主要从事贝类养殖、遗传育种及进化发育生物学研究。海洋动物中包含世界上大多数的动物门类，是研究动物进化的重要对象。同时海洋无脊椎动物大多要经历幼体浮游到成体底栖的转换，称为附着变态，是研究发育机制、种群适应性进化、污损生物防治、养殖动物人工控制、开发生物胶等制品的重要阶段。以贝类激素及其在附着变态中的作用机制为主要切入点，结合基因组学和实验生物学技术，对激素和相关发育基因家族进行系统进化分析和功能验证。以期阐明激素对附着变态的作用机制，以及相关激素系统在动物中的进化机制。

   

070703-海洋生物学
090801-水产养殖
086000-生物与医药

繁殖、发育与调控技术
养殖遗传学与育种生物技术
海洋生物工程

2004-09--2009-07   中国科学院海洋研究所   博士
2000-09--2004-07   中国海洋大学   学士

   

2021-06~现在, 中国科学院海洋研究所, 研究员
2018-01~2020-12,中国科学院海洋研究所, 特聘研究员，汇泉学者
2015-03~2016-03,英国牛津大学, 访问学者、博士后
2014-01~2021-06,中国科学院海洋研究所, 副研究员
2010-11~2011-01,美国普渡大学, 访问学者
2009-07~2013-12,中国科学院海洋研究所, 助理研究员

2021-11-01-今,中国水产流通与加工协会牡蛎分会, 理事
2019-11-01-2023-11-01,中国动物学会中国海洋湖沼学会贝类学分会, 副秘书长
2019-11-01-2023-11-01,山东动物学会, 常务理事

海洋生物学经典文献解读

   

（1） 一种用于海洋工程表面诱导固着生物的水泥基涂料及制备方法, 一等奖, 其他, 2022
（2） 海洋保卫者-重防腐与生态修复一体化海洋工程涂料, 一等奖, 其他, 2022
（3） 高质牡蛎创制技术体系的构建与应用, 一等奖, 省级, 2020
（4） 牡蛎基因组解析与潮间带适应的分子机制, 二等奖, 省级, 2016

