基本信息
涂然  女  硕导  中国科学院天津工业生物技术研究所
电子邮件: tu_r@tib.cas.cn
通信地址: 天津空港经济区西七道32号
邮政编码: 300308

招生信息

   
招生专业
071005-微生物学
071010-生物化学与分子生物学
083100-生物医学工程
招生方向
高通量筛选技术
合成生物学
蛋白质工程

教育背景

2007-04--2010-07   Jacobs University   哲学博士
2001-09--2006-06   中国农业大学   理学博士
1996-09--2000-06   华南理工大学   工学学士

工作经历

   
工作简历
2020-08~现在, 中国科学院天津工业生物技术研究所, 项目研究员
2014-08~2015-02,哈佛大学, 访问学者
2010-09~现在, 中国科学院天津工业生物技术研究所, 副研究员
2007-04~2010-07,Jacobs University, 哲学博士
2006-07~2007-03,清华大学, 博士后研究
2001-09~2006-06,中国农业大学, 理学博士
2000-09~2001-04,北京大学, 实习研究
1996-09~2000-06,华南理工大学, 工学学士

教授课程

微生物菌种筛选技术和应用案例解析
酶的定向进化诱变和高通量筛选
定向改造技术及应用

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 增强红色糖多孢菌的红霉素生产能力的方法及其获得的菌株, 2022, 第 3 作者, 专利号: 202210249185.4

( 2 ) 一种高通量检测筛选生产次级代谢产物放线菌株的方法, 2021, 第 2 作者, 专利号: 202110990958.X

( 3 ) 一种使用液滴微流控芯片的高通量筛选方法在放线菌中的应用, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN112852915A

( 4 ) 一种高通量筛选酮类化合物的检测方法及其在酶筛选中的应用, 2021, 第 4 作者, 专利号: CN112394050A

( 5 ) 基于液滴微流控芯片的毕赤酵母高通量筛选方法, 2020, 第 1 作者, 专利号: CN111718862A

( 6 ) 一种低温碱性蛋白酶及其制备方法, 2019, 第 2 作者, 专利号: CN106801048B

( 7 ) 一种基于生物传感器的高通量筛选方法, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN109679886A

( 8 ) 一种用于液滴荧光检测的显微镜集成光路系统, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN105300943B

