基本信息
张芸  女  硕导  中国科学院微生物研究所
电子邮件: zhangyun@im.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院甲3号
邮政编码: 100101

招生信息

   
招生专业
071007-遗传学
招生方向
重要生物制剂的生物合成和代谢调控
微生物代谢工程和系统生物学
合成生物学的新方法和新技术

教育背景

2005-09--2008-06   中国科学院微生物研究所   博士
2002-09--2005-06   中国农业大学    硕士
1998-09--2002-06   中国农业大学   学士

工作经历

   
工作简历
2008-07~现在, 中国科学院微生物研究所, 博士
2005-09~2008-06,中国科学院微生物研究所, 博士
2002-09~2005-06,中国农业大学 , 硕士
1998-09~2002-06,中国农业大学, 学士

专利与奖励

   
奖励信息
(1) L-苏氨酸,L-蛋氨酸和L-丝氨酸基因工程菌构建及发酵条件优化, 市地级, 2016
(2) 赖氨酸和苏氨酸工业生产菌改造的关键技术与产业化应用, 二等奖, 部委级, 2014
专利成果
( 1 ) 一种产L-氨基酸的重组菌、其构建方法及L-氨基酸生产方法, 2015, 第 3 作者, 专利号: PCT/CN2014/070228
( 2 ) 一种催化生产1, 5-戊二胺的工程菌及其应用, 2014, 第 4 作者, 专利号: 201410302561.7
( 3 ) 生产L-组氨酸的方法及其专用重组菌, 2014, 第 3 作者, 专利号: 201410050868.2
( 4 ) 一种阿拉伯糖诱导的表达载体及其构建方法和应用, 2013, 第 2 作者, 专利号: ZL201210139353.0
( 5 ) 一种生产L-2-氨基丁酸的方法及其专用重组菌, 2015, 第 4 作者, 专利号: 201510208576.1
( 6 ) 一种提高谷氨酸棒杆菌氨基酸产量的方法及其应用, 2016, 第 3 作者, 专利号: CN201610546762.0
( 7 ) 苏氨酸衰减子的突变体及其应用以及解除苏氨酸操纵子反馈阻遏的方法, 2016, 第 4 作者, 专利号: CN201611035232.6
( 8 ) 一种5-UTR元件及其在生产中的应用, 2016, 第 4 作者, 专利号: CN201610987080.3
( 9 ) 産L-アミノ酸の組換え菌およびその構築方法, 2017, 第 3 作者, 专利号: JP6188930
( 10 ) constructing method therefor and method for producing L-amino acid, 2017, 第 3 作者, 专利号: US9,796,991
( 11 ) DNA分子、表达载体、重组菌及其构建方法,以及羟脯氨酸的制备方法, 2017, 第 3 作者, 专利号: 201711165839.0
( 12 ) 生产L-丝氨酸的重组菌及其构建方法, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201711146433.8
( 13 ) Recombinant strain producing L-amino acid, constructing method therefor and method for producing L-amino acid, 2018, 第 3 作者, 专利号: KR10-2015-7032480
( 14 ) 生产L-组氨酸的重组菌、其构建方法以及L-组氨酸的生产方法, 2018, 第 3 作者, 专利号: 201810118782.7
( 15 ) 生产L-亮氨酸的重组菌、其构建方法及L-亮氨酸的生产方法, 2018, 第 3 作者, 专利号: 201810367158.0
( 16 ) 全细胞催化生产5-氨基戊酸的工程菌及5-氨基戊酸的制备方法, 2019, 第 3 作者, 专利号: 201910342666.8

