兼任中科院中非中心微生物分中心副主任、国家人间传染病原微生物实验室生物安全评审专家委员、国际病毒分类委员会（ICTV）Peribunyaviridae Group委员、中国地方病热带病专委会委员、中国医疗保健国际交流促进会分子诊断学分会委员、西湖大学生物安全顾问委员会委员、武汉微生物生物安全专业委员会副主任委员、武汉科学普及研究会副理事长、美国热带医学与卫生学会（ASTMH）及虫媒病毒（ACAV）分会会员; 首位同时获中美（Wuhan National Biosafety Laboratory、Galveston National Laboratory）两国生物安全四级实验室准入资质的中国学者; 《BMC Infectious Disease》、《Virology Journal》、《Zoonoses》、《中国血吸虫病防治杂志》和《中国热带医学》期刊编委。承担国家重点研发计划（课题）、国家自然科学基金、科技部基础性工作专项重点项目、ASNO国际合作等项目。以第一作者/通讯作者（含共同）在Nature Communications、Emerg Infect Dis、mSystem、Scientific Data、Rev Med Virol和PLoS NTD等国际重要科学期刊发表论文40余篇，授权专利5项（1项国际专利），主参编教材/专著3本。
      主要研究方向为虫媒病毒的发现和预警预测、感染传播风险评估与生物安全:
  (1) 开展虫媒病毒组的研究，明确不同地区不同节肢动物媒介中病毒组的组成丰度及差异；
  (2) 开展虫媒病毒的分离鉴定工作，并利用细胞、媒介和动物模型研究病毒的传播感染风险和致病性研究；
  (3) 利用大数据和机器学习开展新发病毒的媒介、宿主范围和致病性的预警预测研究；
  (4) 生物安全实验室人员培训体系与节肢动物实验室生物安全标准规范研究。

071005-微生物学
100103-病原生物学

虫媒病毒
生物安全

2008-09--2011-06   中国科学院武汉病毒研究所   理学博士
2006-09--2008-06   武汉大学   理学硕士

2021-10~现在, 中国科学院武汉病毒研究所, 青年研究员
2016-04~2021-10,中国科学院武汉病毒研究所, 副研究员
2013-10~2016-03,美国德州大学医学分部（University of Texas Medical Branch）, 博士后
2011-07~2013-09,中国科学院武汉病毒研究所, 助理研究员

2023-08-25-2028-08-25,武汉科学普及研究会, 副理事长
2023-08-21-今,中国血吸虫病防治杂志, 编委
2023-06-20-今,中国科学院中-非联合研究中心非洲微生物及流行病控制研究分中心, 副主任
2023-02-01-今,武汉微生物生物安全专业委员会, 副主任委员
2022-10-30-今,湖北微生物学会, 会员
2022-07-31-今,中国地方病协会热带病专业委员会, 专委
2022-07-31-今,中国医疗保健国际交流促进会分子诊断学分会, 专委
2022-07-01-今,湖北江夏实验室, 研究员
2021-04-29-2022-04-01,Frontiers in Microbiology, 客座编辑
2021-04-26-今,西湖大学生物安全顾问委员会, 专家委员
2021-04-14-今,山东理工大学, 外聘硕士研究生导师（学术型）
2021-04-13-今,湖北省侨联青委会, 委员
2021-03-19-今,BMC Infectious Disease, 编委
2021-03-09-今,Zoonoses, 编委
2021-01-06-今,国家人间传染的病原微生物实验室生物安全评审专家委员会, 专家委员
2020-12-30-今,中国热带医学, 编委

   

（1） 口岸生物安全高风险因子快速鉴定与精准检疫技术研究及应用, 二等奖, 省级, 2022
（2） 中国科学院武汉分院优秀研究生指导教师, 院级, 2021
（3） 中国科学院武汉病毒研究所青年年度人物, 研究所（学校）, 2021
（4） 优秀青年科研骨干, 研究所（学校）, 2020