( 9 ) 一种使用液滴微流控芯片的高通量筛选设备, 2018, 第 2 作者, 专利号: CN108020490A

( 10 ) 一种应答3-脱氢莽草酸的生物传感器及其应用, 2018, 第 2 作者, 专利号: CN107974451A

( 11 ) 纤维素酶高产菌株的高通量筛选方法, 2018, 第 2 作者, 专利号: CN108485984A

( 12 ) 一组耐螯合剂乙二胺四乙酸的重组碱性木聚糖酶及其构建方法, 2018, 第 4 作者, 专利号: CN104928270B

( 13 ) 一种使用液滴微流控芯片的高通量筛选设备, 2018, 第 2 作者, 专利号: CN207066929U

( 14 ) 一种基于双酶偶联高通量检测微生物生产异戊醇的新方法, 2014, 第 3 作者, 专利号: CN104099400A

( 15 ) 一种基于液滴微流控芯片的微生物高通量检测系统, 2014, 第 2 作者, 专利号: CN104007091A

( 16 ) 一种利用木质纤维素原料高温同步糖化发酵生产乙醇的新工艺, 2014, 第 5 作者, 专利号: CN103667362A

( 17 ) 一种基于双酶偶联高通量检测微生物生产二元酸的新方法, 2014, 第 3 作者, 专利号: CN103571915A

( 18 ) 一株生产乙醇的耐高温酵母菌及其应用, 2013, 第 5 作者, 专利号: CN103374532A

( 19 ) 一株生产木糖醇的耐高温酵母菌及其应用, 2013, 第 4 作者, 专利号: CN103184165A

( 20 ) 一株可同时生产D-阿拉伯糖醇和木糖醇的酵母菌及其应用, 2013, 第 3 作者, 专利号: CN103184164A

( 21 ) 一种基于双酶偶联高通量检测微生物生产乙醇和C3-C6正烷醇的新方法, 2013, 第 3 作者, 专利号: CN103146803A

( 22 ) 一株生产丙酮酸的耐高温酵母菌及其应用, 2013, 第 3 作者, 专利号: CN103146589A

出版信息

   
发表论文
(1) 液滴微流控技术在微生物工程菌株选育中的应用进展, 合成生物学, 2022, 第 1 作者
(2) Whole-cell biosensor and producer co-cultivation based microfludic platform for screening Saccharopolyspora erythraea with hyper erythromycin production, ACS Synth Biol, 2022, 通讯作者
(3) Recent advances in droplet microfluidics for enzyme and cell factory engineering, CRITICAL REVIEWS IN BIOTECHNOLOGY, 2021, 第 2 作者
(4) Antisense RNA Interference-Enhanced CRISPR/Cas9 Base Editing Method for Improving Base Editing Efficiency in Streptomyces lividans 66, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2021, 第 4 作者
(5) Droplet-based microfluidic platform for high-throughput screening of Streptomyces, COMMUNICATIONS BIOLOGY, 2021, 第 1 作者
(6) A high-throughput fluorescence assay for ketone detection and its applications in enzyme mining and protein engineering, ACS Omega, 2020, 通讯作者
(7) Design and Reconstruction of Regulatory Parts for Fast-frowing Vibrio natriegens Synthetic Biology, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2020, 第 4 作者
(8) High-Throughput Fluorescence Assay for Ketone Detectionand Its Applications in Enzyme Mining and Protein Engineering, ACS OMEGA, 2020, 通讯作者
(9) Biosensor-enabled droplet microfluidic system for the rapid screening of 3-dehydroshikimic acid produced inEscherichia coli, JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 2020, 第 1 作者
(10) 核黄素工业菌株高通量筛选方法的建立和应用, Establishment and Application of High-throughput Screening Method of Riboflavin Industrial Strain, 生物技术通报, 2020, 第 5 作者
(11) 一种基于微芯片快速生成双层乳化液滴的方法, Rapid generation of double-layer emulsion droplets based on microfluidic chip, 生物工程学报, 2020, 第 3 作者
(12) Rapid isolation of antigen-specific B-cells using droplet microfluidics, RSC ADVANCES, 2020, 第 6 作者
(13) Development of a Simple Colorimetric Assay for Determination of the Isoamyl Alcohol-Producing Strain, APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY, 2020, 第 1 作者
(14) Genomic, transcriptomic, and metabolic characterizations of Escherichia coli adapted to branched-chain higher alcohol tolerance, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2020, 第 4 作者
(15) Enhanced production of d-psicose 3-epimerase in Bacillus subtilis by regulation of segmented fermentation, BIOTECHNOLOGY AND APPLIED BIOCHEMISTRY, 2020, 通讯作者
(16) A double-enzyme-coupled high-throughput assay for determination of isoamyl alcohol produced by microorganisms, Appl Biochem Biotechnol, 2020, 第 1 作者
(17) Ultra-high-throughput picoliter-droplet microfluidics screening of the industrial cellulase-producing filamentous fungus Trichoderma reesei, JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 2019, 通讯作者
(18) 毕赤酵母液滴微流控高通量筛选方法的建立与应用, Development and application of a droplet-based microfluidic high-throughput screening of Pichia pastoris, 生物工程学报, 2019, 第 2 作者
(19) Development of a Synthetic 3-Dehydroshikimate Biosensor in Escherichia coli for Metabolite Monitoring and Genetic Screening, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2019, 通讯作者
(20) High-efficiency expression and secretion of human FGF21 in Bacillus subtilis by intercalation of a mini-cistron cassette and combinatorial optimization of cell regulatory components, MICROBIAL CELL FACTORIES, 2019, 第 3 作者
(21) Fluorescence-activated droplet sorting of lipolytic microorganisms using a compact optical system, LAB ON A CHIP, 2018, 第 4 作者
(22) Fluorescence-activated droplet sorting of lipolytic microorganisms using a compact optical system., Lab on a Chip, 2017, 
(23) Increasing activity and thermal resistance of Bacillus gibsonii alkaline protease (BgAP) by directed evolution, BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING, 2013, 第 3 作者
(24) A double-enzyme-coupled assay for high-throughput screening of succinic acid-producing strains, JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY, 2013, 
(25) 大肠杆菌合成启动子的构建及在顺,顺-粘康酸生物合成中的应用, Construction of synthetic promoters for Escherichia coli and application in the biosynthesis of cis,cis-muconic acid, 生物工程学报, 2013, 第 3 作者
(26) A Simple Colorimetric Method for Detection of 16,17-Epoxyprogesterone, CHEMISTRY LETTERS, 2013, 第 2 作者
(27) Directed evolution of cytochrome P450 for sterol epoxidation, BIOTECHNOLOGY LETTERS, 2013, 第 2 作者
(28) 一种基于双酶偶联高通量检测微生物生产乙醇和C3-C6正烷醇的新方法, 2012, 第 3 作者
(29) Branched-Chain Higher Alcohols, BIOTECHNOLOGY IN CHINA III: BIOFUELS AND BIOENERGY, 2012, 
(30) 嗜热碱性果胶酶产生菌的筛选及产酶条件优化, Screening and Optimization of Bacillus smithii RH214 for Pectinase Activity, 食品与发酵工业, 2012, 第 3 作者
(31) 一株生产丙酮酸的耐高温酵母菌及其应用, 2012, 第 3 作者
(32) A flow cytometry based high-throughput screening system for directed evolution of proteases., Journal of Biomolecular Screening, 2011, 第 1 作者
(33) High-throughput screening and characterization of xylose-utilizing and ethanol tolerant thermophilic bacteria for bioethanol production., Journal of Applied Microbiology, 2011, 
(34) cDNA-AFLP analysis of differential gene expression related to cell chemotactic and encystment of Azospirillum brasilense., Microbiological Research, 2010, 第 1 作者
(35) A hybrid two-component system protein from Azospirillum brasilense Sp7 was involved in chemotaxis., Microbiological Research, 2010, 第 1 作者
(36) Flow cytometry based high throughput screening system for screening and improving industrially important enzymes, NEW BIOTECHNOLOGY, 2009, 

