0710J3-生物信息学
0710Z1-基因组学
071007-遗传学

进化基因组学,生物信息学

种群遗传学是遗传学的一个分支，是演化生物学重要的理论基础。但是，种群遗传学在大多数高校中并不是生物专业本科会学习的课程。我和我的同事做过一个《群体遗传学：起源、历史和内容》的微课程。希望对有志于研究演化生物学的学生学习种群遗传学有所帮助。

微课程的网址：

http://www.casmooc.cn/onlineCourseAction.do?method=detail&bookId=1576541862440

2000-09--2006-06   复旦大学生命科学学院   博士（硕博连读）
1996-09--2000-06   河北大学生命科学学院   学士

   

2018-12~现在, 中国科学院微生物研究所, 研究组长、项目研究员
2009-07~2018-11,中国科学院动物研究所, 助理研究员、副研究员
2008-12~2009-06,复旦大学遗传工程国家重点实验室, 研究助理
2006-09~2008-11,复旦大学生物医学研究院, 博士后

2016-12-11-2017-12-10,西华师范大学外聘教师, 生命科学学院外聘教师

   

（1） 大熊猫适应性演化与濒危机制研究, 二等奖, 国家级, 2019

   

（1） Diet drives convergent evolution of gut microbiomes in bamboo-eating species, SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES, 2021, 第 4 作者
（2） A whole-genome association approach for large-scale interspecies traits, SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES, 2021, 通讯作者
（3） A New Alignment-Free Whole Metagenome Comparison Tool and Its Application on Gut Microbiomes of Wild Giant Pandas, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2020, 通讯作者
（4） Chromosome-level genome assembly for giant panda provides novel insights into Carnivora chromosome evolution, GENOME BIOLOGY, 2019, 第 2 作者
（5） Patterns and effects of GC3 heterogeneity and parsimony informative sites on the phylogenetic tree of genes, GENE, 2018, 第 2 作者
（6） Construction and discussion of whole-genome phylogeny of mammals by alignment-free method, Acta Theriologica Sinica., 2018, 通讯作者
（7） Comparative genomics reveals convergent evolution between the bamboo-eating giant and red pandas, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2017, 
（8） Seasonal Variation in Nutrient Utilization Shapes Gut Microbiome Structure and Function in Wild Giant Pandas, PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES, 2017, 第 1 作者
（9） A natural communication system on genome evolution, SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES, 2017, 第 1 作者
（10） Exceptionally low daily energy expenditure in the bamboo eating giant panda, Science, 2015, 
（11） Whole-genome sequencing of giant pandas provides insights into demographic history and local adaptation., Nature Genetics, 2012, 

   

（ 1 ） 基于基因组和宏基因组数据的协同演化机制的方法学探索, 主持, 部委级, 2018-07--2023-12

（1）the Wave-interference-like motion of Multi-allele Systems in Population Dynamics   第8届世界华人数学家大会   2019-06-09
（2）Assessment of kmer degeneration method for complicated genomes   2018-12-10
（3）大熊猫肠道微生物组季节动态及其与营养利用的关系   第十三届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会   2017-10-27
（4）基因组演化的自然通信系统模型   2017年第四届全国统计物理与复杂系统及海峡两岸会议   2017-07-19
（5）非序列联配方法在基因组进化中的理论与应用   首届全国生物系统学学术论坛   2016-12-09

现指导学生

张雅然  硕士研究生  085238-生物工程  

陈萌萌  硕士研究生  071007-遗传学  

代艺  博士研究生  071007-遗传学