[1] 夏菡, 杨辞寒, 王小钰, 王飞, 袁志明. 一种用于蚊虫及其他医学节肢动物感染饲养的生物安全型实验装置. 2024201287934, 2024-01-18.
[2] 夏菡, 王静林, 熊国典, 王飞, 袁志明. Oya病毒RNA依赖的RNA聚合酶突变体、其表达载体和载体组合物及应用. 2023115117515, 2023-11-09.
[3] 明朝燕, 陈湘竣, 付乾坤, 夏菡, 吴明晖. 一种基于预训练模型的微生物遗传序列表型预测方法. ZL202310520356.7, 2023-05-01.
[4] 夏菡, 袁志明, 任南洁, 王飞, 张桂林. 艾比湖病毒的核酸组合物及其应用. CN: CN114836442B, 2023-04-14.
[5] 夏菡, 王飞, 袁志明, 杨辞寒, 吴群. 一种用于蚊虫感染操作相关操作的生物安全隔离装置. 202223554095.0, 2022-12-28.
[6] 唐霜, 张忠, 夏菡, 范兆军, 李天宪. 一种提高禽流感病毒分离率的鸡胚尿囊膜分离方法. CN: CN104046596A, 2014-09-17.

（1） 医学节肢动物野外现场与实验室生物安全规范专家共识, 中国热带医学, 2024, 通讯作者
（2） Cryo-EM structures of Banna virus in multiple states reveal stepwise detachment of viral spikes, Nature Communications, 2024, 第 2 作者
（3） Development and evaluation of RT-qPCR assays for two neglected orthobunyaviruses: Oya virus and Ebinur Lake virus, VIRUS RESEARCH, 2023, 通讯作者
（4） A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus, Scientific Data, 2023, 通讯作者
（5） 节肢动物生物安全二级实验室蚊虫感染相关的生物安全风险及控制, 中国热带医学, 2023, 通讯作者
（6） In vivo and in vitro characterization of a new Oya virus isolate from Culicoides spp. and its seroprevalence in domestic animals in Yunnan, China., PLoS Neglected Tropical Diseases, 2023, 通讯作者
（7） HostNet: improved sequence representation in deep neural networks for virus-host prediction, BMC Bioinformatics, 2023, 通讯作者
（8） 美国节肢动物生物安全实验室建设标准的分级与分类, 暖通空调, 2023, 第 2 作者
（9） Clinical features and transmission risk analysis of dengue virus infections in Shenzhen, During 2014–2019, COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, 2023, 通讯作者
（10） 美国CDC《微生物和生物医学实验室生物安全》（第6版）中虫媒病毒生物安全名录简介, Introduction of arbovirus and biosafety catalogue in the Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories(6th Edition)by U.S.CDC, 中国热带医学, 2022, 通讯作者
（11） 两种检测尼帕病毒的实时荧光定量PCR方法的比较与效果验证, Comparison and validation of two TaqMan real-time RT-PCR methods for detection and quantification of Nipah virus, 中国人兽共患病学报, 2022, 第 3 作者
（12） 人类健康所面临的持久挑战：新发和再现人兽共患病, Emerging and re-emerging zoonoses is a persistent challenges for human health, 中国热带医学, 2022, 通讯作者
（13） Vector competence and immune response of Aedes aegypti for Ebinur Lake virus, a newly classified mosquito-borne orthobunyavirus, PLOS NEGLECTED TROPICAL DISEASES, 2022, 
（14） Infection and pathogenesis of the Delta variant of SARS-CoV-2 in Rhesus macaque, Infection and pathogenesis of the Delta variant of SARS-CoV-2 in Rhesus macaque, VIROLOGICA SINICA, 2022, 通讯作者
（15） High-containment facilities and the role they play in global health security, High-containment facilities and the role they play in global health security, 生物安全和生物安保杂志(英文), 2022, 第 1 作者
（16） Efficient rescue of a newly classified Ebinur lake orthobunyavirus with GFP reporter and its application in rapid antiviral screening, ANTIVIRAL RESEARCH, 2022, 通讯作者
（17） Experimental Viral Infection in Adult Mosquitoes by Oral Feeding and Microinjection, JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, 2022, 通讯作者
（18） Environmental surveillance of SARS-CoV-2 RNA in wastewater systems and related environments in Wuhan:April to May of 2020, Environmental surveillance of SARS-CoV-2 RNA in wastewater systems and related environments in Wuhan: April to May of 2020, JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCES, 2022, 通讯作者
（19） SARS-CoV-2 infection induces testicular injury in Rhesus macaque, VIROLOGICA SINICA, 2022, 通讯作者
（20） In Vitro and In Vivo Characterization of a New Strain of Mosquito Flavivirus Derived from Culicoides, VIRUSES-BASEL, 2022, 通讯作者
（21） A novel lytic phage potentially effective for phage therapy against Burkholderia pseudomallei in the tropics, A novel lytic phage potentially effective for phage therapy against Burkholderia pseudomallei in the tropics, INFECTIOUS DISEASES OF POVERTY, 2022, 第 4 作者
