity of human ribonucleotide reductase small subunit M2., J. Biol. Chem., 2014, 第 2 作者
(11) Important Role of SUMOylation of Spliceosome Factors in Prostate Cancer Cells., J. Proteome Res., 2014, 第 2 作者
(12) The Stabilization Effect of Dielectric Constant and Acidic Amino Acids on Arginine-Arginine (Arg-Arg) Pairings: Database Survey and Computational Studies, J. Phys. Chem. B, 2013, 第 2 作者
(13) Combining pharmacophore, docking and substructure search approaches to identify and optimize novel B-RafV600E inhibitors., Bioorg. Med. Chem. Lett., 2012, 第 1 作者
(14) Utilization of Halogen Bond in Lead Optimization: a Case Study of Rational Design of Potent Phosphodiesterase Type 5 (PDE5) Inhibitors., J. Med. Chem., 2011, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 基于E级高性能计算生物医药应用软件系统研制及应用, 参与, 国家级, 2017-07--2020-12
( 2 ) 镁离子通道蛋白的结构和功能研究, 参与, 国家级, 2016-07--2021-06