（ 1 ） 一种优质太平洋牡蛎精子的采集及超低温冷冻保存的方法, 发明专利, 2015, 第 3 作者, 专利号: CN104336004A

（ 2 ） 一种贝类snRNA U6基因及其引物和应用, 发明专利, 2014, 第 3 作者, 专利号: CN103484465A

（ 3 ） 一种用于鉴别贝类两种近缘物种或鉴定其杂交后代的方法, 发明专利, 2014, 第 1 作者, 专利号: CN104046683A

（ 4 ） 一种双基因microRNA荧光定量内参及其引物在贝类组织样品中的应用, 发明专利, 2014, 第 3 作者, 专利号: CN103740823A

（ 5 ） 一种太平洋牡蛎胚胎超低温冷冻保存方法, 发明专利, 2014, 第 9 作者, 专利号: CN103704204A

（ 6 ） 一种双基因microRNA荧光定量内参及其引物在贝类发育样品中的应用, 发明专利, 2014, 第 3 作者, 专利号: CN103710457A

（ 7 ） 一种在贝类幼虫中定量检测甲状腺激素的方法, 发明专利, 2014, 第 3 作者, 专利号: CN103529226A

（ 8 ） 一种牡蛎近缘物种鉴定的方法, 发明专利, 2012, 第 2 作者, 专利号: CN102758009A

（ 9 ） 一种海湾扇贝雄性不育体的制备方法, 发明专利, 2011, 第 4 作者, 专利号: CN102217561A

编著及近三年主要论文：

（1） Oyster studies reveal the duplication and functional diversification of Bivalvia caspase-8 genes, Journal of Oceanology and Limnology, 2023, 通讯作者
（2） Pooled resequencing of larvae and adults reveals genomic variations associated with Ostreid herpesvirus 1 resistance in the Pacific oyster Crassostrea gigas, FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, 2022, 第 6 作者
（3） Genome of the sea anemone Exaiptasia pallida and transcriptome profiles during tentacle regeneration, FRONTIERS IN CELL AND DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 2022, 第 15 作者
（4） 长牡蛎繁殖期糖原含量与类胰岛素基因表达的相关性分析, Glycogen content during reproduction seasons of Pacific oyster and the correlation analysis with relative expression of insulin-like genes, 海洋科学, 2022, 通讯作者
（5） Duplication and subsequent functional diversification of aquaporin family in Pacific abalone Haliotis discus hannai, Molecular Phylogenetics and Evolution, 2022, 第 2 作者
（6） Genome of elegance coral Catalaphyllia jardinei (Euphylliidae), FRONTIERS IN MARINE SCIENCE, 2022, 第 16 作者
（7） Comparative Genomics Reveals Evolutionary Drivers of Sessile Life and Left-right Shell Asymmetry in Bivalves, GENOMICS, PROTEOMICS & BIOINFORMATICS, 2022, 第 6 作者
（8） Evidence from oyster suggests an ancient role for Pdx in regulating insulin gene expression in animals, NATURE COMMUNICATIONS, 2021, 通讯作者
（9） Functional characterization of retinoid X receptor with an emphasis on the mediation of organotin poisoning in the Pacific oyster (Crassostrea gigas), GENE, 2020, 通讯作者
（10） Metabolomics Adaptation of Juvenile Pacific Abalone Haliotis discus hannai to Heat Stress, SCIENTIFIC REPORTS, 2020, 通讯作者
（11） The transcription of iodothyronine deiodinase genes is regulated by thyroid hormone receptor in the Pacific oyster Crassostrea gigas, JOURNAL OF OCEANOLOGY AND LIMNOLOGY, 2019, 第 2 作者
（12） Oyster Versatile IKK alpha/beta s Are Involved in Toll-Like Receptor and RIG-I-Like Receptor Signaling for Innate Immune Response, FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, 2019, 第 3 作者
（13） The transcription of iodothyronine deiodinase genes is regulated by thyroid hormone receptor in the Pacific oyster Crassostrea gigas, The transcription of iodothyronine deiodinase genes is regulated by thyroid hormone receptor in the Pacific oyster Crassostrea gigas, 海洋湖沼学报(英文), 2019, 第 2 作者
（14） Genetic determination of sex and shell color in the Pacific abalone Haliotis discus hannai revealed by an integrated linkage map, ANIMAL GENETICS, 2019, 
（15） Involvement of clustered oyster Wnt genes in gut formation, Involvement of clustered oyster Wnt genes in gut formation, 海洋湖沼学报（英文）, 2018, 第 2 作者
（16） Evolutionary dynamics of the Wnt gene family: implications for lophotrochozoans, JOURNAL OF OCEANOLOGY AND LIMNOLOGY, 2018, 通讯作者
（17） Transcriptome assembly of Modiolus modiolus and comparative analysis with Bathymodiolus platifrons, Transcriptome assembly of Modiolus modiolus and comparative analysis with Bathymodiolus platifrons, 海洋学报：英文版, 2018, 第 3 作者
（18） Reference gene selection for microrna expression analysis in the pacific oyster, ROMANIAN BIOTECHNOLOGICAL LETTERS, 2018, 第 2 作者
（19） Involvement of clustered oyster Wnt genes in gut formation, Involvement of clustered oyster Wnt genes in gut formation, JOURNAL OF OCEANOLOGY AND LIMNOLOGY, 2018, 通讯作者
（20） Construction of a high-density genetic map and fine QTL mapping for growth and nutritional traits of Crassostrea gigas, BMC GENOMICS, 2018, 第 5 作者
（21） Transcriptome assembly of Modiolus modiolus and comparative analysis with Bathymodiolus platifrons, Transcriptome assembly of Modiolus modiolus and comparative analysis with Bathymodiolus platifrons, ACTA OCEANOLOGICA SINICA, 2018, 第 3 作者
（22） Divergence and plasticity shape adaptive potential of the Pacific oyster, NATURE ECOLOGY & EVOLUTION, 2018, 第 13 作者
（23） The Molecular Differentiation of Anatomically Paired Left and Right Mantles of the Pacific Oyster Crassostrea gigas, MARINE BIOTECHNOLOGY, 2018, 第 2 作者
（24） Evolutionary dynamics of the Wnt gene family: implications for lophotrochozoans, Evolutionary dynamics of the Wnt gene family: implications for lophotrochozoans, 海洋湖沼学报（英文）, 2018, 第 2 作者
（25） Phylogenetics of Lophotrochozoan bHLH Genes and the Evolution of Lineage-Specific Gene Duplicates, GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, 2017, 通讯作者
（26） Characterization of the mollusc rig-i/mavs pathway reveals an archaic antiviral signalling framework in invertebrates, SCIENTIFIC REPORTS, 2017, 第 4 作者
（27） 长牡蛎精子超低温冷冻后超微结构损伤研究, STUDY ON ULTRASTRUCTURE OBSERVATION OF FRESH AND CRYOPRESERVATED SPERM IN CRASSOSTREAGIGAS, 水生生物学报, 2017, 第 3 作者