（22） 国内外节肢动物实验室生物安全概况及其启示, Worldwide developmental situation of arthropod containment and its inspiration, 中国热带医学, 2021, 第 1 作者
（23） A self-powered rapid loading microfluidic chip for vector-borne viruses detection using RT-LAMP, SENSORS AND ACTUATORS B-CHEMICAL, 2021, 通讯作者
（24） Comprehensive investigations revealed consistent pathophysiological alterations after vaccination with COVID-19 vaccines, CELL DISCOVERY, 2021, 第 4 作者
（25） Characterization of a novel reassortment Tibet orbivirus isolated from Culicoides spp. in Yunnan, PR China, THE JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, 2021, 第 10 作者
（26） Dynamic surveillance of mosquitoes and their viromes in Wuhan during 2020, Zoonoses, 2021, 通讯作者
（27） A self-powered rapid-loading microfluidic chip for high-throughput analysis of vector-borne viruses, SENSORS AND ACTUATORS B. CHEMICAL, 2021, 通讯作者
（28） Zika virus pathogenesis and current therapeutic advances, PATHOGENS AND GLOBAL HEALTH, 2021, 通讯作者
（29） Pathogenesis and Immune Response of Ebinur Lake Virus: A Newly Identified Orthobunyavirus That Exhibited Strong Virulence in Mice, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2021, 通讯作者
（30） Transmission competence of a new mesonivirus, Yichang virus, in mosquitoes and its interference with representative flaviviruses, PLOS NEGLECTED TROPICAL DISEASES, 2020, 通讯作者
（31） SARS-CoV-2 Does Not Replicate in Aedes Mosquito Cells nor Present in Field-Caught Mosquitoes from Wuhan, SARS-CoV-2 Does Not Replicate in Aedes Mosquito Cells nor Present in Field-Caught Mosquitoes from Wuhan, VIROLOGICA SINICA, 2020, 第 1 作者
（32） Stability of the Virome in Lab- and Field-Collected Aedes albopictus Mosquitoes across Different Developmental Stages and Possible Core Viruses in the Publicly Available Virome Data of Aedes Mosquitoes, MSYSTEMS, 2020, 通讯作者
（33） Origin and evolution of emerging Liao ning Virus (genus Seadornavirus , family Reoviridae ), VIROLOGY JOURNAL, 2020, 第 10 作者
（34） Characterization of Ebinur Lake Virus and Its Human Seroprevalence at the China–Kazakhstan Border, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2020, 第 1 作者
（35） 东南亚十二节段双链RNA病毒的分子进化及基因组结构特征分析, Analysis of molecular evolution and genomic structure of South-East Asian dodeca RNA viruses, 中华实验和临床病毒学杂志, 2020, 第 4 作者
（36） A dataset of distribution and diversity of mosquito-associated viruses and their mosquito vectors in China (vol 7, 342, 2020), SCIENTIFIC DATA, 2020, 第 9 作者
（37） Networking for training Level 3/4 biosafety laboratory staff, Networking for training Level 3/4 biosafety laboratory staff, 生物安全和生物安保杂志, 2019, 第 3 作者
（38） Rapid detection of Banna virus by reverse transcription-loop -mediated isothermal amplification (RT-LAMP), INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, 2019, 通讯作者
（39） 克里米亚-刚果出血热病毒反向遗传学系统的开发及应用, Development and Application of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Orthonairovirus Reverse Genetics System, 生物技术通讯, 2019, 第 4 作者
（40） Characterization of a Novel Tanay Virus Isolated From Anopheles sinensis Mosquitoes in Yunnan, China, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2019, 通讯作者
（41） Biosafety Level 4 Laboratory User Training Program, China, EMERGING INFECTIOUS DISEASES, 2019, 第 1 作者
（42） 美国高等级生物安全实验室人员培训体系及其启示, High-containment Laboratory Staff Training System in the United States and Its Inspiration, 实验室研究与探索, 2019, 第 1 作者
（43） The discovery and global distribution of novel mosquito-associated viruses in the last decade (2007-2017), REVIEWS IN MEDICAL VIROLOGY, 2019, 通讯作者
（44） Metagenomic virome analysis of culex mosquitoes from kenya and china, VIRUSES-BASEL, 2018, 第 9 作者
（45） Mosquito-Associated Viruses in China, VIROLOGICA SINICA, 2018, 第 1 作者
