基本信息
赵文明  男  博导  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
电子邮件: zhaowm@big.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院
邮政编码:

研究领域

生物信息数据库;

组学大数据;

高性能计算

招生信息

   
招生专业
081203-计算机应用技术
081202-计算机软件与理论
071010-生物化学与分子生物学
招生方向
生物信息

教育背景

2004-02--2006-06   北京航空航天大学   硕士
1997-09--2001-07   西安工业学院   学士
学位
1997年9月-2001年7月 西安工业大学 计算机科学与技术专业 学士学位

2006年2月-2008年6月 北京航空航天大学 计算机应用技术专业 硕士学位

工作经历


工作简历
2011-12~现在, 北京基因组研究所, 高级工程师
2008-04~2011-11,北京基因组研究所, 生物信息工程师
2001-07~2004-06,北京华大基因有限公司, 助理工程师

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 中国科学院关键技术人才, 院级, 2015

出版信息

   
发表论文
(1) GSA: Genome Sequence Archive, Genomics Proteomics & Bioinformatics, 2017, 通讯作者
(2) The BIG Data Center: from deposition to integration to translation, Nucleic Acids Res, 2017, 通讯作者
(3) a Sorghum Genome SNP Database, Biotechnology for Biofuels, 2016, 第 2 作者
(4) 面向国际的生命组学大数据管理体系建设, Constructing the international database management system for omics big data, BIG Data Research, 2016, 第 1 作者
(5) DoGSD: the dog and wolf genome SNP database, Nucleic Acids Res, 2015, 第 2 作者
(6) Web resources for model organism studies, Genomics Proteomics Bioinformatics, 2015, 通讯作者
(7) Transcriptome sequencing and characterization of Japanese scallop Patinopecten yessoensis from different shell color lines, PLoS One, 2015, 第 4 作者
(8) Genomic characterization reveals insights into patulin biosynthesis and pathogenicity in Penicillium species, Mol Plant Microbe Interact, 2015, 第 7 作者
(9) WBSA: web service for bisulfite sequencing data analysis, PLoS One, 2014, 通讯作者
(10) Characterization and comparative profiling of ovarian microRNAs during ovine anestrus and the breeding season, BMC Genomics, 2014, 第 10 作者
(11) wapRNA: a web-based application for the processing of RNA sequences, Bioinformatics, 2011, 第 1 作者
(12) Population genetics in nonmodel organisms: II. natural selection in marginal habitats revealed by deep sequencing on dual platforms, PNAS, 2011, 第 3 作者
(13) Population genetics in nonmodel organisms: II. natural selection in marginal habitats revealed by deep sequencing on dual platforms, Mol Biol Evol, 2011, 第 3 作者
(14) BGI-RIS: an integrated information resource and comparative analysis workbench for rice genomics, Nucleic Acids Res, 2004, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 组学大数据中心和知识库构建与服务技术, 参与, 国家级, 2015-06--2017-12
( 2 ) 多组学数据的存贮与访问平台建设, 主持, 部委级, 2014-07--2019-12
( 3 ) 分子模块辞海, 参与, 部委级, 2013-01--2018-12
( 4 ) 国际健康数据共享计划, 参与, 部委级, 2016-06--2021-06
参与会议
(1)MethBank: DNA Methylation Data Bank   2017-03-25
(2)DoGSD: the dog and wolf genome SNP database   第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会   2016-10-07
(3)BIG Data Center   第5届青年生物信息PI研讨会   2016-08-13
(4)The available resources for genomic data archive and analysis   2016-01-26

合作情况

国际“万狗基因组计划”参与者

项目协作单位
中国科学院昆明动物所