基本信息
王鹏  男  博导  中国科学院上海营养与健康研究所
电子邮件: wangpeng@picb.ac.cn
通信地址: 上海市徐汇区岳阳路320号
邮政编码: 201210

研究领域

   

招生信息

   
招生专业
0710Z2-计算生物学
086000-生物与医药
招生方向
肿瘤调控网络的建模及分析
选择性剪接作为肿瘤标记物及其促进肿瘤发病的机理
大数据挖掘算法研发

教育背景

2001-09--2002-05   Cornell University   Master of Engineering
1996-09--2001-08   UW-Madison   博士
1991-09--1996-07   北京大学   学士
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2017-10~现在, 中国科学院马普学会伙伴计算生物学研究所, 研究员
2011-06~2017-09,中国科学院上海高等研究院, 研究员
2006-08~2011-05,La Jolla Institute for Allergy & Immunology, 博士后, 研究科学家
2003-10~2006-07,University of Georgia, 博士后
2001-09~2002-05,Cornell University, Master of Engineering
1996-09~2001-08,UW-Madison, 博士
1991-09~1996-07,北京大学, 学士
社会兼职
   

教授课程

   

专利与奖励

   
奖励信息
   
专利成果
   

出版信息

   
发表论文
(1) Genomic and Transcriptomic Landscape of Triple-Negative Breast Cancers: Subtypes and Treatment Strategies, Cancer Cell, 2019, 第 11 作者
(2) Competitive endogenous RNA is an intrinsic component of EMT regulatory circuits and modulates EMT, Nature Communications, 2019, 第 11 作者
(3) Computational identification of mutually exclusive transcriptional drivers dysregulating metastatic microRNAs in prostate cancer, Nature Communications, 2017, 第 11 作者
(4) Synergistic action of master transcription factors controls epithelial-to-mesenchymal transition, Nucleic acids research, 2016, 第 11 作者
(5) The 3'UTR signature defines a highly metastatic subgroup of triple-negative breast cancer, Oncotarget, 2016, 第 11 作者
(6) 3UTR shortening identifies high-risk cancers with targeted dysregulation of the ceRNA network, Scientific Reports, 2014, 第 11 作者
(7) Identification of CD4+ T cell epitopes in C. burnetii antigens targeted by antibody responses., PLoS One., 2011, 第 3 作者
(8) Peptide binding predictions for HLA DR, DP and DQ molecules., BMC Bioinformatics, 2010, 第 1 作者
(9) Limitations of Ab initio predictions of peptide binding to MHC class II molecules., PLoS One. , 2010, 第 1 作者
(10) Immune epitope database analysis resource (IEDB-AR)., Nucleic Acids Res., 2008, 第 2 作者
(11) Cutting edge: murine cytomegalovirus induces a polyfunctional CD4 T cell response., J Immunol. , 2008, 第 2 作者
(12) A systematic assessment of MHC class II peptide binding predictions and evaluation of a consensus approach., PLoS Comput Biol., 2008, 第 1 作者
(13) Automating document classification for the Immune Epitope Database., BMC Bioinformatics. , 2007, 第 1 作者
(14) Quantitative evaluation of protein-DNA interactions using an optimized knowledge-based potential., Nucleic Acids Res., 2005, 第 11 作者
(15) Structural genomics analysis of alternative splicing and application to isoform structure modeling., Proc Natl Acad Sci U S A., 2005, 第 1 作者
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) mRNA 3'UTR调控肿瘤竞争性内源RNA网络的研究, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
( 2 ) ****择优支持, 主持, 国家级, 2013-01--2015-12
( 3 ) 竞争性内源RNA做为EMT调控网络核心元件的系统性研究, 主持, 国家级, 2017-01--2020-12
( 4 ) 参芪麝蓉丸的临床前大数据关键技术研究, 主持, 国家级, 2018-01--2020-12
( 5 ) 建立指标共享数据库,开发并验证生物学年龄、老龄化和老年健康风险评估体, 主持, 国家级, 2019-01--2022-12
参与会议
(1)An automatic computational pipeline to display MHC binding motifs   Peng Wang, John Sidney, Alex Sette and Bjoern Peters   2010-08-02

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生