（46） Comparative Metagenomic Profiling of Viromes Associated with Four Common Mosquito Species in China, Comparative Metagenomic Profiling of Viromes Associated with Four Common Mosquito Species in China, VIROLOGICA SINICA, 2018, 第 1 作者
（47） 基于RT-LAMP的10种烈性病毒快速检测方法的研究, Development of a method for rapid detection of 10 high-pathogenic viruses based on reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification, 微生物与感染, 2018, 第 4 作者
（48） First isolation and characterization of a group c banna virus (bav) from anopheles sinensis mosquitoes in hubei, china, VIRUSES-BASEL, 2018, 第 1 作者
（49） NanoLuc标记的重组克里米亚-刚果出血热病毒及其初步用于抗病毒药物筛选, Recombinant Crimean-Congo hemorrhagic fever virus with Nanoluciferase reporter and its potential application for rapid antiviral compounds screening, 中华实验和临床病毒学杂志, 2018, 第 1 作者
（50） Homologous RNA secondary structure duplications in 3 ' untranslated region influence subgenomic RNA production and replication of dengue virus, VIROLOGY, 2018, 通讯作者
（51） Isolation and characterization of a novel mesonivirus from Culex mosquitoes in China, VIRUS RESEARCH, 2017, 第 2 作者
（52） 基于LAMP的新试剂和仪器的效果评估及在蚊媒病毒检测中的应用, Development and Evaluation of New Reagents and Isothermal Amplification Equipment Based on LAMP and Application in Detection of Mosquito-Borne Viruses, 生物技术通讯, 2017, 第 4 作者
（53） A new strategy for full-length ebola virus glycoprotein expression in e.coli, VIROLOGICA SINICA, 2016, 第 3 作者
（54） Transstadial Transmission and Long-term Association of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus in Ticks Shapes Genome Plasticity, SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 第 1 作者
（55） Metagenomic Profile of the Viral Communities in Rhipicephalus spp. Ticks from Yunnan, China, PLOS ONE, 2015, 第 1 作者
（56） Improved methods for isolation of avian influenza virus, JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS, 2014, 第 3 作者
（57） Mini-genome rescue of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus and research into the evolutionary patterns of its untranslated regions, VIRUS RESEARCH, 2013, 第 2 作者
（58） An improved system for the evaluation of antiviral compounds against herpes simplex virus type 2, JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS, 2013, 第 3 作者
（59） Study of the Dynamics ofMicrocystis aeruginosa and its Cyanophage in East Lake using quantitative PCR, Study of the Dynamics ofMicrocystis aeruginosa and its Cyanophage in East Lake using quantitative PCR, 中国病毒学：英文版, 2013, 第 1 作者
（60） Molecular characterization of influenza B viruses isolated in east-central China in 2009-2010, VIRUS GENES, 2013, 第 6 作者
（61） Infection and propagation of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in embryonated chicken eggs, VIRUS RESEARCH, 2013, 第 1 作者
（62） Freshwater Cyanophages, Freshwater Cyanophages, 中国病毒学：英文版, 2013, 第 1 作者
（63） Molecular characterization of H3N2 and H4N6 subtypes avian influenza viruses isolated from mallards in Poyang Lake, China in 2010, Molecular characterization of H3N2 and H4N6 subtypes avian influenza viruses isolated from mallards in Poyang Lake, China in 2010, 中国科学通报：英文版, 2012, 第 5 作者
（64） Genetic Characteristics of 2009 Pandemic H1N1 Influenza A Viruses Isolated from Mainland China, Genetic Characteristics of 2009 Pandemic H1N1 Influenza A Viruses Isolated from Mainland China, 中国病毒学：英文版, 2011, 第 10 作者
（65） Epidemiological survey of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in Yunnan, China, 2008, INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, 2011, 第 1 作者
（66） Molecular characterization of avian influenza virus (h7n8) isolated from poultry in central china in the mid-1980s, CHINESE SCIENCE BULLETIN, 2010, 第 2 作者
（67） 20世纪80年代华中地区H7N8禽流感病毒的分子特征, 科学通报, 2010, 第 2 作者