（28） Characterization of the IRF2 proteins isolated from the deep-sea mussel Bathymodiolus platifrons and the shallow-water mussel Modiolus modiolus., DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE IMMUNOLOGY, 2017, 第 4 作者
（29） A Preliminary Study on the Pattern, the Physiological Bases and the Molecular Mechanism of the Adductor Muscle Scar Pigmentation in Pacific Oyster Crassostrea gigas, FRONTIERS IN PHYSIOLOGY, 2017, 第 4 作者
（30） High expression of new genes in trochophore enlightening the ontogeny and evolution of trochozoans, SCIENTIFIC REPORTS, 2016, 第 1 作者
（31） A bibliometric analysis of oyster research from 1991 to 2014, AQUACULTURE INTERNATIONAL, 2016, 第 2 作者
（32） Molecular Basis for Adaptation of Oysters to Stressful Marine Intertidal Environments, ANNUAL REVIEW OF ANIMAL BIOSCIENCES, 2016, 第 6 作者
（33） Molecular Characterization and Functional Analysis of a Putative Octopamine/Tyramine Receptor during the Developmental Stages of the Pacific Oyster, Crassostrea gigas, PLOS ONE, 2016, 通讯作者
（34） Iodothyronine deiodinase gene analysis of the Pacific oyster Crassostrea gigas reveals possible conservation of thyroid hormone feedback regulation mechanism in mollusks, CHINESE JOURNAL OF OCEANOLOGY AND LIMNOLOGY, 2015, 第 2 作者
（35） 长牡蛎（Crassostrea gigas）Wnt4基因 cDNA 克隆与表达分析, MOLECULAR CLONING AND EXPRESSION OF WNT4 GENE IN PACIFIC OYSTER CRASSOSTREA GIGAS, 海洋与湖沼, 2015, 第 2 作者
（36） Evolution of a novel nuclear receptor subfamily with emphasis on the member from the Pacific oyster Crassostrea gigas, GENE, 2015, 第 2 作者
（37） Reinforcing the Egg-Timer: Recruitment of Novel Lophotrochozoa Homeobox Genes to Early and Late Development in the Pacific Oyster, GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, 2015, 第 2 作者
（38） 牡蛎幼虫光照实验提示复杂遗传背景下基因互作的多样性, THE LIGHT RESPONSES OF OYSTER LARVAE HINTING THE DIVERSITY OF GENE INTERACTION UNDER COMPLICATED GENETIC BACKGROUND, 海洋与湖沼, 2015, 第 2 作者
（39） 长牡蛎（Crassostrea gigas）两个Dmrt家族基因的时空表达, EXPRESSION OF TWO Dmrt FAMILY GENES IN THE PACIFIC OYSTER CRASSOSTREA GIGAS, 海洋与湖沼, 2015, 第 3 作者
（40） Identification of Thyroid Hormones and Functional Characterization of Thyroid Hormone Receptor in the Pacific Oyster Crassostrea gigas Provide Insight into Evolution of the Thyroid Hormone System, PLOS ONE, 2015, 第 2 作者
（41） Phylogeny of forkhead genes in three spiralians and their expression in Pacific oyster Crassostrea gigas, CHINESEJOURNALOFOCEANOLOGYANDLIMNOLOGY, 2014, 第 2 作者
（42） Genomic Analysis of the Pacific Oyster ( Crassostrea gigas ) Reveals Possible Conservation of Vertebrate Sex Determination in a Mollusc, G3-GENES GENOMES GENETICS, 2014, 第 2 作者
（43） Identification and Functional Characterization of Two Executioner Caspases in Crassostrea gigas, PLOS ONE, 2014, 第 5 作者
（44） A new identification method for five species of oysters in genus Crassostrea from China based on high-resolution melting analysis, CHINESE JOURNAL OF OCEANOLOGY AND LIMNOLOGY, 2014, 第 2 作者
（45） 利用排水称重法测定、分析不同海区牡蛎的贝壳密度, MEASUREMENT AND ANALYSIS OF SHELL DENSITY OF OYSTERS FROM DIFFERENT AREAS IN DRAINING-WEIGHING METHOD, 海洋与湖沼, 2014, 第 4 作者
（46） Identification of Conserved and Novel MicroRNAs in the Pacific Oyster Crassostrea gigas by Deep Sequencing, PLOS ONE, 2014, 第 1 作者
（47） Validation of housekeeping genes as internal controls for studying gene expression during Pacific oyster ( Crassostrea gigas ) development by quantitative real-time PCR, FISH AND SHELLFISH IMMUNOLOGY, 2013, 第 3 作者
（48） Validation of housekeeping genes as internal controls for studying gene expression during Pacific oyster (Crassostrea gigas) development by quantitative real-time PCR., FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY, 2013, 第 3 作者
（49） 海湾扇贝混交家系中优先受精以及自然选择压力下杂合子过剩的研究, Investigation of preferential fertilization and heterozygote excess in mixed family of bay scallop (Argopecten irradians), 海洋科学, 2013, 第 2 作者
（50） 水产动物基因资源和分子育种的研究与应用, Studies and Application of Gene Resources and Molecular Breeding of Aquatic Animals, 中国农业科技导报, 2011, 第 2 作者
（51） Bindin gene from the kumamoto oyster crassostrea sikamea, and divergence of the fucose lectin repeats of bindin among three species of crassostrea, JOURNAL OF SHELLFISH RESEARCH, 2011, 第 2 作者
（52） Crosses between two subspecies of bay scallop argopecten irradians and heterosis for yield traits at harvest, AQUACULTURE RESEARCH, 2011, 第 2 作者
（53） 中国北方沿海“褶牡蛎”的分类和订名, Classification of ＂Zhe＂ oysters from North China, 海洋科学, 2009, 第 4 作者
（54） Intracellular copper/zinc superoxide dismutase from bay scallop argopecten irradians: its gene structure, mrna expression and recombinant protein, FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY, 2009, 第 3 作者
（55） Laboratory hybridization between crassostrea ariakensis and c. sikamea, JOURNAL OF SHELLFISH RESEARCH, 2009, 第 1 作者
（56） 海湾扇贝壳色与数量性状之间的关系, RELATIONSHIPS BETWEEN SHELL COLORS AND QUANTITATIVE TRAITS IN THE BAY SCALLOP, ARGOPECTEN IRRADIANS IRRADIANS (LAMARCK, 1819), 海洋与湖沼, 2008, 第 2 作者
（57） 海湾扇贝“中科红”品种与普通养殖群体不同温度下早期性状的比较, Comparison on the larval traits between strain ＂Zhongkehong＂ and common cultured population of bay scallop Argopect-en irradians under different temperature, 水产学报, 2008, 第 1 作者
（58） 牡蛎壳腔容积的两种测量方法比较, Comparison of two methods to measure the internal shell cavity volume of oyster, 海洋科学, 2007, 第 1 作者
（59） 辽宁沿海巨蛎属牡蛎的分布, Distribution of Crassostrea oysters in Liaoning coast, 海洋科学, 2007, 第 3 作者

