基本信息
陈楠生  男  博导  中国科学院海洋研究所
电子邮件: chenn@qdio.ac.cn
通信地址: 青岛市南海路7号
邮政编码:
部门/实验室:海洋生态与环境科学重点实验室

研究领域

   

招生信息

   
招生专业
070703-海洋生物学
招生方向
基因组学、生物信息学、遗传学
生态学
分子进化

教育背景

2000-01--2002-06   加拿大英属哥伦比亚大学   软件系统硕士
1989-09--1994-10   中国科学院海洋研究所   博士
1984-09--1989-07   复旦大学   学士
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2013-09~现在, 加拿大西蒙菲沙大学, 终身正教授
2009-09~2013-09,加拿大西蒙菲沙大学, 终身副教授
2006-07~2009-09,加拿大西蒙菲沙大学, 副教授
2002-09~2006-06,美国冷泉港实验室, (非终身)研究员
1996-07~2000-12,加拿大英属哥伦比亚大学, 博士后
1994-12~1996-06,美国犹他大学, 博士后
社会兼职
2016-01-01-今,Board member: NSERC-CREATE Training Program in Bioinformatics at Simon Fraser University, University of British Columbia, and BC Cancer Agency,
2013-12-31-今,MBB/Simon Fraser University seminar coordinator and organizer,
2013-01-01-今,Committee Member of APBC (2013),
2011-01-01-今,Associate Editor: Frontiers in Genetics,
2011-01-01-今,Associate Editor: BMC Research Notes,
2011-01-01-今,Committee Member of RECOMB,
2011-01-01-今,Grant Review Panel: NIH (2012-present),
2009-01-01-今,Reviewer: Research Grants Council of Hong Kong,
2008-01-01-2013-12-31,External Grant Review Panel: Canada Research Chair,
2007-01-01-2015-12-31,Board member: Bioinformatics Training Program at Simon Fraser University, University of British Columbia, and BC Cancer Agency,
2007-01-01-2015-12-31,Board member: Bioinformatics Training Program at Simon Fraser University, University of British Columbia, and BC Cancer Agency,
2007-01-01-今,MBB/Simon Fraser University Tenure and Promotion Committee,
2007-01-01-2012-12-31,MBB/Simon Fraser University Graduate Studies Committee,
2007-01-01-今,Member: American Society for Human Genetics,
2006-01-01-今,Grant Review Panel: NSF,
2006-01-01-今,Grant Review Panel: CIHR,
2006-01-01-今,Grant Review Panel: NSERC,
2006-01-01-今,Grant Review Panel: MSFHR,
2006-01-01-今,Member: Genetics Society of America,
1996-01-01-今,Member: Society for Neuroscience,

教授课程

海洋生态学
生物信息学
针对分子生物学的Python和R编程
比较基因组学

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 中国科学院“百人计划”A, 部委级, 2018
(2) 加拿大国家卫生研究院新研究员奖, 国家级, 2011
(3) 加拿大迈克司密斯健康研究基金会学者, 省级, 2007
专利成果
   

出版信息

   
发表论文
(1) Genomic identification and functional characterization of essential genes in Caenorhabditis elegans, G3, 2018, 通讯作者
(2) A draft genome assembly of the Chinese sillago (Sillago sinica), the first reference genome for Sillaginidae fishes, Gigascience, 2018, 通讯作者
(3) Mutational landscape of intrahepatic cholangiocarcinoma, Nature Communications, 2014, 通讯作者
(4) Variant surface antigens of malaria parasites: functional and evolutionary insights from comparative gene family classification and analysis, BMC Genomics, 2013, 通讯作者
(5) RNA-seq analysis of C. briggsae transcriptome, Genome Research, 2012, 通讯作者
(6) Genome comparison of human and non-human malaria parasites reveals parasites-specific genes potentially linked to human disease, PLoS Computational Biology, 2011, 通讯作者
(7) genBlastG: using BLAST searches to build homologous gene models., Bioinformatics, 2011, 通讯作者
(8) genBlastA: enabling BLAST to identify homologous gene sequences, Genome Research, 2009, 通讯作者
(9) Identification and characterization of novel human tissue-specific RFX transcription factors, BMC Evolutionary Biology, 2008, 通讯作者
(10) Identification of ciliary and ciliopathy genes in Caenorhabditis elegans through comparative genomics, Genome Biology, 2006, 通讯作者
发表著作
(1) 对虾生物学, 青岛海洋大学出版社, 1993-07, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 中国科学院率先行动“百人计划”学术帅才(A类), 主持, 部委级, 2018-04--2023-12
( 2 ) 利用第三代DNA测序技术研究赤潮发生机制, 主持, 国家级, 2018-06--2020-12
( 3 ) 青岛近岸有害藻华物种的系统鉴定及其动态变化的基因组研究, 主持, 研究所(学校), 2019-04--2022-04
( 4 ) 典型赤潮灾害预警预测与防控处置, 参与, 研究所(学校), 2018-07--2020-12
( 5 ) 深海界面过程与生命演化前沿问题研究, 参与, 部委级, 2019-01--2022-12
( 6 ) 中国海域有害藻华物种的生物多样性, 主持, 市地级, 2019-02--2023-12
参与会议
(1)Ubiquity and critical role of phagotrophy in phytoplankton community   2018-10-21
(2)Comparative analysis of harmful algal blooms using 3rd-generation DNA sequencing technologies   2018-10-09
(3)利用第三代DNA测序技术研究有害藻华物种群落结构的多样性及其动态变化   第六届全国藻类多样性与藻类分类学术研讨会   2018-09-07
(4)Next-Generation Genomcis   二十一世纪的分子设计育种与绿色农业   2018-07-22
(5)构建白金级畜牧动物参考基因组   第十九次全国动物遗传育种学术讨论会   2017-10-13

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生

现指导学生

崔宗梅  博士研究生  070703-海洋生物学  

张梦佳  硕士研究生  0707Z1-海洋生态学  

陈阳  博士研究生  070703-海洋生物学