（1） 普通病毒学（第二版）, 科学出版社, 2019-11, 第 5 作者
（2） 高等级病原微生物实验室人员培训参考用书, 华南理工大学出版社, 2020-01, 第 3 作者

（1）开展我国（湖北、广东、云南、 新疆、海南等）和境外（肯尼亚、巴基斯坦、菲律宾）野外蚊虫样本的采集和病毒组的调查研究，明确了我国代表性地区主要优势蚊种病毒组的组成丰度及差异；新分离鉴定病毒10余种，包括艾比湖病毒（Ebinur lake virus）、版纳病毒（Banna virus）、辽宁病毒（Liaoning virus）、西藏环状病毒（Tibet orbivirus）、乙脑病毒（JEV）、Tanay 病毒、Daknong virus、Mesonivirus 等，其中艾比湖病毒（Ebinur lake virus）于2022年被ICTV认定为新病毒种，C 型版纳病毒为国际上首次分离报道；

（2）建立了烈性虫媒病毒克里米亚-刚果出血热病毒的病毒-媒介蜱动物宿主感染模型和基于高通量测序方法的病毒种间进化分析平台；建立了代表性伊蚊（Aedes aegypti和Aedes albopictus）和库蚊（Culex pipiens和Culex tritaeniorhynchus）和蚊-病毒-宿主动物的感染和传播平台；