（1） 贝类技术100问, 中国农业出版社, 2009-03, 第 1 作者

   

（ 1 ） 牡蛎类胰岛素基因功能及转录调控机制研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 2 ） 海洋固着贝类粘附机制及人工调控技术研究, 负责人, 研究所自选, 2019-11--2022-11
（ 3 ） 牡蛎附着变态基因调控网络研究, 负责人, 地方任务, 2022-07--2025-06
（ 4 ） 北部湾陆海接力智慧渔场养殖装备与新模式, 负责人, 国家任务, 2022-11--2026-12
（ 5 ） 基因组演化与适应性状遗传解析, 参与, 地方任务, 2022-05--2025-04

（1）海洋担轮幼虫新基因高度表达对动物进化发育生物学研究的启示   中国动物学会年会   2016-10-31
（2）The microRNAs of oyster Crassostrea gigas   世界水产养殖大会   2014-06-11
（3）The oyster genome project   国际动植物基因组大会   2011-01-18

已指导学生

高婷婷  博士研究生  070703-海洋生物学  

苗校静  硕士研究生  085238-生物工程  

邓少熙  硕士研究生  085238-生物工程  

现指导学生

于海洋  硕士研究生  086000-生物与医药  

杨名钰  硕士研究生  086000-生物与医药  

张鑫堂  硕士研究生  086000-生物与医药