基本信息

贺思敏  男  博导  中国科学院计算技术研究所
电子邮件: smhe@ict.ac.cn
通信地址: 1
邮政编码: http://pfind.ict.ac.cn/people/hesimin/Chinese/default.htm

招生信息

   
招生专业
081203-计算机应用技术
招生方向
搜索引擎,应用算法学,生物信息学

教育背景

1991-09--1997-07   清华大学计算机科学与技术系   博士
1986-09--1991-07   清华大学计算机科学与技术系   学士
学历
清华大学 19910901--19970701 研究生毕业
学位
清华大学 19910901--19970701 工学博士学位

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 中国计算机学会技术发明奖《蛋白质组海量质谱数据深度解析关键技术及应用》, 一等奖, 其他, 2019
(2) 中国科学院优秀导师奖, 院级, 2013
(3) 中创软件人才奖, 其他, 2009
(4) 数字视频广播编码传输与接收系统, 二等奖, 国家级, 2000

出版信息

   
发表论文
(1) pDeepXL: MS/MS Spectrum Prediction for Cross-Linked Peptide Pairs by Deep Learning, Journal of Proteome Research, 2021, 通讯作者
(2) A high-speed search engine pLink 2 with systematic evaluation for proteome-scale identification of cross-linked peptides, Nature Communications, 2019, 通讯作者
(3) pValid: Validation Beyond the Target-Decoy Approach for Peptide Identification in Shotgun Proteomics, Journal of Proteome Research, 2019, 通讯作者
(4) pNovo 3: precise de novo peptide sequencing using a learning-to-rank framework, Bioinformatics, 2019, 通讯作者
(5) Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine, Nature Biotechnology, 2018, 通讯作者
(6) pSite: Amino Acid Confidence Evaluation for Quality Control of De Novo Peptide Sequencing and Modification Site Localization, Journal of Proteome Research, 2017, 通讯作者
(7) pDeep: Predicting MS/MS Spectra of Peptides with Deep Learning, Analytical Chemistry, 2017, 通讯作者
(8) Open-pNovo: De Novo Peptide Sequencing with Thousands of Protein Modifications, Journal of Proteome Research, 2017, 通讯作者
(9) pGlyco 2.0 enables precision N-glycoproteomics with comprehensive quality control and one-step mass spectrometry for intact glycopeptide identification, Nature Communications, 2017, 通讯作者
(10) pGlyco: a pipeline for the identification of intact N-glycopeptides by using HCD- and CID-MS/MS and MS3, Scientific Reports, 2016, 通讯作者
(11) pFind-Alioth: A novel unrestricted database search algorithm to improve the interpretation of high-resolution MS/MS data, Journal of Proteomics, 2015, 通讯作者
(12) A Note on the False Discovery Rate of Novel Peptides in Proteogenomics, Bioinformatics, 2015, 通讯作者
(13) Mapping native disulfide bonds at a proteome scale, Nature Methods, 2015, 通讯作者
(14) pNovo+: De Novo Peptide Sequencing Using Complementary HCD and ETD Tandem Mass Spectra, Journal of Proteome Research, 2013, 通讯作者
(15) Identification of cross-linked peptides from complex samples, Nature Methods, 2012, 通讯作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 面向数据库搜索的蛋白质组精准鉴定技术研究, 主持, 国家级, 2016-07--2021-06
( 2 ) 计算蛋白质组学创新交叉团队, 主持, 部委级, 2016-01--2018-12
( 3 ) 蛋白质组海量质谱数据的深度解析, 主持, 国家级, 2010-01--2014-08

指导学生

已指导学生

郑强  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

王一  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

迟浩  博士研究生  081203-计算机应用技术  

王文平  硕士研究生  081201-计算机系统结构  

周郴  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

吴妍洁  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

刘超  博士研究生  081203-计算机应用技术  

陈海丰  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

何昆  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

邬龙  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

张昆  博士研究生  081203-计算机应用技术  

樊盛博  博士研究生  081203-计算机应用技术  

曾文锋  博士研究生  081203-计算机应用技术  

杨皓  博士研究生  081203-计算机应用技术  

王钊伟  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

张晓今  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

涂慧君  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

吴建强  硕士研究生  085212-软件工程  

方润乾  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

徐心仪  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

王曦  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

陈镇霖  博士研究生  081203-计算机应用技术  

现指导学生

周文婧  博士研究生  081203-计算机应用技术  

谭永卿  硕士研究生  081202-计算机软件与理论  

李金洋  硕士研究生  081203-计算机应用技术  

毛鹏志  博士研究生  081203-计算机应用技术