基本信息
丁秋蓉  女  博导  中国科学院上海营养与健康研究院
电子邮件: qrding@sibs.ac.cn
通信地址: 上海市岳阳路320号新生命大楼A2104室
邮政编码: 200031
部门/实验室:营养科学研究所

研究领域

1. 基于人多能干细胞的疾病研究和靶向治疗

利用患者来源的诱导性多能干细胞(iPSC)或者体外建立的疾病胚胎干细胞(ESC),结合基因编辑和定向分化平台,在功能基因组水平研究人类肝脏疾病的分子机理,发现新型靶标;发展基于干细胞疾病模型的药物筛选和毒理评价体系;进行药物化合物筛选,研发针对特定靶标的药物先导化合物;优化体外多能干细胞肝向分化平台,建立肝脏异种嵌合动物模型,探索基于人多能干细胞来源的肝脏细胞作为肝移植潜在肝源的可行性。

2. 肝脏脂代谢紊乱的遗传及表观遗传基础

结合干细胞疾病模型、基因编辑在体大规模筛选和人群疾病遗传学分析,研究肝脏脂代谢紊乱及其导致的肝再生能力下降的遗传和表观遗传基础,探索预防和治疗包括脂肪肝、肝纤维化等肝病的方法和手段。

3. 代谢疾病的基因治疗研究
针对高甘油三酯血症、高胆固醇血症、肿瘤恶病质等代谢疾病,以CRISPR/Cas9在体靶向技术为基础,筛选新型靶标,优化基因治疗方案,开展临床前研究。


招生信息

   
招生专业
071003-生理学
100104-病理学与病理生理学
招生方向
肝脏脂质代谢
多能干细胞与转化医学
代谢疾病基因治疗

教育背景

2004-09--2010-08   中科院上海生科院营养科学研究所   博士研究生/获得博士学位
2000-09--2004-08   南京大学   本科生/获得学士学位
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2014-09~现在, 中科院上海生命科学研究院营养科学研究所, 研究员,博士生导师
2010-09~2014-08,哈佛干细胞研究所,哈佛大学干细胞与转化生物学系, 博士后研究
社会兼职
2017-06-01-2020-06-01,Nutrition&Metabolism副主编,
2017-02-01-2020-02-01,Gene Therapy 副主编,

教授课程

营养学

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 国家青年千人计划, 国家级, 2016
(2) 中科院百人计划, 部委级, 2015
(3) 上海浦江人才计划, 省级, 2015
专利成果
( 1 ) 通过基因编辑特异靶向肌肉组织MSTN治疗恶病质, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: 201610965140.1
( 2 ) 一种高特异性的CRISPR基因组编辑体系, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: 201610805040.2
( 3 ) 罗丹宁衍生物在治疗代谢性疾病中的应用, 发明, 2019, 第 1 作者, 专利号: 201910032899.8
( 4 ) 吲哚满酮衍生物在治疗肥胖及其相关疾病中的应用, 发明, 2018, 第 1 作者, 专利号: 201811135612.6

出版信息

   
发表论文
(1) Gain-of-Function Mutations of SLC16A11 Contribute to the Pathogenesis of Type 2 Diabetes, Cell Reports, 2019, 通讯作者
(2) Identification of a rhodanine derivative BML-260 as a potent stimulator of UCP1 expression, Theranostics, 2019, 通讯作者
(3) Screening of FDA-approved drugs identifies sutent as a modulator of UCP1 expression in brown adipose tissue., EBioMedicine, 2018, 通讯作者
(4) Genetic and chemical screenings identify HDAC3 as a key regulator in hepatic differentiation of human pluripotent stem cells, Stem Cell Reports, 2018, 通讯作者
(5) Genome engineering of stem cell organoids for disease modeling., Protein Cell., 2017, 通讯作者
(6) CRISPR/Cas9 with single guide RNA expression driven by small tRNA promoters showed reduced editing efficiency compared to U6 promoter., RNA, 2017, 通讯作者
(7) Prevention of muscle wasting by CRISPR/Cas9-mediated disruption of myostatin in vivo., Mol Ther, 2016, 通讯作者
(8) A Self- restricted CRISPR System to Reduce Off- target Effects., Mol Ther, 2016, 通讯作者
(9) CRISPR-Cas9 Targeting of PCSK9 in Human Hepatocytes In Vivo., Arterioscler Thromb Vasc Biol., 2016, 通讯作者
(10) Genome editing for disease modeling and disease treatment., Chinese Bulletin of Life Sciences, 2015, 通讯作者
(11) Permanent alteration of PCSK9 with in vivo CRISPR-Cas9 genome editing., Circ Res, 2014, 第 1 作者
(12) Enhanced efficiency of human pluripotent stem cell genome editing through replacing TALENs with CRISPRs., Cell Stem Cell, 2013, 第 1 作者
(13) A TALEN genome- editing system for generating human stem cell-based disease models., Cell Stem Cell, 2013, 第 1 作者
(14) PAQR10 and PAQR11 mediate Ras signaling in the Golgi apparatus., Cell Res, 2012, 第 1 作者
(15) In vivo disruption of TGF-β signaling by Smad7 in airway epithelium alleviates allergic asthma but aggravates lung carcinogenesis., PLoS ONE, 2010, 第 1 作者
(16) Endocytosis of adiponectin receptor 1 through a clathrin- and Rab5-dependent pathway., Cell Res, 2009, 第 1 作者
(17) Catalase potentiates retinoic acid-induced THP-1 monocyte differentiation into macrophage through inhibition of peroxisome proliferator-activated receptor gamma., J Leukoc Biol, 2007, 第 1 作者
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 探索利用CRISPR技术进行基因治疗心血管疾病的基础研究, 主持, 省级, 2015-07--2017-06
( 2 ) 利用干细胞疾病模型探索ALS 病人中C9ORF72基因组区域突变的致病机理研究, 主持, 国家级, 2015-01--2016-12
( 3 ) LincRNA通过编码蛋白小肽调节脂肪细胞代谢的分子机制研究, 主持, 国家级, 2017-01--2020-12
( 4 ) 多能干细胞自我更新和分化的表观遗传调控研究, 主持, 国家级, 2017-07--2021-12
( 5 ) 人类多能干细胞定向心肌分化的阶段性调控机制、分 子标记和功能特征, 参与, 国家级, 2017-07--2021-12
( 6 ) 用于异种移植的肝细胞的体外获得与扩增技术, 主持, 部委级, 2017-12--2022-11
参与会议
   

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生

现指导学生

李爽  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

韦余达  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杨圆圆  硕士研究生  085238-生物工程  

邱艳  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈兰兰  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

田程  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

窦唯  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

陈彦好  博士研究生  071003-生理学  

吴晓珊  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

刘小健  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

冯庄慧  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

周婷婷  硕士研究生  071009-细胞生物学