基本信息
方向东  男  博导  中国科学院北京基因组研究所
电子邮件: fangxd@big.ac.cn
通信地址: 北京市朝阳区北辰西路1号院104号楼
邮政编码: 100101

研究领域

   

招生信息

   
招生专业
071007-遗传学
071022-基因组学
083100-生物医学工程
招生方向
基因组大数据与精准医学研究
细胞分化的表观遗传调控网络
基因组学成果转化与应用

教育背景

1996-09--1999-07   第一军医大学   人体解剖学和组织胚胎学博士
1992-09--1995-07   第一军医大学   免疫学硕士
1986-09--1992-07   第一军医大学   临床医学本科
学历
   
学位
   

工作经历

   
工作简历
2009-01~现在, 中国科学院北京基因组研究所, “百人计划”研究员
2000-05~2009-01,美国华盛顿大学医学院, 博士后、讲师、研究助理教授
社会兼职
2013-01-01-今,《发育医学电子杂志》, 副主编
2011-03-31-今,《遗传》, 编委
2010-01-01-今,Genomics Proteomics Bioinformatics, 副主编

教授课程

基因组学前沿
基因组学

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 《基因组学前沿》国科大生命学院优秀课程, 院级, 2013
(2) 中国科学院知识创新工程“百人计划”择优支持, , 院级, 2010
(3) 上海市科学技术进步奖, 三等奖, 省级, 1999
(4) 广东省科学技术进步奖, 二等奖, 省级, 1995
专利成果
( 1 ) 用于检测人肝癌细胞标志物的引物和探针及其检测试剂盒, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: 201310551809.9

出版信息

   
发表论文
(1) Transcriptome analysis reveals a ribosome constituents disorder involved in the RPL5 downregulated zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia., BMC Med Genomics, 2016, 通讯作者
(2) MAGE-A1 promotes melanoma proliferation and migration through C-JUN activation., Biochem Biophys Res Commun, 2016, 通讯作者
(3) Regulation of ALAS2 by miR-218 during iron metabolism and erythroid differentiation., Int J Mol Sci, 2015, 通讯作者
(4) Integrated analysis of gene expression and microRNA regulation in three leukemia-related lymphoblastic cell lines, Gene, 2015, 通讯作者
(5) Knockdown of transcription factor forkhead box O3 (FOXO3) suppresses erythroid differentiation in human cells and zebrafish, Biochem Biophys Res Commun , 2015, 通讯作者
(6) Insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP5) functions as a tumor suppressor in human melanoma cells, Oncotarget, 2015, 通讯作者
(7) Characterization of miRNomes in acute and chronic myeloid leukemia cell lines., Genomics Proteomics Bioinformatics, 2014, 通讯作者
(8) Whole transcriptome RNA-seq analysis: the tumorigenesis and metastasis of melanoma, Gene, 2014, 通讯作者
(9) Systematic transcriptome analysis of the zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia induced by RPS24 deficiency,  BMC Genomics , 2014, 通讯作者
(10) Few de novo single nucleotide variations in exomes of human cord blood induced pluripotent stem cells. , PLoS One, 2013, 通讯作者
(11) Dynamic transcriptomes of human myeloid leukemia cells., Genomics, 2013, 通讯作者
(12) Comprehensive characterization of erythroid-specific enhancers in the genomic regions of human Krüppel-like factors., BMC Genomics, 2013, 通讯作者
(13) Epigenetic modifications and chromosome conformations of the beta-globin locus throughout development. , Stem Cell Rev , 2013, 第 1 作者
(14) Long-term cultured mesenchymal stem cells frequently develop genomic mutations but do not undergo malignant transformation. , Cell Death Dis, 2013, 通讯作者
(15) Dynamic transcriptomes during human erythroid differentiation and development., Genomics, 2013, 通讯作者
(16) Assessment of hematopoietic failure due to RPL11 deficiency in a zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia by deep sequencing., BMC Genomics, 2013, 通讯作者
(17)  Influence of carbon monoxide on growth and apoptosis of human umbilical artery smooth muscle cells and vein endothelial cells. , Int J Biol Sci , 2012, 通讯作者
(18) The higher structure of chromatin in the LCR of the beta-globin locus changes during development, J Mol Biol, 2009, 第 1 作者
(19) Cooperativeness of the higher chromatin structure of the beta-globin locus revealed by the deletion mutations of HS3 of the LCR., J Mol Biol, 2007, 第 1 作者
(20) Synergistic and additive properties of the beta-globin LCR revealed by 5'HS3 deletion mutations: Implication for LCR chromatin architecture., Mol Cell Biol, 2005, 第 1 作者
(21) Developmentally specific role of the CCAAT box in regulation of human gamma-globin gene expression., J Biol Chem, 2004, 第 1 作者
(22) Developmental specificity of recruitment of TBP to the TATA box of the human gamma-globin gene., Proc Natl Acad Sci USA, 2002, 第 1 作者
(23) The interaction of the calcium- and integrin-binding protein (CIBP) with the coagulation factor VIII., Thromb Res, 2001, 第 1 作者
(24) 甲型血友病诊断和治疗进展., 自然杂志, 1993, 第 1 作者
发表著作
   

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 高通量细胞分选多模式检测仪器在血液干细胞分化研究中的应用, 主持, 国家级, 2011-10--2016-09
( 2 ) 中国科学院“引进国外杰出人才”择优支持, 主持, 部委级, 2011-01--2012-12
( 3 ) 肿瘤个体化治疗方法及其相关的基因组和系统生物学研究, 主持, 部委级, 2012-05--2014-12
( 4 ) 利用高通量组学平台和系统生物学分析技术筛选肿瘤干细胞的特异性标记物和治疗靶点, 主持, 部委级, 2012-06--2015-05
( 5 ) 肿瘤的个体化RNA干扰治疗, 参与, 国家级, 2012-05--2015-04
( 6 ) 生物大数据表述索引、搜索与存储访问关键技术研发, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12
( 7 ) 转录因子KLFs调控干细胞红系分化的分子网络机制, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12
( 8 ) 精准医学大数据处理和利用的标准化技术体系建设, 主持, 国家级, 2016-01--2020-12
参与会议
   

合作情况

   
项目协作单位
   

指导学生

已指导学生

张倩  02  52764  

孙红英  02  52764  

王海  01  19180  

熊倩  01  52764  

李杰  02  63228  

亓合媛  01  52764  

王均云  01  52764  

刘淑阁  02  19180  

邓友辉  02  52764  

李艳明  01  19180  

郑佳文  02  19180  

董绪浓  02  67917  

丁楠  01  67917  

现指导学生

杨琼  01  19180  

任岚  02  19180  

施剑  02  19180  

张璐  02  19180  

李品  02  19180  

王晨  02  19180  

贺宁  02  19180  

杨亚东  01  67917  

谢兵兵  01  67687  

任云晓  02  19180  

祝俊伟  02  19180  

赵学彤   02  19180