0710Z2-计算生物学
086000-生物与医药

计算生物学-计算生物学；肿瘤系统生物学；生物网络
生物与医药-计算生物学；肿瘤系统生物学；生物网络

2001-09--2002-05   Cornell University   Master of Engineering
1996-09--2001-08   UW-Madison   博士
1991-09--1996-07   北京大学   学士

   

2017-10~现在, 中国科学院马普学会伙伴计算生物学研究所, 研究员
2011-06~2017-09,中国科学院上海高等研究院, 研究员
2006-08~2011-05,La Jolla Institute for Allergy & Immunology, 博士后， 研究科学家
2003-10~2006-07,University of Georgia, 博士后
2001-09~2002-05,Cornell University, Master of Engineering
1996-09~2001-08,UW-Madison, 博士
1991-09~1996-07,北京大学, 学士

   

（1） Genomic and Transcriptomic Landscape of Triple-Negative Breast Cancers: Subtypes and Treatment Strategies, Cancer Cell, 2019, 通讯作者
（2） Competitive endogenous RNA is an intrinsic component of EMT regulatory circuits and modulates EMT, Nature Communications, 2019, 通讯作者
（3） Computational identification of mutually exclusive transcriptional drivers dysregulating metastatic microRNAs in prostate cancer, Nature Communications, 2017, 通讯作者
（4） Synergistic action of master transcription factors controls epithelial-to-mesenchymal transition, Nucleic acids research, 2016, 通讯作者
（5） The 3'UTR signature defines a highly metastatic subgroup of triple-negative breast cancer, Oncotarget, 2016, 通讯作者
（6） 3UTR shortening identifies high-risk cancers with targeted dysregulation of the ceRNA network, Scientific Reports, 2014, 通讯作者
（7） Identification of CD4+ T cell epitopes in C. burnetii antigens targeted by antibody responses., PLoS One., 2011, 第 3 作者
（8） Peptide binding predictions for HLA DR, DP and DQ molecules., BMC Bioinformatics, 2010, 第 1 作者
（9） Limitations of Ab initio predictions of peptide binding to MHC class II molecules., PLoS One. , 2010, 第 1 作者
（10） Immune epitope database analysis resource (IEDB-AR)., Nucleic Acids Res., 2008, 第 2 作者
（11） Cutting edge: murine cytomegalovirus induces a polyfunctional CD4 T cell response., J Immunol. , 2008, 第 2 作者
（12） A systematic assessment of MHC class II peptide binding predictions and evaluation of a consensus approach., PLoS Comput Biol., 2008, 第 1 作者
（13） Automating document classification for the Immune Epitope Database., BMC Bioinformatics. , 2007, 第 1 作者
（14） Quantitative evaluation of protein-DNA interactions using an optimized knowledge-based potential., Nucleic Acids Res., 2005, 通讯作者
（15） Structural genomics analysis of alternative splicing and application to isoform structure modeling., Proc Natl Acad Sci U S A., 2005, 第 1 作者

   

（ 1 ） mRNA 3'UTR调控肿瘤竞争性内源RNA网络的研究, 负责人, 国家任务, 2013-01--2016-12
（ 2 ） ****择优支持, 负责人, 国家任务, 2013-01--2015-12
（ 3 ） 竞争性内源RNA做为EMT调控网络核心元件的系统性研究, 负责人, 国家任务, 2017-01--2020-12
（ 4 ） 参芪麝蓉丸的临床前大数据关键技术研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2020-12
（ 5 ） 建立指标共享数据库，开发并验证生物学年龄、老龄化和老年健康风险评估体, 负责人, 国家任务, 2019-01--2022-12

（1）An automatic computational pipeline to display MHC binding motifs   Peng Wang, John Sidney, Alex Sette and Bjoern Peters   2010-08-02