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 特定DNA元件的合成和调控元件的表征与优化, 负责人, 国家任务, 2011-01--2013-06
( 2 ) 高频多位点突变对碱性蛋白酶定向进化影响作用的研究, 负责人, 国家任务, 2013-01--2015-12
( 3 ) 基于液滴微流芯片的工业微生物高通量筛选系统的研制, 参与, 中国科学院计划, 2012-11--2014-12
( 4 ) 中国科学院青年促进会基金, 负责人, 中国科学院计划, 2012-01--2015-12
( 5 ) 液滴微流控微生物高通量筛选系统研制, 参与, 地方任务, 2014-10--2017-09
( 6 ) 基于液滴微量化反应器的高通量检测分选平台及技术服务, 负责人, 中国科学院计划, 2016-01--2017-12
( 7 ) 基于液滴微流控技术的肠激酶智能筛选系统及应用, 负责人, 境内委托项目, 2016-01--2017-12
( 8 ) 工业微生物通用型高通量筛选技术开发, 负责人, 地方任务, 2019-10--2022-09
( 9 ) 丝状真菌高通量培养与筛选技术, 负责人, 地方任务, 2019-10--2022-09
( 10 ) 低温自养硝化细菌的高通量检测和分离, 负责人, 境内委托项目, 2019-06--2025-06
( 11 ) 液滴微流控细胞选育技术及装备研制, 负责人, 国家任务, 2021-12--2024-11
( 12 ) 工业酶高效表达共性关键技术平台创建及分子工具挖掘, 负责人, 国家任务, 2021-07--2024-06
参与会议
(1)微生物菌种筛选技术和应用案例解析   2021微生物发酵菌种选育与培养基优化技术研讨班   2021-10-15
(2)高通量筛选技术和装备   工业微生物发酵高产菌种选育及优化暨高通量筛选技术与装备创新应用研讨会   2019-03-17
(3)液滴微流控高通量筛选技术在“细胞工厂”中的应用   第二届微流控技术应用创新论坛   2018-12-09
(4)液滴微流控高通量筛选系统及应用   第九届中国工业生物技术发展高峰论坛暨第二届中国生物工业投资大会   2017-11-08
(5)液滴微流控高通量筛选系统研究与应用   第五届国际微流控芯片与微纳尺度生物分离分析学术会议   涂然   2016-05-08
(6)新一代高通量筛选技术:液滴微流控芯片分选系统   第九届中国酶工程研讨会   涂然,袁会领,吴晟,王钦宏   2013-11-15
(7)Micorfluidics based high throughput screening system   2012 美国化工年会   Ran Tu, Huiling Yuan, Lin Sun, Qinhong Wang and Yanhe Ma   2012-10-30
(8)Flow Cytometry-Based High-Throughput Screening Systems for Directed Evolution of Proteases   2011 第二届工业酶与生物催化大会   Ran Tu   2011-04-25