出版信息

   
发表论文
(1) Reconstruction of TCA cycle in Corynebacterium glutamicum with a genome‐scale metabolic network model for trans‐4‐hydroxyproline production, Biotechnology and Bioengineering, 2019, 通讯作者
(2) 2.Molecular basis for feedback inhibition of tyrosine-regulated 3-deoxy-Darabino- heptulosonate-7-phosphate synthase from Escherichia coli, Journal of Structural Biology, 2019, 第 10 作者
(3) A RecET-assisted CRISPR-Cas9 genome editing in Corynebacterium glutamicum., Microbial Cell Factories, 2018, 通讯作者
(4) Efficient CRISPR–Cas9 mediated multiplex genome editing in yeasts, Biotechnol Biofuels, 2018, 第 3 作者
(5) Reprogramming one-carbon metabolic pathways to decouple L-serine catabolism from cell growth in Corynebacterium glutamicum, ACS synthetic Biology, 2018, 第 1 作者
(6) Bacterial Genome Editing via a Designed Toxin−Antitoxin Cassette, ACS synthetic biology, 2017, 第 7 作者
(7) A new genome‑scale metabolic model of Corynebacterium glutamicum and its application., Biotechnology for Biofuels, 2017, 通讯作者
(8) A Novel Tool for Microbial Genome Editing Using the Restriction-Modification System., ACS synthetic Biology, 2017, 第 10 作者
(9) A novel pyruvate kinase and its application in lactic acid production under oxygen deprivation in Corynebacterium glutamicum, BMC biotechnology, 2016, 通讯作者
(10) YjeH Is a Novel Exporter of L-Methionine and Branched-Chain Amino Acids in Escherichia coli, Applied and Environmental Microbiology, 2015, 第 3 作者
(11) Benzoate metabolism intermediate benzoyl coenzyme affects gentisate pathway regulation in Comamonas testosteroni. , Applied and Environmental Microbiology, 2014, 第 2 作者
(12) Characterization and molecular mechanism of AroP as an aromatic amino acid and histidine transporter in Corynebacterium glutamicum, Journal of Bacteriology, 2013, 第 1 作者
(13) Assimilation of aromatic compounds by Comamonas testosteroni: characterization and spreadability of protocatechuate 4,5-cleavage pathway in bacteria, Applied Microbiology and Biotechnology, 2013, 第 2 作者
(14) Development and application of an arabinose-inducible expression system by facilitating inducer uptake in Corynebacterium glutamicum. , Applied and Environmental Microbiology, 2012, 第 1 作者
(15) Genetic and biochemical characterization of Corynebacterium glutamicum ATP phosphoribosyltransferase and its three mutants resistant to feedback inhibition by histidine, Biochimie, 2012, 第 1 作者
(16) Metabolic engineering and flux analysis of Corynebacterium glutamicum for L-serine production. , Science China Life Sciences, 2012, 第 2 作者
(17) A mimicking-of-DNA-methylation-patterns pipeline for overcoming the restriction barrier of bacteria., PLoS Genetics, 2012, 第 5 作者
(18) Enhancing electro-transformation competency of recalcitrant Bacillus amyloliquefaciens by combining cell-wall weakening and cell-membrane fluidity disturbing. , Analytical Biochemistry, 2011, 第 3 作者
(19) Purification and characterization of a surfactant-stable high-alkaline protease from Bacillus sp. B001.,  Bioresource Technology, 2010, 第 3 作者
(20) Proteomic and molecular investigation on the physiological adaptation of Comamonas sp. strain CNB-1 growing on 4-chloronitrobenzene, Biodegradation , 2009, 第 1 作者
(21) The complete genome of Comamonas testosteroni reveals its evolutionary and genetic adaptations to the changing environments. , Applied and Environmental Microbiology. , 2009, 第 2 作者
(22)  Responses to arsenate stress by Comamonas sp. strain CNB-1 at genetic and proteomic levels, Microbiology, 2007, 第 1 作者
(23) Comparative proteomes of Corynebacterium glutamicum grown on aromatic compounds revealed novel proteins involved in aromatic degradation and a clear link between aromatic catabolism and gluconeogenesis via fructose-1,6-bisphosphatase. , Proteomics, 2007, 第 3 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 组氨酸工程菌发酵关键技术研究与生产示范, 主持, 部委级, 2014-03--2015-12
( 2 ) 尼龙5X 盐关键生产技术及产业化, 参与, 部委级, 2017-01--2018-12
( 3 ) 5-氨基戊酸合成功能模块的组装及人工生物系统构建, 主持, 国家级, 2019-01--2020-12
参与会议
(1)基因组规模代谢网络模型指导的代谢工程研究   2017氨基酸国际产业高峰论坛   2017-12-05
(2)基因组规模代谢网络模型指导的氨基酸代谢工程改造   中国生物工程学会第11届学术年会暨2017年全国生物技术大会   2017-09-24