（3）完成了我国新分离蚊媒病毒艾比湖病毒、Oya病毒，西藏环状病毒等的生物学特征、感染致病和传播风险研究；

（4）建立了蚊媒布尼亚病毒的反向遗传操作平台及其高内涵药物筛选系统；

（5）创建我国首个蚊虫媒介和病毒种类及分布的综合地理信息数据集，及全球虫媒病毒多样性、序列和生物安全分级综合信息数据集；

（ 1 ） 基于NanoLuc荧光素酶的重组克里米亚-刚果出血热病毒的构建及体外抗病毒药物快速筛选模型的研究, 负责人, 国家任务, 2017-01--2019-12
（ 2 ） 国产化高等级病原微生物模式实验室建设及管理体系研究, 负责人, 国家任务, 2016-07--2018-12
（ 3 ） 我国新分离人畜共患病病毒——版纳病毒基因组进化特征研究, 参与, 研究所自主部署, 2017-01--2018-12
（ 4 ） 湖北省新分离人畜共患病病毒-版纳病毒的分布 规律及其特征研究, 负责人, 地方任务, 2019-01--2020-12
（ 5 ） 新型冠状病毒追踪及环境风险评估, 参与, 国家任务, 2020-03--2021-03
（ 6 ） 疫情期间医疗废物，医疗废水污泥处置及土壤，地下水影响和治理对策研究, 参与, 地方任务, 2020-03--2020-05
（ 7 ） 抗新型冠状病毒（2019-nCoV）应急药物, 参与, 地方任务, 2020-01--2020-12
（ 8 ） 一株库蠓来源的西藏环状病毒全基因组分析及病原生物学特征研究, 负责人, 其他国际合作项目, 2021-01--2022-12
（ 9 ） 改良型新型冠状病毒灭活疫苗的研制, 负责人, 地方任务, 2021-06--2021-12
（ 10 ） 海南省疑似虫媒病症候群携带病毒的分子流行病学研究, 负责人, 其他国际合作项目, 2021-09--2023-12
（ 11 ） Mosquitome of Flying Syringes-Aedes aegypti and Aedes albopictus & their Fitness vis a vis their Competency to Transmit Infection With Changing Climate, 参与, 其他国际合作项目, 2021-01--2023-12
（ 12 ） 跨境虫媒传染病新型病原体的发现及感染传播风险研究, 负责人, 国家任务, 2022-11--2025-11
（ 13 ） 虫媒病毒病原发现与感染传播风险研究, 负责人, 研究所自主部署, 2023-08--2024-07
（ 14 ） 潜在虫媒新病毒的传播和致病机制研究, 负责人, 国家任务, 2023-12--2026-11

（1）全球虫媒病毒多样性概况及我国两种新发蚊媒布尼亚病毒的研究进展   2023年全国虫媒病毒病监测技术培训班   2023-09-05
（2）蚊媒正布尼亚病毒及其可视化感染模型的构建和应用   "一带一路"热带医学联盟第五届热带医学高峰论坛   2023-04-29
（3）PPE and Aerosol Control in Biosafety Lab   2022年生物安全实验室管理与技术国际培训班   2022-12-16
（4）生物安全实验室个人防护装备、气溶胶控制与应急处置   2022湖北省微生物学会学术年会暨生物安全培训   2022-11-13
（5）我国蚊媒病毒概况及新发蚊媒病毒感染传播风险评估   2021中华医学会热带病与寄生虫学分会学术年会   2021-12-18

合作伙伴

1. University of Texas Medical Branch, USA, Prof. Dennis Bente

2. Centers for Disease Control and Prevention, USA, Senior Scientist. Eric Bergeron

3. COMSATS University, Pakistan, Prof. Habib Bokhari

4. KU Leuven,Belgium, Prof. Jelle Matthijnssens

5. Research Institute for Tropical Medicine, Philippines, Prof. Ferdinand V. Salazar 

6. 海南医学院，热带医学与检验医学院，夏乾峰教授

7. 浙江大学计算机创新研究院/浙大城市学院，明朝燕教授

8. 中山大学公共卫生学院，罗欢乐副教授

9. 山东理工大学生命科学学院，刘红副教授​

已指导学生

赵路  博士研究生  071005-微生物学  

梁梦莹  硕士研究生  085238-生物工程  

黄伊  硕士研究生  071005-微生物学  

现指导学生

任南洁  博士研究生  071005-微生物学  

杨辞寒  博士研究生  071005-微生物学  

王小钰  博士研究生  071005-微生物学  

吴群  博士研究生  071005-微生物学  

李兆麟  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

耿敬可  硕士研究生  071005-微生物学  

熊国典  硕士研究生  100103-病原生物学  

汪顺龙  博士研究生  071005-微生物学